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Tandem repeat distribution of gene transcripts in three plant families Genet. Mol. Biol.
Maia,Luciano Carlos da; Souza,Velci Queiróz de; Kopp,Mauricio Marini; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de.
Tandem repeats (microsatellites or SSRs) are molecular markers with great potential for plant genetic studies. Modern strategies include the transfer of these markers among widely studied and orphan species. In silico analyses allow for studying distribution patterns of microsatellites and predicting which motifs would be more amenable to interspecies transfer. Transcribed sequences (Unigene) from ten species of three plant families were surveyed for the occurrence of micro and minisatellites. Transcripts from different species displayed different rates of tandem repeat occurrence, ranging from 1.47% to 11.28%. Both similar and different patterns were found within and among plant families. The results also indicate a lack of association between genome size...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: SSR; EST; Comparative genomics; Molecular markers.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572009000400025
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Association between genetic distances in wheat (Triticum aestivum L.) as estimated by AFLP and morphological markers Genet. Mol. Biol.
Vieira,Eduardo Alano; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Bertan,Ivandro; Kopp,Mauricio Marini; Zimmer,Paulo Dejalma; Benin,Giovani; Silva,José Antônio Gonzalez da; Hartwig,Irineu; Malone,Gaspar; Oliveira,Antônio Costa de.
Molecular and morphological data analyses matrices are very informative tools for the estimation of genetic distances. We used AFLP markers, morphological traits and combined analysis to estimate the genetic distances between wheat genotypes and ascertain any associations between the two techneques. Nineteen wheat (Triticum aestivum L.) genotypes were analyzed using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers and field evaluated for two years. The matrices obtained by morphological and molecular marker data analyses revealed a significant but moderate correlation (r = 0.47), indicating that such techniques sample distinct genome regions. The combined analysis was found to be highly correlated with AFLP (r = 0.97) and moderately correlated with...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Reeding; Genetic divergence; Molecular markers; Morphological traits.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300016
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Dissimilaridade genética em população segregante de soja com variabilidade para caracteres morfológicos de semente Rev. bras. sementes
Dellagostin,Marisa; Henning,Fernando Augusto; Mertz,Liliane Marcia; Kopp,Mauricio Marini; Crestani,Maraisa; Schuster,Ivan; Zimmer,Paulo Dejalma.
O tegumento das sementes de soja é uma estrutura relacionada à capacidade de germinação, vigor e longevidade das sementes. Entre genótipos de soja existe variabilidade genética quanto aos caracteres do tegumento da semente, a qual pode ser utilizada em programas de melhoramento genético. Diante do exposto, realizou-se esse estudo com os objetivos de: Analisar a dissimilaridade genética de população segregante de soja para caracteres morfológicos de sementes, por meio de marcadores morfológicos e marcadores moleculares (AFLP, SSR e RAPD); Estimar a correlação entre as matrizes de dissimilaridade obtidas por meio da utilização das diferentes classes de marcadores. A população utilizada no estudo originou-se do cruzamento entre dois genótipos contrastantes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Tegumento da semente; Marcadores moleculares.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-31222011000400011
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Avaliação de genótipos de arroz sob efeito do ácido butírico Acta Botanica
Kopp,Mauricio Marini; Luz,Viviane Kopp da; Maia,Luciano Carlos da; Coimbra,Jefferson Luiz Meirelles; Sousa,Rogério Oliveira de; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de.
Solos do tipo hidromórfico apresentam uma reduzida capacidade de drenagem, sendo utilizados principalmente para cultivo de arroz irrigado. Esta condição favorece o desenvolvimento de microrganismos anaeróbios que produzem substâncias fitotóxicas. O objetivo do trabalho foi avaliar a resposta de 25 genótipos de arroz ao ácido butírico, um composto produzido em solos de deficiente drenagem e alto teor de matéria orgânica. O trabalho foi executado em sistema de hidroponia com 4 doses do ácido e o delineamento utilizado foi blocos casualizados com 3 repetições em um esquema fatorial. As variáveis mensuradas foram comprimento de raízes (CR) e de parte aérea (CPA), número de raízes (NR) e matéria seca de raízes (MSR) e parte aérea (MSPA). Foram procedidas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Estresse abiótico; Ácidos orgânicos; Oryza sativa; Fitotoxidez.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062010000200027
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Níveis críticos dos ácidos acético, propiônico e butírico para estudos de toxicidade em arroz em solução nutritiva Acta Botanica
Kopp,Mauricio Marini; Luz,Viviane Kopp da; Coimbra,Jefferson Luiz Meirelles; Sousa,Rogério Oliveira de; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de.
A ocorrência de condições anaeróbias nos solos hidromórficos, associada com a presença de matéria orgânica favorece o desenvolvimento de microrganismos anaeróbios que produzem substâncias fitotóxicas, principalmente ácidos orgânicos de cadeia curta. A seleção de constituições genéticas de arroz promissoras para utilização nestas situações requer avaliações de difícil execução em campo, sendo simplificada pela utilização de sistemas hidropônicos. O objetivo deste trabalho foi determinar a faixa de concentração e as respostas mais apropriadas para serem utilizadas em seleção de genótipos de arroz para tolerância a ácidos orgânicos em sistemas hidropônicos. Foram estudados os efeitos de seis concentrações dos três principais ácidos formados no solo: ácido...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Ácidos orgânicos; Toxidez.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062007000100014
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Dissimilaridade genética em mutantes de aveia tolerantes e sensíveis a ácidos orgânicos Bragantia
Souza,Velci Queiroz de; Pereira,Arione da Silva; Kopp,Mauricio Marini; Coimbra,Jefferson Luiz Meirelles; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Luz,Viviane Kopp da; Oliveira,Antônio Costa de.
Para que o cultivo da aveia (Avena sativa L.) seja também alternativa economicamente viável em solos de várzea, faz-se necessário a utilização de cultivares tolerantes aos principais ácidos orgânicos produzidos pela decomposição da matéria orgânica gerada em cultivos com plantio direto. Este trabalho objetivou determinar a dissimilaridade genética entre famílias mutantes M3 e a cultivar UFRGS 14 de aveia mediante a utilização de marcadores ISSR, e detectar regiões genômicas associadas ao caráter tolerância a ácidos orgânicos. Foram avaliadas 30 famílias mutantes (M3), pertencentes ao banco de mutantes de aveia do Centro de Genômica e Fitomelhoramento da Faculdade de Agronomia "Eliseu Maciel". As famílias estudadas foram originadas da cultivar UFRGS 14...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores moleculares; Marcadores ISSR; Raios gama (Co60).
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052005000400006
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Identification of variability for agronomically important traits in rice mutant families Bragantia
Luz,Viviane Kopp da; Silveira,Solange Ferreira da Silveira; Fonseca,Gabriela Magalhães da; Groli,Eder Licieri; Figueiredo,Ricardo Garcia; Baretta,Diego; Kopp,Mauricio Marini; Magalhães Junior,Ariano Martins de; Maia,Luciano Carlos da; Oliveira,Antonio Costa de.
ABSTRACT The increase of yield potential in new rice (Oryza sativa L.) varieties has been a major challenge for genetic improvement. The generation of mutants, followed by their characterization, constitutes a great possibility to isolate and select genes and genotypes that present agronomic traits of interest. This study aimed to evaluate the effect of chemical mutagen ethyl methane sulphonate (EMS) on agronomic traits in 340 M3 families of rice derived from BRS Querência cultivar. Seeds from each family and the original genotype BRS Querência were sown in the experimental field, and the characters main panicle length, main panicle weight, main panicle grain weight, flag leaf width and plant height were evaluated. Data were subjected to analysis of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Ethyl methane sulphonate; Mutagenic; Variability.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052016000100041
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Caracterização de famílias mutantes de arroz para tolerância ao frio nos períodos vegetativo e reprodutivo Bragantia
Martins,Andreza Figueirola; Vieira,Eduardo Alano; Kopp,Mauricio Marini; Luz,Viviane Kopp da; Carvalho,Marcos Fontoura de; Castelo Branco,Juliana Severo; Cruz,Renata Pereira da; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de.
As temperaturas baixas que ocorrem durante o cultivo do arroz na Região Sul do Brasil causam prejuízos ao rendimento e à qualidade dos grãos de arroz. Genótipos tolerantes a baixas temperaturas seriam uma alternativa para minimizar tais prejuízos. Desse modo, o presente trabalho teve como objetivo avaliar a tolerância ao frio em famílias mutantes de arroz (geração M4) nos períodos, vegetativo e reprodutivo, como forma de identificação de variabilidade genética para o caráter. Para a avaliação das famílias mutantes quanto à tolerância ao frio, no período vegetativo, foram utilizadas 10 sementes de cada família colocadas em bandejas celuladas, sendo as plântulas mantidas em casa de vegetação à temperatura de 13 ºC por 10 dias em sala climatizada, com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa L.; Melhoramento genético; Tolerância a baixas temperaturas; Mutação induzida.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052007000200006
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Avaliação de genótipos de aveia branca sob estresse de ácidos orgânicos Bragantia
Kopp,Mauricio Marini; Luz,Viviane Kopp da; Maia,Luciano Carlos da; Sousa,Rogerio Oliveira de; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de.
A ocorrência de condições anaeróbias nos solos hidromórficos, associada com a presença de matéria orgânica favorece o desenvolvimento de microrganismos anaeróbios que produzem substâncias fitotóxicas, principalmente ácidos orgânicos de cadeia curta. O objetivo do trabalho foi avaliar a resposta de 20 genótipos de aveia (Avena sativa L.) aos ácidos acético, propiônico e butírico. O trabalho foi executado em sistema de hidroponia com três doses (0; 3 e 6 mM) da mistura dos três ácidos na relação 6:3:1 respectivamente. O delineamento utilizado foi em blocos casualizados com três repetições em esquema fatorial. As variáveis mensuradas foram: comprimento de raízes (CR) e parte aérea (CPA), número de raízes (NR) e matéria seca de raízes (MSR) e parte aérea...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Estresse abiótico; Fitotoxidez; Dissimilaridade genética; Recursos genéticos.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052009000200006
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Methodology adjustments for organic acid tolerance studies in oat under hydroponic systems BABT
Kopp,Mauricio Marini; Luz,Viviane Kopp da; Souza,Velci Queiróz de; Coimbra,Jefferson Luis Meirelles; Sousa,Rogério Oliveira de; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de.
The occurrence of anaerobic conditions in hydromorphic soils favors the development of anaerobic microorganisms that produce phytotoxic substances representing primarily by organic acids. The selection of promising oat (Avena sativa L.) genotypes for use in those situations requires field evaluations that can be cumbersome, making hydroponics a viable alternative. The objective of this work was to adjust a methodology to use in studies of tolerance to organic acids in oat under hydroponic systems. For such goal, the best germination system was determined in order to reduce the seedling initial establishment effects under hydroponics, the ideal concentration for screening genotypes and the best variable for stress evaluation. It was found that the most...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Phytotoxicity; Levels; Abiotic stress; Genetic breeding.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132009000300003
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Análise da germinação de cultivares de arroz submetidas a estresse por ácido acético Ciência Rural
Kopp,Mauricio Marini; Luz,Viviane Kopp da; Maia,Luciano Carlos da; Sousa,Rogério Oliveira de; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de.
O objetivo do trabalho foi avaliar a germinação de 12 genótipos de arroz submetidos ao estresse por ácido acético, composto fitotóxico produzido em solos com drenagem deficiente e alto teor de matéria orgânica. Foram realizados os testes de primeira contagem da germinação (PCG) e germinação (G) dos genótipos submetidos às concentrações de 0mM, 4mM, 8mM e 12mM de ácido acético. As sementes de cada genótipo foram colocadas em papel germitest, os quais foram embebidos com as soluções-tratamento e acondicionados em sacos individuais. A germinação foi executada em câmara a 25°C e as contagens realizadas aos sete (PCG) e aos 14 dias (G). O delineamento experimental utilizado foi fatorial inteiramente casualizado, com quatro repetições de 50 sementes por...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Estresse abiótico; Ácidos orgânicos; Oryza sativa; Fitotoxidez.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000900030
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Absorção de P, Mg, Ca e K e tolerância de genótipos de arroz submetidos a estresse por alumínio em sistemas hidropônicos Ciência Rural
Freitas,Fábio Almeida de; Kopp,Mauricio Marini; Sousa,Rogério Oliveira de; Zimmer,Paulo Dejalma; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de.
Solos com concentrações elevadas de alumínio (Al3+), podem prejudicar o desenvolvimento e a absorção de nutrientes de plantas de arroz. O objetivo do experimento foi avaliar o desempenho de dezoito genótipos de arroz quanto a absorção de P, Mg, Ca e K e identificar genótipos com bom desempenho quando submetidos ao estresse por Al3+ em sistema hidropônico. Foram utilizados quatro níveis de Al3+ (0, 10, 20 e 30mg L-1) e o delineamento experimental foi blocos casualizados com três repetições. As plântulas permaneceram em sistema hidropônico por 20 dias sob efeito dos tratamentos, e após foram avaliadas quanto ao comprimento de raízes (CR) e teores de P, Mg, Ca e K. Todas as variáveis apresentaram reduções significativas nos seus valores, e os genótipos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Alumínio tóxico; Variabilidade.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782006000100011
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Mineração da interação genótipo x ambiente em Phaseolus vulgaris L. para o Estado de Santa Catarina Ciência Rural
Coimbra,Jefferson Luís Meirelles; Bertoldo,Juliano Garcia; Elias,Haroldo Tavares; Hemp,Silmar; Vale,Naine Martins do; Toaldo,Diego; Rocha,Fabiani da; Barili,Leiri Daine; Garcia,Soraya Helena; Guidolin,Altamir Frederico; Kopp,Mauricio Marini.
Genótipos de feijão (Phaseolus vulgaris L.) dos grupos preto (testados em seis ambientes) e carioca (testados em cinco ambientes) foram avaliados para rendimento de grãos na safra agrícola de 2006/07, no Estado de Santa Catarina. Desse modo, o objetivo deste trabalho foi avaliar a sensibilidade genotípica, por meio de funções preditas entre a diferença do potencial rendimento de grãos médio (kg ha-1), considerando todas as combinações possíveis entre os ambientes estudados. Ausência de significância para todos os genótipos testados de feijão preto indica um comportamento insensível destes genótipos frente às variações do par de ambiente Chapecó versus Lages. Por outro lado, o ambiente de Ponte Serrada, independentemente do grupo (preto ou carioca) e do...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Variância fenotípica; BLUP; Sensibilidade; Rendimento de grãos de feijão.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000200007
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