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Registros recuperados: 57 | |
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Lallias, Delphine. |
Genetic linkage maps consist of ordering molecular markers across the genome and require a high number of markers for a good coverage of the genome. Such maps represent a framework which enables the identification and localisation of Quantitative Trait Loci (QTLs) for traits of interest, such as growth or disease resistance, with the final aim of achieving genetic improvement through marker-assisted selection (MAS). Data on bivalves are scarce. No genetic map has yet been constructed in any mussel or flat oyster species. We report construction of a preliminary genetic linkage map in the blue mussel, Mytilus edulis (n=14). Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) markers were used in a mapping family containing 86 full-sibs issued from a controlled... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Microsatellite; AFLP; Mussel; Flat oyster; QTL; Genetic mapping; Microsatellite; AFLP; Moule; Huître plate; QTL; Cartographie génétique. |
Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/these-2603.pdf |
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Salerno,Juan Carlos; Kandus,Mariana; Boggio Ronceros,R.; Sorarrain,O.; González,Cecilia; Almorza,David. |
The objective of this work is to study the genetic process related to the hybrid vigour (heterosis) and the identification of quantitative trait loci (QTL) in maize. A biometric model was built using the mathematical formalism relating to the discrete absorbent Markov chain in canonical form, in order to analyse the evolution of chromosome segments, with recessive lethal genes linked with grain yield factors through generations. The grain yield obtained from an inbred maize line regulated by a balanced lethal system, and other lines without this system as control, were evaluated during five inbreeding generations. The use of the Markov chain theory for the study of evolution during these generations was a different approach of the classical mathematical... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Maize; Lethal alleles; Heterosis; Markov Chains; QTL. |
Ano: 2007 |
URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332007000100003 |
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Mori, Masahiko; Onishi, Kazumitsu; Tokizono, Yoshiro; Shinada, Hiroshi; Yoshimura, Toru; Numao, Yoshinori; Miura, Hideho; Sato, Takashi; 大西, 一光; 三浦, 秀穂. |
Cold stress at the booting stage in rice induces spikelet sterility because of aberrant microspore development, which often seriously damages seed production. Some breeding lines with high cold tolerance were developed by using tropical japonica variety Silewah as a donor of cold tolerance; however, the genetic factors that confer cold tolerance of this variety have not been comprehensively analyzed. In this study, phenotypic and molecular characterization of novel cold-tolerant strains derived from crosses with Silewah was performed to identify quantitative trait loci (QTLs) responsible for cold tolerance. Molecular marker analysis revealed that 2 cold-tolerant strains carried chromosomal segments of Silewah at the same genomic regions on chromosomes 3, 4... |
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Palavras-chave: Oryza sativa; Cold tolerance; Booting stage; QTL; Phenotypic selection; Marker-assisted selection; Exotic germplasm. |
Ano: 2011 |
URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/3040 |
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Kottearachchi, NS; Uchino, N.; Kato, Kiyoaki; Miura, Hideho; 加藤, 清明; 三浦, 秀穂. |
White-grained wheat cultivars have long been recognized to be less resistant to preharvest sprouting (PHS) than the red-grained ones. Previously two QTLs for grain dormancy, QPhs.ocs-3A.1 (QPhs-3AS) and QPhs.ocs-4A.1 (QPhs-4AL) were identified in a highly dormant Japanese red wheat, Zenkoujikomugi (Zen). Aiming at improvement of PHS tolerance in white-grained wheat, the introgression effect of these two QTLs in a white-grained population consisting of 40 recombinant inbred lines (RILs) developed from a cross between Zen and white-grained Spica was examined here. Random 20 RILs with red grains were also developed from the same cross and used as a control population. The RILs were grown in the field and in the glasshouse to evaluate the grain dormancy by... |
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Palavras-chave: Grain dormancy; Molecular marker; QTL; Triticum aestivum; White-grained wheat. |
Ano: 2006 |
URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/714 |
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Nogueira,Danilo Gustavo; Maluf,Wilson Roberto; Nogueira,Douglas Willian; Maciel,Gabriel Mascarenhas; Paiva,Luciano Vilela; Figueira,Antônia dos Reis. |
O objetivo deste trabalho foi associar um marcador microssatélite ao alelo Ty-1 de resistência a Begomovirus em tomateiro, e avaliar a eficiência desta associação na seleção de linhagens resistentes ao vírus. Os marcadores SSR-47 e SSR-48 foram testados em linhagens isogênicas contrastantes quanto à presença do alelo Ty-1 (LA-3473, LA-3474, LA-3475). O marcador SSR-47, por ter detectado polimorfismo nas linhagens, foi o único utilizado nas etapas subsequentes da pesquisa. Detectada a associação entre o SSR-47 e o alelo Ty-1, testou-se sua eficiência na seleção de genótipos avançados de tomateiro. Para confirmar a eficiência da seleção, foi realizada a avaliação fenotípica das plantas com padrões contrastantes de bandas para SSR-47, quanto à resistência a... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Geminiviridae; Lycopersicon esculentum; Solanum lycopersicum; QTL; Seleção assistida por marcadores. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000400011 |
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Rosado,Tatiana Barbosa; Tomaz,Rafael Simões; Rocha,Rodrigo Barros; Rosado,Antônio Marcos; Alves,Alexandre Alonso; Araújo,Elza Fernandes de; Alfenas,Acelino Couto; Cruz,Cosme Damião. |
The objective of this work was to verify the existence of a lethal locus in a eucalyptus hybrid population, and to quantify the segregation distortion in the linkage group 3 of the Eucalyptus genome. A E. grandis x E. urophylla hybrid population, which segregates for rust resistance, was genotyped with 19 microsatellite markers belonging to linkage group 3 of the Eucalyptus genome. To quantify the segregation distortion, maximum likelihood (ML) models, specific to outbreeding populations, were used. These models consider the observed marker genotypes and the lethal locus viability as parameters. The ML solutions were obtained using the expectation‑maximization algorithm. A lethal locus in the linkage group 3 was verified and mapped, with high confidence,... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Eucalyptus; Gametic selection; Genetic mapping; QTL; Rust resistance; Segregation distortion. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000900008 |
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Faleiro,Fábio Gelape; Schuster,Ivan; Ragagnin,Vilmar Antônio; Cruz,Cosme Damião; Corrêa,Ronan Xavier; Moreira,Maurílio Alves; Barros,Everaldo Gonçalves de. |
O objetivo deste trabalho foi caracterizar 154 linhagens endogâmicas recombinantes por meio da avaliação de características quantitativas, morfológicas, moleculares e de resistência a doenças e mapear locos de características quantitativas associados a ciclo e produtividade do feijoeiro-comum. Adotando o valor do limite de detecção (LOD) de 4,0 e uma freqüência máxima de recombinação de 0,40, foram mapeados 43 marcadores em nove grupos de ligação cobrindo uma distância de recombinação total de 247,8 cM. A distância entre marcadores adjacentes variou entre 0 e 28 cM, com média de 7,3 cM. Os grupos de ligação variaram em tamanho de 2,3 a 61,2 cM. Os genes de resistência à ferrugem e à antracnose ficaram localizados no mesmo grupo de ligação. Foram mapeados... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; QTL; Mapa genético; Progênie; Marcador genético; Método de melhoramento. |
Ano: 2003 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2003001200005 |
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Mollinari,Marcelo; Margarido,Gabriel Rodrigues Alves; Garcia,Antonio Augusto Franco. |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência, na construção de mapas genéticos, dos algoritmos seriação e delineação rápida em cadeia, além dos critérios para avaliação de ordens: produto mínimo das frações de recombinação adjacentes, soma mínima das frações de recombinação adjacentes e soma máxima dos LOD Scores adjacentes, quando usados com o algoritmo de verificação de erros " ripple" . Foi simulado um mapa com 24 marcadores, posicionados aleatoriamente a distâncias variadas, com média 10 cM. Por meio do método Monte Carlo, foram obtidas 1.000 populações de retrocruzamento e 1.000 populações F2, com 200 indivíduos cada, e diferentes combinações de marcadores dominantes e co-dominantes (100% co-dominantes, 100% dominantes e mistura com 50%... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Algoritmo ripple; Dados perdidos; Marcadores dominantes e co-dominantes; Método Monte Carlo; QTL. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000400009 |
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Rodrigues,Josiane Isabela da Silva; Arruda,Klever Márcio Antunes; Cruz,Cosme Damião; Piovesan,Newton Deniz; Barros,Everaldo Gonçalves de; Moreira,Maurilio Alves. |
O objetivo deste trabalho foi avaliar a associação de marcadores microssatélites localizados próximos a locos de caracteres quantitativos (QTL) descritos na literatura, com os teores de óleo e proteína de genótipos de soja cultivados no Brasil. Quarenta e nove genótipos de soja foram avaliados em Viçosa, MG (12/2009); Visconde do Rio Branco, MG (2/2010); e São Gotardo, MG (2/2010 e 10/2011). Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso, com três repetições. Os teores de óleo e proteína foram determinados por espectrometria do infravermelho. Foi observada ampla variabilidade genética para esses teores. Dos 65 marcadores microssatélites testados, 35 apresentaram associação significativa com pelo menos um dos teores, mas poucos foram consistentes com a... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Glycine max; Melhoramento; QTL; Seleção assistida. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000300003 |
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Villalobos-Cortés,Axel; Martínez,Amparo; Vega-Pla,José Luis; Landi,Vincenzo; Quiroz,Jorge; Martínez,Rubén; López,Roberto Martínez; Sponenberg,Phil; Armstrong,Eileen; Zambrano,Delsito; Marques,Jose Ribamar; Delgado,Juan Vicente. |
El objetivo de este trabajo fue establecer la relación genética entre poblaciones bovinas panameñas Guabalá y Guaymí y algunas poblaciones criollas de Latinoamérica. Se practicó un análisis factorial de correspondencias, análisis de varianza molecular, distancias genéticas, número medio de migrantes por población y los estadísticos F de Wright. Se evaluó la estructura de la población mediante un modelo Bayesiano, suponiéndose un número desconocido de K grupos diferentes genéticamente. El análisis factorial de correspondencias mostró que las poblaciones Guabalá y Guaymí se agrupan con los bovinos criollos mexicanos y el Texas Longhorn. Igualmente se observó menor diferenciación genética de las criollas panameñas con mexicanos y el Texas Longhorn. Los... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Conservación; Criollo; Estructura genética; Guabalá; Guaymí; QTL. |
Ano: 2012 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012001100011 |
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Cardoso,Juliana Morini Kupper; Oblessuc,Paula Rodrigues; Campos,Tatiana de; Sforça,Danilo Augusto; Carbonell,Sérgio Augusto Moraes; Chioratto,Alisson Fernando; Formighieri,Eduardo Fernandes; Souza,Anete Pereira de; Benchimol,Luciana Lasry. |
The objective of this work was to develop new microsatellite markers in common bean. Ninety nine new microsatelitte loci were developed from a microsatellite enriched library for (CT)8 and (GT)8 motifs, from CAL-143 line. The majority of microsatellite sequences (51%) was related to cellular metabolism. The remaining sequences were associated to transcription functions. Only 17.2% of the sequences presented some level of similarity with other plant species genes. |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; Molecular markers; Plant breeding; QTL; SSR. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000700019 |
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Santos,Rogério Mercês Ferreira; Lopes,Uilson Vanderlei; Bahia,Rita de Cássia; Machado,Regina Celle Rebouças; Ahnert,Dário; Corrêa,Ronan Xavier. |
Os objetivos deste trabalho foram caracterizar a resistência à vassoura-de-bruxa de plantas de cacau originadas do cruzamento entre TSH 1188 e CCN 51 (população segregante), por meio de dois métodos de inoculação em condições de campo, e identificar marcadores microssatélites específicos para grupos de plantas resistentes e suscetíveis. As plantas-controle avaliadas pelos métodos de inoculação natural e inoculação artificial em campo produziram os mesmos padrões de sintomas. As plantas da população segregante também coincidiram os padrões de sintomas em 90%, por esses dois métodos. O método de inoculação artificial em campo permite detectar falso-resistentes. Dos 18 pares de primers microssatélites amplificados, 15 foram polimórficos entre os genitores, e... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Theobroma cacao; Moniliophthora perniciosa; Inoculação; Marcador molecular; QTL; Melhoramento genético. |
Ano: 2007 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000800010 |
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Pereira,Helton Santos; Santos,João Bosco dos; Souza,Thaís Paula de; Lima,Igor Almeida. |
O objetivo deste trabalho foi selecionar famílias de feijoeiro-comum, com alta produtividade de grãos, por meio de seleção fenotípica e de seleção assistida por marcadores moleculares (SAM). Foram avaliadas 394 famílias, de quatro populações, e seus seis genitores, no Município de Lavras, em dois experimentos: um na geração F3:4, na safra das águas de 2005/2006, em látice simples 20x20; e outro na geração F3:5, na safra da seca de 2006, em látice triplo 20x20. Foram estimados parâmetros genéticos e fenotípicos, e foi realizada a genotipagem das famílias, com marcadores microssatélites associados a QTL controladores da produção de grãos, previamente identificados. Também foram realizadas análises de associação por marcas simples, entre os marcadores e a... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; QTL; Locos de características quantitativas; Associação por marcas simples; Ganho genético; Herdabilidade; Microssatélites. |
Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008001100014 |
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Pettersson,Mats E.; Carlborg,Örjan. |
Long-term selection experiments provide a valuable resource for understanding the genetic changes that take place in animal improvement programs. The Virginia chicken lines have for more than 50 years been subjected to single-trait, bi-directional, divergent selection for high and low juvenile body weight. It is one of the most well studied experimental populations in agricultural animals and has played an instrumental role in the understanding of the genetic basis of complex traits. In this paper, we summarize the findings from the more recent publications focusing on the efforts to identify the loci contributing to selection response as well as discuss the currently ongoing research. We conclude by describing some future research prospects that promise... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Body weight; Chicken; Epistasis; Metabolic; QTL; Selection. |
Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001300028 |
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Silva,Marcos Vinicius G. Barbosa da; Martinez,Mário Luiz; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Pereira,Carmen Silva; Machado,Marco Antônio; Arbex,Wagner. |
O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h² = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias,... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Mapeamento por intervalo; Marcador genético; Método dos pares de irmãos; Modelo aleatório; QTL. |
Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000100009 |
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