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Epidemiological Survey of Theileria Parasite Infection of Cattle in Northeast China by Allele-Specific PCR OAK
YU, Longzheng; ZHANG, Shoufa; LIANG, Wanfeng; JIN, Chunmei; JIA, Lijun; LUO, Yuzi; LI, Yan; CAO, Shinuo; YAMAGISHI, Junya; NISHIKAWA, Yoshifumi; KAWANO, Suguru; FUJISAKI, Kozo; XUAN, Xuenan; 西川, 義文; 玄, 学南.
An epidemiological survey on a Theileria parasite infection of cattle in Northeast China was carried out using allele-specific PCR and DNA sequence analysis of the major piroplasm surface protein (MPSP) gene. The results showed that 14 of 104 blood samples were positive for Theileria by PCR. Among the positive cases, co-infection with various combinations of C- and I-type parasites was detected in 12 samples; no B- and Thai-type parasites were detected by allele-specific PCR. Phylogenetic analysis based on the MPSP gene sequences revealed that Theileria parasites with the MPSP types 1, 2, and 4 were distributed in Northeast China.
Palavras-chave: Major piroplasm surface protein; PCR; Theileria.
Ano: 2011 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/3586
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PCR Detection and Genetic Diversity of Bovine Hemoprotozoan Parasites in Vietnam OAK
SIVAKUMAR, Thillaiampalam; LAN, Dinh Thi Bich; LONG, Phung Thang; YOSHINARI, Takeshi; TATTIYAPONG, Muncharee; GUSWANTO, Azirwan; OKUBO, Kazuhiro; IGARASHI, Ikuo; INOUE, Noboru; XUAN, Xuenan; YOKOYAMA, Naoaki; 井上, 昇; 玄, 学南; 横山, 直明.
Hemoprotozoan infections often cause serious production losses in livestock. In the present study, we conducted a PCR-based survey of Babesia bovis, Babesia bigemina, Theileria annulata, Theileria orientalis, Trypanosoma evansi and Trypanosoma theileri, using 423 DNA samples extracted from blood samples of cattle (n=202), water buffaloes (n=43), sheep (n=51) and goats (n=127) bred in the Hue and Hanoi provinces of Vietnam. With the exception of T. annulata and T. evansi, all other parasite species (B. bovis, B. bigemina, T. orientalis and T. theileri) were detected in the cattle populations with B. bovis being the most common among them. Additionally, four water buffaloes and a single goat were infected with B. bovis and B. bigemina, respectively. The Hue...
Palavras-chave: Epidemiology; Hemoprotozoa; Livestock; PCR; Vietnam.
Ano: 2013 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/4015
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Specific Molecular Detection and Characterization of Anaplasma marginale in Mongolian Cattle OAK
YBAÑEZ, Adrian Patalinghug; SIVAKUMAR, Thillaiampalam; BATTSETSEG, Badgar; BATTUR, Banzragch; ALTANGEREL, Khukhuu; MATSUMOTO, Kotaro; YOKOYAMA, Naoaki; INOKUMA, Hisashi; 松本, 高太郎; 横山, 直明; 猪熊, 壽.
Anaplasma marginale is an etiologic agent of bovine anaplasmosis. This study aimed to molecularly detect and characterize A. marginale that is prevalent in Mongolian cattle populations. A highly specific and sensitive nested PCR (nPCR) method based on the Msp5 gene was developed to detect A. marginale (Msp5 nPCR). The method detected A. marginale from the positive DNA samples obtained from different countries, while no amplicons were observed from DNA samples of several other bovine blood pathogens tested. The detection limit of Msp5 nPCR was determined to be 2 copies/μl. The method was tested against field blood DNA samples prepared from 300 Mongolian cattle in 2010. Results indicated a prevalence rate of 8.7% (26 of 300). On the other hand, partial DNA...
Palavras-chave: Anaplasma marginale; Cattle; Mongolia; Msp5; PCR.
Ano: 2013 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/3867
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PCR detection of Babesia microti and Babesia divergens in ticks OAK
Skotarczak, Bogumila; ACichocka, Gnieszka.
We investigated the presence of Babesia microti and B. divergens in Ixodes ricinus ticks collected in a Lyme borreliosis endemic area of Northern Poland. We used as the PCR target the fragment from a gene encoding the nuclear small-subunit ribosomal RNA (SS-rDNA). We have made a thorough analysis of the quantitative and rate per cent occurrence Ixodes ricinus from two areas of forest in province of Szczecin, known as highly recreative and frequented of many people resort. A total of 533 specimens collected in 13.3% was detected DNA of B. microti and in 3.0% of B. divergens.
Palavras-chave: Babesia microti; Babesia divergens; Ixodes ricinus; PCR.
Ano: 2001 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/135
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First Molecular Characterization of Anaplasma marginale in Cattle and Rhipicephalus (Boophilus) microplus Ticks in Cebu, Philippines OAK
YBAÑEZ, Adrian Patalinghug; SIVAKUMAR, Thillaiampalam; YBAÑEZ, Rochelle Haidee Daclan; RATILLA, Jowarren Catingan; PEREZ, Zandro Obligado; GABOTERO, Shirleny Reyes; HAKIMI, Hassan; KAWAZU, Shin-ichiro; MATSUMOTO, Kotaro; YOKOYAMA, Naoaki; INOKUMA, Hisashi; 河津, 信一郎; 松本, 高太郎; 横山, 直明; 猪熊, 壽.
Anaplasma marginale has been detected in the Philippines only by peripheral blood smear examination and serological methods. This study generally aimed to molecularly detect and characterize A. marginale in cattle and ticks in Cebu, Philippines. A total of 12 bovine blood samples and 60 Rhipicephalus (Boophilus) microplus ticks were collected on the Cebu Island in 2011. 16S rRNA-based screening-PCR and DNA sequencing revealed 8 cattle (66.7%) and 8 ticks (13.3%) to be positive for A. marginale, and 1 tick (1.7%) to be positive for A. centrale. Selected positive DNA samples were further characterized based on 16S rRNA (longer sequence), Msp5, Msp1α,gltA and groEL genes for phylogenetic analyses. Sequence identities of partial DNA fragments of A. marginale...
Palavras-chave: Anaplasma marginale; Cattle; PCR; Philippines; Rhipicephalus (Boophilus) microplus.
Ano: 2013 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/3866
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犬におけるパピローマウイルス関連皮膚疾患の病理学的並びに分子病理学的解析 OAK
古林, 与志安; KOBAYASHI, YOSHIYASU.
2007年度~2008年度科学研究費補助金基盤研究(C) 研究成果報告書19580365
Palavras-chave: 病理・病態; ; 色素性表皮母斑; 表皮過誤腫; パピローマウイルス; パラフィン材料; PCR; In situ Hybridization.
Ano: 2009 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/2751
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Sequence of ITS-2 Amplified from Pearl Millet Downy Mildew Samples Open Agri
Viswanathan, A..
Palavras-chave: DNA; PCR; Genetic techniques; Sampling; Ribosomes; Fungi; Genetic variation; Genes; Millets; Cloning.
Ano: 2005 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3262
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Working together on groundnut virus diseases Open Agri
D.V.R..
Palavras-chave: Viruses; Groundnuts; RNA; Genes; ELISA; Genotypes; Transgenics; PCR; Genetic structures.
Ano: 1994 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/4178
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Working Together on Groundnut Virus Diseases Open Agri
D.V.R.( editor).
Palavras-chave: Viruses; Groundnuts; RNA; Genes; ELISA; Genotypes; Transgenics; PCR; Genetic structures.
Ano: 1994 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3121
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Isolation and characterization of novel microsatellite markers and their application for diversity assessment in cultivated groundnut (Arachis hypogaea) Open Agri
Luu M Cuc.
Palavras-chave: Genomes; Genetic structures; Polymorphism; Alleles; DNA; Genotypes; PCR; Cloning; Locus; Groundnuts.
Ano: 2008 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3317
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Development of new simple sequence repeat markers for pearl millet Open Agri
Yadav, O.P..
Palavras-chave: Locus; DNA; Genetic structures; PCR; Millets; Polymorphism; Genomes; Biotechnology; Breeds (animals); Melting.
Ano: 2007 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3309
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Genetic structure, diversity, and allelic richness in composite collection and reference set in chickpea (Cicer arietinum L.) Open Agri
Upadhyaya, H.D..
Palavras-chave: Alleles; Chickpeas; Locus; Genomes; Polymorphism; Genes; Genetic structures; DNA; PCR; Peas.
Ano: 2008 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3334
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Groundnut bacterial wilt: past, present, and future Open Agri
V.K..
Palavras-chave: Bacteria; Groundnuts; Pathogens; PCR; DNA; Enzymes; Genotypes; Oil crops; Mutants.
Ano: 1994 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/4181
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An effective method for cloning of partial MADS-box genes related to flower development in groundnut Open Agri
Yuan, M..
Palavras-chave: Genes; PCR; DNA; Cloning; Transcription factors; Genomes; Transcription; Genetic structures; Nucleotides; Molecular cloning.
Ano: 2005 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3213
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Fatores de risco na transmissão do lentivírus caprino pelo sêmen PAB
Andrioli,Alice; Gouveia,Aurora Maria Guimarães; Martins,Almir de Sousa; Pinheiro,Raymundo Rizaldo; Santos,Diones Oliveira.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a presença do DNA pró-viral do lentivírus caprino (LVC) em ejaculados de machos infectados naturalmente, e verificar a influência da lavagem do sêmen e da presença de inflamação testicular sobre a carga viral. Foram realizadas oito coletas de sêmen de sete reprodutores soropositivos para o LVC: quatro antes dos animais sofrerem dano testicular e quatro depois. Entre as coletas realizadas na mesma semana, em uma, o ejaculado era lavado, para retirada do plasma seminal, e na outra, não. O DNA pró-viral do LVC foi identificado pela reação em cadeia da polimerase Nested (PCR Nested), e pelo isolamento viral. O vírus foi isolado em 7,1% das amostras. A PCR identificou o DNA pró-viral em 35,7% do total das amostras: 17,9%...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Reprodução; PCR; Artrite-encefalite caprina; Transmissão.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000800015
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Amplification of 16S rRNA gene sequences to differentiate two highly related bradyrhizobia species PAB
Giongo,Adriana; Ambrosini,Adriana; Freire,João Ruy Jardim; Zanettini,Maria Helena Bodanese; Passaglia,Luciane Maria Pereira.
A 16S rRNA gene PCR-based assay was developed aiming at a fast molecular diagnostic method to differentiate the two phylogenetically closely related species Bradyrhizobium japonicum and B. elkanii, isolated from soybean nodules, in order to identify those more competitive and comprising greater nitrogen fixation ability for use in the formulation of commercial inoculants. The assay used was able to discriminate ten reference strains belonging to these two Bradyrhizobium species, as well as to efficiently identify 37 strains isolated from fields cultivated with soybean.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: PCR; Rhizobial diversity; Commercial inoculants.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000900019
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Identificação dos genes Ty-2 e Ty-3 de resistência a begomovírusem genótipos de tomateiro PAB
Aguilera,Jorge González; Hurtado,Francisco Dueñas; Xavier,Cesar Augusto Diniz; Laurindo,Bruno Soares; Nick,Carlos; Gil,Marta Álvarez; Silva,Derly José Henriques da; Zerbini,Francisco Murilo.
O objetivo deste trabalho foi identificar a presença dos genes Ty-2 e Ty-3, de resistência a begomovírus, em acessos de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa. Os oligonucleotídeos TO302 F/R e FLUW25 F/R foram utilizados em reações de PCR, para verificar a presença de marcadores relacionados aos genes Ty-2 e Ty-3, respectivamente. Observou-se a presença do gene Ty-2, em heterozigose na subamostra BGH-6881 (Solanum peruvianum), e do gene Ty-3, em homozigose nas subamostras BGH-6878, BGH-6897 (S. lycopersicum) e em heterozigose na subamostra BGH-6881. A identificação dos genes de resistência, com reações de PCR, representa um avanço para os programas de melhoramento de tomateiro no Brasil.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Solanum lycopersicum; Solanum peruvianum; Geminivírus; PCR; Recursos genéticos.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000700014
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Alterações microbianas no solo durante o ciclo do milho nos sistemas plantio direto e convencional PAB
Vargas,Luciano Kayser; Selbach,Pedro Alberto; Sá,Enílson Luiz Saccol de.
A disponibilidade de resíduos de aveia-preta, com relação C:N elevada, resulta em imobilização microbiana de nitrogênio no solo, exigindo cuidados no manejo da adubação nitrogenada da cultura subseqüente. O objetivo deste trabalho foi avaliar as alterações na estrutura da comunidade microbiana ao longo do ciclo do milho, na presença de resíduos de aveia-preta e da aplicação de nitrogênio. Foram coletadas amostras de um Argissolo Vermelho distrófico no dia da semeadura do milho e 46, 62, 88 e 112 dias após a semeadura. O nitrogênio foi aplicado 25 dias e 49 dias após a semeadura. As alterações na comunidade microbiana foram avaliadas mediante relações entre carbono (C) e nitrogênio (N), nitrogênio reativo com ninidrina (N-Nin) e carboidratos (CHO) da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biomassa microbiana; PCR; Preparos de solo; Imobilização de nitrogênio; Zea mays.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2004000800004
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Clasificación y estimación de la diversidad genética de Nopal Opuntia spp en base a descriptores fenotípicos y marcadores genético moleculares Phyton
García-Zambrano,Eduardo A; Gutiérrez-Díez,Adriana; Salinas-García,Gilberto E; Cárdenas-Cerda,Elizabeth; Vázquez-Alvarado,Rigoberto E; Zavala-García,Francisco; Martínez de la Cerda,Jesús.
El objetivo de esta investigación fue desarrollar y aplicar marcadores moleculares de tipo RAPD para la estimación de la diversidad genética de 100 accesiones de nopal que forman el Banco de Germoplasma de la FAUANL. Los datos moleculares fueron evaluados por medio del análisis multivariado, utilizando los métodos de Ward y UPGMA; estos resultados se compararon con datos fenotípicos tomados de las mismas accesiones, evaluados por los métodos ya mencionados. Para lograr este objetivo se modificó el protocolo para la extracción del DNA de nopal con el fin de reducir la cantidad de polisacáridos y su influencia en la calidad de la extracción. Posteriormente, se desarrolló un protocolo para la generación de marcadores moleculares del tipo RAPD para nopal y así...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores moleculares; RAPD; Accesión; PCR.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1851-56572006000100013
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Resistance to ACCase inhibitors in Eleusine indica from Brazil involves a target site mutation Planta Daninha
Osuna,M.D.; Goulart,I.C.G.R.; Vidal,R.A.; Kalsing,A.; Ruiz Santaella,J.P.; De Prado,R..
Eleusine indica (goosegrass) is a diploid grass weed which has developed resistance to ACCase inhibitors during the last ten years due to the intensive and frequent use of sethoxydim to control grass weeds in soybean crops in Brazil. Plant dose-response assays confirmed the resistant behaviour of one biotype obtaining high resistance factor values: 143 (fenoxaprop), 126 (haloxyfop), 84 (sethoxydim) to 58 (fluazifop). ACCase in vitro assays indicated a target site resistance as the main cause of reduced susceptibility to ACCase inhibitors. PCR-generated fragments of the ACCase CT domain of the resistant and sensitive reference biotype were sequenced and compared. A point mutation was detected within the triplet of aspartate at the amino acid position 2078...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Goosegrass; Cross-resistance; Enzyme; PCR; Herbicide.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-83582012000300025
Registros recuperados: 425
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