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Separomics applied to the proteomics and peptidomics of low-abundance proteins: choice of methods and challenges - a review Genet. Mol. Biol.
Baracat-Pereira,Maria Cristina; Barbosa,Meire de Oliveira; Magalhães Júnior,Marcos Jorge; Carrijo,Lanna Clicia; Games,Patrícia Dias; Almeida,Hebréia Oliveira; Sena Netto,José Fabiano; Pereira,Matheus Rodrigues; Barros,Everaldo Gonçalves de.
The enrichment and isolation of proteins are considered limiting steps in proteomic studies. Identification of proteins whose expression is transient, those that are of low-abundance, and of natural peptides not described in databases, is still a great challenge. Plant extracts are in general complex, and contaminants interfere with the identification of proteins involved in important physiological processes, such as plant defense against pathogens. This review discusses the challenges and strategies of separomics applied to the identification of low-abundance proteins and peptides in plants, especially in plants challenged by pathogens. Separomics is described as a group of methodological strategies for the separation of protein molecules for proteomics....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Sample preparation; Complex protein extract; Subproteomes; Low-abundance proteins; Cell wall proteins.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572012000200009
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Enzimas marcadoras de indução de resistência diferencialmente reguladas em soja resistente e suscetível à ferrugem-asiática-da-soja PAB
Almeida,Hebréia Oliveira; Barbosa,Meire de Oliveira; Marques,Ana Ermelinda; Pereira,Tânus Henrique Abdalla; Magalhães Júnior,Marcos Jorge; Tessarollo,Nayara Gusmão; Games,Patrícia Dias; Barros,Everaldo Gonçalves de; Stolf-Moreira,Renata; Marcelino-Guimarães,Francismar Corrêa; Abdelnoor,Ricardo Vilela; Pereira,Paulo Roberto Gomes; Baracat-Pereira,Maria Cristina.
O objetivo deste trabalho foi avaliar, por meio de enzimas marcadoras, a indução de resistência à ferrugem-asiática-da-soja em genótipos de soja contrastantes quanto à suscetibilidade a Phakopsora pachyrhizi. Aproteína total e as atividades de cinco enzimas marcadoras da indução de resistência (lipoxigenases, peroxidases, fenilalanina amônia-liase, quitinases e β-1, 3-glucanases) foram avaliadas em extratos de folhas de plantas de soja dos genótipos Embrapa 48 (suscetível) e PI 561356 (resistente), submetidas à inoculação ou não com o patógeno. Foram observadas respostas de defesa discrepantes entre os dois genótipos e entre os tempos de coleta (12, 72 e 168 horas após inoculação). A resposta de indução dessas enzimas assemelha-se à defesa bifásica, para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Glycine max; Phakopsora pachyrhizi; Atividade enzimática; Mecanismos de defesa; Resistência sistêmica; Resposta em cascata.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012000200003
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