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Comparison between simulated annealing algorithms and rapid chain delineation in the construction of genetic maps Genet. Mol. Biol.
Nascimento,Moysés; Cruz,Cosme Damião; Peternelli,Luiz Alexandre; Campana,Ana Carolina Mota.
The efficiency of simulated annealing algorithms and rapid chain delineation in establishing the best linkage order, when constructing genetic maps, was evaluated. Linkage refers to the phenomenon by which two or more genes, or even more molecular markers, can be present in the same chromosome or linkage group. In order to evaluate the capacity of algorithms, four F2 co-dominant populations, 50, 100, 200 and 1000 in size, were simulated. For each population, a genome with four linkage groups (100 cM) was generated. The linkage groups possessed 51, 21, 11 and 6 marks, respectively, and a corresponding distance of 2, 5, 10 and 20 cM between adjacent marks, thereby causing various degrees of saturation. For very saturated groups, with an adjacent distance...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Better order; Genetic mapping; Genomic analyses; Stochastic optimization.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000200032
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Adaptabilidade e estabilidade via regressão não paramétrica em genótipos de café PAB
Nascimento,Moysés; Ferreira,Adésio; Ferrão,Romário Gava; Campana,Ana Carolina Mota; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião; Ferrão,Maria Amélia Gava; Fonseca,Aymbiré Francisco Almeida da.
O objetivo deste trabalho foi avaliar uma metodologia de análise de adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos de café baseada em regressão não paramétrica. A técnica utilizada difere das demais, pois reduz a influência na estimação do parâmetro de adaptabilidade de algum ponto extremo, ocasionado pela presença de genótipos com respostas demasiadamente diferenciadas a determinado ambiente. Foram utilizados dados provenientes de um experimento sobre produtividade média de grãos de 40 genótipos de café (Coffea canephora), com delineamento em blocos ao acaso, com seis repetições. Os genótipos foram avaliados em cinco anos (1996, 1998, 1999, 2000 e 2001), em dois locais (Sooretama e Marilândia, ES) no total de dez ambientes. A metodologia proposta...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coffea canephora; Análise estatística; Interação genótipo x ambiente; Melhoramento genético; Pontos extremos.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000100006
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Alteração no método centroide de avaliação da adaptabilidade genotípica PAB
Nascimento,Moysés; Cruz,Cosme Damião; Campana,Ana Carolina Mota; Tomaz,Rafael Simões; Salgado,Caio Césio; Ferreira,Reinaldo de Paula.
O objetivo deste trabalho foi alterar o método centroide de avaliação da adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos, para deixá-lo com maior sentido biológico e melhorar aspectos quantitativos e qualitativos de sua análise. A alteração se deu pela adição de mais três ideótipos, definidos de acordo com valores médios dos genótipos nos ambientes. Foram utilizados dados provenientes de um experimento sobre produção de matéria seca de 92 genótipos de alfafa (Medicago sativa) realizado em blocos ao acaso, com duas repetições. Os genótipos foram submetidos a 20 cortes, no período de novembro de 2004 a junho de 2006. Cada corte foi considerado um ambiente. A inclusão dos ideótipos de maior sentido biológico (valores médios nos ambientes) resultou em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Medicago sativa; Análise gráfica; Componentes principais; Interação genótipos x ambientes.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009000300007
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