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A re-annotation of the Anopheles darlingi mobilome Genet. Mol. Biol.
Diesel,Jose Francisco; Ortiz,Mauro F.; Marinotti,Osvaldo; Vasconcelos,Ana Tereza R.; Loreto,Elgion L. S..
Abstract The mobilome, portion of the genome composed of transposable elements (TEs), of Anopheles darlingi was described together with the genome of this species. Here, this mobilome was revised using similarity and de novo search approaches. A total of 5.6% of the A. darlingi genome is derived of TEs. Class I gypsy and copia were the most abundant superfamilies, corresponding to 22.36% of the mobilome. Non-LTR elements of the R1 and Jockey superfamilies account for 11% of the TEs. Among Class II TEs, the mariner superfamily is the most abundant (16.01%). Approximately 87% of the A. darlingi mobilome consist of short, truncated and/or degenerated copies of TEs. Only three retrotransposons, two belonging to gypsy and one to copia superfamilies, are...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Transposable elements; Transposons; Mosquitoes; Evolvability..
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572019000100125
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