Data/hora: 11/06/2024 05:39:00

Provedor de dados: | Acta Biológica Colombiana
País: | Colombia
Título: | APLICACIÓN DEL MODELO DE PÉRDIDA DE ADN PARA EL DISEÑO DE CEBADORES EN Potamotrygon magdalenae (POTAMOTRYGONIDAE)
Autores: | LÓPEZ-ARDILA,Iván Yesid; MARTÍNEZ-PÉREZ,Francisco José; RONDÓN-GONZÁLEZ,Fernando.
Data: | 2022-04-01
Ano: | 2022
Palavras-chave: | Alineamiento de secuencias; Elasmobranquios; Genética de población; Reacción en Cadena de la Polimerasa.
Resumo: | RESUMEN El diseño de cebadores es fundamental para amplificar regiones de genes debido a que la especificidad que mantienen cebador-secuencia de interés puede causar el éxito o fracaso en la reacción de PCR. En relación a Potamotrygon magdalenae (especie de interés de acuerdo al PAN Tiburones-Colombia), existe poca información disponible de aspectos relacionados con la genética poblacional de esta Raya. El objetivo del presente trabajo consistió en diseñar cebadores bajo los criterios del Modelo de Pérdida de ADN (DNA-LM), que permitan evaluar el estado genético de las poblaciones de P. magdalenae. Alineamos secuencias de la superfamilia Dayastoidea, disponibles en el NCBI, de los genes mitocondriales Citocromo C Oxidasa 1 (MT-CO1) y Citocromo b (MT-CYB). Seguimos los parámetros Gap open penalty (5), Gap extension penalti (0,2) y Terminalgap penalties (0,1) y seleccionamos dos pares de cebadores de acuerdo con el DNA-LM. Estimamos el producto amplificado del gen MT-CO1 en 916 pb y del gen MT-CYB en 774 pb, en muestras de P. magdalenae procedentes de diferentes ciénagas del Magdalena medio. Discutimos los resultados desde la perspectiva de validar la especificidad de los cebadores diseñados, teniendo en cuenta la correspondencia e identidad de las secuencias de los genes considerados. Los cebadores aquí reportados pueden contribuir a ampliar el conocimiento de la genética poblacional, biogeografía y filogenética de la raya de agua dulce P. magdalenae.
Tipo: | Info:eu-repo/semantics/article
Idioma: | Espanhol
Identificador: | http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2022000100097
Editor: | Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología
Relação: | 10.15446/abc.v27n1.87401
Formato: | text/html
Fonte: | Acta Biológica Colombiana  v.27 n.1 2022
Fonte: | info:eu-repo/semantics/openAccess