Data/hora: 07/06/2024 18:37:44

Provedor de dados: 	Acta Biológica Colombiana	
País: 	Colombia	
Título: 	SECUENCIACIÓN DEL GENOMA COMPLETO DEL Potato yellow vein virus (PYVV) EN TOMATE (Solanum lycopersicum) EN COLOMBIA	
Autores: 	MUÑOZ BAENA,Laura; GUTIÉRREZ SÁNCHEZ,Pablo Andrés; MARÍN MONTOYA,Mauricio.	
Data: 	2017-04-01	
Ano: 	2017	
Palavras-chave: 	Crinivirus; RT-PCR; RT-qPCR; Secuenciación de nucleótidos de alto rendimiento; Solanaceae.	
Resumo: 	RESUMEN Potato yellow vein virus (PYVV), es uno de los fitopatógenos más limitantes para la producción de papa en la región de Los Andes. A pesar que se le ha detectado infectando tomate en Colombia, el conocimiento de las características biológicas de las cepas presentes en este hospedante es muy limitado. En este estudio, utilizando secuenciación masiva de nueva generación (NGS), se obtuvo la secuencia completa de los tres segmentos genómicos del PYVV en plantas de tomate en Marinilla (Antioquia) y se evalúo la utilidad de tres juegos de cebadores para su detección mediante pruebas de RT-PCR convencional y en tiempo real (RT-qPCR). El genoma de la secuencia consenso presentó tamaños de 8043 nt (ARN1), 5346 nt (ARN2) y 3896 nt (ARN3) y se identificaron los diez ORF previamente reportados en este virus, aunque, en general, éstos presentaron menores niveles de identidad que los registrados entre cepas de PYVV de papa. Análisis de variación y de selección identificaron dos regiones en los ORF MET/HEL y CPm que presentan selección positiva, lo que podría estar asociado a la adaptación por hospedante. Los tres juegos de cebadores amplificaron las regiones esperadas de la cápside de PYVV, siendo posible identificar, por diferencias en valores de temperatura de fusión (Tm) y por secuenciación Sanger, la ocurrencia de al menos dos variantes principales de este virus en el Oriente Antioqueño, lo que concuerda con los niveles moderados de polimorfismos encontrados en las secuencias obtenidas por NGS.	
Tipo: 	Info:eu-repo/semantics/article	
Idioma: 	Espanhol	
Identificador: 	http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2017000100001	
Editor: 	Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología	
Relação: 	10.15446/abc.v22n1.59211	
Formato: 	text/html	
Fonte: 	Acta Biológica Colombiana  v.22 n.1 2017	
Fonte: 	info:eu-repo/semantics/openAccess