Data/hora: 11/06/2024 01:36:40

Provedor de dados: | 86
País: | Brazil
Título: | Marcadores moleculares derivados de sequências expressas do genoma café potencialmente envolvidas na resistência à ferrugem
Autores: | Alvarenga,Samuel Mazzinghy; Caixeta,Eveline Teixeira; Hufnagel,Bárbara; Thiebaut,Flávia; Maciel-Zambolim,Eunize; Zambolim,Laércio; Sakiyama,Ney Sussumu.
Data: | 2011-08-01
Ano: | 2011
Palavras-chave: | Coffea arabica; Hemileia vastatrix; Bioinformática; EST-PCR; Genes de resistência; Mineração de dados.
Resumo: | O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores moleculares relacionados à resistência do cafeeiro (Coffea arabica) à ferrugem (Hemileia vastatrix). Foram identificadas sequências de DNA potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças, por meio de análise "in silico", a partir das informações geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café. A partir das sequências mineradas, foram desenhados 59 pares de iniciadores para amplificá-las. Os 59 iniciadores foram testados em 12 cafeeiros resistentes e 12 susceptíveis a H. vastatrix. Vinte e sete iniciadores resultaram em bandas únicas e bem definidas, enquanto um deles amplificou fragmento de DNA em todos os cafeeiros resistentes, mas não nos suscetíveis. Esse marcador molecular polimórfico amplificou uma região do DNA que corresponde a uma janela aberta de leitura parcial do genoma de C. arabica que codifica uma proteína de resistência a doenças. O marcador CARF 005 é capaz de diferenciar os cafeeiros analisados em resistentes e susceptíveis a H. vastatrix.
Tipo: | Info:eu-repo/semantics/article
Idioma: | Português
Identificador: | http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000800015

Editor:

Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento

Pesquisa Agropecuária Brasileira

Relação: | 10.1590/S0100-204X2011000800015
Formato: | text/html
Fonte: | Pesquisa Agropecuária Brasileira  v.46 n.8 2011
Fonte: | info:eu-repo/semantics/openAccess