Data/hora: 09/06/2024 10:24:46

Provedor de dados: | Pesquisa Agropecuária Brasileira
País: | Brazil
Título: | Validação e correção de fenótipos na seleção genômica ampla
Autores: | Almeida,Ísis Fernanda de; Cruz,Cosme Damião; Resende,Marcos Deon Vilela de.
Data: | 2016-12-01
Ano: | 2016
Palavras-chave: | Acurácia; Blasso; Genotipagem em larga escala; Marcadores moleculares; RR-Blup.
Resumo: | Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar a influência da distribuição dos efeitos de QTL, do tipo de população de validação e da correção dos fenótipos sobre a acurácia da seleção genômica ampla. Duas populações de irmãos completos, com 500 indivíduos, foram simuladas, tendo-se considerado, genotipicamente, 1.000 locos marcadores - 100 ligados a QTL. Os efeitos de QTL apresentaram distribuição uniforme ou exponencial. Na validação 1, uma amostra com 100 indivíduos constituiu a população de validação; na validação 2, aplicou-se a validação cruzada, com amostra de 100 indivíduos em cinco repetições; e na 3, uma segunda geração constituiu a população de validação. As metodologias de análise utilizadas foram RR-Blup e Blasso, com modelos mistos para correção dos fenótipos. Sem correção fenotípica, a distribuição exponencial proporcionou maiores acurácias, e o método Blasso foi mais acurado com essa distribuição; enquanto o RRBlup foi mais acurado com a distribuição uniforme. Nesse cenário sem correção, as validações 1 e 3 foram mais acuradas. Com correção, as distribuições exponencial e uniforme produziram acurácias similares, e o método Blasso mostrou-se mais acurado para ambas. Nesse cenário, as validações 1 e 2 foram mais acuradas. No geral, o método RR-Blup foi mais acurado, e o Blasso menos viciado.
Tipo: | Info:eu-repo/semantics/article
Idioma: | Português
Identificador: | http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016001201973

Editor:

Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento

Pesquisa Agropecuária Brasileira

Relação: | 10.1590/s0100-204x2016001200008
Formato: | text/html
Fonte: | Pesquisa Agropecuária Brasileira  v.51 n.12 2016
Fonte: | info:eu-repo/semantics/openAccess