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Registro completo
Provedor de dados:  Repositório Alice
País:  Brazil
Título:  Método de estimação e validação na seleção genômica.
Autores:  ALMEIDA, I. F. de
CRUZ, C. D.
RESENDE, M. D. V. de
ALMEIDA, R. V. de
Data:  2013-01-15
Ano:  2012
Palavras-chave:  Análise genômica
Marcador molecular
Genética
Resumo:  A seleção genômica ampla (GWS) consiste na utilização simultânea de centenas ou milhares de marcadores, os quais cobrem o genoma de maneira densa, de forma que todos os genes de um caráter quantitativo estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos uma parte dos marcadores. Este trabalho teve por objetivo avaliar a acurácia ao se aplicar diferentes métodos estatísticos de seleção genômica (RR-BLUP e BLASSO) e diferentes formas de validação. Foram simulados genomas com dez grupos de ligação contendo 100 marcas bi-alélicas e co-dominantes por grupo, totalizando 1010 marcadores apresentando intervalos entre marcas adjacentes equidistantes. Esses genomas foram utilizados para a geração da população simulada de famílias de meios-irmãos com 1.000 indivíduos. As diferentes características quantitativas, uniformes e binomiais, de herdabilidade 0,40, foram avaliadas. Para um tipo de validação criou-se uma população de validação independente com 1000 indivíduos e para outro tipo, aplicou-se a validação cruzada de Jacknife, usando a mesma população para estimação e validação. Os programas estatísticos utilizados foram GENES, SELEGEN GENÔMICA e R. As acurácias apresentaram valores entre 0,55 e 0,92. De forma geral, a validação feita através da população independente apresentou valores mais elevados de acurácia. Para famílias de meios-irmãos e com distribuição binomial dos efeitos genéticos, o método BLASSO foi ligeiramente superior ao RR-BLUP. Para a distribuição uniforme, os dois métodos de análise apresentaram valores superiores de acurácia a depender da forma de validação.

2012
Tipo:  Artigo em periódico indexado (ALICE)
Idioma:  Português
Identificador:  50680

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/945201

http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/74155/1/2012-M.Deon-RAgrotec-Metodos.pdf
Editor:  Revista Agrotecnologia, Anápolis, v. 3, n. 2, 2012.
Relação:  Embrapa Florestas - Artigo em periódico indexado (ALICE)
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