Sabiia Seb
PortuguêsEspañolEnglish
Embrapa
        Busca avançada

Botão Atualizar


Botão Atualizar

Registro completo
Provedor de dados:  Repositório Alice
País:  Brazil
Título:  POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes.
Autores:  HONGO, J. A.
CASTRO, G. M. de
CINTRA, L. C.
ZERLOTINI, A.
LOBO, F. P.
Data:  2015-11-04
Ano:  2015
Palavras-chave:  Potion
Evolução Darwiniana
Comparative genomics
Positive selection
Gene
Fenótipo
Pesquisa
Genomics
Phylogeny
Genes
Genome
Resumo:  Abstract: Background: Detection of genes evolving under positive Darwinian evolution in genome-scale data is nowadays a prevailing strategy in comparative genomics studies to identify genes potentially involved in adaptation processes. Despite the large number of studies aiming to detect and contextualize such gene sets, there is virtually no software available to perform this task in a general, automatic, large-scale and reliable manner. This certainly occurs due to the computational challenges involved in this task, such as the appropriate modeling of data under analysis, the computation time to perform several of the required steps when dealing with genome-scale data and the highly error-prone nature of the sequence and alignment data structures needed for genome-wide positive selection detection.
Tipo:  Artigo de periódico
Idioma:  Inglês
Identificador:  BMC Genomics, London, v. 16, p. 1-16, Aug. 2015.

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1027912

10.1186/s12864-015-1765-0
Direitos:  openAccess
Fechar
 

Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária - Embrapa
Todos os direitos reservados, conforme Lei n° 9.610
Política de Privacidade
Área restrita

Embrapa
Parque Estação Biológica - PqEB s/n°
Brasília, DF - Brasil - CEP 70770-901
Fone: (61) 3448-4433 - Fax: (61) 3448-4890 / 3448-4891 SAC: https://www.embrapa.br/fale-conosco

Valid HTML 4.01 Transitional