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Data/hora: 09/06/2024 06:46:00

Genes encoding enzymes of the lignin biosynthesis pathway in Eucalyptus
Provedor de dados: Genetics and Molecular Biology
Autores: Harakava,Ricardo.
Eucalyptus ESTs libraries were screened for genes involved in lignin biosynthesis. This search was performed under the perspective of recent revisions on the monolignols biosynthetic pathway. Eucalyptus orthologues of all genes of the phenylpropanoid pathway leading to lignin biosynthesis reported in other plant species were identified. A library made with mRNAs extracted from wood was enriched for genes involved in lignin biosynthesis and allowed to infer the isoforms of each gene family that play a major role in wood lignin formation. Analysis of the wood library suggests that, besides the enzymes of the phenylpropanoids pathway, chitinases, laccases, and dirigent proteins are also important for lignification. Colocalization of several enzymes on the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Eucalyptus; Lignin; Expressed sequenced tag; Phenylpropanoids pathway; Monolignols.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000400015

Identification and molecular characterization of Carnation mottle virus Brazilian isolates from carnation
Provedor de dados: Horticultura Brasileira
Autores: Alexandre,Maria AV; Duarte,Ligia ML; Ramos,Alyne F; Harakava,Ricardo.
Carnation mottle virus (CarMV), associated with carnation plants showing or not symptoms, was identified by host range, serology and molecular analysis of the coat protein gene. Seven samples were assayed by biological and serological tests. Two of them, one from São Paulo and another from Minas Gerais states, Brazil, which presented higher absorbance values in DAS-ELISA, were selected for molecular studies. Foliar samples were submitted to total RNA extraction, RT-PCR with specific primers, and amplicons obtained were sequenced. Phylogenetic analyses were carried out using the PAUP program after determining the nucleotide substitution model. The identity percentages between Brazilian sequences were 99%. When sequences of CP carnation isolates from other...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Dianthus caryophyllus; Carmovirus; Phylogenetic analysis.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362015000200019

GUS gene expression driven by a citrus promoter in transgenic tobacco and 'Valencia' sweet orange
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Azevedo,Fernando Alves de; Mourão Filho,Francisco de Assis Alves; Schinor,Evandro Henrique; Paoli,Luis Gustavo de; Mendes,Beatriz Madalena Januzzi; Harakava,Ricardo; Gabriel,Dean W.; Lee,Richard F.
The objective of this work was the transformation of tobacco and 'Valencia' sweet orange with the GUS gene driven by the citrus phenylalanine ammonia-lyase (PAL) gene promoter (CsPP). Transformation was accomplished by co-cultivation of tobacco and 'Valência' sweet orange explants with Agrobacterium tumefaciens containing the binary vector CsPP-GUS/2201. After plant transformation and regeneration, histochemical analyses using GUS staining revealed that CsPP promoter preferentially, but not exclusively, conferred gene expression in xylem tissues of tobacco. Weaker GUS staining was also detected throughout the petiole region in tobacco and citrus CsPP transgenic plants.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Xylella fastidiosa; PAL; Citrus variegated chlorosis; Cultivar resistance.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006001100008

Microrganismos endofíticos de mandioca de áreas comerciais e etnovariedades em três estados brasileiros
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Teixeira,Manoel Araújo; Melo,Itamar Soares de; Vieira,Rosana Faria; Costa,Francisco Eduardo Carvalho; Harakava,Ricardo.
O objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento da diversidade de microrganismos endofíticos, em plantas de mandioca (Manihot esculenta Crantz) coletadas de áreas comerciais, no Estado de São Paulo, e de etnovariedades dos estados do Amazonas e Bahia e, também, avaliar seu potencial para fixar N atmosférico e para produzir ácido indolacético. Nos três estados, foram identificadas 47 espécies de microrganismos pertencentes a 27 gêneros. Bacillus spp. foi o mais freqüente em todas as regiões. O maior número de gêneros foi encontrado em plantas provenientes do Estado do Amazonas, que apresenta a maior diversidade de microrganismos endofíticos. Amplificações por PCR do gene nifH foram avaliadas em espécies bacterianas pertencentes às...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Manihot esculenta; Bacillus; Actinobacteria; Fixação de nitrogênio; Ácido indolacético.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000100006

Promoção de crescimento e indução de resistência à antracnose por Trichoderma spp. em pepineiro
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Silva,Veronica Nogueira da; Guzzo,Sylvia Dias; Lucon,Cleusa Maria Mantovanello; Harakava,Ricardo.
O objetivo deste trabalho foi determinar o efeito de 60 isolados de Trichoderma e do produto Trichodermil na promoção do crescimento e na indução de resistência sistêmica à antracnose, causada por Colletotrichum lagenarium em pepineiro, além de identificar as espécies dos isolados de Trichoderma spp. efetivas como indutores de resistência. Nos experimentos de promoção de crescimento, os isolados de Trichoderma spp. foram submetidos à inoculação no substrato e, após 21 dias, a massa de matéria seca da parte aérea das plantas foi mensurada. Nos experimentos de indução de resistência, os isolados que promoveram crescimento foram introduzidos no substrato, na base das plantas, sete dias antes da inoculação de C. lagenarium nas folhas. O isolado que apresentou...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Colletotrichum lagenarium; Cucumis sativus; Antagonismo; Biocontrole; Indução de proteção sistêmica; Peroxidase.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011001200005

Transformação genética de laranja 'Valência' com o gene cecropin MB39
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Paoli,Luis Gustavo de; Camargo,Raquel Luciana Boscariol; Harakava,Ricardo; Mendes,Beatriz Madalena Januzzi; Mourão Filho,Francisco de Assis Alves.
O objetivo deste trabalho foi obter plantas transgênicas de laranja 'Valência' com o gene cecropin MB39 controlado pelo promotor do gene da fenilalanina-amônia-liase de citros, visando a expressão gênica específica nos vasos do xilema. A transformação genética foi realizada via Agrobacterium tumefaciens por meio do co-cultivo de segmentos de epicótilo. Onze plantas transgênicas foram identificadas por PCR, pela amplificação do fragmento esperado de 189 pb, as quais foram aclimatizadas em casa de vegetação. A integração do transgene foi confirmada em três plantas pela análise de transferência de Southern.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Agrobacterium tumefaciens; Citrus sinensis; CVC; Peptídeo antibacteriano; Xilema.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007001100020

Selection of Trichoderma spp. strains for the control of Sclerotinia sclerotiorum in soybean
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Haddad,Patrícia Elias; Leite,Luis Garrigós; Lucon,Cleusa Maria Mantovanello; Harakava,Ricardo.
Abstract: The objective of this work was to evaluate, in vitro and in vivo, the potential of Trichoderma spp. strains to control Sclerotinia sclerotiorum in soybeans (Glycine max) and to perform the molecular identification of the best perfoming strains. The effect of 120 strains of Trichoderma spp. on the viability of S. sclerotiorum sclerotia was evaluated in vitro through immersion in suspension of conidia from the antagonists and plating in culture medium. The best performing strains were evaluated in vivo, in a greenhouse, for control of the pathogen inoculated on 'Pintado' soybean seeds and plants. Of the 120 strains tested in vitro, 22 strains of Trichoderma spp. caused 100% inhibition of sclerotia germination. In the greenhouse, five strains...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Glycine max; Biological control; DNA sequencing; Sclerotia; White mold.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2017001201140

Occurrence and molecular analysis of quarantine virus in lily cultivation areas in Brazil
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Rivas,Eliana Borges; Bôdi,Estevão Cardoso de Almeida; Harakava,Ricardo; Gregori,Fabio; Gonçalves,Marcos Cesar.
Abstract: The objective of this work was to describe the occurrence of quarantine Tulip breaking virus (TBV, synonym Lily mottle virus - LMoV) and Lily symptomless virus (LSV), and their respective molecular analyses, to provide data for supporting TBV removal from the Brazilian A1 quarantine pest list, since this virus has spread among the main commercial lily crops in Brazil. The occurrence of these viruses was detected in 12 cultivation areas through multiplex reverse transcription (RT-PCR), using specific primers to genes encoding the respective coat proteins (CP). Eight fragments of 800 nucleotides (nt) obtained from the LMoV-infected lilies and nine fragments of 600 nt from LSV-infected lilies were sequenced. Phylogenetic tree reconstruction showed a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Lilium; Lily mottle virus; Lily symptomless virus; Phylogeny; Recombination analysis; RT-PCR.
Ano: 2016
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016000500615

Clonagem e purificação de fragmento da proteína capsidial de Banana streak OL virus
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Lombardi,Ricardo; Harakava,Ricardo; Colariccio,Addolorata.
O objetivo deste trabalho foi clonar e induzir a expressão de fragmento da proteína capsidial de Banana streak OL virus (BSOLV-CP) em Escherichia coli, bem como purificar a proteína recombinante obtida. Empregou-se um par de iniciadores específicos para amplificar, em PCR, um fragmento de aproximadamente 390 pb, da região codificadora da porção central da BSOLV-CP. O fragmento obtido foi clonado em vetor pGEM-T Easy, subclonado em vetor pQE-30 e transformado em células de E. coli M15 (pREP4) por choque térmico. A expressão da proteína foi induzida por tiogalactopiranosídeo de isopropila (IPTG), e a proteína recombinante BSOLV-rcCP de 14 kDa foi detectada em Western blot e Dot blot. A expressão da proteína BSOLV-rcCP abre novas possibilidades para a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Badnavirus; Escherichia coli; Musa; Antissoro; Bananeira; Expressão de proteínas recombinantes.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000800006

Bioprospecção de isolados de Trichoderma spp. para o controle de Rhizoctonia solani na produção de mudas de pepino
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Lucon,Cleusa Maria Mantovanello; Koike,Claudia Mitsue; Ishikawa,Alice Ishida; Patrício,Flávia Rodrigues Alves; Harakava,Ricardo.
O objetivo deste trabalho foi selecionar e identificar isolados de Trichoderma spp. para o controle do tombamento causado por Rhizoctonia solani (AG-4) em plântulas de pepino (Cucumis sativus L.), além de avaliar o efeito de concentrações crescentes e de combinações dos isolados mais eficientes no controle da doença. Os experimentos foram conduzidos em casa de vegetação, com 490 isolados. O tombamento das mudas foi avaliado uma semana após a aplicação à base das plântulas de substrato infestado com antagonista (1%) e patógeno (1%). Os doze isolados que proporcionaram mais de 85% de redução da doença foram testados em concentrações crescentes para o controle do patógeno (1%): 0,5, 1, 2, 3 e 4%. Também foi avaliado o efeito das combinações dos cinco isolados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cucumis sativus; Antagonistas; Controle biológico; Método de seleção; Tombamento.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009000300002

Proteção do cafeeiro contra cercosporiose por acibenzolar-S-metil e proteína harpina
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Galdeano,Diogo Manzano; Guzzo,Sylvia Dias; Patrício,Flávia Rodrigues Alves; Harakava,Ricardo.
O objetivo deste trabalho foi avaliar, em cafeeiro suscetível, a proteção contra a cercosporiose, pela aplicação da proteína harpina e acibenzolar-S-metil (ASM), e avaliar seu efeito na germinação de conídios e crescimento micelial in vitro. No primeiro experimento, cafeeiros tratados com ASM (25, 50, 100, 200 μg mL-1) receberam o inóculo de uma suspensão de conídios de Cercospora coffeicola, e a severidade da doença foi avaliada aos 30 e 60 dias após a inoculação. No segundo experimento, cafeeiros foram aspergidos com harpina (7,5, 15, 30, 60, 120 μg mL-1), tendo-se utilizado o mesmo procedimento. No terceiro experimento, plantas aspergidas previamente com ASM (200 μg mL-1) ou harpina (15 μg mL-1) foram tratadas novamente com esses produtos, aos 30 dias...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Cercospora coffeicola; Coffea arabica; Indutores de resistência; Resistência sistêmica.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000700008

Genetic transformation of sweet oranges with the D4E1 gene driven by the AtPP2 promoter
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Attílio,Lísia Borges; Mourão Filho,Francisco de Assis Alves; Harakava,Ricardo; Silva,Tatiane Loureiro da; Miyata,Luzia Yuriko; Stipp,Liliane Cristina Libório; Mendes,Beatriz Madalena Januzzi.
The objective of this work was to produce transgenic 'Pêra' and 'Valência' sweet orange plants using the D4E1 gene driven by the Arabidopsis thaliana phloem protein (AtPP2) promoter and to quantify transgene expression in different transformation events. Genetic transformation experiments were carried out with epicotyl segments co‑cultivated with Agrobacterium tumefaciens. Six plants from 'Pêra' sweet orange and seven plants from 'Valência' sweet orange were confirmed as different transgenic events by means of the polymerase chain reaction (PCR) and the Southern blot techniques. Transgene expression was quantified using real‑time quantitative PCR. D4E1 gene expression levels vary from 5 up to 50 times among different transformation events.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Citrus sinensis; Antimicrobial peptide; Tissue‑specific promoter.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000700006

Promoção do crescimento do feijoeiro e controle da antracnose por Trichoderma spp
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Pedro,Erica Aparecida de Souza; Harakava,Ricardo; Lucon,Cleusa Maria Mantovanello; Guzzo,Sylvia Dias.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a capacidade de Trichoderma spp. em promover o crescimento de plantas de feijão e reduzir a severidade da antracnose do feijoeiro (Colletotrichum lindemuthianum), bem como identificar os isolados mais eficientes. Sessenta isolados de Trichoderma spp. foram avaliados quanto à capacidade de promoção do crescimento nas plantas. Os sete isolados que mais se destacaram foram adicionados ao substrato de cultivo e avaliados quanto à redução na severidade da antracnose em plantas de feijão tratadas com conídios de C. lindemuthianum. Os mais eficientes no controle da doença foram identificados por sequenciamento de DNA. O isolado IB 28/07 foi avaliado nas concentrações 0,5, 1, 1,5 e 2% (peso:volume), que reduziram a severidade...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Colletotrichum lindemuthinum; Bioprospecção; Controle biológico; Resistência sistêmica; Sequenciamento de DNA.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012001100005

Promoção de crescimento e controle de tombamento de plântulas de pepino por rizobactérias
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Lucon,Cleusa Maria Mantovanello; Akamatsu,Milena Apetito; Harakava,Ricardo.
O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de rizobactérias, no crescimento de plântulas de pepino e no controle de tombamento, causado por Pythium aphanidermatum. Foram realizados em laboratório ensaios de: degradação de 1-aminociclopropano-1-carboxilato (ACC); colonização das raízes de plântulas de pepino; e pareamento de culturas. A identificação dos melhores isolados foi feita pela determinação das seqüências do gene 16S rDNA. Trinta e sete isolados, dos 165 testados, aumentaram a massa de matéria seca das plantas de pepino em até 63%. Desses, somente um isolado (N13 - Pseudomonas fluorescens) reduziu o tombamento de plântulas em 25%; 21 isolados inibiram o crescimento micelial de P. aphanidermatum, colonizaram o sistema radicular das plantas de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Pythium aphanidermatum; ACC; Colonização de raiz; Controle biológico.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008000600004

In vitro organogenesis and genetic transformation of mandarin cultivars
Provedor de dados: Revista Brasileira de Fruticultura
Autores: Soriano,Leonardo; Tavano,Eveline Carla da Rocha; Correa,Marcelo Favaretto; Harakava,Ricardo; Mendes,Beatriz Madalena Januzzi; Mourão Filho,Francisco de Assis Alves.
Abstract  The in vitro organogenesis of Fremont (Citrus clementina x ), Citrus reticulataThomas (Citrus reticulata), and Nules (Citrus clementina) mandarins was evaluated aiming to optimize a regeneration protocol that could be applied in genetic transformation. The use of epicotyl-derived explants resulted in higher explant responsiveness and number of shoots developed per explant when compared with the use of internodal-derived explants. The highest efficiency in shoot regeneration was observed in the presence of 1 mg L-1 of BAP, regardless of the explant type and cultivar. The in vitro organogenesis protocol produced transgenic plants from three mandarin cultivars expressing attA gene under the control of phloem-specific promoters.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Antimicrobial peptide; Cultivar improvement; Cytokinin; Huanglongbing; Transgenic plants.
Ano: 2019
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452019000200802

Eficiência de transformação genética de citrange 'carrizo' com duas construções gênicas
Provedor de dados: Revista Brasileira de Fruticultura
Autores: Miyata,Luzia Yuriko; Mourão Filho,Francisco de Assis Alves; Scarpare Filho,João Alexio; Zambon,Flávia; Bassan,Meire Menezes; Mendes,Beatriz Madalena Januzzi; Harakava,Ricardo.
Transformação genética é considerada uma importante ferramenta auxiliar no melhoramento genético de plantas cítricas. Entretanto, a eficiência de transformação pode variar em função de diversos fatores, incluindo a própria construção gênica utilizada. Este trabalho buscou avaliar a eficiência de transformação genética de plantas de citrange 'Carrizo' [Poncirus trifoliata (L.) Raf. x Citrus sinensis (L.) Osbeck] com duas construções gênicas diferentes contendo o gene uidA (GUS) sob o controle dos promotores Arabidopsis thaliana phloem protein 2 (AtPhP2) e Arabidopsis thaliana sucrose transporter 2 (AtSuT2). Segmentos de epicótilo de plântulas germinadas in vitro foram utilizados como explantes. O gene nptII, que confere resistência ao antibiótico...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Biotecnologia; Citrus spp.; Cultura de tecidos; Gene uidA (GUS); Melhoramento genético.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452011000100039

Tomato chlorotic spot virus in hydroponically-grown lettuce in São Paulo State, Brazil
Provedor de dados: Tropical Plant Pathology: fitopatologia brasileira
Autores: Colariccio,Addolorata; Eiras,Marcelo; Chaves,Alexandre L. R.; Harakava,Ricardo; Chagas,César M.
In the regions of Campinas and Sumaré, São Paulo, Brazil, hidroponically grown crops of Lettuce (Lactuca sativa) cv. Verônica, which showed virus-like symptoms were examined by electron microscope, biological, serological and molecular tests. Pleomorphic, enveloped particles (80-100 nm in diameter) were always detected in these samples. Experimentally inoculated host plants, including lettuce, reacted with tospoviruses-induced symptoms. Some differences were observed in Gomphrena globosa, which reacted by showing local lesions and systemic mosaic. Two isolates of Tomato chlorotic spot virus (TCSV) were identified by DAS-ELISA and by RT-PCR. The sequencing and alignment of the RT-PCR coat protein amplified fragments have indicated a high degree of homology...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Palavras-chave: Tospovirus; Serology; RT-PCR; Sequencing.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000300012

Caracterização de um isolado do Sugarcane mosaic virus que quebra a resistência de variedades comerciais de cana-de-açúcar
Provedor de dados: Tropical Plant Pathology: fitopatologia brasileira
Autores: Gonçalves,Marcos C.; Santos,Amaury S.; Maia,Ivan G.; Chagas,César M.; Harakava,Ricardo.
Os vírus pertencentes ao subgrupo do Sugarcane mosaic virus (SCMV, gênero Potyvirus, família Potyviridae) infectam e causam mosaico em diferentes espécies botânicas da subfamília Panicoideae (família Poaceae), porém apenas o SCMV e o Sorghum mosaic virus (SrMV) infectam naturalmente cana-de-açúcar. No Brasil, a espécie SCMV parece ser o único agente causal da doença. Embora a maioria das variedades comerciais de cana-de-açúcar seja considerada resistente ou tolerante ao SCMV, relatos de incidência de mosaico em tais variedades têm ocorrido no campo. Amostras com sintomas, de diversos clones e variedades, foram coletadas em campos experimentais e comerciais de cana-de-açúcar. Dentre as variedades, a RB72-454, uma das mais plantadas no país e considerada...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Potyviridae; Mosaico da cana; Sugarcane mosaic virus subgroup.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582007000100004

Caracterização parcial de um Tymovirus isolado de tomateiros
Provedor de dados: Bragantia
Autores: Batista,Isabel Cristina; Eiras,Marcelo; Harakava,Ricardo; Colariccio,Addolorata.
Um Tymovirus isolado de sementes de tomateiro (Solanum lycopersicum) 'Paronset' com sintomas de necrose, denominado TyToRS08, foi caracterizado quanto ao círculo de hospedeiras, propriedades físico-químicas, sorológicas e moleculares. O vírus foi transmitido mecanicamente a partir de folhas, frutos e sementes infectadas. A gama de hospedeiras incluiu espécies de Amaranthaceae, Chenopodiaceae e Solanaceae, induzindo sintomas local e sistêmicos na maior parte das espécies, exceto para Nicotiana sylvestris, N. tabacum 'Samsun', 'White Burley' e 'Xanthi' que não manifestaram sintomas. Em tomateiros 'Alambra', 'Thomas', 'Diva', 'Romana' e 'Graziela', o vírus induziu sintomas de mosaico e necrose branca. A presença do vírus foi detectada, nas sementes infectadas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Tymoviridae; Solanum lycopersicum; Transmissão; Semente.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052012000200011

Molecular subtyping of Campylobacter jejuni subsp. jejuni strains isolated from different animal species in the state of São Paulo, Brazil
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Scarcelli,Eliana; Piatti,Rosa Maria; Harakava,Ricardo; Miyashiro,Simone; Fernandes,Flora Maria de Campos; Campos,Fabíola Ribeiro; Francisco,Waldemar; Genovez,Margareth Élide; Richtzenhain,Leonardo José.
The objective of the present trial was to characterize genetically strains of Campylobacter jejuni subsp. jejuni isolated from humans and several animal sources (bovines, swine, dogs, primates, wild boars and poultry). A total of 828 different animal samples (feces, carcass, aborted fetus and hysterectomized uterus) were analysed by means of routine bacteriological methods, and 36 C. jejuni strains were isolated. Thirty strains of human fecal origin were obtained in clinical analysis laboratories in the city of São Paulo. The 66 C. jejuni strains isolated were submitted to genetic characterization. Primers based on fla A gene were used in a polymerase chain reaction (PCR) and amplified a fragment of the 702 bp. PCR products were evaluated by means of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Campylobacter jejuni subtyping sequencing; Flagellin.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822005000400014

Partial VP1 sequencing of Brazilian infectious bursal disease virus strains
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Fernandes,Maria Judite Bittencourt; Simoni,Isabela Cristina; Harakava,Ricardo; Rivas,Eliana Borges; Arns,Clarice Weis.
Infectious bursal disease virus (IBDV) is classified according to the antigenicity and virulence into classical virulent (cv), very virulent (vv), and antigenic variant strains. The molecular basis for the IBDV antigenic variation is well established and is associated to the capsid protein, VP2 (gene VP2 of segment A), whereas both VP2 and the RNA-dependent RNA polymerase, VP1 (gene VP1 of segment B), have been correlated with the virulence. In this study, seventeen Brazilian IBDV samples previously characterized by the VP2 gene as cv (three) and vv (fourteen) strains were genetically and molecularly analyzed for their VP1 gene. All of the strains kept with the same cv or vv classification except one sample, Br/03/DR. This sample was classified as vv by...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Brazilian infectious bursal disease virus; Very virulent strain; VP1; Sequencing; Phylogenetic analysis.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822012000300024

Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource
Provedor de dados: Brazilian Journal of Plant Physiology
Autores: Vieira,Luiz Gonzaga Esteves; Andrade,Alan Carvalho; Colombo,Carlos Augusto; Moraes,Ana Heloneida de Araújo; Metha,Ângela; Oliveira,Angélica Carvalho de; Labate,Carlos Alberto; Marino,Celso Luis; Monteiro-Vitorello,Claúdia de Barros; Monte,Damares de Castro; Giglioti,Éder; Kimura,Edna Teruko; Romano,Eduardo; Kuramae,Eiko Eurya; Lemos,Eliana Gertrudes Macedo; Almeida,Elionor Rita Pereira de; Jorge,Érika C.; Albuquerque,Érika V. S.; Silva,Felipe Rodrigues da; Vinecky,Felipe; Sawazaki,Haiko Enok; Dorry,Hamza Fahmi A.; Carrer,Helaine; Abreu,Ilka Nacif; Batista,João A. N.; Teixeira,João Batista; Kitajima,João Paulo; Xavier,Karem Guimarães; Lima,Liziane Maria de; Camargo,Luis Eduardo Aranha de; Pereira,Luiz Filipe Protasio; Coutinho,Luiz Lehmann; Lemos,Manoel Victor Franco; Romano,Marcelo Ribeiro; Machado,Marcos Antonio; Costa,Marcos Mota do Carmo; Sá,Maria Fátima Grossi de; Goldman,Maria Helena S.; Ferro,Maria Inês T.; Tinoco,Maria Laine Penha; Oliveira,Mariana C.; Van Sluys,Marie-Anne; Shimizu,Milton Massao; Maluf,Mirian Perez; Eira,Mirian Therezinha Souza da; Guerreiro Filho,Oliveiro; Arruda,Paulo; Mazzafera,Paulo; Mariani,Pilar Drummond Sampaio Correa; Oliveira,Regina L.B.C. de; Harakava,Ricardo; Balbao,Silvia Filippi; Tsai,Siu Mui; Mauro,Sonia Marli Zingaretti di; Santos,Suzana Neiva; Siqueira,Walter José; Costa,Gustavo Gilson Lacerda; Formighieri,Eduardo Fernandes; Carazzolle,Marcelo Falsarella; Pereira,Gonçalo Amarante Guimarães.
Coffee is one of the most valuable agricultural commodities and ranks second on international trade exchanges. The genus Coffea belongs to the Rubiaceae family which includes other important plants. The genus contains about 100 species but commercial production is based only on two species, Coffea arabica and Coffea canephora that represent about 70 % and 30 % of the total coffee market, respectively. The Brazilian Coffee Genome Project was designed with the objective of making modern genomics resources available to the coffee scientific community, working on different aspects of the coffee production chain. We have single-pass sequenced a total of 214,964 randomly picked clones from 37 cDNA libraries of C. arabica, C. canephora and C. racemosa,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea; CDNA; EST; Transcriptome.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1677-04202006000100008