Consulta: creatorFacets:"Sakiyama,Ney Sussumu"
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Data/hora: 11/06/2024 04:09:48

In silico identification of coffee genome expressed sequences potentially associated with resistance to diseases
Provedor de dados: Genetics and Molecular Biology
Autores: Alvarenga,Samuel Mazzinghy; Caixeta,Eveline Teixeira; Hufnagel,Bárbara; Thiebaut,Flávia; Maciel-Zambolim,Eunize; Zambolimand,Laércio; Sakiyama,Ney Sussumu.
Sequences potentially associated with coffee resistance to diseases were identified by in silico analyses using the database of the Brazilian Coffee Genome Project (BCGP). Keywords corresponding to plant resistance mechanisms to pathogens identified in the literature were used as baits for data mining. Expressed sequence tags (ESTs) related to each of these keywords were identified with tools available in the BCGP bioinformatics platform. A total of 11,300 ESTs were mined. These ESTs were clustered and formed 979 EST-contigs with similarities to chitinases, kinases, cytochrome P450 and nucleotide binding site-leucine rich repeat (NBS-LRR) proteins, as well as with proteins related to disease resistance, pathogenesis, hypersensitivity response (HR) and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea; Data mining; ESTs; Genomics; In silico; Bioinformatics.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000400031

Marcadores moleculares derivados de sequências expressas do genoma café potencialmente envolvidas na resistência à ferrugem
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Alvarenga,Samuel Mazzinghy; Caixeta,Eveline Teixeira; Hufnagel,Bárbara; Thiebaut,Flávia; Maciel-Zambolim,Eunize; Zambolim,Laércio; Sakiyama,Ney Sussumu.
O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores moleculares relacionados à resistência do cafeeiro (Coffea arabica) à ferrugem (Hemileia vastatrix). Foram identificadas sequências de DNA potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças, por meio de análise "in silico", a partir das informações geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café. A partir das sequências mineradas, foram desenhados 59 pares de iniciadores para amplificá-las. Os 59 iniciadores foram testados em 12 cafeeiros resistentes e 12 susceptíveis a H. vastatrix. Vinte e sete iniciadores resultaram em bandas únicas e bem definidas, enquanto um deles amplificou fragmento de DNA em todos os cafeeiros resistentes, mas não nos suscetíveis. Esse marcador molecular polimórfico...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea arabica; Hemileia vastatrix; Bioinformática; EST-PCR; Genes de resistência; Mineração de dados.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000800015

Absorção, translocação e utilização de zinco, cobre e manganês por mudas enxertadas de Coffea arabica
Provedor de dados: Revista Brasileira de Ciência do Solo
Autores: Tomaz,Marcelo Antonio; Martinez,Herminia Emilia Pietro; Sakiyama,Ney Sussumu; Cruz,Cosme Damião; Pereira,Antonio Alves.
Comparativamente ao pé-franco, a combinação enxerto/porta-enxerto altera os complexos mecanismos de "feedback" entre parte aérea e raízes, afetando de maneira positiva ou negativa a eficiência nutricional da planta. Este trabalho teve como objetivo avaliar, em cultivo hidropônico, a eficiência da absorção, translocação e utilização de Zn, Cu e Mn por mudas de Coffea arabica L., de acordo com o porta-enxerto utilizado. O experimento foi realizado em casa de vegetação, por um período de 170 dias, em vasos que continham areia como substrato, recebendo solução nutritiva circulante. Utilizaram-se, como enxerto, quatro genótipos de C. arabica: os cultivares Catuaí Vermelho IAC 15 e Oeiras MG 6851 e os híbridos 'H 419-10-3-1-5' e 'H 514-5-5-3' , e, como...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea canephora; Enxertia; Hidroponia; Solução nutritiva.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-06832006000200017

Secafé: metodologia para acelerar a germinação das sementes de café
Provedor de dados: Revista Brasileira de Sementes
Autores: Meireles,Robson Celestino; Araujo,Eduardo Fontes; Reis,Múcio Silva; Sediyama,Carlos Sigueyuki; Sakiyama,Ney Sussumu; Reis,Luciléa Silva dos.
Para analisar o uso do hipoclorito de sódio na degradação do pergaminho, como alternativa à remoção manual, bem como verificar seu efeito sobre a germinação das sementes, foram utilizadas sementes de café arábica da variedade Catuaí 44, provenientes da área experimental da Empresa Fertilizantes Heringer, no município de Manhuaçú, MG, com umidade inicial de 28,14%. Os tratamentos foram constituídos pela combinação de cinco concentrações de hipoclorito de sódio (0; 2,5; 5,0; 7,5 e 10%) e quatro tempos de embebição (6, 12, 18 e 24h), além de duas testemunhas, uma com pergaminho e outra sem pergaminho, o qual foi retirado manualmente. O experimento foi conduzido no delineamento inteiramente casualizado, em esquema fatorial 5 x 4, com 2 testemunhas adicionais,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea arabica L.; Hipoclorito de sódio; Sementes.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0101-31222007000300012

Receptor-Like Kinase (RLK) as a candidate gene conferring resistance to Hemileia vastatrix in coffee
Provedor de dados: Scientia Agricola
Autores: Almeida,Dênia Pires de; Castro,Isabel Samila Lima; Mendes,Tiago Antônio de Oliveira; Alves,Danúbia Rodrigues; Barka,Geleta Dugassa; Barreiros,Pedro Ricardo Rossi Marques; Zambolim,Laércio; Sakiyama,Ney Sussumu; Caixeta,Eveline Teixeira.
ABSTRACT: The biotrophic fungus Hemileia vastatrix causes coffee leaf rust (CLR), one of the most devastating diseases in Coffea arabica . Coffee, like other plants, has developed effective mechanisms to recognize and respond to infections caused by pathogens. Plant resistance gene analogs (RGAs) have been identified in certain plants as candidates for resistance ( R ) genes or membrane receptors that activate the R genes. The RGAs identified in different plants possess conserved domains that play specific roles in the fight against pathogens. Despite the importance of RGAs, in coffee plants these genes and other molecular mechanisms of disease resistance are still unknown. This study aimed to sequence and characterize candidate genes from coffee plants...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea arabica; Coffee leaf rust; Resistance gene analogs; Molecular markers; Plant breeding.
Ano: 2021
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162021000601101

Assessment of EST-SSR markers for genetic analisys on coffee
Provedor de dados: Bragantia
Autores: Missio,Robson Fernando; Caixeta,Eveline Teixeira; Zambolim,Eunize Maciel; Pena,Guilherme Ferreira; Ribeiro,Ana Paula; Zambolim,Laércio; Pereira,Antônio Alves; Sakiyama,Ney Sussumu.
EST-SSR markers were used to investigate the genetic diversity among and within coffee populations, to explore the possibility of their use for fingerprinting of cultivars and to assist breeding programs. Seventeen markers, developed from ESTs (Expressed Sequence Tags) from the Brazilian Coffee Genome Project, were used. All markers showed polymorphism among the genotypes assessed. The average number of allele per primer was 5.1. The highest polymorphisms were found within C. canephora (88.2%) and rust-resistant varieties (35.3%). About 29.4% of the markers differentiated C. arabica from Híbrido de Timor; it was also possible to identify those closest and farthest from C. arabica . The analysis of population-grouped genotypes revealed a 64.0% genetic...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: DNA markers; Coffea sp.; UPGMA; Amova; Microsatellite markers.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052009000300003

Porta-enxertos afetando o desenvolvimento de mudas de Coffea arabica L.
Provedor de dados: Ciência Rural
Autores: Tomaz,Marcelo Antonio; Sakiyama,Ney Sussumu; Martinez,Hermínia Emília Prieto; Cruz,Cosme Damião; Pereira,Antônio Alves; Freitas,Rogério Soares de.
O desenvolvimento de mudas de Coffea arabica L., em função do porta-enxerto, foi avaliado em condições de campo, na fazenda Jatobá município de Paula Cândido - MG. Utilizaram-se como enxerto quatro genótipos de C. arabica L.: as variedades Catuaí Vermelho IAC 15 e Oeiras MG 6851 e as linhagens H 419-10-3-1-5 e H 514-5-5-3, e, como porta-enxerto, três genótipos de Coffea canephora Pierre et Froenher: Apoatã LC 2258, Conilon Muriaé-1, Robustão Capixaba (EMCAPA 8141) e um genótipo de C. arabica L.: Mundo Novo IAC 376-4, além da utilização de quatro pés-francos. A combinação de enxertia H419/EMCAPA teve aumento na altura da planta, no número de nós da haste principal, no número de ramos plagiotrópicos da haste principal, no diâmetro de caule, no número de nós...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea canephora; Enxertia; Porta-enxertos; Propagação.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782005000300012

Diferenças genéticas na eficiência de absorção, na translocação e na utilização de K, Ca e Mg em mudas enxertadas de cafeeiro
Provedor de dados: Ciência Rural
Autores: Tomaz,Marcelo Antonio; Martinez,Hermínia Emília Prieto; Cruz,Cosme Damião; Ferrari,Rafael Binda; Zambolim,Laércio; Sakiyama,Ney Sussumu.
O estudo da eficiência nutricional de plantas enxertadas de cafeeiro é importante para a seleção de combinações enxerto/porta-enxerto visando desenvolvimento e produção máximos. O presente trabalho teve como objetivo avaliar as diferenças genéticas na eficiência de absorção, no transporte e na utilização de Potássio, Cálcio e Magnésio em mudas enxertadas de cafeeiro. O plantio foi realizado em vasos de 20L contendo como substrato terra, areia e esterco na proporção de 3:1:1, em que as plantas permaneceram por 18 meses até a coleta do experimento. Utilizaram-se como enxertos quatro genótipos de Coffea. arabica L.: as variedades Catuaí Vermelho IAC 15 e Oeiras MG 6851 e os híbridos H419-10-3-4-4 e H514-5-5-3 do programa de melhoramento da EPAMIG/UFV. Como...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea arabica; Coffea canephora; Eficiência nutricional; Porta-enxerto.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000600008

Eficiência relacionada à absorção e utilização de nitrogênio, fósforo e enxofre, em plantas de cafeeiros enxertadas, cultivadas em vasos
Provedor de dados: Ciência e Agrotecnologia
Autores: Tomaz,Marcelo Antonio; Martinez,Hermínia Emília Prieto; Cruz,Cosme Damião; Freitas,Rogério Soares de; Pereira,Antonio Alves; Sakiyama,Ney Sussumu.
O estudo da eficiência nutricional de plantas de cafeeiro (Coffea. arabica) enxertadas visou conhecer preliminarmente os potenciais de clones de Conilon (C. canephora) como porta-enxertos quanto à absorção e utilização de N, P e S. O experimento foi realizado no viveiro do setor de cafeicultura do Departamento de Fitopatologia da Universidade Federal de Viçosa, utilizando vasos de 20 litros em ambiente aberto. Foram empregados como porta-enxerto cinco progênies famílias de meio-irmãos de clones elites de C. canephora Pierre cv. Conilon do programa de melhoramento de cafeeiros robusta do INCAPER: 'ES 21', 'ES 36', 'ES 26', 'ES 23' e 'ES 38'. Utilizaram-se como enxertos as cultivares Catuaí Vermelho IAC 15 e Oeiras MG 6851 e as linhagens H 419-10-3-4-4 e H...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Coffea canephora; Coffea arabica; Eficiência nutricional; Porta-enxertos.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542009000400008