Consulta: creatorFacets:"Silveira,Érico Leandro da"
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Data/hora: 09/06/2024 11:28:38

Bacterial diversity of soil under eucalyptus assessed by 16S rDNA sequencing analysis
Provedor de dados: Pesquisa Agropecuária Brasileira
Autores: Silveira,Érico Leandro da; Pereira,Rodrigo Matheus; Scaquitto,Denilson César; Pedrinho,Eliamar Aparecida Nascimbém; Val-Moraes,Silvana Pómpeia; Wickert,Ester; Carareto-Alves,Lúcia Maria; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Studies on the impact of Eucalyptus spp. on Brazilian soils have focused on soil chemical properties and isolating interesting microbial organisms. Few studies have focused on microbial diversity and ecology in Brazil due to limited coverage of traditional cultivation and isolation methods. Molecular microbial ecology methods based on PCR amplified 16S rDNA have enriched the knowledge of soils microbial biodiversity. The objective of this work was to compare and estimate the bacterial diversity of sympatric communities within soils from two areas, a native forest (NFA) and an eucalyptus arboretum (EAA). PCR primers, whose target soil metagenomic 16S rDNA were used to amplify soil DNA, were cloned using pGEM-T and sequenced to determine bacterial diversity....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Genetic diversity; Metagenomic; Microbial communities.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006001000008

Avaliação de populações de possíveis rizobactérias em solos sob espécies florestais
Provedor de dados: Revista Brasileira de Ciência do Solo
Autores: Pereira,Rodrigo Matheus; Silveira,Érico Leandro da; Carareto-Alves,Lúcia Maria; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Embora estudos recentes relatem a utilização de RCPC (Rizobactérias Promotoras de Crescimento de Plantas) no Brasil, raríssimos trabalhos avaliam a presença natural dessas espécies bacterianas no solo. O objetivo deste trabalho foi avaliar a ocorrência de RPCP em duas amostras de solo sob diferentes tipos de manejo, através da construção e do seqüenciamento de bibliotecas de DNA metagenômico. Utilizaram-se oligonucleotídeos específicos para amplificação da região hipervariável do espaço intergênico dos genes ribossomais 16S-23S de DNA extraído de diferentes solos, sob Eucalyptus sp. e sob mata. Os fragmentos obtidos foram inseridos em vetor e clonados. As bibliotecas geraram 495 clones, que foram seqüenciados e identificados através de comparações...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: RPCP; Ecologia microbiana; Eucalyptus sp.; ITS.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-06832008000500013

Relações filogenéticas e diversidade de isolados de Guignardia spp oriundos de diferentes hospedeiros nas regiões ITS1-5,8S-ITS2
Provedor de dados: Revista Brasileira de Fruticultura
Autores: Wickert,Ester; Goes,Antonio de; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo; Souza,Andressa de; Silveira,Érico Leandro da; Pereira,Fernanda Dias; Rinaldo,Davi.
Fungos do gênero Guignardia são frequentemente isolados em diferentes espécies de plantas, sendo muitas vezes caracterizados como fungos endofíticos. Entretanto, algumas espécies deste fungo, a exemplo de G. citricarpa e G. psidii, são causadores de importantes doenças que afetam culturas agrícolas, como a Mancha-Preta dos Citros (MPC) e a podridão dos frutos de goiabeira, respectivamente. Também são apontados como causadores de manchas foliares em diferentes espécies de frutíferas e também em outras culturas. Este trabalho teve o objetivo de isolar, identificar e caracterizar a diversidade genética existente entre isolados de Guignardia oriundos de citros, mangueira, goiabeira, eucaliptos, jabuticabeira e pitangueira através da análise da sequência de DNA...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Fungos endofíticos; Patogênicos; Variabilidade genética.
Ano: 2009
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452009000200010

Molecular characterization of bacterial populations of different soils
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Pereira,Rodrigo Matheus; Silveira,Érico Leandro da; Scaquitto,Denilson César; Pedrinho,Eliamar Aparecida Nascimbém; Val-Moraes,Silvana Pompéia; Wickert,Ester; Carareto-Alves,Lúcia Maria; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
Until recently, few studies were carried out in Brazil about diversity of bacterial soil communities. Aiming to characterize the bacterial population in the soil through 16S rRNA analysis, two types of soil have been analyzed: one of them characterized by intensive use where tomato, beans and corn were cultivated (CS); the other analyzed soil was under forest (FS), unchanged by man; both located in Guaíra, São Paulo State, Brazil. Using specific primers, 16S rRNA genes from metagenomic DNA in both soils were amplified by PCR, amplicons were cloned and 139 clones from two libraries were partially sequenced. The use of 16S rRNA analysis allowed identification of several bacterial populations in the soil belonging to the following phyla: Acidobacteria,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Metagenome; Microbial diversity; 16S rRNA.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822006000400007