Consulta: subjectFacets:"E. coli"
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Especies novedosas de champiñones (Agaricus) con propiedades funcionales antioxidantes y antimicrobianas, aisladas de zonas rurales de México.
Provedor de dados: Depósito Institucional Abierto de Documentos Digitales del Colegio de Postgraduados (COLPOS DIGITAL )
Autores: Cruz Romero, Elizabeth.
México cuenta con una gran diversidad biológica, sin embargo, poco se han aprovechado los recursos genéticos nativos para la producción comercial de hongos comestibles. Los champiñones, son los hongos comestibles más comercializados en el mercado mexicano para lo cual se usan cepas extranjeras. La presente investigación se inició con el estudio preliminar de 15 cepas nativas de México de Agaricus spp. Dado que la investigación requería de biomasa micelial, al final solo se trabajó con dos cepas de Agaricus spp. (CP-83 y CP-89). Al micelio de estas cepas se les determinaron antioxidantes y pruebas antimicrobianas. Estas pruebas se realizaron de macerados y extractos acuosos y etanólico. La prueba antimicrobiana se realizo con una cepa de E. coli (CPB-8). En...
Palavras-chave: Agaricus; Micelio; Cultivo de hongos comestibles; Antioxidantes; Antimicrobianos; E. coli; Agaricus mycelia; Cultivation of edible mushrooms; Antimicrobials; EDAR; Estrategias para el Desarrollo Agrícola Regional; Maestría; Antioxidants.
Ano: 2012
URL: http://hdl.handle.net/10521/675

An improved system for competent cell preparation and high efficiency plasmid transformation using different Escherichia coli strains
Provedor de dados: Electronic Journal of Biotechnology
Autores: Tu,Zhiming; He,Guangyuan; Li,Kexiu X.; Chen,Mingjie J.; Chang,Junli; Chen,Ling; Yao,Qing; Liu,Dongping P.; Ye,Huan; Shi,Jiantao; Wu,Xuqian .
This paper describes an efficient bacterial transformation system that was established for the preparation of competent cells, plasmid preparation, and for the storage in bacterial stocks in our laboratory. Using this method, a number of different plasmids have been amplified for further experiments. Competent cells for bacterial transformation were prepared by the calcium chloride method with an optimum concentration of 75 mM. Three different strains of Escherichia coli that were tested are DH5&amp;#945;, TG1 and XL1 blue, and the most efficient strain being XL1 blue. The optimal optical density (OD600) range for competent cell preparation varied for each of the strains investigated, and for XL1 blue it was 0.15-0.45; for TG1 it was 0.2-0.5; and for...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Competent cells; E. coli; Plasmid; Storage; Transformation.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582005000100014

New ammonia lyases and amine transaminases: Standardization of production process and preparation of immobilized biocatalysts
Provedor de dados: Electronic Journal of Biotechnology
Autores: Casablancas,Antoni; Cárdenas-Fernández,Max; Álvaro,Gregorio; Benaiges,Maria Dolors; Caminal,Glòria; Mas,Carles de; González,Glòria; López,Carmen; López-Santín,Josep.
Background: New enzymes for biotransformations can be obtained by different approaches including directed mutagenesis and in vitro evolution. These mutants have to be efficiently produced for laboratory research on bioreactions as well as for process development. In the framework of a European ERA-IB project, two different types of enzymes (ammonia lyases and aminotransferases) have been selected as biocatalysts for the synthesis of industrially relevant amines. New mutant enzymes have been obtained: a) aspartases able to recognize &amp;#946;-amino acids; b) &amp;#969;-transaminases with improved activity. The objectives are to find out a common operational strategy applicable to different mutants expressed in E. coli with the same initial genetic...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Amine transaminases; Ammonia lyases; E. coli; Fed-batch; Immobilized biocatalysts.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582013000300004

Human sulfatase transiently and functionally active expressed in E. coli K12
Provedor de dados: Electronic Journal of Biotechnology
Autores: Poutou-Piñales,Raúl A; Vanegas Niño,Adriana; Landázuri,Patricia; Sáenz,Homero; Lareo,Leonardo; Echeverri Peña,Olga Yaneth; Barrera Avellaneda,Luis A.
The recombinant human iduronate 2-sulfate sulfatase (hrIDS) was transiently and functionally active expressed in E. coli K12. The enzyme activity (crude extract) at 100 ml and 400 ml oscillated between 0.25 and 10.58 nmol h-1 mg-1. The wide Western-blot peptide profile suggest that hrIDS is proteolitically processed “randomly” which agrees with the ultrafiltration assay in which the hrIDS activity was found in all fractions (&lt;30kDa, 30-100kDa and &gt;100kDa). No glycation sites were found by computer analysis of the hIDS sequence; discarding the possibility of marks for glycation and proteolytic processing.
Tipo: Journal article
Palavras-chave: E. coli; Glycation; Human sulfatase; Transient expression.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582010000300005

Sanitary quality of broiler litter reused
Provedor de dados: Engenharia Agrícola
Autores: Vieira,Maria de F. A.; Tinoco,Ilda de F. F.; Santos,Bernadete M. dos; Inoue,Keles R. A.; Mendes,Múcio A. dos S. A.
ABSTRACT Considering the importance of the substrate to bedding in the poultry industry in Brazil, and the enormous pressure on environmental management as to the correct use and management of the waste generated by the production sector, this study aimed to analyze the effect of reuses of two types of litter on sanitary qualities and productive performance of broilers. The study was conducted with litter from 32 different broiler houses, two types of substrates and four cycles of reuses. The litter sanitary quality was verified by the identification of the presence of Escherichia coli and Salmonellaspp. and the incidence of footpad dermatitis. It was observed that the coffee hulls litter presented a reduction of 28.61 percentage points in the probability...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Salmonella spp.; E. coli; Footpad; Productive performance.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-69162015000500800

Clustering of water bodies in unpolluted and polluted environments based on Escherichia coli phylogroup abundance using a simple interaction database
Provedor de dados: Genetics and Molecular Biology
Autores: Stoppe,Nancy de Castro; Silva,Juliana Saragiotto; Torres,Tatiana Teixeira; Carlos,Camila; Hachich,Elayse Maria; Sato,Maria Inês Zanoli; Saraiva,Antonio Mauro; Ottoboni,Laura Maria Mariscal.
Different types of water bodies, including lakes, streams, and coastal marine waters, are often susceptible to fecal contamination from a range of point and nonpoint sources, and have been evaluated using fecal indicator microorganisms. The most commonly used fecal indicator is Escherichia coli, but traditional cultivation methods do not allow discrimination of the source of pollution. The use of triplex PCR offers an approach that is fast and inexpensive, and here enabled the identification of phylogroups. The phylogenetic distribution of E. coli subgroups isolated from water samples revealed higher frequencies of subgroups A1 and B2(3) in rivers impacted by human pollution sources, while subgroups D1 and D2 were associated with pristine sites, and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: E. coli; Phylogenetic groups; Pollution sources; Interaction networks; Social network analysis.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572014000500012

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicoles. Région Corse. Edition 2018
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Orsoni, Valerie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel de la Région Corse. Il présente l’ensemble des résultats obtenus entre 2014 et 2017, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées : les étangs de la plaine orientale de la Corse.
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Région Corse.
Ano: 2018
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00441/55305/56820.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole - Département d'Ille et Vilaine - Edition 2017
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Cheve, Julien; Le Noc, Sandrine.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique des zones de production conchylicoles (REMI) et du réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de l’Ille-et-Vilaine (35). Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.Pour la troisième année consécutive, les résultats du suivi microbiologique sont globalement bons dans le département d’Ille-et-Vilaine. Les alertes sanitaires ont été quasiment absentes, il n’y a eu qu’une alerte préventive qui n’a pas donné de...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département 35.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00388/49909/50481.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département du Finistère. Edition 2017
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Boulben, Sylviane.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Finistère. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité. Pour quelques zones, le classement en vigueur est discordant avec l’estimation de la qualité. En décembre 2016, l’arrêté préfectoral portant classement sanitaire des zones de production de coquillages vivants dans le Finistère a été révisé et a permis le classement de quatre zones B en A.
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production conchylicole; Département du Finistère.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00393/50403/51117.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Vendée (85). Edition 2020.
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Gervais, Hugo; Gautier, Emeric; Grizon, James; Morin, Dimitri; Soletchnik, Patrick; Piquet, Jean-come; Bruneau, Audrey.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d'interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport décrit le programme annuel du département de la Vendée. Il présente l'ensemble des résultats obtenus sur la période 2017-2019, en particulier l'estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.  
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Vendée (85); LERPC.
Ano: 2020
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00632/74397/74099.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département : Charente-Maritime. Edition 2019
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Morin, Dimitri.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport décrit le programme annuel du département de la Charente-Maritime. Il présente l’ensemble des résultats obtenus sur la période 2016-2018, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Charente Maritime (17); LERPC.
Ano: 2019
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00487/59911/63097.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conhylicoles. Département du Finistère. Edition 2018
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Boulben, Sylviane.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Finistère. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité. En 2017, pour quelques zones, le classement en vigueur est discordant avec l’estimation de la qualité. C’est le cas, pour la qualité microbiologique des fouisseurs de l’anse de Penfoul, les niveaux en plomb des moules en rade de Brest, partie sud-est qui sont très mauvais.
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production conchylicole; Département du Finistère.
Ano: 2018
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00441/55269/56763.pdf

Etude sanitaire de la zone 22.02.10 – Baie de la Fresnaie Groupe III. Rapport d’étude. Département des Côtes d’Armor
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Cheve, Julien; Le Noc, Sandrine.
Ce rapport final présente l’évaluation de la qualité microbiologique et chimique de la zone 22.02.10 (baie de la Fresnaie) pour le groupe III en vue de sa sectorisation. L’étude s’est déroulée entre novembre 2015 et février 2017, avec l’obtention de 48 résultats microbiologiques (dénombrement des E. coli dans 100 g de CLI) en deux points : « Fresnaie f3 - 023-P- 004 » et « Fresnaie f4 - 023-P-005 » et la recherche de molécules chimiques (Pb, Hg, Cd, par kg de chair humide), au point « Baie de la Fresnaie - 023-P-014 ». Les résultats du suivi sanitaire ont confirmé les conclusions de l’étude de dossier et des anciennes données REMI. Il existe une différence de contamination entre les secteurs Est et Ouest de la zone de production conchylicole en baie de la...
Tipo: Text
Palavras-chave: Etude sanitaire; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Contaminants chimiques; Milieu marin; Qualité microbiologique et chimique des zones de production; Département 22; Côtes d’Armor; Baie de la Fresnaie; Groupe III.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00375/48586/48909.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole - Département des LANDES - Edition 2013
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Barbier, Claire; Auby, Isabelle.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2010-2012. La qualité a pu être estimée pour la zone de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimé de qualité B pour le groupe 3. L’étude des tendances met en évidence une augmentation de la contamination...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2013
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00151/26270/24354.pdf

Journées Rémi des 23 et 24 novembre 1998 - Réseau de contrôle microbiologique (Rémi) et surveillance microbiologique
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Catherine, Martial.
Ce document est un rapport de synthèse des présentations faites lors des journées REMI, tenues à Nantes les 23 et 24 novembre 1998. Les exposés de la première journée sont principalement destinés aux actions visant à améliorer le fonctionnement du réseau REMI. Ils concernent les sujets suivants : bilan de la mise en oeuvre du réseau de contrôle REMI en 1998 (nouvelle version), bilan de l'état d'avancement du plan qualité surveillance microbiologique et du programme Malthus (méthodologie, normalisation), approches préliminaires pour la détermination des fréquences d'échantillonnage en vue de la surveillance régulière des zones de production classées. La seconde journée est dédiée aux études conduites par les laboratoires côtiers, dont les procédures sont...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; Réseau; Surveillance; Microbiologie; Quadrige; Assurance qualité; AFNOR; Impédancemétrie; Rejets agricoles; Station d'épuration; Bateaux de plaisance; Oiseaux; Huîtres; Moules; Tellines; Eaux littorales; Coliformes fécaux; E. coli; Streptocoques fécaux; Bactériophages.
Ano: 1999
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00040/15157/12493.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la GIRONDE. Edition 2015
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde.  Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2012-2014. La qualité a pu être estimée pour dix zones de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, sur le Bassin d’Arcachon une zone suivie est estimée de qualité A pour le groupe 3, trois zones suivies sont estimées de qualité B pour le groupe 3 et...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2015
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00275/38580/37104.pdf

Modeling of Faecal Contamination in Water from Catchment to Shellfish Growing Area
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Bougeard, Morgane; Le Saux, Jean-claude; Perenne, Nicolas; Le Guyader, Soizick; Pommepuy, Monique.
During rainstorms, watersheds can introduce large amounts of faecal pollution into the rivers and sea, leading to shellfish contamination. In this study, we assessed Escherichia coli fluxes from a catchment, and their impact on estuarine water quality, using two assembled models. For the catchment, the agro-hydrological model SWAT was implemented integrating land uses, soil, topography, rainfall and other climatic data on Daoulas watershed (France). Initially, the SWAT model was calibrated and validated for river flow rates, and results were found satisfactory. Subsequently, different faecal contamination sources were integrated into the model: point sources (WWTP discharges into rivers) and non-point sources (manure spreading on fields). During rainfall...
Tipo: Text
Palavras-chave: Modeling; SWAT; MARS; E. coli; Shellfish; Catchment; Estuary.
Ano: 2009
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17748/15270.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicoles . Départements des Bouches du Rhône, du Var et de la Haute Corse. Edition 2019
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Marco-miralles, Francoise; Brach-papa, Christophe.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI, ce rapport effectue un bilan national et décrit le programme annuel des départements des Bouches-du-Rhône, du Var et de la Haute-Corse. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité pour la période 2016-2018.
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production; Région PACA (Provence-Alpes-Côte d’Azur).
Ano: 2019
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00494/60524/63987.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Charente-Maritime (17). Edition 2020
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Ervais, Hugo; Gautier, Emeric; Grizon, James; Morin, Dimitri; Soletchnik, Patrick; Piquet, Jean-come; Bruneau, Audrey.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d'interprétation des résultats du reseau de contôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport décrit le programme annuel du département de la Charente-Maritime. Il présente l'ensemble des résultats obtenus sur la période 2017-2019, en particulier l'estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Charente Maritime (17); LERPC.
Ano: 2020
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00631/74329/73967.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole.Départements des Pyrénées orientales, de l’Aude, de l’Hérault et du Gard. Edition 2018
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Crottier, Anais; Abadie, Eric; Brun, Melanie; Piquet, Jean-come; Fiandrino, Annie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel des départements de l’Hérault, du Gard et de l’Aude. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2015-2017. Sur les 29 zones de production conchylicole classées et suivies en Occitanie, la qualité a pu être estimée pour 23 d’entre elles. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), dans les départements de...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de l’Hérault; Départemen tdu Gard; Département de l’Aude.
Ano: 2018
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55635/57280.pdf

Etude sanitaire de la zone n° 34.39 "Lotissements conchylicoles de la lagune de Thau" Groupe III. Département de l'Hérault
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Marzin, Anahita; Crottier, Anais; Piquet, Jean-come; Abadie, Eric; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Fiandrino, Annie.
L’étude de zone des lotissements conchylicoles de la lagune de Thau (34.39) a été menée, à la demande du Comité Régional de la Conchyliculture en Méditerranée et du préfet de l’Hérault, pour étudier la possibilité de sectoriser la zone de production en sous-zones, au regard du risque microbiologiques (REMI). Une étude de dossier a été réalisée afin de recenser les principales sources de contamination. Celles-ci sont essentiellement d’origine anthropique et impactent différemment les secteurs envisagés. Des prélèvements de coquillages du groupe 3 ont été réalisés de mai 2017 à mai 2018 avec une fréquence bimensuelle. Au regard des critères du règlement (CE) n° 854/2004, les résultats des analyses microbiologiques (indicateur Escherichia coli) ont permis...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Étude de zone; Lagune de Thau; Département de l’Hérault.
Ano: 2018
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00459/57056/58965.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la GIRONDE. Édition 2017
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2014-2016. La qualité a pu être estimée pour dix zones de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n°854/2004, modifié par le règlement (CE) n° 2285/2015, sur le Bassin d’Arcachon deux zones suivies sont estimées de qualité « A » pour le groupe « 3 » et sont classées...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00387/49825/50409.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département : Vendée (85)
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Morin, Dimitri.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport décrit le programme annuel du département de la Vendée. Il présente l’ensemble des résultats obtenus sur la période 2016-2018, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées.
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Vendée (85); LERPC.
Ano: 2019
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00491/60243/63641.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole . Région Corse. Edition 2017
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Orsoni, Valerie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel de la Région Corse. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées : les étangs de la plaine orientale de la Corse.
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Région Corse.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00389/50029/50619.pdf

Identification de l'origine de la contamination observée en baie de La Baule : Première partie de l'étude
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Caprais, Marie-paule; Gourmelon, Michele; Le Mennec, Cecile; Joubrel, Rozenn.
Afin d'améliorer la qualité sanitaire des coquillages du secteur La Baule - Le Pouliguen, la Communauté d'Agglomération CAP Atlantique a mis en place un programme d'étude pour identifier les sources de pollution sur ce secteur et initier des actions permettant de limiter les apports d'origine fécale aux coquillages. Dans le cadre de cette présente étude, de juin 2006 à décembre 2007, deux méthodes d'identification de l'origine de la contamination fécale en cours de développement au laboratoire de microbiologie d'Ifremer de Brest, ont été appliquées sur des lots de coquillages (n=87 ; 6 sites) et des échantillons d'eaux (n=40 ; 7 localisations). La première méthode consistait à rechercher par PCR conventionnelle les gènes codant les ARN ribosomiques (ARNr)...
Tipo: Text
Palavras-chave: Bacteroidales; Bactériophages F +ARN spécifiques; Marqueurs de contamination fécale; E. coli; Génotypage; PCR conventionnelle; Coquillage; Littoral.
Ano: 2008
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00622/73452/72691.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département du Finistère. Edition 2020
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Boulben, Sylviane.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique REMI et d’observation des contaminants chimiques ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Finistère. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité. En 2019, pour quelques zones, le classement en vigueur est discordant avec l’estimation de la qualité microbiologique, c’est le cas pour des coques de la baie de Locquirec, des huîtres de baie de Morlaix aval et large, et en eaux profondes de la rade de Brest pour lesquelles la qualité s’est dégradée. A...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; ROCCH; Contaminations bactériologique et chimique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production conchylicole; Département du Finistère.
Ano: 2020
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00632/74402/74124.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Gironde. Edition 2021
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire; Perriere-rumebe, Myriam.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2018-2020. La qualité a pu être estimée pour dix zones de production conchylicole. Selon les critères réglementaires pris en compte (articles 53, 54 et 55 du règlement d’exécution (UE) n°2019/627), dans le département de la Gironde, la qualité microbiologique est estimée en « A » pour cinq zones de...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2021
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00690/80193/83287.pdf

Etude sanitaire de la zone 22.03.24 – Baie d’Yffiniac Sud Groupe II. Rapport d’étude. Département des Côtes d’Armor
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Cheve, Julien; Le Noc, Sandrine.
Ce rapport présente l’évaluation de la qualité microbiologique et chimique au Nord-Ouest de la zone 22.03.24 (baie d’Yffiniac Sud) pour le groupe II en vue d’une extension de la zone 22.03.23 (baie d’Yffiniac Est). L’étude s’est déroulée entre novembre 2015 et février 2017, avec l’obtention de 48 résultats microbiologiques (dénombrement des E. coli dans 100 g de CLI) en deux points : « Saint Laurent – 025-P-130 » et « Les Anses – 025-P-129 » et la recherche de molécules chimiques (Pb, Hg, Cd, par kg de chair humide), au point « Saint-Brieuc coques - 025-P-037 ». L’amélioration globale de la qualité sanitaire est attestée en baie de Saint-Brieuc mais le risque de contamination persiste sur le secteur à l’extrême Ouest. En conséquence une extension vers...
Tipo: Text
Palavras-chave: Etude sanitaire; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Contaminants chimiques; Milieu marin; Qualité microbiologique et chimique des zones de production; Département 22; Côtes d’Armor; Baie d’Yffiniac; Plage de Saint-Laurent; Groupe II.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00375/48589/48910.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département des LANDES. Édition 2017
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique de la zone de production de coquillages classée (40.01 Lac d’Hossegor) pour la période 2014-2016. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n°854/2014, modifié par le règlement (CE) n° 2285/2015, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimée de qualité B pour le groupe 3 (coquillages non fouisseurs). L’étude des tendances d’évolution de la qualité...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00387/49826/50410.pdf

Paquet Hygiène et surveillance REMI - Surveillance microbiologique des zones de production conchylicoles
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Favre, Pauline; Amouroux, Isabelle.
REMI has been managed by Ifremer for 20 years, in order to monitor and assess the microbiological quality of the shellfish growing areas. Recent EU regulation allows for evolution of the monitoring, with the development of sanitary surveys prior to classification of the area. The sampling strategy is based on the knowledge of the sources of faecal contamination, their characteristics and their behaviour (seasonal variations, circulation of pollutants...). The threshold fixed by Regulation EC n°854/2004 has changed, no tolerance for A and C class is permitted under the current regulation. The quality of 238 areas (on 299) classified in 2009 was determined (exceptional unfavorable results were not taken into account and should be removed) : 4 areas were of A...
Tipo: Text
Palavras-chave: Paquet hygiène; Zone de production de coquillages; Surveillance microbiologique; E. coli; REMI; Qualité microbiologique; Hygiene package; Shellfish growing area; Microbiological monitoring; E. coli; REMI; Microbiological quality assessment.
Ano: 2009
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00014/12565/9431.pdf

The role of models in assessing the impact of sewage overflows on feacal water contamination
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Riou, Philippe; Le Saux, Jean-claude; Dumas, Franck; Le Guyader, Soizick; Le Goff, R.; Maheux, Frank; Lamort, Laure; Pommepuy, Monique.
Climate change contributes to local weather modifications such as storm events and heavy rainfall, and in particular, changes in the frequency and intensity of extreme storm and rainfall events. Observations have indicated that rainfall-runoff processes, like sewage overflow may induce fecal contamination in coastal water. Pathogens present in runoff water could therefore contaminate shellfish and be responsible for food-borne disease outbreaks. Mathematical models for this were used to predict the effect of climate modifications on shellfish quality. Using a hydrodynamic model, simulations of water quality conditions under a variety of storm event scenarios were run and are presented here for a harvesting area in France. Major storm events occurring in...
Tipo: Text
Palavras-chave: Modeling; Seawater fecal contamination; E. coli; Virus; Shellfish; Climate change.
Ano: 2008
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17739/15261.pdf

Etude sanitaire de la zone 35.01 groupe I - Crépidule. Ille et Vilaine
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Cheve, Julien; Gerla, Daniel.
Ce rapport final présente l’évaluation de la qualité microbiologique et chimique de la zone 35.01 pour le groupe I : crépidule (Crepidula fornicata), gastéropode filtreur. Aux vues de l’étendue de la zone d’étude (environ 20 km) et de sa position au large, la phase initiale de l’étude ne s’est pas attachée à la définition précise de l’ensemble des caractéristiques du littoral bordant la zone. Mais elle a consisté en une approche plus globale à l’échelle des bassins versants. L’étude s’est déroulée entre novembre 2012 et janvier 2014, avec l’obtention de 26 résultats microbiologiques (dénombrement des E. coli dans 100 g de CLI (Chair et Liquide Intervalvaire)) et la recherche sur un échantillon de molécules chimiques (Cadmium, mercure, plomb, PCB dioxine...
Tipo: Text
Palavras-chave: Etude sanitaire; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Contaminants chimiques; Milieu marin; Qualité microbiologique et chimique des zones de production; Département 35; Ille-et-Vilaine; Baie du Mont- Saint-Michel; Groupe I; Crépidule; Crepidula fornicata.
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00179/29044/27481.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole - Département de la GIRONDE - Edition 2013
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Barbier, Claire; Auby, Isabelle.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2010-2012. La qualité a pu être estimée pour 10 zones de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, sur le Bassin d’Arcachon 2 zones suivies sont estimées de qualité A pour le groupe 3, 2 zones suivies sont estimées de qualité B pour le groupe 3 et sont...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2013
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00151/26269/24353.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Gironde. Edition 2018
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2015-2017. La qualité a pu être estimée pour dix zones de production conchylicole. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), dans le département de la Gironde, la qualité microbiologique est estimée en « A » pour sept zones de production...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2018
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00441/55219/56696.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département des Landes. Edition 2021
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire; Perriere-rumebe, Myriam.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique (REMI) et du réseau de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique de la zone de production de coquillages classée (40.01 Lac d’Hossegor) pour la période 2018-2020. Suivant les seuils microbiologiques des articles 53, 54 et 55 du règlement d’exécution (UE) n°2019/627, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimée de qualité « B » pour le groupe 3 (coquillages non fouisseurs). L’étude des tendances d’évolution de la qualité...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2021
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00690/80204/83290.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole - Département des LANDES - Édition 2016
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes.  Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique de la zone de production de coquillages classée (40.01 Lac d’Hossegor) pour la période 2013-2015. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimée de qualité B pour le groupe 3 (coquillages non fouisseurs). L’étude des tendances d’évolution de la qualité microbiologique de la zone ne met aucune tendance...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00332/44310/43860.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département d'Ille-et-Vilaine. Edition 2018
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Cheve, Julien; Le Noc, Sandrine.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique des zones de production conchylicoles (REMI) et du réseau d’observation de la contamination chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de l’Ille-et-Vilaine (35). Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. En Rance et en baie de Saint-Malo, l’état sanitaire s’était considérablement dégradé au début des années 2010. Mais depuis 2015, l’essentiel des zones suivies connaît un regain de qualité et permet un classement généralisé en qualité moyenne. La...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département 35.
Ano: 2018
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00441/55230/56710.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la Gironde. Edition 2019
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2016-2018. La qualité a pu être estimée pour dix zones de production conchylicole. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), dans le département de la Gironde, la qualité microbiologique est estimée en « A » pour six zones de production...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2019
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00497/60859/64190.pdf

Microbial impact of small tributaries on water and shellfish quality in shallow coastal areas
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Riou, Philippe; Le Saux, Jean-claude; Dumas, Franck; Caprais, Marie-paule; Le Guyader, Soizick; Pommepuy, Monique.
This study aimed to investigate the impact of small tributaries on seawater and shellfish quality in coastal area subjected to brief episodes leading to fecal contamination. Escherichia coli and F-RNA-specific bacteriophages were selected as fecal indicators and astroviruses were chosen as being representative of pathogens in the human population during winter viral epidemics. A two-dimensional hydrodynamic model was built to simulate the current and dispersion in the model domain, which includes areas uncovered at low tide. The model also includes decay rates to simulate microorganism behavior and assess the influence of fecal input on shellfish quality. The originality lies in the fact that specific features of the study area were considered. Modeling...
Tipo: Text
Palavras-chave: Shellfish; Astrovirus; F RNA specific; E. coli; Seawater fecal contamination; Modeling.
Ano: 2007
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2675.pdf

Synthèse des résultats REMI - Etang de Thau - Période 1997-2006 - OMEGA Thau étape 1
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Serais, Ophelie; Derolez, Valerie; Fiandrino, Annie.
The yearly shellfish harvest on Thau lagoon (75 km2) is about 13 000 tons of oysters and 4 000 tons of mussels, and represents 10% of French shellfish harvest. In the microbiological monitoring network of French shellfish harvest areas, managed by Ifremer, a total of 2 374 shellfish samples were collected on Thau lagoon and analysed (Escherichia coli) on 9 sampling stations between 1997 and 2006.  Despite a population increasing rate of 15.6% between 1999 and 2006 on the Thau lagoon watershed, the shellfish faecal contamination level is stable between 1997 and 2006, and corresponds to B sanitary standard, authorizing marketing for human consumption after purification. Though the microbiological quality of the lagoon’s shellfish can episodically be altered...
Tipo: Text
Palavras-chave: Lagune de Thau; REMI; E. coli; Épisodes pluvieux; Impact de la pluviométrie; Qualité microbiologique des coquillages en élevage.
Ano: 2007
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15338/12690.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la GIRONDE. Edition 2014
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2011-2013. La qualité a pu être estimée pour 10 zones de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, sur le Bassin d’Arcachon 2 zones suivies sont estimées de qualité A pour le groupe 3, 2 zones suivies sont estimées de qualité B pour le groupe 3 et sont...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31508/29920.pdf

Faecal contamination of echinoderms: first report of heavy     Escherichia coli     loading of sea urchins from a natural growing area
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Bouchoucha, Marc; Piquet, Jean-come; Chavanon, Fabienne; Dufresne, C.; Le Guyader, Soizick.
Although little evidence existed to support that view, European countries and in particular France, have regarded echinoderms, including sea urchins, as low risk in terms of feacal contamination. It is hypothesized that the sea urchins mode of feeding, which is based on grazing and differs from bivalve molluscs, would prevent it from concentrating high levels of Escherichia coli. Here, we monitored E. coli levels in sea urchins (Paracentrotus lividus) and in filter-feeder mussels (Mytillus galloprovincialis), collected concurrently from the same natural area over a 1-year period to verify this assumption. Sea urchins were collected on the seafloor, whereas mussels were collected from the water column at a depth of 4 m. Our results showed heavy bacterial...
Tipo: Text
Palavras-chave: E. coli; Fecal contamination; Mussel; Sea urchin; Shellfish monitoring program.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00310/42086/41400.pdf

Etude Sanitaire de la zone 44.04.03 Piriac - Lanséria. Coquillages non fouisseurs (Groupe 3). Département de la Loire – Atlantique
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Blouin, Antoine.
Etude de la qualité microbiologique et chimique de la zone 44.04.03 – Piriac - Lanséria Groupe 3. Département de Loire – Atlantique. Rapport final – 2017 L’étude de zone 44.04.03 « Côte Piriac Lanséria » conduite pour le groupe 3 avait pour objectifs de déterminer la qualité de la zone et de définir le point le plus pertinent à retenir dans le cadre de la surveillance régulière REMI. Deux points de suivi ont été positionnés dans des secteurs jugés sensibles aux sources de contamination et ont été échantillonnés de Janvier à Décembre 2016.
Tipo: Text
Palavras-chave: Ifremer; REMI; Etude sanitaire; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Zone 44.04.03; Piriac Lanséria; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Loire - Atlantique.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00372/48325/48442.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département des LANDES. Edition 2014
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2011-2013. La qualité a pu être estimée pour la zone de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimé de qualité B pour le groupe 3. L’étude des tendances met en évidence une augmentation de la contamination...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00204/31509/29921.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole - Département de la GIRONDE - Édition 2016
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde.  Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2013-2015. La qualité a pu être estimée pour dix zones de production conchylicole. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, sur le Bassin d’Arcachon quatre zones suivies sont estimées de qualité B pour le groupe 3 et sont classées de qualité A et six zones suivies sont estimées...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00332/44309/43858.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département des LANDES. Edition 2015
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes.  Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique de la zone de production de coquillages classée (40.01 Lac d’Hossegor) pour la période 2012-2014. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n° 854/2004, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimée de qualité B pour le groupe 3 (coquillages non fouisseurs). L’étude des tendances met en évidence une augmentation de la contamination microbiologique sur un...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2015
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00275/38579/37103.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département des Landes. Edition 2018
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique (REMI) et du réseau de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique de la zone de production de coquillages classée (40.01 Lac d’Hossegor) pour la période 2015-2017. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n°854/2014, modifié par le règlement (CE) n° 2285/2015, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimée de qualité B pour le groupe 3 (coquillages non fouisseurs). L’étude des tendances d’évolution de la qualité...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2018
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00440/55202/56695.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département du Morbihan. Edition 2018
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Piquet, Jean-come; Gabellec, Raoul; Manach, Soazig; Retho, Michael; Cochennec-laureau, Nathalie.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Morbihan. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2015-2017. En 2017, la surveillance microbiologique des zones de production conchylicole a concerné 51 zones classées. Selon les critères réglementaires pris en compte (règlement CE n°854/2004, modifié par le règlement n°2285/2015), la qualité microbiologique est estimée en « A » pour 23 zones de production,...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Départements de l’Hérault; Du Gard et de l’Aude.
Ano: 2018
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00450/56157/57713.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département : Charente-Maritime. Edition 2017
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Morin, Dimitri.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI, ce rapport présente le bilan national et décrit le programme annuel pour le département de la Charente-Maritime. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité sur la période 2014-2016. Le programme de surveillance 2016 a été réalisé à 99%. Les données manquantes résultent d’un manque de ressource ou de problèmes de disponibilité. Au total, le dispositif d’alerte a été déclenché à 25 reprises en 2016 et a donné lieu à la réalisation de 37 prélèvements et analyses supplémentaires. Toutes les zones de...
Tipo: Text
Palavras-chave: Ifremer; REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production; Charente-Maritime.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00384/49509/50003.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département des Landes. Edition 2020
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique (REMI) et du réseau de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique de la zone de production de coquillages classée (40.01 Lac d’Hossegor) pour la période 2017-2019. Suivant les seuils microbiologiques des articles 53, 54 et 55 du règlement d’exécution (UE) n°2019/627, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimée de qualité « B » pour le groupe 3 (coquillages non fouisseurs). L’étude des tendances d’évolution de la qualité...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2020
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00629/74133/73582.pdf

Etude sanitaire de la zone 17.53 Château d'Oléron - Ors. Charente-Maritime
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Morin, Dimitri; Piquet, Jean-come; Fillon, Alain.
Suite à la demande d’exploitation de la zone 17.53 Château d’Oléron-Ors par les professionnels, la Direction Départementale du Territoire et de la Mer (DDTM) a demandé la réalisation d’une étude sanitaire en vue du classement de cette zone de production pour le groupe 2 (bivalves fouisseurs). Cette étude réalisée par le Laboratoire Environnement Ressources des Pertuis Charentais, avec le concours des professionnels, bénéficie d’un financement de la Direction Générale de l’Alimentation (DGAL). Basée sur le paramètre microbiologique (Escherichia coli) et chimiques (plomb, mercure, cadmium), l’étude sanitaire a pour objectifs : d’estimer la qualité microbiologique et chimique de la zone en vue du classement sanitaire de la zone par l’administration...
Tipo: Text
Palavras-chave: Etude sanitaire; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production; E. coli; Palourdes; Château d’Oléron-Ors; Bassin de Marennes Oléron; Département de la Charente-Maritime.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00308/41965/41234.pdf

Etude des contaminations microbiologiques par temps sec de l'étang de Thau
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Serais, Ophelie; Derolez, Valerie; Caprais, Marie-paule.
Microbes regularly contaminate Thau lagoon shellfish. Between 1997 and 2007, 18% of the analyses carried out in dry weather recorded more than 230 Escherichia coli / 100 g of bivalves (Ifremer French microbial monitoring network), leading the administration to restrict the shellfish harvest area, including suspension of production. This study aims to determine, the contribution of seabirds, which roost at night on the Thau lagoon shellfish growing frames, to shellfish faecal pollution in dry weather. Data were collected in 2008 from both the drainage area (pollution input) and the lagoon (water quality and microbial monitoring, seabird counts) in dry weather. The data showed that, with no watershed input or lagoon resurgence, microbial contaminants were...
Tipo: Text
Palavras-chave: Etang de Thau; Contamination microbiologique; Contamination aviaire; E. coli; Coquillages.
Ano: 2009
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00042/15337/12689.pdf

Qualité microbiologique des zones conchylicoles dans les Pertuis Charentais
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Thomas, Gerard; Piquet, Jean-come; Ryckaert, Mireille; Masson, Daniel; Pepin, Jean-francois; Polsenaere, Pierre; Fillon, Alain.
Marine environment contamination can affect fishing and shellfish farming products (and shellfish in the first place), thus making them improper for human consumption, threatening public health and producer’s business. Analysis and health risk management are mandatory for consumer’s security and shellfish production survival.  About microbial risk, monitoring shellfish production areas and several studies carried by LERPC laboratory give a good view of the microbial contamination impacting the Pertuis Charentais shellfish production area. On the other hand, State-Region Plan Contract (CPER) studies results from 2007 to 2013 are presented and discussed; additionally, the law-prescribed sanitary studies for professional on foot-fishing classification are...
Tipo: Text
Palavras-chave: Microbiologie; E. coli; Norovirus; Étude sanitaire; Conchyliculture; Pêche à pied professionnelle; Pertuis Charentais; Microbiology; E.coli; Norovirus; Sanitary(health) studies; Shellfish farming; On foot]fishing; Pertuis Charentais.
Ano: 2015
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00302/41299/40472.pdf

Prediction of faecal contamination in shellfish production areas: Interest and limits of the salinity parameter
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Le Saux, Jean-claude; Le Vaillant, Gael; Guillermou, Ghislain; Vilbas, Jean-valere; Deter, Julie; Delyon, Bernard; Le Guyader, Soizick; Pommepuy, Monique.
Estuarine areas are sensitive to rapid and punctual contamination linked to heavy rainfall inducing rapid fresh water input. Thus, the increase of seawater contamination may be linked to a salinity decrease. The objective of this study was to measure salinity variation as a proxy to evaluate the risk of faecal contamination. Salinity sensors were set up on shellfish beds in Daoulas estuary (Bay of Brest) and monitored every 10 min over a four year period. Precipitation and river flows were also recorded. Moreover E. coli concentrations and salinity were measured in the estuarine surface water during different hydrodynamic conditions and seasons. The results indicated a significant relationship between E. coli concentration and salinity in the estuary....
Tipo: Text
Palavras-chave: Salinity; Sensor; E. coli; Shellfish; Prediction; Alert; Daoulas estuary.
Ano: 2009
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00066/17751/15273.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département de la gironde. Edition 2020
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique (REMI) et de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département de la Gironde. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées pour la période 2017-2019. La qualité a pu être estimée pour dix zones de production conchylicole. Selon les critères réglementaires pris en compte (articles 53, 54 et 55 du règlement d’exécution (UE) n°2019/627), dans le département de la Gironde, la qualité microbiologique est estimée en « A » pour six zones de production...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département de la Gironde.
Ano: 2020
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00629/74132/73581.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département du Finistère. Edition 2019
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Boulben, Sylviane.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats des réseaux de contrôle microbiologique REMI et d’observation des contaminants chimiques ROCCH, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Finistère. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l’évolution de leur qualité. En 2018, pour quelques zones, le classement en vigueur est discordant avec l’estimation de la qualité microbiologique des fouisseurs de l’anse de Penfoul, les huîtres de la rivière de la Laïta et les moules de la rade de Brest en partie sud-est.
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; ROCCH; Contaminations bactériologique et chimique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production conchylicole; Département du Finistère.
Ano: 2019
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00493/60420/63857.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département des Landes. Edition 2019
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Meteigner, Claire.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique (REMI) et du réseau de surveillance chimique (ROCCH), ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département des Landes. Il présente l’ensemble des résultats obtenus, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique de la zone de production de coquillages classée (40.01 Lac d’Hossegor) pour la période 2016-2018. Suivant les seuils microbiologiques du règlement (CE) n°854/2004, modifié par le règlement (CE) n° 2285/2015, la zone suivie sur le Lac d’Hossegor est estimée de qualité B pour le groupe 3 (coquillages non fouisseurs). L’étude des tendances d’évolution de la qualité...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaire des zones de production; Département des Landes.
Ano: 2019
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00497/60861/64192.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département du Finistère. Edition 2016
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Boulben, Sylviane.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d'interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI, ce rapport inclut un bilan national et décrit le programme annuel du département du Finistère. Il présente l'ensemble des résultats obtenus, en particulier l'estimation de la qualité des zones de production de coquillages classées et l'évolution de leur qualité. Pour quelques zones, le classement en vigueur est discordant avec l'estimation de la qualité. En décembre 2015, trois nouvelles zones conchylicoles ont été classées pour les coquillages du groupe II lors de la révision de l'arrêté préfectoral portant classement sanitaire des zones de production de coquillages vivants dans le Finistère.
Tipo: Text
Palavras-chave: E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; Classement sanitaire des zones de production conchylicole; Département du Finistère.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00327/43789/44079.pdf

Evaluation de la qualité des zones de production conchylicole. Département : Vendée. Edition 2017
Provedor de dados: Institutional Archive of Ifreme (ArchiMer)
Autores: Morin, Dimitri; Treguier, Cathy; Blouin, Antoine.
Après un rappel des objectifs, du fonctionnement et de la méthode d’interprétation des résultats du réseau de contrôle microbiologique REMI et du réseau de surveillance chimique ROCCH, ce rapport décrit le programme annuel du département de la Vendée nord (aire de compétence du LER/MPL) et Vendée sud (aire de compétence du LER/PC). Il présente l’ensemble des résultats obtenus sur la période 2014-201, en particulier l’estimation de la qualité microbiologique et chimique des zones de production de coquillages classées. Les classements sanitaires arrêtés le 12 octobre 2016 ne sont pas concordants avec la qualité microbiologique estimée de toutes les zones de la Vendée. En effet, deux zones classées A sont évaluées en B (« Baie de bourgneuf-Nord-Est du Gois »...
Tipo: Text
Palavras-chave: REMI; E. coli; Contamination bactériologique des coquillages; ROCCH; Contaminants chimiques; Milieu marin; Classement sanitaie des zones de production; Département de la Vendée.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00387/49800/50368.pdf

The antibacterial activity of propolis produced by Apis mellifera L. and Brazilian stingless bees
Provedor de dados: Journal of Venomous Animals and Toxins
Autores: FERNANDES JR.,A.; LEOMIL,L.; FERNANDES,A.A.H.; SFORCIN,J.M.
This study investigated the antibacterial activity of propolis produced by A. mellifera and Brazilian stingless bees, called "meliponíneos". Susceptibility tests to ethanolic extracts of propolis (EEP) were performed using bacterial strains (Staphylococcus aureus, Enterococcus sp, and Escherichia coli) isolated from human infections. Dilution of EEP in agar (%v/v) was used for determination of minimal inhibitory concentration (MIC). The stingless bee species (and common names) were: Nannotrigona testaceicornis ("Iraí"), Tetragonisca angustula ("Jataí"), Trigona spinipes ("Arapuá"), Scaptotrigona sp ("Tiúba"), Partamona sp ("Cupira"), Melipona scutellaris ("Uruçu"), Melipona sp ("Manduri"), and Melipona mandaçaia ("Mandaçaia"). EEP inhibitory efficiencies...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Ethanolic extract of propolis; Apis mellifera; Brazilian stingless bees; S. aureus; E. coli; Enterococcus sp.
Ano: 2001
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0104-79302001000200003

Microbioal assessment of el-max farm
Provedor de dados: Ocean Docs: e-repository of  publications
Autores: Elsersy, N.A.; Abo-Ella, G.M.; El-Shenawy, M.; Abdel-Mawla, E.
El-Max fish farm is one of the most important natural fish farm in Alexandria which is suffering from die-off of large amounts of fish. Facing this problem we must deal with the estimation of the quality of the farm raring unit environment (ponds). Analysis of samples using the Bray - Curtis similarity coefficient test yielded that, the input and El-Khandac were similar at (97%), while the eight ponds were classified at different level of similarity as follows: pond1 (B1) and pond7 (B7) were similar at (86%), B2 and B3 were similar at (90%), B14, B10 and B9 were similar at (93%), where as B11 is singly separated at (83%). Moreover, results indicate that distribution of the different bacterial groups was affected with one or more chemical parameters such as...
Tipo: Journal Contribution
Palavras-chave: Vibriosis; Fish farm; E. coli; Streptococcus faecalis Microbiological analysis Microbiology Fish farms Microbiological analysis Microbiology http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_25302 http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_4800.
Ano: 2005
URL: http://hdl.handle.net/1834/1262

Chapter 09: VALUATION BY THE COST OF ILLNESS METHOD: THE SOCIAL COSTS OF ESCHERICHIA COLI O157:H7 FOODBORNE DISEASE
Provedor de dados: Research in Agricultural & Applied Economics (AgEcon Searh)
Autores: Roberts,   Tanya; Marks,   Suzanne.
This book was originally published by Westview Press, Boulder CO, 1995.
Tipo: Book Chapter
Palavras-chave: Cost of illness; E. coli; Foodborne illness; Food Consumption/Nutrition/Food Safety.
Ano: 1995
URL: http://purl.umn.edu/25977

The Effects of E. Coli 0157:H7, FMD and BSE on Japanese Retail Beef Prices: A Historical Decomposition
Provedor de dados: Research in Agricultural & Applied Economics (AgEcon Searh)
Autores: Saghaian,   Sayed H.; Maynard,   Leigh J.; Reed,   Michael R.
This study examines the time-varying Japanese price reactions to the 2001 Bovine Spongiform Encephalopathy (BSE) discovery, the 2000 outbreak of foot and mouth disease (FMD), and the 1996 E. coli food po isoning events. Historical decomposition of retail-level price-series aids in explaining the behavior of beef prices in a neighborhood (period-by-period time interval) of the three events. This is based on an application of directed acyclic graphs, constructing orthogonal innovations to determine causal patterns behind contemporaneous innovations. The results show the beef safety events had different negative impacts on Japanese retail beef prices, suggesting that consumers understood and differentiated among the health risks. The results provide...
Tipo: Conference Paper or Presentation
Palavras-chave: Japan; Beef prices; BSE; FMD; E. coli; Historical decomposition.; Demand and Price Analysis; Food Consumption/Nutrition/Food Safety; Livestock Production/Industries; Q11; Q13.
Ano: 2006
URL: http://purl.umn.edu/25580

USING BEST WORST SCALING TO INVESTIGATE PERCEPTIONS OF CONTROL &amp; CONCERN OVER FOOD AND NON-FOOD RISKS
Provedor de dados: Research in Agricultural & Applied Economics (AgEcon Searh)
Autores: Erdem,   Seda; Rigby,   Dan.
This research locates a series of risks or hazards within a framework characterised by the level of control respondents believe they have over the risks, and the level of worry the risks prompt. It does this for a set of both food and non-food risks. The means by which this is done is novel, and differs from past risk perception analyses in that it questions people directly regarding their relative assessments of the levels of control and worry over the risks presented. The cognitive burden associated with people ranking and scaling items in large sets is notoriously heavy, so this study uses an elicitation method designed to make the process intuitive and cognitively manageable for respondents. The substantive analysis of the risk perceptions has four...
Tipo: Conference Paper or Presentation
Palavras-chave: Best-worst scaling; Risk; Perception; Novel technology; E. coli; UK; Risk and Uncertainty.
Ano: 2011
URL: http://purl.umn.edu/108790

Growth performance, carcass yield and intestinal microflora populations of broilers fed diets containing thepax and yogurt
Provedor de dados: Revista Brasileira de Ciência Avícola
Autores: Boostani,A; Mahmoodian Fard,H R; Ashayerizadeh,A; Aminafshar,M.
The present study aimed at evaluating the effect of the probiotic thepax and yogurt (as probiotic) on the growth response and intestinal microflora results of broiler chickens. Two hundred forty day-old Ross 308 broilers were equally distributed into 12 floor pens and reared for 42 day. The treatments consisted of yogurt (10, 5 and 2.5% during starter, grower and finisher periods in the drinking water, respectively) and thepax (1000, 500, 250 g/ton-1 in the starter, grower and finisher diets, respectively), resulting three experimental diets and a control group. Each dietary treatment was fed ad-libitum to four replicate group of 20 birds at the beginning of rearing period. Birds and feed were weighed on days 21 and 42. The results of experiment indicate...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Ross 308; Probiotic; Carcass yield; E. coli.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-635X2013000100001

Effects of E. Coli Infection on the Expressions of TGF-β/Smads Signaling Pathway in Broiler Intestine
Provedor de dados: Revista Brasileira de Ciência Avícola
Autores: Juang,J; Yin,H; Zhang,C; Wang,J.
ABSTRACT This experiment aimed to investigate whether Escherichia coli (E. coli) infection could affect the TGF-β/smads signaling pathway in the jejunal tissue of chickens. One-day-old Cobb 500 broilers were randomly divided into 2 groups and treated with intraperitoneal E. coli or broth injection. Clinical signs of the birds were assessed every day. Spleen and bursa of Fabricius of the birds, post-infection (pi), were collected to evaluate immune organ index. Jejunal tissues were collected to ascertain the expression of TGF-βs, TβRs, and Smads. The results showed that the infected birds had significantly higher index of the spleen (24hrs and 48hrs pi) compared with birds in the control group (p&lt;0.05). The relative gene expression of TGF-β4 increased...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: TGF-β/Smads; Intestinal lesion; E. coli; Chicken.
Ano: 2020
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-635X2020000100311

Disinfection of a farmstead roof harvested rainwater for potable purposes using an automated solar photocatalytic reactor.
Provedor de dados: Agricultural Engineering International : The CIGR e-journal
Autores: Nwoke, Okala Okala; Ezema, Ifeanyichukwu Fabian; Chigor, Vincent Nnamdigadi; Anoliefo, Edward Chukwud; Mbajiorgu, Constantine Crowner.
Access to safe and reliable water supply is a challenge in many parts of the developing world. The use of roof harvested rainwater for domestic and potable purposes is common in households and farmsteads in the rainforest and some parts of savannah ecological zones of  Nigeria in spite of  the health risk associated with ingestion of water from an unimproved source such as untreated roof harvested rainwater. Solar photocatalysis has been proven to be effective in water treatment devoid of the short comings of high fuel cost and formation of carcinogens associated with conventional households water disinfection methods such as boiling and the use of chemicals.  In this study, an automated photocatalytic batch reactor which uses solar radiation as its photon...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Agricultural Engineering; Water Engineering; Water Treatment. Solar radiation dose; E. coli; Water disinfection; TiO2; Photocatalytic reactor.
Ano: 2018
URL: http://www.cigrjournal.org/index.php/Ejounral/article/view/4893

Listeria monocytogenes, E. coli O157, Salmonella spp. e microrganismos indicadores em carcaças bovinas para exportação
Provedor de dados: Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia
Autores: Matos,A.V.R.; Nunes,L.B.S.; Vianna,C.; Spina,T.L.B.; Zuim,C.V.; Possebon,F.S.; Xavier,D.M.; Ferraz,M.C.; Pinto,J.P.A.N.
Foram colhidas amostras de 100 carcaças em um frigorífico exportador, localizado no interior do estado de São Paulo, amostradas ao longo de um ano, por meio do método de esponjas, aplicado na região do peito do animal. As amostras foram colhidas em três pontos, denominados A, B e C, sendo cada carcaça amostrada nos três pontos, localizados nas etapas: pós-sangria (A); pós-esfola (B) e pós-lavagem (C). Foram realizadas pesquisas de Listeria sp., E. coli O157, Salmonella spp. e microrganismos indicadores (Petrifilms® AC, EC e EB). Não foram isolados Listeria ou E. coli O157 em nenhuma das 300 amostras. Salmonella spp. foi isolada em nove, sendo oito no ponto A e uma no ponto B. Para mesófilos, as contagens variaram de 0 a 6,8 log UFC/cm², para coliformes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Bovinos; Salmonella; E. coli; Listeria; Microrganismos indicadores.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352013000400007

Dinâmica da população de coliformes durante a compostagem automatizada de dejetos líquidos de suínos
Provedor de dados: Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia
Autores: Sá,M.F.; Aita,C.; Doneda,A.; Pujol,S.B.; Cantú,R.R.; Jacques,I.V.C.; Bastiani,G.G.; Oliveira,P.D.; Lopes,P.D.
Microrganismos presentes em dejetos de suínos podem contaminar o meio ambiente. Embora a compostagem seja preconizada como um método eficiente para reduzir este potencial poluidor dos dejetos, existem poucas informações de pesquisa sobre tal processo. O presente trabalho teve o objetivo de avaliar a eficiência da compostagem automatizada dos dejetos líquidos de suínos (DLS) na redução da população de coliformes, usados como indicadores de poluição fecal. Os DLS foram adicionados periodicamente, durante 106 dias, em substrato constituído pela mistura, em partes iguais, de maravalha e serragem. Foram efetuadas 14 adições de DLS, e em cada adição as leiras de compostagem eram revolvidas por meio de uma máquina especialmente desenvolvida para este fim. Foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: E. coli; Resíduos da suinocultura; Tratamento de efluentes.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352014000401197

Perfil de sensibilidade e multirresistência em linhagens de Escherichia coli isoladas de infecção do trato urinário, de piometra e de fezes de cães
Provedor de dados: Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia
Autores: Siqueira,A.K.; Ribeiro,M.G.; Salerno,T.; Takahira,R.K.; Lopes,M.D.; Prestes,N.C.; Silva,A.V.
Susceptibility profile and multiple drug resistance in 158 E. coli strains isolated from urinary tract infection (UTI), pyometra, and feces of dogs were studied. Norfloxacin, ciprofloxacin, and enrofloxacin were the most-effective drugs (&gt;60%) for E. coli strains. High rates of resistance to antimicrobials were observed in 60% or more of the isolated strains using sulfametoxazole/trimetoprim. Multiple drug resistance for three or more antimicrobials was observed in two (47.1%) strains isolated from UTI, seven (13.5%) from pyometra, and four (7.3%) from feces. From these, 17 (33.3%), one (1.9%), and three (5.5%), respectively, showed multiple resistance to five or more drugs.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Palavras-chave: Cão; E. coli; Sensibilidade antimicrobiana; Infecção do trato urinário; Piometra.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000500033

The subsidiary GntII system for gluconate metabolism in Escherichia coli: Alternative induction of the gntV gene
Provedor de dados: Biological Research
Autores: Gómez,Keyla M; Rodríguez,Andrea; Rodriguez,Yesseima; Ramírez,Alvaro H; Istúriz,Tomás.
Two systems are involved in the transport and phosphorylation of gluconate in Escherichia coli. GntI, the main system, consists of high and low-affinity gluconate transporters and a thermoresistant gluconokinase for its phosphorylation. The corresponding genes, gntT, gntU and gntK at 76.5 min, are induced by gluconate. GntII, the subsidiary system, includes IdnT and GntV, which duplicate activities of transport and phosphorylation of gluconate, respectively. Gene gntV at 96.8 min is divergently transcribed from the idnDOTR operon involved in L-idonate metabolism. These genetic elements are induced by the substrate or 5-keto-D-gluconate. Because gntV is also induced in cells grown in gluconate, it was of interest to investigate its expression in this...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: E. coli; Gluconate; GntII; GntV.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-97602011000300008

Molecular Characterization of a MYB Protein from Oryza sativa for its Role in Abiotic Stress Tolerance
Provedor de dados: Brazilian Archives of Biology and Technology
Autores: Deeba,Farah; Sultana,Tasawar; Javaid,Bushra; Mahmood,Tariq; Naqvi,S. M. S.
ABSTRACT The MYB family represents one of the most abundant classes of transcriptional regulators that perform pivotal role under different developmental processes and abiotic stresses. In present study, a MYB gene from Oryza sativa was selected for functional characterization. Bioinformatics analysis revealed that OsMYB1 cDNA encodes R2-R3 type DNA binding domain consisting of 413 amino acids having size of 44 kDa and pI of 6.24. DNA binding domain containing region was cloned and over-expressed in E. coli. Then, the survival of pGEX-OsMYB1 transformed E. coli cells was compared with control plasmid under different concentrations of NaCl, mannitol, high and low temperature. pGEX-OsMYB1 enhanced the survival of cells at high temperature and salinity....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Abiotic stress; E. coli; Oryza sativa; OsMYB1; PGEX; Real time qPCR.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132017000100411

Coexpression of rumen fungal xylanase and bifunctional cellulase genes in Escherichia coli
Provedor de dados: Brazilian Archives of Biology and Technology
Autores: Comlekcioglu,Ugur; Gunes,Merva; Altun,Hanifi; Ekiz,Dilek Ozgun; Aygan,Ashabil.
ABSTRACT Rumen fungi inhabit the gastro-intestinal tract of ruminants and the most non-ruminant herbivores. Rumen fungi produce highly active plant cell wall degrading enzymes, therefore they have gained scientific interest. In this study, genes encoding xylanase (xynA-7) and cellulase (celA-5) were amplified from Neocallimastix sp. GMLF7 and Orpinomyces sp. GMLF5, respectively, and expressed in Escherichia coli. XynA-7 was found to be active only on xylan, however CelA-5 had activity both on carboxymethyl cellulose and lichenan. Lichenase activity of CelA-5 was found to be higher than carboxymethyl cellulase activity. The optimal conditions were at pH 6.0 and 40 °C for CelA-5 and at pH 6.5 and 50 °C for XynA-7. A coexpression vector was constructed to...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Rumen fungi; Xylanase; Cellulase; Coexpression; E. coli.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132017000100407

Sensibilidade antimicrobiana de amostras de Escherichia coli isoladas de leitões com diarréia após o desmame
Provedor de dados: Brazilian Archives of Biology and Technology
Autores: Brito,Benito Guimarães de; Tagliari,Kelly Cristina.
The main infectious agent responsible by post-weaning diarrhoea in piglets is the Escherichia coli and the therapy by drugs is used for control of this disease. The antimicrobial sensitivity of 66 strains of Escherichia coli isolated from piglets with post-weaning diarrhoea was studied. The results show high resistance at four drugs (streptomycin, sulfonamide, tetracycline and chloramphenicol). Gentamycin and neomycin were the best antimicrobial in the inhibition of strains of Escherichia coli, isolated from piglets with post-weaning diarrhoea, in the southwest of Paraná.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: E. coli; Antimicrobial sensibility; Drugs; Piglets; Diarrhoea.
Ano: 2000
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132000000100017

Follow-up after infants younger than 2 months of age with urinary tract infection in Southern Israel: epidemiologic, microbiologic and disease recurrence characteristics
Provedor de dados: Brazilian Journal of Infectious Diseases
Autores: Gurevich,Evgenia; Tchernin,Dov; Schreyber,Ruth; Muller,Robert; Leibovitz,Eugene.
Abstract  Background The timing of most recurrences after neonatal urinary tract infection is during the first year of life, with peak incidence 2–6 months after the initial infection. Information on the microbiologic characteristics of recurrent urinary tract infection episodes in relation to the microbiology of the initial episodes is limited.  Objectives To analyze the epidemiologic/microbiological characteristics of 1st and recurrent urinary tract infection in infants &lt;2 months of age.  Methods A retrospective study including all infants &lt;2 months of age with urinary tract infection admitted during 2005–2009 and followed till the age of 1 year.  Results 151 neonates were enrolled (2.7% of all 5617 febrile infants &lt;2 months of age admitted)....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Antibiotics; E. coli; Urinary tract infection; Recurrence.
Ano: 2016
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-86702016000100019

CTX-M-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from community-acquired urinary tract infections in Valledupar, Colombia
Provedor de dados: Brazilian Journal of Infectious Diseases
Autores: Martinez,Pedro; Garzón,Denisse; Mattar,Salim.
OBJECTIVE: Describe the presence of CTX-M-1 phylogenetic subgroup extended-spectrum i-lactamases (ESBL), associated with TEM and SHV genes, and the gene encoding cephalosporinase, CMY-2 in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates from community-acquired urinary tract infections. METHODS: 102 E. coli and 21 K. pneumoniae were collected from patients with culture-proven urinary tract infection (UTI), during February and March, 2011. Antimicrobial susceptibility test was performed by disk diffusion according to the standards of the Clinical Laboratory Standard Institute. Screening for cephalosporins-resistant E. coli and K. pneumoniae was performed by PCR assay for blaTEM, blaSHV, blaCTX-M-1,-2,-8,-9, blaPER-2 and blaCMY-2 genes. Statistical...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: ESBL; CTX-M; E. coli; K. pneumonia; Community-acquired UTIs; Colombia.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-86702012000500003

Isolation of Escherichia coli and Salmonella spp. from free-ranging wild animals
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Iovine,Renata de Oliveira; Dejuste,Catia; Miranda,Flávia; Filoni,Claudia; Bueno,Marina Galvão; Carvalho,Vania Maria de.
Increasing interactions between humans, domestic animals and wildlife may result in inter-species transmission of infectious agents. To evaluate the presence of pathogenic E. coli and Salmonella spp. and to test the antimicrobial susceptibility of isolates, rectal swabs from 36 different free-ranging wild mammals were taken from two distinct natural sites in Brazil: Cantareira State Park (CSP, state of São Paulo) and Santa Isabel do Rio Negro Region (SIRNR, state of Amazonas). The swabs were randomly collected and processed for bacterial isolation, identification, characterization and antimicrobial resistance. Eighteen E. coli strains from CSP and 20 from SIRNR were recovered from 14 and 22 individuals, respectively. Strains from animals captured in CSP,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: E. coli; Salmonella; Wild mammals; One Health; Brazil.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822015000401257

Role of wild birds as carriers of multi-drug resistant Escherichia coli and Escherichia vulneris
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Shobrak,Mohammed Y.; Abo-Amer,Aly E.
Emergence and distribution of multi-drug resistant (MDR) bacteria in environments pose a risk to human and animal health. A total of 82 isolates of Escherichia spp. were recovered from cloacal swabs of migrating and non-migrating wild birds. All bacterial isolates were identified and characterized morphologically and biochemically. 72% and 50% of isolates recovered from non-migrating and migrating birds, respectively, showed positive congo red dye binding (a virulence factor). Also, hemolysin production (a virulence factor) was showed in 8% of isolates recovered from non-migrating birds and 75% of isolates recovered from migrating birds. All isolates recovered from non-migrating birds were found resistant to Oxacillin while all isolates recovered from...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: E. coli; E. vulneris; Multi-drug resistance (MDR); Migrating and non-migrating birds; Congo red binding; Hemolysin; API 20E; 16S rRNA; Plasmid profile.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822014000400010

Growth inhibition of Staphylococcus aureus and escherichia coli strains by neutralizing IgY antibodies from ostrich egg yolk
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Tobias,Fernando Luiz; Garcia,Luize Néli Nunes; Kanashiro,Milton Masahiko; Medina-Acosta,Enrique; Brom-de-Luna,João Gato; Almeida,Claudia Maria Costa de; Azevedo Junior,Romildo Rocha; Lemos,Môsar; Vieira-da-Motta,Olney.
Ostrich raising around the world have some key factors and farming profit depend largely on information and ability of farmers to rear these animals. Non fertilized eggs from ostriches are discharged in the reproduction season. Staphylococcus aureus and Escherichia coli are microorganisms involved in animal and human diseases. In order to optimize the use of sub products of ostrich raising, non fertilized eggs of four selected birds were utilized for development of polyclonal IgY antibodies. The birds were immunized (200ug/animal) with purified recombinant staphylococcal enterotoxin C (recSEC) and synthetic recRAP, both derived from S. aureus, and recBFPA and recEspB involved in E. coli pathogenicity, diluted in FCA injected in the braquial muscle. Two...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Ostrich IgY antibodies; Inhibition; Recombinant proteins; E. coli; S. aureus.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822012000200015

Relationship among Shigella spp. and enteroinvasive Escherichia coli (EIEC) and their differentiation
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Ud-Din,Abu; Wahid,Syeda.
Shigellosis produces inflammatory reactions and ulceration on the intestinal epithelium followed by bloody or mucoid diarrhea. It is caused by enteroinvasive E. coli (EIEC) as well as any species of the genus Shigella, namely, S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii, and S. sonnei. This current species designation of Shigella does not specify genetic similarity. Shigella spp. could be easily differentiated from E. coli, but difficulties observed for the EIEC-Shigella differentiation as both show similar biochemical traits and can cause dysentery using the same mode of invasion. Sequencing of multiple housekeeping genes indicates that Shigella has derived on several different occasions via acquisition of the transferable forms of ancestral virulence plasmids...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Diarrhea; E. coli; Shigella; Real-time PCR.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822014000400002

Virulence factors of Escherichia coli isolated from calves with diarrhea in Brazil
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Salvadori,Márcia Regina; Valadares,Geórgio Freesz; Leite,Domingos da Silva; Blanco,Jesús; Yano,Tomomasa.
Two hundred and five Escherichia coli strains isolated from calves with diarrhea from mid-western Brazil were screened for the presence of virulence factors associated with bovine colibacillosis. One hundred and two (49.8%) of the E. coli strains produced toxins: Shiga toxins 1 (9.7%) and 2 (6.3%), a-hemolysin (9.7%), enterohemolysin(6.8%), Cytotoxic Necrotizing Factors type 1 (0.5%), and type 2 (4.4%), enterotoxins LT-II (8.3%) and STa (3.9%). No strain produced enterotoxin LT-I. Fimbrial adhesins F5 and F17 were produced by 7.3% and 4.8% of the strains, respectivly, and none expressed F41. Seven strains (3.4%) possessed the gene eae and belonged to serotypes O26:H-; O111:H- and O118:H16. These results suggest that calves in Brazil may be an important...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Calves; Diarrhea; E. coli; Virulence factors.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822003000300009

Identification of pathogens and virulence profile of Rhodococcus equi and Escherichia coli strains obtained from sand of parks
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Fernandes,M.C.; Takai,S.; Leite,D.S.; Pinto,J.P.A.N.; Brandão,P.E.; Santarém,V.A.; Listoni,F.J.P.; Silva,A.V. Da; Ribeiro,M.G.
The identification of pathogens of viral (Rotavirus, Coronavirus), parasitic (Toxocara spp.) and bacterial (Escherichia coli, Salmonella spp., Rhodococcus equi) origin shed in feces, and the virulence profile of R. equi and E. coli isolates were investigated in 200 samples of sand obtained from 40 parks, located in central region of state of Sao Paulo, Brazil, using different diagnostic methods. From 200 samples analyzed, 23 (11.5%) strains of R. equi were isolated. None of the R. equi isolates showed a virulent (vapA gene) or intermediately virulent (vapB gene) profiles. Sixty-three (31.5%) strains of E. coli were identified. The following genes encoding virulence factors were identified in E. coli: eae, bfp, saa, iucD, papGI, sfa and hly. Phylogenetic...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Enteric pathogens; Virulence; Sand; Feces; Parks; E. coli; R. equi.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822013000200025

Increase resistant rates and ESBL production between E. coli isolates causing urinary tract infection in young patients from Iran
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Pourakbari,Babak; Ferdosian,Farzad; Mahmoudi,Shima; Teymuri,Mostafa; Sabouni,Farah; Heydari,Hossein; Ashtiani,Mohammad Taghi Haghi; Mamishi,Setareh.
Emerging antimicrobial resistance rates and Extended-spectrum beta-lactamase producing Escherichia coli recovered from urinary tract infections (UTI) is an increasing problem in specific regions, limiting therapeutic options. One hundred E. coli isolates causing UTI in patients with age from 2 months to 12 years admitted at CMC in the period of April 2009 to March 2010 were tested for antibiotic susceptibility using the disk diffusion method. Surprisingly high resistance rates were recorded for E. coli against TMP/SMX (84%), cefalotin (66%), cefuroxime (50%), cefixime (50%) and ceftriaxone (45%). Antimicrobial susceptibility of E. coli isolates was followed by meropenem (98%), amikacin (95%), nitrofurantoin (91%) and gentamicin (68%). Extended spectrum...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: E. coli; Urinary Tract Infection; Antimicrobial susceptibility; ESBL.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822012000200041

Occurrence and characteristics of virulence genes of Escherichia coli strains isolated from healthy dairy cows in Inner Mongolia, China
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Huasai,Simujide; Chen,Aorigele; Wang,Chun-jie; Li,Yu; Tongrige,Bai.
Virulence genes of Escherichia coli (E. coli) isolates from healthy dairy cows were identified and characterized by a multiplex PCR assay and serogrouping test. The results showed that among the target genes, eaeA was most frequently detected, accounting for 22.11% (67/303) in all strains from 101 cows. For categorization of E. coli, aEPEC was the category with widest distribution detected in 55 (18.15%) strains from 22 cattle. All of 84 PCR-positive strains belonged to 14 O serogroups, and O149 (25.00%) was most common identified, followed by O2 (17.86%), O8 (11.90%) and O103 (9.52%) with relatively high prevalence.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: E. coli; Virulence gene; Multiplex PCR; Serogroup; Healthy dairy cow.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822012000200013

Capture immunoassay for LT detection produced by enterotoxigenic Escherichia coli in bacterial isolates
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Menezes,Caroline Anunciação; Gonçalves,Danielle Silva; Amianti,Jackeline; Fernandes,Irene; Taddei,Carla Romano; Koga,Paula Célia Mariko; Trabulsi,Luiz Rachid; Martinez,Marina Baquerizo; Piazza,Roxane Maria Fontes.
A capture enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), which detects LT-I toxin produced by enterotoxigenic Escherichia coli strains, has beendeveloped. This capture assay was performed using the IgG enriched fraction of anti-LT-I antiserum and IgG2b anti-LT-I monoclonal antibody and allowed a clear distinction between E. coli LT-I - producing and non-producing strains. The estimated accuracy of the assay is 78% for sensitivity, 94% for specificity and 92% for efficiency. Thus, the capture immunoassayis a sensitive tool for detection of E. coli, which produces heat-labile enterotoxin, and is suitable for use in clinical laboratories and epidemiological surveys in developing world.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Detection; Polyclonal antibody; Monoclonal antibody; Thermo-labile toxin; E. coli.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822003000500004

Comparison of thermotolerant coliforms and Escherichia coli densities in freshwater bodies
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Hachich,Elayse M.; Di Bari,Marisa; Christ,Ana Paula G.; Lamparelli,Cláudia C.; Ramos,Solange S.; Sato,Maria Inês Z.
Fecal bacterial indicator analyses have been widely used for monitoring the water quality. This study was designed to determine the ratio between the density of Escherichia coli and other Thermotolerant Coliforms (TtC) bacteria from freshwater samples collected for a two-year period of monitoring. TtC were enumerated by membrane filtration on mFC agar. E. coli enumeration was done by two methods: TtC colonies identified in mFC were inoculated in EC-MUG or water samples were filtered and inoculated in modified mTEC agar media, and both methods were compared for quantitative recovery of E. coli. The results pointed out a mean percentage of E. coli among other thermotolerant coliforms (E. coli/TtC ratio) of 84.3% in mFC media. Taking these results into...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Thermotolerant Coliforms (TtC); E. coli; Water quality; Microbiological standards.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822012000200032

Occurrence of Salmonella spp. and generic Escherichia coli on beef carcasses sampled at a brazilian slaughterhouse
Provedor de dados: Brazilian Journal of Microbiology
Autores: Silva,Fabiana Fernanda Pacheco da; Horvath,Mariana Bandeira; Silveira,Juliana Guedes; Pieta,Luiza; Tondo,Eduardo Cesar.
A total of 120 beef carcasses were analyzed during processing at a slaughterhouse in southern Brazil. The carcasses were sampled by swab at three different steps of the slaughter line and then they were tested for Salmonella and E. coli. The Salmonella isolates were also examined for antimicrobial susceptibility. Salmonella prevalence distribution was modeled and the probability of contamination was simulated using @Risk program and 10,000 interactions. Results demonstrated that 4 beef carcasses (3.3%) were positive for Salmonella only in the first point. The six isolates of Salmonella were classified: S. Newport (n = 3), S. Saintpaul (n = 2) and S. Anatum (n = 1). No Salmonella strains exhibited resistance to any of the antimicrobials tested. As expected,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Salmonella; E. coli; Beef carcasses; Slaughter line; Antimicrobial susceptibility.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822014000100004

Glycodendrimers: versatile tools for nanotechnology
Provedor de dados: Brazilian Journal of Pharmaceutical Sciences
Autores: Roy,René; Shiao,Tze Chieh; Rittenhouse-Olson,Kate.
Combining nanotechnology with glycobiology has triggered an exponential growth of research activities in the design of novel functional bionanomaterials (glyconanotechnology). More specifically, recent synthetic advances towards the tailored and versatile design of glycosylated nanoparticles namely glyconanoparticles, considered as synthetic mimetics of natural glycoconjugates, paved the way toward diverse biomedical applications. The accessibility of a wide variety of these structured nanosystems, in terms of shapes, sizes, and organized around stable nanoparticles have readily contributed to their development and applications in nanomedicine. In this context, glycosylated gold-nanoparticles (GNPs), glycosylated quantum dots (QDs), fullerenes, single-wall...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Dendrimer; Glycodendrimer; Vaccine; Bacteria; Nanoparticles; E. coli; Lanthanides.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1984-82502013000700008

Fatores de virulência presentes em amostras de Escherichia coli uropatogênicas - UPEC para suínos
Provedor de dados: Ciência Rural
Autores: Brito,Benito Guimarães de; Vidotto,Marilda Carlos; Berbel,Milene Martins; Tagliari,Kelly Cristina.
As infecções urinárias são freqüentes nos rebanhos suínos, sendo a principal causa de descarte e mortalidade de animais adultos. Apesar das características multifatoriais da doença o microrganismo freqüentemente isolado é a Escherichia coli. Vários fatores de virulência de Escherichia coli foram descritos em amostras uropatogênicas e permitem diferenciar cepas patogênicas de não patogênicas. Esta revisão tem por objetivo apresentar alguns tópicos relativos aos fatores de virulência presentes em amostras de E. coli uropatogênicas para suínos.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Suínos; E. coli; Uropatogênicas.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782004000200050