Consulta: subjectFacets:"Microsatélites"
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Diversidad y estructura genética de poblaciones de hongos patógenos infectando larvas de gallina ciega en Guanajuato, México.
Provedor de dados: Depósito Institucional Abierto de Documentos Digitales del Colegio de Postgraduados (COLPOS DIGITAL )
Autores: Carrillo Benitez, María Guadalupe.
Los hongos entomopatógenos se encuentran  comúnmente en el suelo, por lo que el estudio y determinación de poblaciones nativas de estos microorganismos, previos es importante, previos a la introducción de aislamientos exóticos, es importante. Las larvas de gallina ciega causan daños a cultivos importantes como el maíz en Guanajuato y otras regiones de México. La principal estrategia de manejo de esta plaga es el control químico; sin embargo, su efecto no ha sido suficiente por lo que se requiere de otras alternativas. El control microbiano es una de las estrategias más importantes para plagas de suelo, y especies dentro de los géneros Beauveria y Metarhizium estánson consideradosconsideradas entre los candidatos más prometedores. Esta investigación reporta...
Palavras-chave: Beauveria pseudobassiana; Metarhizium anisopliae; Metarhizium pingshaense; Metarhizium robertsii; Taxonomía molecular; Microsatélites; ERIC; Phyllophaga polyphylla; Entomología y Acarología; Doctorado.
Ano: 2012
URL: http://hdl.handle.net/10521/1695

Variabilidad genética del mildiu (Bremia lactucae Regel) en Salamanca y San Miguel de Allende, Guanajuato, mediante RAPD e ISSR
Provedor de dados: Depósito Institucional Abierto de Documentos Digitales del Colegio de Postgraduados (COLPOS DIGITAL )
Autores: Martínez Martínez, Susana.
Bremia lactucae Regel causa una de las enfermedades de mayor importancia en la lechuga a nivel mundial. Debido a que este pseudohongo presenta dos tipos de reproducción: sexual y asexual, su diversidad genética es amplia y puede dar origen a nuevas razas. Dicha situación se desconoce en México, por lo que es importante conocer este aspecto en las zonas productoras de esta hortaliza, así como también la influencia que ejercen los factores ambientales sobre la incidencia y severidad del patógeno. Por ello, fueron determinadas la incidencia y severidad de B. lactucae en 15 variedades de lechuga, además se registraron variables ambientales como la temperatura, humedad relativa, humedad de la hoja y precipitación en los municipios de Salamanca y San Miguel de...
Tipo: Tesis
Palavras-chave: Bremia lactucae; Mildiu; Diversidad genética; Microsatélites; Maestría; Fitopatología; Mildew; Genetic diversity; Microsatellite.
Ano: 2008
URL: http://hdl.handle.net/10521/1675

Caracterización genética de cuatro poblaciones de ovinos criollos de Argentina
Provedor de dados: Journal of Basic and Applied Genetics (BAG)
Autores: Peña,S; Martínez,A; Villegas Castagnasso,E; Aulicino,M; Género,E.R; Giovambattista,G; Martínez,R.D.
Los ovinos criollos son los fundadores de la ganadería ovina en la Argentina y han contribuido de manera sostenida al desarrollo económico, social y cultural de algunas regiones del país. A pesar de ello, es un recurso zoogenético escasamente valorizado y por ende poco estudiado. En orden de caracterizar genéticamente a los ovinos criollos argentinos, se tomaron muestras de ADN de cuatro poblaciones representativas localizadas en las provincias de Buenos Aires, Corrientes, Santiago del Estero y Salta. Estas majadas se seleccionaron por ser grupos conservados, que presentan las características fenotípicas de la raza y no registran la introducción de animales de otras razas en el sistema de reproducción. Un total de 30 marcadores microsatélites y la región...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Ovejas; Variabilidad genética; Microsatélites; ADN mitocondrial.
Ano: 2017
URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332017000300005

Identificación de cultivares de trébol blanco (Trifolium repens L.) mediante SSR
Provedor de dados: Journal of Basic and Applied Genetics (BAG)
Autores: Randazzo,C.P; Rosso,B.S; Pagano,E.M.
El trébol blanco (Trifolium repens L) es una leguminosa forrajera de gran valor nutritivo y muy eficiente en la incorporación de nitrógeno (N) al suelo mediante fijación simbiótica. En Argentina se ha difundido ampliamente en las regiones húmeda y subhúmeda. Los objetivos del presente trabajo fueron i) detectar la capacidad de marcadores moleculares microsatélites (SSR) para la diferenciación genética e identificación de cultivares de trébol blanco y ii) determinar la relación entre los agrupamientos de los cultivares basados en marcadores moleculares y caracteres agronómicos. Se analizaron 24 cultivares de trébol blanco y dos de trébol rojo de diversos orígenes. Se utilizaron 15 SSR marcados con fluorescencia. Los productos de PCR fueron separados en...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Marcadores moleculares; Microsatélites; Trébol blanco; Cultivares.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332013000100003

Mapeo de QTL para una medida multivariada de la reacción al virus del mal de Río cuarto
Provedor de dados: Journal of Basic and Applied Genetics (BAG)
Autores: Bonamico,N.C; Di Renzo,M.A; Borghi,M.L; Ibañez,M.A; Díaz,D.G; Salerno,J.C; Balzarini,M.G.
El índice de severidad de enfermedad (ISE), un indicador de resistencia multidimensional, es una media ponderada de la severidad e incidencia de la enfermedad del maíz causada por el Mal de Río Cuarto Virus (MRCV). En el presente estudio se realizó un mapeo por intervalo con el objetivo de identificar loci de caracteres cuantitativos o QTL ("quantitative trait loci") asociados con el ISE del Mal de Río Cuarto (MRC) en una población de líneas endocriadas recombinantes (RILs) de maíz evaluadas en ambientes donde la enfermedad es endémica. Los resultados sugieren que algunas regiones genómicas (cromosomas 1, 4, 6, 8 y 10) tienen un efecto significativo sobre la reacción al MRCV. Alrededor del 40% de los intervalos significativos coinciden con aquellos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Maíz; Líneas endocriadas recombinantes; Índice de severidad de enfermedad; Microsatélites; Enfermedad viral.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332013000300002

Variabilidad genética de Hartón del Valle mediante RAM
Provedor de dados: Acta Agronómica
Autores: Piedrahíta,Ana M; Posso,Andrés; Muñoz,Jaime E; Álvarez,Luz A.
El Hartón del Valle (HV) hace parte de las siete razas criollas de ganado bovino colombiano y de acuerdo con los criterios de la FAO está considerado como vulnerable. Para estudiar su variabilidad genética fueron muestreados 33 individuos HV y tres animales de la raza Holstein, como control externo. Se extrajo ADN utilizando el método de Salting Out y las muestras fueron analizadas mediante la técnica molecular RAM (Randon amplified microsatellites). Se utilizaron los cebadores CGA, CCA, TG, y CT. El valor promedio de heterocigosidad esperada fue de 0.26 y el F ST fue 0.39 ± 0.03. Con el índice de Dice-Nei Li y agrupando con el método UPGMA se distinguieron dos grupos: uno integrado por dos hatos de conservación y el otro por cuatro fincas que han...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Diversidad genética; Bovinos criollos; Microsatélites; Hartón del Valle; RAM.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122008000100011

Diversidad genética y contenido de carotenos totales en accesiones de yuca (Manihot esculenta Crantz)
Provedor de dados: Acta Agronómica
Autores: Morillo C.,Ana Cruz; Morillo C.,Yacenia; Fregene,Martín; Ramírez,Hernando; Chávez,Alba Lucía; Sánchez,Teresa; Morante,Nelson; Ceballos L,Hernán.
La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un arbusto perenne cultivado en África, América Latina y el Sureste asiático, cuya raíz constituye una fuente importante de energía en la dieta humana en países tropicales. Los carotenoides son pigmentos naturales que se encuentran ampliamente distribuidos en la naturaleza. Se reconoce que aproximadamente cincuenta de ellos tienen actividad provitamina A, siendo b-caroteno el de mayor eficiencia para su conversión en vitamina A. El estudio de la variabilidad genética es un procedimiento útil para fortificar, enriquecer o incrementar el contenido de nutrientes de los alimentos o cultivos, entre ellos los carotenos en raíz de yuca mediante procesos de selección y recombinación en programas de mejoramiento que permitan...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Calidad proteica; Carotenoides; Manihot esculenta; Microsatélites; Valor nutritivo; Variación genética; Yuca.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122011000200001

Análisis de segregación de marcadores moleculares en una población derivada de Coffea liberica Hiern x C. eugenioides L.
Provedor de dados: Acta Agronómica
Autores: López Gartner,Germán Ariel; Rutherford McCouch,Susan; Moncada Botero,María del Pilar.
El café es un cultivo importante para la economía mundial. La producción comercial de café se basa en dos especies, Coffea arabica L. (70%) y C. canephora Pierre (30%). La primera es la única alotetraploide (2n = 4x = 44) que tiene su centro primario de diversidad en las tierras altas del suroeste de Etiopía; la segunda es la única cultivada en Colombia y representa un importante valor económico y social. Sin embargo, C. arabica tiene una base genética muy estrecha y por ello es importante el uso de especies diploides en el mejoramiento del café para ampliar su diversidad. En este trabajo fueron evaluados los patrones de segregación genética en una población consistente en 101 plantas híbridas F1 de un cruce entre la especie diploide C. liberica y C....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Café; Microsatélites; Distorsión de segregación.
Ano: 2014
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122014000200008

Evidencia molecular de diferenciación genética e introgresión entre razas de fríjol común del acervo andino
Provedor de dados: Acta Agronómica
Autores: Blair,Matthew W.; Díaz S,Juan M.; Duque,Myriam C.; Hidalgo,Rigoberto.
Se utilizó la información generada por 29 microsatélites en 63 accesiones del acervo andino de P. vulgaris para elaborar agrupamientos y calcular índices de prevalencia. Las accesiones formaron grupos que correspondieron a las razas Nueva Granada, Chile y Perú. Se determinó la existencia de notoria introgresión en genotipos de las razas Chile y Perú
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris L.; Acervo genético; Introgresión; Índice prevalencía; Diferenciación genética; Microsatélites.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122007000400002

DIVERSIDAD GENÉTICA DE POBLACIONES DE GUANÁBANA (Annona muricata L.) EN NAYARIT, MÉXICO MEDIANTE MARCADORES SSR Y SRAP.
Provedor de dados: Acta Biológica Colombiana
Autores: LIRA-ORTIZ,Rosalba; CORTÉS-CRUZ,Moisés Alberto; LÓPEZ-GUZMÁN,Graciela Guadalupe; PALOMINO-HERMOSILLO,Yolotzin Apatzingan; SANDOVAL-PADILLA,Isaac; OCHOA-JIMÉNEZ,Verónica Alhelí; SÁNCHEZ-HERRERA,Leticia Mónica; BALOIS-MORALES,Rosendo; BERUMEN-VARELA,Guillermo.
RESUMEN La guanábana (Annona muricata L.) es un cultivo de importancia económica para Nayarit, México. Los frutos han tenido una excelente aceptación en el mercado regional, dificultando su comercialización a lugares lejanos porque la producción es altamente perecedera, aunado a que los árboles de los huertos de guanábana son en su mayoría ecotipos o fenotipos sin ningún plan de mejoramiento genético. Debido a la falta de variedades comerciales y de un banco de germoplasma, es importante conocer la diversidad genética para identificar y seleccionar genotipos; una de las herramientas para este propósito es el uso de marcadores moleculares. El objetivo de esta investigación fue analizar la diversidad genética de guanábana de las principales zonas productoras...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Distancia genética; Microsatélites; Poblaciones; Polimorfismo.
Ano: 2022
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2022000100104

POLIMORFISMO DE MICROSATELITES EN INDIVIDUOS DE RAZAS DE BOVINO CRIOLLO COLOMBIANO
Provedor de dados: Acta Biológica Colombiana
Autores: ORTEGA TORRES,JANETH; GARCÍA,LUIS FERNANDO.
Se evaluó el polimorfismo de tres sistemas microsatelitales (BMS 527, BMS 4440 y BMS 2113) en 5 razas de ganado bovino criollo colombianas: ROM (Romosinuano), BON (Blanco Orejinegro), CAS (Casanareño), SM (San Martinero) CCC (Costeño con cuernos) y dos razas foráneas: Cebú y Holstein. Se encontraron 38 alelos en 105 individuos estudiados y se reportan alelos únicos para BON, ROM, CCC y CAS. La heterocigosidad esperada total incluidas las dos razas foráneas fue de 0.7228, mientras que la observada osciló entre 0.3511 y 0.7787. Se evidenció desequilibrio de Hardy- Weinberg para algunas razas en dos sistemas microsatélitales, resultado probable de efectos de selección a los cuales las razas criollas y foráneas han estado sujetas. El análisis de diversas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Microsatélites; Razas criollas; Polimorfismo.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2010000100015

Uso de Marcadores SSR para Identificación de Germoplasma de Papa en el Programa de Mejoramiento de INIA de Chile
Provedor de dados: Agricultura Técnica
Autores: Mathias R,Mónica; Sagredo D,Boris; Kalazich B,Julio.
Los marcadores moleculares basados en Secuencias Simples Repetidas (SSR) constituyen una herramienta altamente eficaz para la identificación de genotipos de papa (Solanum tuberosum L.) y pueden ser de gran utilidad en la conservación y manejo de germoplasma. Con el propósito de incorporar esta tecnología al Programa de Mejoramiento de Papa del Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA) de Chile, se evaluó un grupo de 26 marcadores SSR sobre una muestra de 71 genotipos de papa. Cada marcador se caracterizó según su número de alelos y sus respectivas combinaciones, calidad de lectura, contenido de información polimórfica (PIC) y poder discriminatorio (D). Del total sólo 21 marcadores SSR mostraron productos legibles con un número de alelos que varió...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Microsatélites; Huella digital de ADN.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072007000100001

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA DE SEGREGANTES IDENTIFICADOS CON MARCADORES DE MICROSATÉLITES, CON ÉNFASIS EN APIRENIA Y RESPUESTA A ÁCIDO GIBERÉLICO EN CRECIMIENTO DE BAYAS DE UVA
Provedor de dados: Agricultura Técnica
Autores: Barticevic R.,Margarita; Zavala M.,Kattina; De Felice,Simona; Valenzuela B.,Jorge; Muñoz Sch.,Carlos; Hinrichsen R.,Patricio.
En este artículo se reporta la caracterización de algunos cruzamientos de uva de mesa (Vitis vinifera L.) para los caracteres desarrollo de semilla, tamaño de bayas y respuesta al tratamiento con ácido giberélico (GA3) para crecimiento de baya. Para ello, se han usado segregantes de identidad conocida por cuanto se ha verificado su filiación en base a un conjunto de cinco marcadores de microsatélites heterocigotos en los progenitores, con los que se detectó entre 18 y 21% de autofertilización del cultivar madre, además de cerca de 3% de plantas que no coinciden genéticamente con ninguno de los progenitores. Los cruzamientos estudiados fueron Ruby Seedless x Sultanina, Ruby Seedless x Perlette y sus respectivos recíprocos (76 y 56 segregantes en producción,...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Vitis vinifera L.; Mejoramiento genético de uva de mesa; Filiación; Microsatélites; Apirenia; Ácido giberélico; Tamaño de bayas.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0365-28072004000100001

Caracterización genética de Manilkara zapota de Veracruz, México, con marcadores SSR
Provedor de dados: Agrociencia
Autores: González-Hernández,Dolores; García-Pérez,Eliseo; Guntin-Marey,Pablo.
Manilkara zapota, un fruto de las sapotáceas, es nativo de México y América Central y se cultiva en países tropicales. La variabilidad morfológica de la especie está documentada, pero la diversidad genética no se ha estudiado con marcadores moleculares co-dominantes. Los objetivos de este estudio fueron: 1) probar si los loci de microsatélites diseñados para Manilkara huberi pueden usarse para estudiar la variación genética en M. zapota, 2) conocer la variación de esta especie en ejemplares silvestres o aislados de plantaciones comerciales del estado de Veracruz, México y 3) identificar los individuos más contrastantes que puedan usarse en un programa de manejo a largo plazo. La variación genética se evaluó en 20 árboles adultos de diferentes regiones...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Manilkara zapota; Manilkara huberi; Árbol tropical; Recursos genéticos; Marcadores moleculares; Microsatélites.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952012000700003

EVALUACIÓN DE AMPLIFICACIÓN CRUZADA DE MICROSATÉLITES PARA ESTUDIOS DE GENÉTICA POBLACIONAL DEL CAZÓN ANTILLANO RHIZOPRIONODON POROSUS (CARCHARHINIDAE) EN EL CARIBE COLOMBIANO
Provedor de dados: Boletín de Investigaciones Marinas y Costeras (INVEMAR)
Autores: Almanza-Bernal,Mónica; Márquez,Edna J.; Chasqui,Luis.
El tiburón cazón antillano, Rhizoprionodon porosus, constituye un recurso importante para pesquerías artesanales de pequeña escala; es uno de los tiburones costeros más abundantes dentro de su ámbito de distribución y desempeña una importante función como depredador en los ecosistemas marino-costeros. Por sus hábitos costeros, la especie es susceptible de sufrir extracción intensiva, especialmente en estados juveniles. Para darle un manejo apropiado y conservar las poblaciones explotadas de R. porosus se necesita conocer la diversidad genética y la estructura de las poblaciones dentro de sus rangos de distribución. En este estudio se probó la habilidad de cebadores heterólogos desarrollados para otras especies de tiburones de la familia Carcharhinidae para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Estructura genética; Microsatélites; Amplificación cruzada; Rhizoprionodon; Carcharhinidae.
Ano: 2016
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0122-97612016000100003

AMPLIFICACIÓN CRUZADA DE MICROSATÉLITES PARA ESTUDIOS POBLACIONALES DE DOS ESPECIES DE CAMARÓN DEL GÉNERO LITOPENAEUS EN COLOMBIA
Provedor de dados: Boletín de Investigaciones Marinas y Costeras (INVEMAR)
Autores: Fresneda-Rodríguez,Adriana; Chasqui-Velasco,Luis; Alonso-Carvajal,David.
Los microsatélites son marcadores moleculares usados con frecuencia en estudios de genética de poblaciones, aunque su desarrollo es un proceso costoso y prolongado dada su elevada especificidad. Un método que permite ahorrar tiempo y dinero es la amplificación cruzada, que consiste en amplificar el ADN de una especie determinada (especie objetivo) utilizando cebadores que han sido diseñados para una especie diferente (especie fuente). Usando este método se evalúo la idoneidad de 15 loci microsatélites, desarrollados para las especies Litopenaeus setiferus y L. vannamei, para estudiar regiones microsatélites de L. schmitti y L. occidentalis. Cinco cebadores son adecuados para amplificar consistentemente microsatélites polimórficos en L. schmitti y cuatro en...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Amplificación cruzada; Marcadores moleculares; Litopenaeus schmitti; Litopenaeus occidentalis; Microsatélites.
Ano: 2013
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0122-97612013000100007

Comparación de protocolos de extracción de ADN con muestras de aleta y larva de peces: extracción modificada con cloruro de sodio
Provedor de dados: Ciencia e Investigación Agraria, Revista Latinoamericana en Ciencias de la Agricultura
Autores: Lopera-Barrero,Nelson M; Povh,Jayme A; Ribeiro,Ricardo P; Gomes,Patricia C; Jacometo,Carolina B; Silva Lopes,Tais da.
El uso de apropiados métodos de muestreo, tipo de tejido y la utilización de protocolos viables de extracción del ADN son aspectos críticos en estudios basados en PCR. Los métodos de extracción de ADN deben ser simples, reproducibles, económicos y no contaminantes. Este trabajo tuvo por objetivo comparar un protocolo modificado de extracción con sal común (NaCl) y un protocolo modificado de extracción con fenol-cloroformo para la obtención de ADN genómico en alta cantidad y calidad desde muestras de aleta y larva de pez (Brycon orbignyanus, Piaractus mesopotamicus, Oreochromis niloticus, Leporinus elongatus y Prochilodus lineatus). Las muestras aisladas de diferentes especies de peces usando la extracción con sal común permitieron obtener ADN de buena...
Tipo: Journal article
Palavras-chave: Amplificación por PCR; Estudios de peces; Investigación genética; Microsatélites; RAPD.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202008000100008