Consulta: subjectFacets:"Oryza glumaepatula"
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Data/hora: 09/06/2024 09:33:28

Genetic structure of Brazilian wild rice (Oryza glumaepatula Steud., Poaceae) populations analyzed using microsatellite markers
Provedor de dados: 74
Autores: Karasawa,Marines M.G.; Vencovsky,Roland; Silva,Cynthia M.; Zucchi,Maria Imaculada; Oliveira,Giancarlo C.X.; Veasey,Elizabeth A.
Knowledge of the genetic structure and diversity of natural populations is important in developing strategies for in situ and ex situ conservation. We used eight microsatellite loci to estimate genetic structure and investigate within and between population genetic variation in eleven Brazilian wild rice (Oryza glumaepatula) populations. The study showed the following genetic diversity parameters: average number of 3.1 alleles per locus; 77.3% polymorphic loci; 0.091 observed heterozygosity and 0.393 gene diversity. F-statistics detected by microsatellite loci were: F ST = 0.491 (and R ST = 0.608), F IS = 0.780 and F IT = 0.888. No population was in Hardy-Weinberg equilibrium. The estimated apparent outcrossing rate (0.143) indicated a predominance of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Conservation; Gene flow; Genetic diversity; Microsatellites; Oryza glumaepatula.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300017

Comparative linkage mapping of Oryza glumaepatula and Oryza sativa interspecific crosses based on microsatellite and expressed sequence tag markers
Provedor de dados: 74
Autores: Rangel,Priscila Nascimento; Brondani,Rosana Pereira Vianello; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes; Rangel,Paulo Hideo Nakano; Brondani,Claudio.
Molecular linkage maps representing the rice genome have been an important tool for breeding programs because they allow the elucidation of polygenic traits and are an efficient tool for monitoring wild introgressions in interspecific crosses. Common markers among rice genetic maps are important in defining the homology of chromosomes and the synteny between genomic target regions. We used 148 markers (expressed sequence tags, microsatellites and single nucleotide polymorphisms) to construct a molecular linkage map based on co-dominant markers for an interspecific backcross population using a wild rice (Oryza glumaepatula) from Brazil and performed a comparative analysis with other interspecific maps. The comparative analysis revealed a Spearman...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Comparative linkage map; Molecular markers; Oryza glumaepatula; Rice.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000400019

Estrutura genética de populações silvestres de Oryza glumaepatula em três biomas brasileiros utilizando marcadores microssatélites.
Provedor de dados: 14
Autores: BRONDANI, R. P. V.; RANGEL, P. H. N.; ZUCCHI, M. I.; MAGALHÃES, M. R.; BORBA, T. C. O.; VENCOVSKY, R.; BRONDANI, C.
Oryza glumaepatula, uma das 21 espécies silvestres do gênero Oryza, no qual está incluído o arroz cultivado (O. sativa), constitui uma valiosa fonte doadora de alelos favoráveis para características de interesse agronômico desta espécie. Diversas áreas de ocorrência natural de O. glumaepatula estão sob ameaça de devastação e, desta forma, a implementação de estratégias de conservação destes recursos genéticos a partir de estudos de genética de populações é de extrema relevância. Marcadores moleculares microssatélites, ou SSR, são uma ferramenta útil para investigar questões relacionadas ao sistema de cruzamento, fluxo gênico e estrutura genética das populações naturais de O. glumaepatula. Este trabalho objetivou caracterizar a variabilidade genética e...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Oryza glumaepatula; Silvestre; SSR; Variabilidade genética.; Arroz; Conservação; Marcador Molecular.
Ano: 2003
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/212641

Avaliação de genótipos de arroz oriundos de hibridação interespecífica entre Oryza sativa e Oryza glumaepatula, em várzea de Roraima.
Provedor de dados: 14
Autores: CORDEIRO, A. C. C.; RANGEL, P. H. N.; MEDEIROS, R. D. de.
É provável que a reduzida base genética das populações utilizadas nos programas de melhoramento de arroz no Brasil represente um dos fatores que contribuem para o estabelecimento de patamares de produtividade. Uma das opções para aumentar a variabilidade genética é a utilização de espécies silvestres que ocorrem no Brasil, como é o caso da O. glumaepatula que é entre as espécies conhecidas, a mais promissora para uso em hibridações interespecíficas, por ser autógama, diplóide e possuir genoma semelhante ao da espécie cultivada. O objetivo deste trabalho foi avaliar genótipos oriundos de hibridação interespecífica entre O. sativa x O. glumaepatula, nas condições de Roraima, visando indicar as de melhor performance para participar na formação de novas...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)
Palavras-chave: Oryza glumaepatula; Roraima; Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Hibridação.
Ano: 2009
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/878665

Genetic diversity of American wild rice species
Provedor de dados: 63
Autores: Veasey,Elizabeth Ann; Bressan,Eduardo de Andrade; Zucchi,Maria Imaculada; Vencovsky,Roland; Cardim,Daruska Cavalcante; Silva,Rainério Meireles da.
Studies on genetic diversity and genetic structure of natural populations are important in order to define strategies for in situ and ex situ conservation actions and for plant pre-breeding programs. Aiming to assess the genetic diversity and genetic structure of three wild American Oryza species with isozyme markers, 14 populations of the diploid O. glumaepatula (AglAgl), 11 populations of the tetraploid O. grandiglumis (CCDD) and five populations of the also tetraploid O. latifolia (CCDD) were studied. They were all originated from Rio Paraguay hydrographic basin and the Amazon. Four enzymes were used and they gave 40 polymorphic bands. The most polymorphic species was O. glumaepatula, followed by O. latifolia and O. grandiglumis. A cluster analysis with...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Oryza glumaepatula; O. latifolia; O. grandiglumis; Amazon; Genetic structure.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162011000400008

Elevada diversidade genética interpopulacional em Oryza glumaepatula Steud. (Poaceae) avaliada com microssatélites
Provedor de dados: 49
Autores: Silva,Cynthia Maria; Karasawa,Marines Marli Gniech; Vencovsky,Roland; Veasey,Elizabeth Ann.
Marcadores microssatélites foram usados para caracterizar a diversidade genética entre e dentro de sete populações naturais de Oryza glumaepaula. Seis dessas populações são originárias da bacia hidrográfica da Amazônia e uma do rio Paraguai no Pantanal Matogrossense. Utilizando sete locos de microssatélites, observou-se diversidade genética intrapopulacional média de 1,98 alelos por loco, 56,2% de locos polimórficos, Ho = 0,026 e He = 0,241. Elevada diferenciação interpopulacional foi observada pelo índice de fixação de Wright e pelo parâmetro de divergência de Slatkin (F ST = 0,715 e R ST = 0,595, respectivamente), bem como elevado nível de endogamia total (F IT = 0,963), em grande parte influenciada pelo sistema reprodutivo (F IS = 0,858). Verificou-se...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Diversidade genética; Estrutura genética; Oryza glumaepatula; Microssatélites; Sistema reprodutivo; Populações.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1676-06032007000200019

Caracterização agromorfológica interpopulacional em Oryza glumaepatula
Provedor de dados: 53
Autores: Rosa,Mariana Silva; Santos,Patrícia Pimentel dos; Veasey,Elizabeth Ann.
O gênero Oryza apresenta duas espécies cultivadas e 21 espécies silvestres, sendo quatro originárias da América do Sul e Central. Dentre essas, a única espécie diplóide é Oryza glumaepatula Steud., compatível em cruzamentos com a espécie cultivada O. sativa L. O objetivo deste trabalho foi caracterizar, por meio de caracteres agromorfológicos, oito populações de O. glumaepatula, coletadas em diferentes bacias hidrográficas brasileiras. O experimento foi realizado em casa de vegetação utilizando-se o delineamento em blocos ao acaso com oito tratamentos e seis repetições. Cada parcela foi constituída de quatro plantas, obtendo-se o total de 24 plantas por população. Foram avaliadas três características agronômicas e 18 características morfológicas. Os dados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Arroz silvestre; Caracterização morfológica; Caracterização agronômica; Diversidade genética; Oryza glumaepatula.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052006000100002

Assessing the genetic structure of Oryza glumaepatula populations with isozyme markers
Provedor de dados: 52
Autores: Veasey,Elizabeth Ann; Cardin,Daruska; Silva,Rainério Meireles; Bressan,Eduardo de Andrade; Vencovsky,Roland.
To assess the genetic diversity and genetic structure parameters, nine populations of Oryza glumaepatula from the Amazon biome, four from the Pantanal biome, and one collected at Rio Xingu, Mato Grosso, totaling 14 populations and 333 individuals were studied with isozyme markers. Six loci were evaluated showing a moderate allozyme variability (A = 1.21, P = 20.7%, Ho = 0.005, He = 0.060). The populations from the Pantanal biome showed higher diversity levels than the Amazon biome. High genetic differentiation among the populations, expected for self-fertilizing species, was observed (F ST=0.763), with lower differentiation found among the Pantanal populations (F ST=0.501). The average apparent outcrossing rate was higher for the Pantanal populations (t a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Genetic diversity; Isozymes; Oryza glumaepatula; Outcrossing rate; Populations.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132008000500001