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Genes diferencialmente expressos no músculo Longissimus dorsi de novilhos nelore divergentes para eficiência bruta. Repositório Alice
SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: RNA-seq; Eficiência alimentar.; Bos Indicus..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1054252
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Genome-enabled prediction of breeding values for feedlot average daily weight gain in nelore cattle. Repositório Alice
SOMAVILLA, A. L.; REGITANO, L. C. de A.; ROSA, G. J. M.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; COUTINHO, L. L.; MUNARI, D. P..
Nelore is the most economically important cattle breed in Brazil, and the use of genetically improved animals has contributed to increase beef production efficiency. The Brazilian beef feedlot industry has grown considerably in the last decade, so the selection of animals with higher growth rates on feedlot has become quite important. Genomic selection could be used to reduce generation intervals and improve the rate of genetic gains. The aim of this study was to evaluate the prediction of genomic estimated breeding values for average daily gain in 718 feedlot-finished Nelore steers. Analyses of three Bayesian model specifications (Bayesian GBLUP, BayesA, and BayesCπ) were performed with four genotype panels (Illumina BovineHD BeadChip, TagSNPs,...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genomic selection; Bos taurus indicus; Growth.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1070097
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Genome-wide distribution of allele-specific expression in Nelore steers muscle. Repositório Alice
SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; NICIURA, S. C. M.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O.; AFONSO, J.; CESAR, A. S. M; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
The difference between the allelic expression of a gene is known as allele-specific expression (ASE), and it is a common event in mammal?s transcriptome. ASE is named genomic imprinting when guided by epigenetics mechanisms regarding the allele parental origin.
Tipo: Separatas Palavras-chave: ASE; Allele-specific expression; Polimorfismo Genético; Melhoramento Genético Animal; Gene expression.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1100405
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Identificação de possíveis causas de expressão alelo-específica em músculo de novilhos da raça Nelore. Repositório Alice
MELO, A. L. de; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
A qualidade da carne é determinada pela cor da carne, cor da gordura, textura, marmoreio e maciez, sendo esta última o atributo mais valorizado pelos consumidores. A análise dessas características só pode ser feita após o abate do animal, o que dificulta e encarece o processo de avaliação da influência dos fatores ambientais e genéticos na qualidade da carne. De forma a facilitar o melhoramento genético desses animais, recomenda?se o uso de marcadores genéticos.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Novilho de Corte; Gado Nelore; Melhoramento Animal; Beef cattle; Beef quality.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096168
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Identification of genes associated with copper-deficient fatty acid increase in Nelore cattle. Repositório Alice
AFONSO, J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; SILVA, J. V. da; BUSS, C. E.; GROMBONI, C. F.; MOURAO, G. B.; NOGUEIRA, A. R. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Genome regulation.; Gene expression; Meat production..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079227
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Influência do sistema de cultivo e de manejo do solo na podridão de maçãs e severidade da ramulária do algodoeiro. Repositório Alice
PERINA, F. J.; BOGIANI, J. C.; SILVA, F. I. S. da; SOUZA, M. M. de; BORIN, A. L. D. C.; FERREIRA, A. C. de B..
A mancha-de-ramulária é a principal doença que acomete o algodoeiro nas regiões de cultivo do cerrado brasileiro, enquanto que o apodrecimento de maçãs consiste num dos fatores que mais limitam a produtividade do algodoeiro em safras agrícolas com ocorrência de chuvas na fase de abertura de capulhos. A monocultura de algodão é ainda, predominante na região do cerrado brasileiro. Este sistema leva à degradação física, química e biológica do solo, além de favorecer o desenvolvimento de doenças, pragas e plantas daninhas.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Ramularia areola; Apodrecimento; Algodão; Rotação de cultura; Plantio direto.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1042713
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Inovações em sistemas de criação de caprinos e ovinos: integração lavoura - pecuária - caatinga. Infoteca-e
ARAUJO, M. R. A. de; FARIAS, J. L. de S.; RAMOS, R.; SOUZA, M. M. de.
bitstream/item/55823/1/Folder-Inovacoes-em-sistemas.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Caprino; Ovino; Inovação; Criação.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/917619
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Iron content affects lipogenic gene expression in the muscle of nelore beef cattle. Repositório Alice
DINIZ, W. J. da S.; COUTINHO, L. L.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; GROMBONI, C. F.; NOGUEIRA, A. R. de A.; OLIVEIRA, P. S. N. de; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Iron (Fe) is an essential mineral for metabolism and plays a central role in a range of biochemical processes. Therefore, this study aimed to identify differentially expressed (DE) genes and metabolic pathways in Longissimus dorsi (LD) muscle from cattle with divergent iron content, as well as to investigate the likely role of these DE genes in biological processes underlying beef quality parameters. Samples for RNA extraction for sequencing and iron, copper, manganese, and zinc determination were collected from LD muscles at slaughter. Eight Nelore steers, with extreme genomic estimated breeding values for iron content (Fe-GEBV), were selected from a reference population of 373 animals. From the 49 annotated DE genes (FDR<0.05) found between the two...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Fisiologia esquelético muscular; Metabolismo lipídico; Gado Nelore; Ferro; Nellore.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1055127
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LDHB gene has allele-specific expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice
ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M..
Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti, ESALQ/USP; Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCar.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Residual feed intake; Differential expression.; Cattle; MicroRNA..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075647
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Liver DNA methylation profile in Nelore cattle extremes for feed efficiency. Repositório Alice
ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; DINIZ, W. J. S.; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. N. de; REGITANO, L. C. de A.; KOLTES, J. E.; NICIURA, S. C. M..
The production cost of cattle is high, especially the fraction related to animal nutrition. The increase in feed efficiency may provide increased efficiency in beef production, minimizing feed expenditures, methane gas emission and nitrogen excretion.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Feed efficiency; RRBS; Differential methylation; Beef production; Gado de Corte; Bovino; Gene expression regulation; Animal nutrition.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110134
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Muscle allele-specifc expression QTLs may afect meat quality traits in Bos indicus. Repositório Alice
BRUSCADIN, J. J.; SOUZA, M. M. de; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A..
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in transcript sequences showing allele-specifc expression (ASE SNPs) were previously identifed in the Longissimus thoracis muscle of a Nelore (Bos indicus) population consisting of 190 steers. Given that the allele-specifc expression pattern may result from cis-regulatory SNPs, called allele-specifc expression quantitative trait loci (aseQTLs), in this study, we searched for aseQTLs in a window of 1 Mb upstream and downstream from each ASE SNP. After this initial analysis, aiming to investigate variants with a potential regulatory role, we further screened our aseQTL data for sequence similarity with transcription factor binding sites and microRNA (miRNA) binding sites. These aseQTLs were overlapped with...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão gênica; Functional genomics; Regulação gênica; Polimorfismo de nucleotídeo único; Gene regulation; Animal biotechnology; Bos Indicus; Gado Nelore; Animal breeding; Gene expression; Genetic markers; Genetics; Genome; Genomics; Genotype; Single nucleotide polymorphism; Quantitative trait loci.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1131654
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Muscle allele-specific expression QTLs may affect meat quality traits in Bos indicus. Repositório Alice
BRUSCADIN, J. J.; SOUZA, M. M. de; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A..
Abstract. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in transcript sequences showing allele-specific expression (ASE SNPs) were previously identified in the Longissimus thoracis muscle of a Nelore (Bos indicus) population consisting of 190 steers. Given that the allele-specific expression pattern may result from cis-regulatory SNPs, called allele-specific expression quantitative trait loci (aseQTLs), in this study, we searched for aseQTLs in a window of 1 Mb upstream and downstream from each ASE SNP. After this initial analysis, aiming to investigate variants with a potential regulatory role, we further screened our aseQTL data for sequence similarity with transcription factor binding sites and microRNA (miRNA) binding sites. These aseQTLs were...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Loci de característica quantitativa; Expressão alélica; Imprint genômico; Allelic expression; Allele-specific expression; Gado Nelore; Bos Indicus; Single nucleotide polymorphism; Quantitative trait loci; Genomic imprinting.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1133623
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Ocorrência de parasitos gastrintestinais em matrizes caprinas durante período chuvoso em Quixadá-CE. Repositório Alice
OLIVEIRA, D. A. dos S.; NEVES, M. R. M. das; BRITO, R. L. L. de; SOUZA, M. M. de; ALBUQUERQUE, F. L.; VIEIRA, L. da S..
Resumo: O presente estudo teve como objetivo determinar a ocorrência de parasitos gastrintestinais de matrizes caprinas de propriedades rurais do município de Quixadá-CE, durante o período chuvoso. Foram realizadas coletas de fezes de 71 cabras, durante o mês de maio de 2013, em dez propriedades rurais distribuídas nos distritos de Cipó dos Anjos, Daniel de Queiroz, Tapuiará, Califórnia e Sede. Foram realizados exames parasitológicos de Contagem de Ovos por Gramas de Fezes (OPG) e cultura de larvas. As análises estatísticas foram realizadas pelo teste T de Student. A ocorrência de parasitos gastrintestinais em matrizes das dez propriedades de Quixadá, CE foi de 74,65% (53/71). A média geral de OPG para ovos do tipo Strongyloidea foi de 493 e do tipo...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: OPG; Strongyloidea; EPG; Helminthoses.; Caprino; Nematóide; Parasito de animal; Parasitose; Helminto gastrintestinal; Goats; Haemonchus; Nematode infections; Strongyloides; Gastrointestinal nematodes; Brazil..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/976706
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Períodos de interferência de plantas daninhas na cultura do sorgo sacarino. Repositório Alice
SILVA, C. da; SOUZA, M. M. de; FILIMBERTI, E. L.; VALE, W. G. do; TARDIN, F. D.; MAY, A.; SILVA, A. F. da.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: BRS 511; Competição; Períodos de controle.; Sorghum Bicolor..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/972712
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Putative genes involved in muscle functioning are differentially expressed in Nelore steers divergent for sodium and potassium concentration. Repositório Alice
AFONSO, J.; LINS, L. A.; CASSARO, E. G.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de O.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; SILVA, J. V. da; BUSS, C. E.; GROMBONI, C. F.; MOURAO, G. B.; NOGUEIRA, A. R. de A.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti, ESALQ/USP; Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCar.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Gene regulation; RNA-Seq.; Cattle; Minerals..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075625
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Relatório de viagem a Pernambuco, Rio Grande do Norte e Paraíba para detalhar aspectos do segmento de pesquisa e experimentação do POLONORDESTE. Infoteca-e
QUEIRÓZ, M. A. de; PEREIRA, J. R.; SOUZA, M. M. de.
Em Recife foi feita uma palestra por Manoel Abílio de Queiroz para' os técnicos do DAA (EX, PR) a convite do Dr. Milton Moreira de Souza e Grupo Regional do POLONORDESTE onde foram abordados todos os aspectos na nova metodologia que se pretende implementar no âmbito do POLONORDESTE.
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: POLONORDESTE; Relatório de viagem; Experimentação; Relatório; Pesquisa.
Ano: 1980 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/156452
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Relatório de viagem às unidades técnicas do POLONORDESTE do Maranhão, Piauí e Ceará. Infoteca-e
QUEIROZ, M. A. de; SOUZA, M. M. de; ALENCAR, D. G..
Notou-se que o trabalho de pesquisa orientado pelo IRAT está bem concebido e se ajusta muito bem às necessidades do POLONORDESTE.
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: POLONORDESTE; Relatório de viagem; Relatório.; Pesquisa..
Ano: 1980 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/156454
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Screening for Single Nucleotide polymorphisms in MYOD1 gene and its association with meat tenderness in cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; SOUZA, M. M. de; OLIVEIRA, P. S. N. de; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; TULLIO, R. R..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Nucleotide polymorphisms; MYOD1 gene.; Beef cattle; Meat tenderness..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908938
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Synechococcus elongatus as a model of photosynthetic bioreactor for expression of recombinant B-glucosidases. Repositório Alice
AZEVEDO, R.; LOPES, J. L.; SOUZA, M. M. de; QUIRINO, B. F.; JUNGMANN, L.; MARINS, L. F..
Background: The production of glucose from cellulose requires cellulases, which are obtained from decomposing microorganisms such as fungi and bacteria. Among the cellulases, &#946;-glucosidases convert cellobiose to glucose and have low concentration in commercial cocktails used for the production of second-generation (2G) ethanol. Genetic engineering can be used to produce recombinant &#946;-glucosidases, and cyanobacteria may be interesting bioreactors. These photosynthetic microorganisms can be cultured using CO2 emitted from the first-generation ethanol (1G) industry as a carbon source. In addition, vinasse, an effluent of 1G ethanol production, can be used as a source of nitrogen for cyanobacteria growth. Thus, photosynthetic bioreactors...
Tipo: Separatas Palavras-chave: PET system; Cellulases; Cyanobacteria; Genetic engineering.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1111615
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