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Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos (BDGF) para suporte a estudos de associação genômica ampla e seleção genômica em programas de melhoramento animal. Infoteca-e
HIGA, R. H.; OLIVEIRA, G. B. de..
Este documento complementa os trabalhos previamente desenvolvidos, apresentando um modelo de dados para armazenamento de dados de genótipos, fenótipos e pedigree de animais de interesse agropecuário para suporte tanto a experimentos de GWAS quanto a programas de melhoramento genético animal, Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos(BDGF).
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Melhoramento animal; Associação genômica; Genome-wide association studies; Genótipo; Fenótipo; Genotype; Phenotype; Genetic improvement.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022327
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Desenvolvimento de pacotes estatísticos em linguagem R para análise de associação genômica ampla baseada em conjuntos de genes. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Linguagem R; Associação genômica; Genome Wide Association Studies.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981924
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Disponibilização de análise de controle de qualidade em GWAS e seleção de SNPs para exclusão de paternidade na plataforma Galaxy. Repositório Alice
PIETROBON, T.; HIGA, R. H..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Plataforma Galaxy; Associação genômica; Genome wide association studies.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981932
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Genome-wide association study for femur-related traits in broilers. Repositório Alice
ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; SOLLERO, B. P.; SUREK, D.; MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Abstract: Due to the intense selection for heavier and faster growing broilers, metabolic disorders such as skeletal problems became a worldwide concern. Advances in genome-wide association study (GWAS) methodologies increased the possibility of elucidating the genetic architecture controlling bone integrity traits. Therefore, the aim of this study was to perform a GWAS to identify potential genetic markers and candidate genes associated with femur traits in a paternal broiler line developed by Embrapa. To this, three femur bone-related traits were evaluated in 1,433 chickens: dry matter (FDM), ash content (FAC) and breaking strength (FBS). Chickens were genotyped using the 600K Affymetrix® Axiom® HD panel. A total of 16 regions associated to FAC, being a...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Integridade óssea; Características do fêmur; Associação genômica; QTLs; Melhoramento Genético Animal; Frango de Corte; Formação Óssea; Fêmur; Animal genetic resources; Broiler chickens; Bone metabolism; Quantitative trait loci.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093205
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