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Avaliação da variabilidade do Grapevine leafroll-associated virus 1 e 3 por análise de seqüências de nucleotídeos e polimorfismo conformacional de fita simples Trop. Plant Pathol.
Fajardo,Thor V.M.; Eiras,Marcelo; Schenato,Paula G.; Nickel,Osmar; Kuhn,Gilmar B..
As principais espécies de vírus envolvidas na etiologia do enrolamento da folha da videira (Vitis spp.) são Grapevine leafroll-associated virus 1 e 3 (GLRaV-1 e -3). Neste estudo da variabilidade desses vírus, foram amplificados dois fragmentos de DNA (396 bp do GLRaV-1 e 602 bp do GLRaV-3) por RT-PCR, a partir de RNA total extraído de nervuras e pecíolos de videiras infetadas, utilizando-se dois pares de oligonucleotídeos. Os DNAs amplificados foram clonados e reamplificados, a partir dos clones recombinantes, e comparados quanto às diferenças conformacionais das fitas simples desnaturadas (SSCP). Foram observados dois padrões distintos de perfis eletroforéticos para cada vírus, tendo sido seqüenciado pelo menos um clone viral correspondente a cada...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Videira; Vitis; GLRaV-1; GLRaV-3; SSCP.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582005000200013
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Detecção de Closterovirus em videira e caracterização parcial de um isolado do Grapevine leafroll-associated virus 3 Trop. Plant Pathol.
FAJARDO,THOR V.M.; KUHN,GILMAR B.; EIRAS,MARCELO; NICKEL,OSMAR.
O enrolamento da folha da videira (Vitis spp.) é uma doença causada por até oito vírus, Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV) 1 a 8, sorologicamente distintos e associados ao floema de videiras infetadas. Neste trabalho, foram detectados GLRaV-1 e -3 por DAS-ELISA em 6,9 e 14,7% das amostras analisadas, respectivamente, e provenientes de duas importantes regiões vitícolas do Brasil (Serra Gaúcha e Vale do São Francisco). Os GLRaV-2, -5 e -7 não foram detectados. O GLRaV-3 também foi detectado por dot-ELISA e western blot, observando-se a provável proteína capsidial com cerca de 36 kDa. Um fragmento de 340 pb, compreendendo o terminal 3' do gene da polimerase viral de GLRaV-3, foi amplificado por PCR e seqüenciado. As seqüências de nucleotídeos e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Vitis; GLRaV-1; GLRaV-3; Sorologia; RT-PCR; RNA polimerase.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582002000100009
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Detecção e identificação molecular de vírus associados a videiras sintomáticas e assintomáticas Ciência Rural
Basso,Marcos Fernando; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Eiras,Marcelo; Ayub,Ricardo Antônio; Nickel,Osmar.
A propagação vegetativa da videira favorece infecções virais múltiplas, com expressão diferencial de sintomas em função da combinação da cultivar ou espécie da hospedeira com a espécie viral. Os objetivos deste trabalho foram detectar e identificar as espécies virais presentes em duas espécies/cultivares de videira: uma sintomática e outra assintomática. DsRNA de ambas as amostras foi submetido à RT-PCR com 17 pares de oligonucleotídeos específicos para a detecção de Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine fanleaf virus (GFLV), Arabis mosaic virus (ArMV), Grapevine chrome mosaic virus (GCMV), Rupestris stem pitting-associated virus (RSPaV), Grapevine leafroll-associated virus 1 a 4...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: RSPaV; GLRaV-2; GLRaV-3; Vitis; Diagnose; Variabilidade.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010001100001
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Embrapa vai produzir mudas de videiras livres de vírus Infoteca-e
MELO, N. F. de.
A infecção de plantas por vírus é um dos problemas mais sérios que afetam a produtividade dos parreirais nos quatro cantos do planeta. Responsável por perdas que podem chegar a 100%, preocupa agricultores e pesquisadores de especialidades e de lugares diversos. No Submédia do Vale do rio São Francisco, a Embrapa Semiárido e a Cooperativa Agrícola de Juazeiro (CAJ) firmaram convênio para contornar esse problema, produzindo mudas isentas desses microrganismos. Análises recentes feitas em variedades
Tipo: Artigo na mídia Palavras-chave: Uvas sem sementes; Thompson; Superior; Crimson Seedless; GLRaV-3; Enrolamento das folhas; Uva; Doença; Virus; Biotecnologia; Muda; Grapes.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1059076
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Expression of Grapevine leafroll-associated virus 3 coat protein gene in Escherichia coli and production of polyclonal antibodies Trop. Plant Pathol.
Fajardo,Thor V.M.; Barros,Danielle R.; Nickel,Osmar; Kuhn,Gilmar B.; Zerbini,F. Murilo.
Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3), the main viral species of the grapevine leafroll complex, causes yield and quality reduction in grapes (Vitis spp.). The coat protein gene was RT-PCR-amplified from total RNA extracted from infected grapevine leaves and the amplified fragment was cloned and completely sequenced. The fragment was subsequently subcloned into the pRSET-C expression vector. The recombinant plasmid was used to transform Escherichia coli BL21:DE3 and express the capsid protein. The coat protein, fused to a 6 His-tag, was purified by affinity chromatography using an Ni-NTA resin. The identity of the purified protein was confirmed by SDS-PAGE and Western blot. The in vitro-expressed protein was quantified and used for rabbit...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other Palavras-chave: Grapevine; GLRaV-3; Recombinant protein; Serology; Antibodies.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582007000600007
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Variability of the 3' terminal of the polymerase gene of Grapevine leafroll-associated virus 3 isolates from Vale do São Francisco, Brazil Trop. Plant Pathol.
Dianese,Érico de C.; Ramalho,Eduardo D.; Cerqueira,Daniela M.; Lopes,Daniela B.; Fajardo,Thor V.M.; Ferreira,Marisa A.S.V.; Martins,Cláudia R.F..
Many viral diseases, including leafroll, which is of great economic importance, affect grapevines (Vitis spp.). A complex of eight viruses [Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV) -1 to 8] is associated with this disease. The objective of this study was to compare the variability of the 3' terminal region of the polymerase gene of three isolates of GLRaV-3 (Grapevine leafroll-associated virus-3), from Submédio do Vale do Rio São Francisco (Petrolina-PE) with that of other isolates available at the GenBank, including an isolate from North America and another from Southern Brazil. The viral RNA was extracted from three infected ELISA reactive plants and a fragment of 340 bp was amplified, by RT-PCR, using primers that recognize that portion of the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: GLRaV-3; Vitis spp.; Ampelovirus; RNA dependent RNA polymerase.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582005000200012
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Variability of the coat protein gene of Grapevine leafroll-associated virus 3 in Brazil Trop. Plant Pathol.
Fajardo,Thor V.M.; Dianese,Érico C.; Eiras,Marcelo; Cerqueira,Daniela M.; Lopes,Daniela B.; Ferreira,Marisa A.S.V.; Martins,Cláudia R.F..
Leafroll is an economically important disease affecting grapevines (Vitis spp.). Nine serologically distinct viruses, Grapevine leafroll-associated virus-1 through 9, are associated with this disease. The present study describes the coat protein gene sequence of four GLRaV-3 isolates occurring in the São Francisco River basin, Northeastern Brazil. The viral RNA was extracted from GLRaV-3 ELISA-positive plants and the complete coat protein gene was amplified by RT-PCR. Sequences were generated automatically and compared to the complete coat protein sequence from North American (NY1) and Chinese (Dawanhong Nº2 and SL10) GLRaV-3 isolates. The four studied isolates, named Pet-1 through 4, showed deduced amino acid identities of 98-100% (Pet-1 through 3) and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Closteroviridae; Ampelovirus; GLRaV-3.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582007000400008
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Variation over time in the prevalences of three viruses of the grapevine leafroll complex in a commercial vineyard in south-central Chile Ciencia e Investigación Agraria
Mujica,María Valentina; Mora,Roxana; Rosales,Marlene; Sandoval,Claudio.
A vineyard in south-central Chile was surveyed during five growing seasons to analyze the increase over time in the number of plants infected with Grapevine leafroll-associated virus-1, -2 and -3. At the end of the study, GLRaV-3 was found to be the most prevalent virus, with 46% of plants infected by this pathogen. GLRaV-2 infected 13% of plants, and GLRaV-1 infected 12%. Considering all three viruses together, the prevalence of infection increased exponentially from 14% of the plants at the beginning of the study period to 68% at the end. The patterns of the spread of GLRaV-2 and GLRaV-3 were mostly along the rows, whereas the pattern of spread for GLRaV-1 could not be determined.
Tipo: Journal article Palavras-chave: Field transmission; Grapevine leafroll-associated virus; GLRaV-1; GLRaV-2; GLRaV-3; Virus diagnosis.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202013000100012
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