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Construction of gene networks for growth traits and genetic profiling of Nelore beef cattle of Brazil Repositório Alice
MUDADU, M. de A.; PORTO-NETO, L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Nelore; Genome Wide Association Studies; Gado Nelore; Nelore.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039990
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Estudo de associação genômica ampla para importantes características agronômicas em Coffea canephora. Repositório Alice
CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; VEIGA, A. D.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MARRACCINI, P.; VIEIRA JUNIOR, I. C.; BALESTRE, M.; ANDRADE, A. C..
RESUMO: O Estudo de Associação Genômica Ampla (Genome-Wide Association Studies ? GWAS) surgiu com o intuito de capturar o efeito de genes na determinação de determinada característica fenotípica. Para isso, os indivíduos selecionados são genotipados em escala genômica e fenotipados para as características de interesse e então, a partir de análises estatísticas entre os polimorfismos de DNA e a variação no fenótipo, os genes que controlam essas características podem ser identificados. Por se tratar de uma espécie perene e de ciclo longo, os programas de melhoramento genético convencional do cafeeiro são demorados (vários anos) e de custo elevado. A geração de cultivares superiores via melhoramento genético ainda lida com o desafio de agregar simultaneamente...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Nucleotídeo de polimorfismo único; Genome Wide Association Studies; Genetic diversity; Café; Coffea Canephora; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114202
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Desenvolvimento de pacotes estatísticos em linguagem R para análise de associação genômica ampla baseada em conjuntos de genes. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Linguagem R; Associação genômica; Genome Wide Association Studies.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981924
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Análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes: implementação em R. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
O objetivo deste trabalho é a criação de um pacote R (R CORE TEAM, 2014) que implemente quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS, considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Modelos mistos; Genome Wide Association Studies; Random forests; Mixed models; Single nucleotide polymorphisms.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009826
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