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Caracterização e diversidade genética de cultivares de morangueiro Horticultura Brasileira
Radmann,Elizete Beatriz; Bianchi,Valmor João; Oliveira,Roberto P. de; Fachinello,José Carlos.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genético-molecular, por marcadores RAPD, das dez principais cultivares de morangueiro utilizadas no País: Aromas, Bürkley, Camarosa, Campinas, Dover, Milsei-Tudla, Oso Grande, Santa Clara, Sweet Charlie e Vila Nova. O DNA foi extraído de folhas maduras, as análises RAPD foram realizadas com 26 primers e os produtos de amplificação separados por eletroforese. O coeficiente de Dice foi utilizado para estimar a similaridade genética entre as cultivares e o método UPGMA para gerar o fenograma por meio do NTSYS. Houve amplificação de fragmentos consistentes com 19 primers, tendo sido encontrado polimorfismo em 14. Dos 116 fragmentos gerados, 84 foram polimórficos. As cultivares foram classificadas em dois...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fragaria x ananassa Duch.; RAPD; Fingerprint; Marcador molecular.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362006000100017
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Caracterização e identificação de cultivares e seleções de pereiras através de marcadores RAPD Rev. Bras. Frutic.
SAWAZAKI,HAIKO ENOK; BARBOSA,WILSON; COLOMBO,CARLOS AUGUSTO.
Trinta e seis acessos de pereira representando diversas espécies, híbridos e seleções do banco de germoplasma do Instituto Agronômico (IAC) foram geneticamente caracterizados através de marcadores RAPD. Cada primer originou de 10 a 19 bandas, sendo que 26 deles forneceram 250 bandas polimórficas, de um total de 353. Os primers OPC02, OPC08, OPD02, OPD19, OPD20 e OPE06 revelaram bandas específicas para as peras orientais e OPA01, OPA11, OPC08, OPD04, OPD09 e OPD15 para as ocidentais. O dendograma obtido foi confirmado pela análise de coordenada principal, originando três principais agrupamentos: 1) Todas as pereiras lançadas pelo IAC, como 'Seleta', 'Triunfo', 'Primorosa', 'Tenra', IAC 16-41, 'Centenária', além de 'William's', 'Packham's Triumph', 'D'água',...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pyrus ssp; Pereira; Marcadores moleculares; RAPD; Germoplasma; Cultivares IAC; Pêra oriental; Pêra ocidental.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452002000200033
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Caracterização genética da ipeca (Psychotria ipecacuanha Stokes) por meio de marcadores RAPD. Repositório Alice
COSTA, M. R.; LAMEIRA, O. A.; DINIZ, I. G..
2003
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Ipeca; Divergência genética; Coleção de germoplasma; Poliformismo; RAPD.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/407275
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Caracterização genética de Brycon orbignyanus utilizando o sistema seminatural Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Lopera-Barrero,N.M.; Vargas,L.; Sirol,R.N.; Ribeiro,R.P.; Povh,J.A.; Mangolin,C.A..
Avaliou-se o efeito do sistema seminatural na diversidade genética de um estoque de Brycon orbignyanus, utilizado em programas de repovoamento, com o marcador molecular RAPD. Vinte e quatro reprodutores, 12 machos e 12 fêmeas e 95 larvas da progênie foram analisados. Os nove primers utilizados produziram 90 fragmentos, dos quais 94,4% foram polimórficos. Houve diferença significativa na frequência de 20 dos 90 fragmentos entre os reprodutores e sua progênie sem a presença de fragmentos exclusivos. O índice de diversidade genética de Shannon, a porcentagem de fragmentos polimórficos e a diversidade genética de Nei foram mais altos nos indivíduos da progênie. A similaridade genética foi maior nos indivíduos do estoque de reprodutores. A análise de variância...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Piracanjuba; Programa de repovoamento; RAPD; Similaridade genética; Variabilidade genética.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352010000100025
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Caracterização genética do pirarucu Arapaima gigas (Cuvier) (Teleostei, Osteoglossidae) da bacia Tocantins-Araguaia, Estado do Mato Grosso. Repositório Alice
MARQUES, D. K. S..
Os Osteoglossiformes são representados na América do Sul pelos gêneros Arapaima e Osteoglossum, que ocorrem particulamente na região Amazônica, nas bacias Amazônica e Tocantins-Araguaia. Os estudos genético neste grupo são praticamente inexistentes, evidenciando a necessidade de informações para programas de conservação. A espécie Arapaima gigas da bacia hidrográfica Tocantins-Araguaia apresentou um 2n=56 cromossomos, com fórmula cariotípica 28M/SM+28ST/ A. A marcação por nitrato de prata evidenciou uma RON simples localizada intersticialmente no braço curto do par três, confirmada pela hibridação fluorescente in situ com sonda de rDNA 18S, que evidenciou um polimorfismo de tamanhos nos sítios de RON. A heterocromatina constitutiva foi localizada na região...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: RAPD; Citogenética; Conservação; Peixe; Pirarucu; Arapaima; Fish.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/811765
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Caracterização molecular de cultivares de milheto (Pennisetum glaucum (L.) R. Br.) usando marcadores moleculares RAPD. Repositório Alice
VASCONCELOS, M. J. V.; MOREIRA, C.V.; NETTO, D. A. M..
1998
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Milheto; Marcador molecular; RAPD; Pennisetum glaucum; Pearl Millet.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/480667
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Caracterização molecular de isolados de Colletotrichum sublineolum por RAPD. Repositório Alice
GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; OLIVEIRA, M. T. S de; PETRILLO, C. P.; TINOCO, C. F. S.; CASELA, C. R..
2008
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Collletotrichum sublineolum; Diversidade molecular; Polimorfismo; RAPD; Antracnose.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/491229
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Caracterização molecular de uma população de Anthonomous grandis (Coleoptera :Curculionidae) utilizando marcadores moleculares RAPD. Infoteca-e
QUEIROZ, P. R.; MARTINS, E. S.; MONNERAT, R. G.; LIMA, L. H. C..
Indivíduos de uma população de A.grandis foram caracterizados geneticamente por meio da técnica de RAPD-PCR. Para isso foi desenvolvida uma metodologia para extração de DNA e testados diferentes primers. Os primers selecionados foram: OPA-03, OPA-04, OPA-10, OPA-11 e OPA-13. Foi encontrada alta variabilidade genética, apontada por um coeficiente de similaridade que variou de 35 a 90%.
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Anthonomous grandis; Insecta; RAPD; Caracterização molecular.
Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/187139
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Caracterizacao molecular e estabelecimento de colecao de trabalho de Stylosanthes macrocephala com base em marcadores RAPD. Infoteca-e
FALEIRO, F. G.; BARROS, A. M.; FALEIRO, A. S. G.; CORDEIRO, M. C. R.; KARIA, C. T.; GOMES, A. C.; ANDRADE, R. P..
0
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Marcador molecular; RAPD; Leguminosa forrageira; Variacao genetica; Biotecnologia; Biologia molecular; Genetic markers; Feed legumes; Genetic variation; Biotechnology; Molecular biology.
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/567912
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Caracterização morfológica e molecular de acessos de melancia Horticultura Brasileira
Silva,Maria Luciene da; Queiróz,Manoel Abílio de; Ferreira,Maria Aldete J da F; Buso,Gláucia SC.
Acessos de melancia do Banco de Germoplasma da Embrapa Semi-Árido, coletados a partir de sementes de polinização livre na Chapada Diamantina, em Irecê e em Vitória da Conquista, na Bahia, foram caracterizados através de descritores morfológicos e moleculares, adicionando-se ao grupo, como testemunha a cultivar Crimson Sweet. O experimento de campo, em blocos ao acaso com três repetições, foi conduzido na estação experimental da Embrapa Semi-Árido, em Petrolina-PE. Os dados obtidos foram submetidos à análise uni- e multivariada, com agrupamento pelo método de Tocher. Amostras de cinco a oito indivíduos de cada um dos 43 acessos avaliados, foram submetidas à análise molecular utilizando marcadores RAPD, obtidos através de seis primers. O polimorfismo...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Citrullus lanatus; Descritores morfológicos; Marcadores moleculares; RAPD; Germoplasma.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362006000400002
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Caracterização morfológica e molecular de genótipos de mangaba. Repositório Alice
SILVA, S. A.; CRUZ, E. M. de O.; REIS, R. V. dos; FERREIRA, C. F.; PASSOS, A. R..
O objetivo do trabalho foi verificar a divergência genética entre 25 genótipos de mangaba da região de Iramaia-Chapada Diamantina-Bahia, utilizando os marcadores morfológicos e os marcadores RAPD. As seguintes aferições foram realizadas nos frutos maduros: diâmetro longitudinal (DL) e transversal (DT), massas do fruto (MF), da semente (MS) e da polpa (MP), rendimento de polpa (%P) e a contagem do número de sementes (NS). Os caracteres químicos avaliados no fruto maduro foram: pH, acidez (Ac), sólidos solúveis totais (SST), ácido ascórbico (AA), açúcar total (ACT) açúcar redutor (ACR), açúcar não redutor (ACNR) e relação sólidos solúveis totais: acidez (SST/Ac). Para a amplificação, foram testados 51 random primers. Os resultados médios das aferições foram:...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: RAPD; Divergência genética; Mangaba; Hancornia speciosa.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/981151
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Caracterização morfológica e molecular de genótipos de mangaba Rev. Bras. Frutic.
Silva,Simone Alves; Cruz,Elizangela Mércia de Oliveira; Reis,Ronaldo Viana dos; Ferreira,Claudia Fortes; Passos,Adriana Rodrigues.
O objetivo do trabalho foi verificar a divergência genética entre 25 genótipos de mangaba da região de Iramaia-Chapada Diamantina-Bahia, utilizando os marcadores morfológicos e os marcadores RAPD. As seguintes aferições foram realizadas nos frutos maduros: diâmetro longitudinal (DL) e transversal (DT), massas do fruto (MF), da semente (MS) e da polpa (MP), rendimento de polpa (%P) e a contagem do número de sementes (NS). Os caracteres químicos avaliados no fruto maduro foram: pH, acidez (Ac), sólidos solúveis totais (SST), ácido ascórbico (AA), açúcar total (ACT) açúcar redutor (ACR), açúcar não redutor (ACNR) e relação sólidos solúveis totais: acidez (SST/Ac). Para a amplificação, foram testados 51 random primers. Os resultados médios das aferições foram:...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Hancornia speciosa Gomes; RAPD; Divergência genética.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452013000400021
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Caracterização morfológica e molecular de matrizes selecionadas da espécie de maracujazeiro silvestre Passiflora cincinnata. Repositório Alice
FONSECA, K. G. da; FALEIRO, F. G.; LIMA, H. C. de; ARAUJO, F. P. de; ARAYA, S.; COSTA, A. M..
Neste trabalho, objetivou-se realizar a caracterização morfológica e molecular de 12 matrizes selecionadas de P. cincinnata.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Passiflora cincinnata; Proteção de cultivares; Variabilidade genética; Descritores; ISSR; RAPD; Maracujá; Melhoramento genético; Marcador molecular; Passion fruit; Genetical enhancement; Molecular marker.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027415
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Caracterização morfológica e molecular de matrizes selecionadas da espécie de maracujazeiro silvestre Passiflora cincinnata. Repositório Alice
FONSECA, K. G. da; FALEIRO, F. G.; LIMA, H. C. de; ARAUJO, F. P. de; ARAYA, S.; COSTA, A. M..
Neste trabalho, objetivou-se realizar a caracterização morfológica e molecular de 12 matrizes selecionadas de P. cincinnata.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Passiflora cincinnata; Proteção de cultivares; Variabilidade genética; Descritores; ISSR; RAPD; Maracujá; Melhoramento genético; Marcador molecular; Passion fruit; Genetical enhancement; Molecular marker.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032906
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Caracterização por meio de RAPD de Helicoverpa armigera (HUBNER) (Lepidoptera, Noctuidae), proveniente de Burkina Faso. Infoteca-e
LIMA, L. H. C.; QUEIROZ, P. R.; OLIVEIRA, M. R. V. de..
Insetos-pragas pertencentes à Ordem Lepidoptera são em muitos casos destrutivos, cosmopolitas e polífagos. A identificação e diagnose correta de espécies dessa ordem são essenciais na elaboração de políticas públicas de sanidade vegetal. Helicoverpa armigera é uma das principais pragas polífagas das culturas agrícolas do mundo todo. Insetos provenientes de Burkina Faso, coletados em diferentes regiões e plantas hospedeiras foram caracterizados por meio de RAPD, no Laboratório de Biologia Molecular, da Estação Quarentenária de Germoplasma Vegetal - EQGV, da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Por se tratar de uma praga quarentenária para o Brasil, a manipulação das larvas para extração de DNA ocorreu em ambiente seguro já que a EQGV é uma estação...
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Helicoverpa armigera; Burkina Faso; RAPD; Identificação molecular.
Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/187219
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Caracterización de tilapia roja (Oreochromis sp.) con marcadores moleculares RAPD Acta Agron. (Palmira)
Torres Jaramillo,Julieta; Muñoz,Jaime Eduardo; Cárdenas,Heiber; álvarez,Luz ángela; Palacio,Juan Diego.
Se utilizó la técnica RAPD (amplificación al azar de ADN polimórfico) para el estudio de la diversidad genética de Oreochromis sp. (tilapia roja) en cinco piscícolas del Valle del Cauca (Colombia) y en la determinación del nivel de introgresión de las especies parentales Oreochromis mosambicus, O. niloticus y O. aureus. Se evaluaron 25 cebadores, ocho fueron polimórficos y se obtuvieron 109 bandas. Los valores de heterocigosidad esperada (0.196 a 0.256) y la estructura genética (Gst = 0.22) para Oreochromis sp. indicaron un elevado grado de polimorfismo y alta estructuración genética. Estos resultados fueron consistente con el Fst = 0.268 (P < 0.0001) dado por el Amova y el Gst = 0.040 del análisis de correspondencia múltiple. Los valores de similitud...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Oreochromis; Mosambicus; O niloticus; O aureus; Cichlidae; DNA fingerprinting; RAPD; Variación genética; Diferenciación de especies.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122010000200013
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Characteristics of random amplified polymorphic DNA markers discriminating Helianthus annuus inbred lines Inra
Teulat, B.; Zhang, Y.X..
Nous avons testé l’utilisation de marqueurs RAPD (random amplified polymorphic DNA) pour permettre la discrimination de lignées de tournesol cultivé Helianthus annuus. En testant 100 amorces décamères sur les ADN de 4 lignées, nous obtenons 40 amorces révélant un polymorphisme. Nous montrons qu’en sélectionnant les amorces donnant des signaux reproductibles on obtient 14 marqueurs RAPD permettant de caractériser des lignées de tournesol. L’étude moléculaire des fragments amplifiés montre que ces marqueurs sont de type «présence/absence» : un locus est caractérisé par une bande chez une lignée et l’absence de bande chez les autres lignées. Des expériences de Southern utilisant des fragments RAPD polymorphes comme sondes produisent des signaux d’hybridation...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: RAPD; RFLP; MARQUEUR GENETIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500019671048235&uri=/notices/prodinra1/2009/11/
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Characterization of DNA polymorphisms in Caryocar brasiliense (Camb.) in populations with and without thorn at the endocarp by RAPD markers Anais da ABC (AABC)
Londe,Luciana N.; Ueira-Vieira,Carlos; Kerr,Warwick E.; Bonetti,Ana Maria.
Caryocar brasiliense (pequi), is one of the main species at the biome of the Brazilian savannah due to its use in culinary, popular medicine, industry in general, and iron and steel industry. At São José do Xingu (MT), a tree of C. brasiliense without thorn at the endocarp was found, which enables the improvement of C. brasiliense not only for consumption but also to the high appreciation it already has. To detect the existing differences between the pequi with and without the thorn at the endocarp, RADP markers were used. The generated polymorphisms were cloned and sequenced in order to identify the sequences that are responsible for the fenotypical alteration. It was observed that the pequi without thorn is genetically isolated from the other populations...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Caryocar brasiliense; Pequi; Thorn; RAPD.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652010000300024
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Characterization of fusion products from protoplasts of yeasts and their segregants by electrophoretic karyotyping and RAPD Rev. Microbiol.
Martins,Cleide Viviane Buzanello; Horii,Jorge; Pizzirani-Kleiner,Aline Aparecida.
In order to characterize fusion products from yeast protoplasts and their segregants, with important features to the wine making industry, electrophoretic karyotyping and RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) were utilized. Electrophoretic karyotyping was performed by the CHEF ("contour-clamped homogeneous electric field electrophoresis") method, which allowed the detection of chromosomal band complementation in fusion products and the presence of patterns of both parental and intermediary strains in segregants. By utilizing two primers, an amplification pattern of DNA fragments was obtained. While fusion products (diploid) showed a pattern of complementary bands, segregants showed bands of either parental strains or even intermediary bands
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Protoplast fusion; Electrophoretic karyotyping; RAPD.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37141999000100014
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Characterization of Nomuraea rileyi strains using polymorphic DNA, virulence and enzyme activity BABT
Vargas,Lúcia Rosane Bertholdo; Rossato,Marcelo; Ribeiro,Rute Terezinha da Silva; Barros,Neiva Monteiro de.
The characterization of entomopathogenic microorganisms is important for the selection of more effective strains for use in integrated pest-control programs. Five Nomuraea rileyi strains (SA86101, GU87401, SR86151, CG128 and VA9101) were characterized using random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis, virulence studies and assessment of chitinolytic and proteolytic activity. RAPD analysis divided the strains into two groups with a similarity coefficient of 0,76%, group 1 consisting of strains SA86101, GU87401 and SR86151 and group 2 of strains CG128 and VA9101. The LT50 varied from 165h with strain VA9101 to 246h with strain GU87401. Chitinolytic and proteolytic activity of the fungi after 144h growth in minimal medium were tested using colloidal...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Nomuraea rileyi; Anticarsia gemmatalis; Chitinase; Protease; RAPD; Virulence.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132003000100003
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