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Diversidade genética entre acessos de Jatropha sp. Repositório Alice
OLIVEIRA, A. dos S.; GOIS, I. B.; SILVA-MANN, R.; BOARI, A. de J.; FRAGA, A. C..
Uma das formas de identificação rápida de genótipos para composição de um banco de germoplasma é por meio da técnica de marcadores isoenzimáticos e moleculares. Com o objetivo de avaliar a variabilidade genética de acessos de Jatropha sp. Utilizou-se a técnica de marcadores isoenzimáticos e moleculares tipo RAPD. Foram utilizados 14 acessos de pinhão manso de diferentes origens, coletadas folhas jovens e procedido a extração (Isoenzimas) e purificação do DNA (RAPD). Para as isoenzimas a revelação foi feita para os sistemas enzimáticos álcool desidrogenase (ADH), esterase (EST), glutamato oxaloacetato transaminase (GOT) e peroxidase (PO), e na amplificação do DNA foram utilizados 14 oligonucleotídeos, sendo os produtos de amplificação separados em gel de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Similaridade genética; Isoenzimas; RAPD.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/957317
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Diversidade genética entre plantas sexuais de Panicum maximum Jacq. acessada por marcadores RAPD. Infoteca-e
MELLO, R. C. B. P. de.; JANK, L.; CHIARI, L.; ZORZATOO, C.; ZAGO, J. P.; BLUMA-MARQUES, A. C..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética entre plantas sexuais tetraploides de Panicum maximum do banco de germoplasma da Embrapa Gado de Corte, utilizando a técnica de polimorfismos de DNA amplificados ao acaso (RAPD). Quatroze plantas foram avaliadas com 17 primers. A similaridade genética foi calculada usando o coeficiente de Jaccard e o agrupamento foi feito pelo método de médias aritméticas dos pares de grupos não-balanceados (UPGMA) com base nas dissimilaridades. Uma análise de bootstrap foi feita para avaliar a consistência dos grupos formados. Um total de 145 bandas de DNA foi obtido, sendo que 128 (~88,3%) delas foram polimórficas entre as plantas estudadas. Os valores de similaridade variaram de 0,34 a 0,69. Quatro grupos...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Pastagem; Melhoramento genético vegetal; Gramínea forrageira; Panicum maximum; Marcador molecular; RAPD.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941837
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Diversidade genética entre três linhagens de codorna selecionadas para produção de ovos Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Prioli,R.A.; Gasparino,E.; Soares,M.A.M.; Marques,D.S.; Blanck,D.V.; Prioli,S.M.A..
A diversidade genética entre três linhagens de codorna (Coturnix japônica) foi avaliada utilizando-se a técnica de random amplified polymorphic DNA (RAPD). As linhagens selecionadas para produção de ovos foram identificadas como amarela, azul e vermelha por meio de anilhas no pé esquerdo. Seis primers de RAPD amplificaram 55 loci, os quais geraram padrão de bandas intensa e reproduzível em gel de agarose. Os resultados indicaram polimorfismos dentro e entre as linhagens. A similaridade de Jaccard média e o índice de diversidade Shannon revelaram alta diversidade dentro das linhagens de codornas. O teste de Mantel por meio do algoritmo unweighted pair-group method using arithmetic average (UPGMA) e a dispersão de coordenadas principais indicaram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Codorna; Coturnix japonica; Diversidade genética; RAPD.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352010000300030
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Diversidade genética molecular entre cultivares e híbridos de Brachiaria spp. e Panicum maximum Ciência Rural
Almeida,Mariana Castro da Costa; Chiari,Lucimara; Jank,Liana; Valle,Cacilda Borges do.
A utilização de marcadores moleculares pode servir para direcionar cruzamentos, confirmar novos híbridos e identificar genótipos para fins comerciais. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética entre cultivares e híbridos de Brachiaria spp. e Panicum maximum usando marcadores moleculares do tipo RAPD (Polimorfismos de DNA amplificados ao acaso). Foram 22 genótipos analisados com 10 primers, os quais amplificaram 178 fragmentos polimórficos de DNA, que foram usados para estimar a similaridade genética por meio do coeficiente de Jaccard. Os valores de similaridade obtidos variaram de 0,066 a 0,841. A estrutura genética entre todos os genótipos estudados foi estimada pelo método UPGMA (Método de agrupamento com médias...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Brachiaria spp.; Forrageiras; Marcadores moleculares; Panicum maximum; RAPD.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011001100024
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Diversidade genética por marcadores moleculares em Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Estado de Santa Catarina Ciência Rural
Silva,Cristiane Maria da; Hinz,Robert Harri; Stadnik,Marciel João; Pereira,Adriana; Tcacenco,Fernando Adami.
O mal-do-panamá, causado por Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC), é um dos principais problemas fitossanitários da bananicultura. O uso de cultivares resistentes é o método preferencialmente recomendado para o seu controle, sendo a avaliação da diversidade genética do patógeno necessária no desenvolvimento de estratégias de manejo da doença a longo prazo. Assim, este trabalho teve como objetivo estudar a variabilidade genética de isolados de FOC por marcadores moleculares RAPD e SSR. Foram avaliados 64 isolados coletados em regiões produtoras do estado de Santa Catarina, sendo que 100% deles foram patogênicos à bananeira da cv. 'Enxerto'. As análises de conglomerados com esses marcadores revelaram variabilidade entre os isolados amostrados. As técnicas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Banana; Doença; Fungo; RAPD; SSR.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010001200007
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Diversity of Meloidogyne incognita populations from cotton and aggressiveness to Gossypium spp. accessions. Repositório Alice
LOPES, C. M. L.; CARES, J. E.; PERINA, F. J.; NASCIMENTO, G. F.; MENDONÇA, J. S. F.; MOITA, A. W.; CASTAGNONE-SERENO, P.; CARNEIRO, R. M. D. G..
bitstream/item/195765/1/Lopes-et-al-2019-Plant-Pathology.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: AFLP; RAPD; Resistance; RKN management; Gossypium spp; Pathogenicity.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108178
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Diversity of Meloidogyne spp. from peri-urban areas of sub-Saharan Africa and their genetic similarity with populations from the Latin America. Repositório Alice
SANTOS, M. F. A. dos; MATTOS, V. da S.; MONTEIRO, J. M. S.; ALMEIDA, M. R. A.; JORGE JÚNIOR, A. S.; CARES, J. E.; CASTAGNONE-SERENO, P.; COYNE, D.; CARNEIRO, R. M. D. G..
bitstream/item/192497/1/1-s2.0-S0885576518301681-main.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Esterase phenotypes; SCAR markers; RAPD; Cryptic species; Species identification.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105805
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Diversity of Meloidogyne spp. on Musa in Martinique, Guadeloupe, and French Guiana. Repositório Alice
COFCEWICZ, E. T.; CARNEIRO, R. M. D. G.; RANDING, O.; CHABRIER, C.; QUÉNÉHERVÉ, P..
bitstream/item/177930/1/ID-26168-1.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Identificação bioquímica; RAPD; Banana; Eletroforese; Meloidogyne spp; Musa.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/186617
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DNA polymorphism and total protein in mutants of Metarhizium anisopliae var. Anisopliae (Metsch.) Sorokin strain E9 BJM
Freire,Laurineide Lopes de Carvalho; Costa,Ana Bolena Lima da; Góes,Larissa Brandão; Oliveira,Neiva Tinti de.
Five mutants (MaE10, MaE27, MaE24, MaE41 e MaE49) of Metarhizium anisopliae wild strain E9 were analysed for DNA profile through the RAPD technique and for changes in total protein content by spectrophotometry, polyacrylamide gel electrophoresis and densitometry. The pattern of RAPD markers showed genetic polymorphism among the strains: out of twenty primers seven were selected, producing 113 bands. Forty seven bands were present in all strains (41.6% of monomorphic bands) and 66 showed polymorphism (58.4%). The mean coefficient of similarity among all strains was 0.75 (75%). The total protein content varied, staining in the interval of 6.0-8.0 µg/µl. The electrophoresis analysis, through zymogram and protein fraction profiles by densitometry, allowed the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Metarhizium anisopliae; Mutants; RAPD; Total protein.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822001000200004
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Dois tipos de castanheiras-do-brasil? Verificação da classificação popular por meio de marcadores moleculares. Repositório Alice
SUJII, P. S.; BRAGA, E. T. M.; MARTINS, K.; CIAMPI, A. Y.; WADT, L. H. de O.; AZEVEDO, V. C. R..
2010
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bertholletia excelsa; RAPD; Bulked Segregant Analysis.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/862521
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Efficiency of RAPD and ISSR markers in assessing genetic variation in Arthrocnemum macrostachyum (Chenopodiaceae) BABT
Saleh,Basel.
The goal of this study was to investigate the molecular characterization of A. macrostachyum genotypes grown in the Western coast of Syria using RAPD and ISSR techniques. PCR amplifications with 20 RAPD primers gave an average of 9.25 selected markers/ primer, with a maximum of 17 (OPG05) and a minimum of four (OPA02). Percentage of polymorphic bands ranged from 40 to 100% according to RAPD primers tested. Among the 185 selected bands, 160 (84.96%) were polymorphic. The amplification with seven ISSR primers generated 88 bands, and 80 (90.91%) were polymorphic. (CA)8RG and (AG)8GTG ISSR primers tested in this study yielded highly informative patterns. RAPD and ISSR fragment sizes ranged from 0.2-3 kb. Based on this study, the use of RAPD and ISSR...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: A. macrostachyum; Genetic diversity; Genotype; ISSR; Polymorphism; RAPD.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132011000500002
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El picudo del algodonero en la Argentina: Principales resultados e implicancias de los estudios moleculares Rev. Soc. Entomol. Argent.
Lanteri,Analía A.; Confalonieri,Viviana A.; Scataglini,M. Amalia.
Después de diez años del primer registro del picudo del algodonero, Anthonomus grandis Boheman (Coleoptera, Curculionidae), en la Argentina, el insecto ha llegado a la zona algodonera del Chaco. Los estudios moleculares realizados sobre poblaciones de la Argentina, Brasil y Paraguay, y posibles poblaciones fuente de EE.UU y México, han aportado información relevante para el control de la plaga. Se aplicaron las técnicas de RAPD (Polimorfismos del ADN Amplificados al Azar) y de secuenciación de los genes mitocondriales de la Citocromo Oxidasa I y II, las cuales permitieron identificar dos linajes principales de picudos: a) linajes con escasa o nula variabilidad medida en términos de heterocigosis y diversidad haplotípica, considerados colonizadores...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Picudo del algodonero; ADN mitocondrial; RAPD; Argentina; Variabilidad poblacional; Linajes ancestrales y colonizadores recientes.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0373-56802003000200001
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Estimation of genetic distance among genotypes of caraway (Carum carvi L.) using RAPD-PCR Agronomy
Seidler-Łożykowska, Katarzyna; Institute of Natural Fibres and Medicinal Plants; Kuczyńska, Anetta; Polish Academy of Sciences; Mikołajczyk, Katarzyna; Plant Breeding and Acclimatization Institute; Nowakowska, Joanna; Plant Breeding and Acclimatization Institute; Bocianowski, Jan; Poznań University of Life Sciences.
In order to estimate genetic diversity among starting materials and breeding strains of caraway, a collection of 17 accessions from botanical gardens in Europe, two cultivars ‘Rekord’ and ‘Kończewicki’, and four own breeding strains were analyzed by RAPD-PCR. The representative samples, each of five individual plants of accession, cultivar or strain, were taken from young rosette leaves. Forty of Genset Oligos RAPD primers were used for analysis and eight of them produced clear and reproducible banding patterns. In total, 62 banding patterns were obtained revealing 23 polymorphic bands, whereas the number of polymorphic bands ranged from two to four for one primer. The GS12 and GS43 primers generated two polymorphic bands, while each of the GS8, GS21,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Carum carvi L.; Genetic distance; Genotype; RAPD.
Ano: 2014 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/18197
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Estimativa da taxa de cruzamento em Stylosanthes capitata usando marcadores RAPD. Repositório Alice
CHIARI, L.; RESENDE, R. M. S.; MATIDA, E.; ROBLES, C. S. A ..
2007
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético vegetal; Stylosanthes capitata; Estilosante; Marcador genético; RAPD; Plant breeding; Genetic markers.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/326275
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Estimativa da variabilidade genética em linhagens de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) com a técnica de RAPD - DOI: 10.4025/actascianimsci.v27i1.1236 Animal Sciences
Povh, Jayme Aparecido; UEM; Moreira, Héden Luiz Marque; Universidade Federal de Pelotas; Ribeiro, Ricardo Pereira; UEM; Prioli, Alberto José; UEM; Vargas, Lauro; UEM; Blanck, Danielly Veloso; UEM; Gasparino, Eliane; UEM; Streit Jr, Danilo Pedro; UEM.
A variabilidade genética é essencial para que se possa obter melhoramento genético e, portanto, é de grande importância a sua estimação. Desta forma, o objetivo do presente experimento foi estimar, pela técnica Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD), a divergência e a variabilidade genética nas linhagens de tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) Bouaké e Chitralada em duas gerações de reprodutores do rio Nilo. Foram utilizados 20 animais de cada linhagem. A matriz de coeficientes de similaridade de Jaccard entre indivíduos foi utilizada para a construção de um dendrograma e para a determinação, com o teste de Mantel, da divergência genética entre linhagens. A variabilidade genética foi estimada pelo índice de Shannon e pela porcentagem de loci...
Palavras-chave: 5.05.04.00-2 Reprodução Animal divergência genética; Melhoramento genético; Oreochromis niloticus; RAPD; Polimorfismo; Variabilidade genética 5.05.04.00-2 Reprodução Animal.
Ano: 2005 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAnimSci/article/view/1236
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Estrutura genética e sistema de acasalamento de Piper hispidinervum. Repositório Alice
WADT, L.H. de O.; KAGEYAMA, P.Y..
A pimenta-longa (Piper hispidinervum C. DC.) arbusto encontrado em áreas antropizadas no Estado do Acre, possui expressiva importância econômica decorrente da presença de safrol em seu óleo essencial. O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura genética e o sistema de acasalamento dessa espécie, utilizando marcadores RAPD (polimorfismo de DNA amplificado ao acaso). A diversidade genética entre e dentro de populações naturais foi avaliada em 13 populações do Vale do Rio Acre, distribuídas nas Regiões do Baixo e Alto Acre. A taxa preferencial de cruzamento foi estimada em 25 famílias de polinização livre de uma população do Município de Assis Brasil, Acre. A espécie apresentou diversidade genética estruturada no espaço segundo um padrão de isolamento...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pimenta; RAPD; Variação genética; Cruzamento; Pepper; Genetic variation; Crossbreeding.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/110077
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Estrutura genética e sistema de acasalamento de Piper hispidinervum PAB
Wadt,Lúcia Helena de Oliveira; Kageyama,Paulo Yoshio.
A pimenta-longa (Piper hispidinervum C. DC.) arbusto encontrado em áreas antropizadas no Estado do Acre, possui expressiva importância econômica decorrente da presença de safrol em seu óleo essencial. O objetivo deste trabalho foi avaliar a estrutura genética e o sistema de acasalamento dessa espécie, utilizando marcadores RAPD (polimorfismo de DNA amplificado ao acaso). A diversidade genética entre e dentro de populações naturais foi avaliada em 13 populações do Vale do Rio Acre, distribuídas nas Regiões do Baixo e Alto Acre. A taxa preferencial de cruzamento foi estimada em 25 famílias de polinização livre de uma população do Município de Assis Brasil, Acre. A espécie apresentou diversidade genética estruturada no espaço segundo um padrão de isolamento...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pimenta; RAPD; Variação genética; Cruzamento.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2004000200008
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Estrutura genética em populações naturais de Tibouchina papyrus (pau-papel) em áreas de campo rupestre no cerrado Rev. Bras. Bot.
Telles,Mariana Pires de Campos; Silva,Sandra Pereira da; Ramos,Juliana Rosa; Soares,Thannya Nascimento; Melo,Dayane Borges; Resende,Lucileide Vilela; Batista,Eliane cotrim; Vasconcellos,Breno de Faria.
O presente trabalho teve como objetivo utilizar marcadores RAPD para conhecer a variabilidade genética de populações de Tibouchina papyrus (Pohl) Toledo, provenientes da região de Serra Dourada e Serra dos Pirineus, no Estado de Goiás. Os seis iniciadores RAPD produziram um total de 147 locos, variando entre 23 e 26 por iniciador. A avaliação hierárquica da estruturação da variabilidade genética, realizada pela a AMOVA, considerando a existência de duas regiões (Serra dos Pirineus e Serra Dourada) apresentou uma estimativa de F ST = 0,3439. O valor do componente entre regiões (F CT) foi igual a 18,96% e a variação entre populações dentro de regiões igual a 15,43%. As estimativas de fluxo gênico sugerem a existência de uma baixa proporção de migrantes entre...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cerrado; RAPD; Tibouchina papyrus; Variabilidade genética.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042010000200010
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Estudo da diversidade genética de cultivares de sorgo (Sorghum bicolor (L.) Moench) selecionados para eficiência do uso de nitrogênio. Repositório Alice
VASCONCELOS, M. J. V.; MOREIRA, C. V.; SANTOS, F. G.; SCHAFFERT, R. E.; MARRIEL, I. E..
2006
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: RAPD; Nitrogênio; Distância genética.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/490244
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Estudo da variabilidade genética e escurecimento epidérmico em caqui 'Fuyu' (Diospyrus kaki) após armazenamento refrigerado Rev. Bras. Frutic.
Gonçalves,Emerson Dias; Trevisan,Renato; Silva,Jorge Adolfo; Rombaldi,Cesar Valmor.
O presente trabalho teve o objetivo de avaliar a ocorrência de escurecimento epidérmico no caqui cv. Fuyu e sua relação com variabilidade genética. O experimento foi realizado com folhas e frutas obtidas de cinco pomares comerciais, sendo quatro deles situados na região serrana do Rio Grande do Sul e um na região de Pelotas. A escolha dos pomares foi baseada na idade das plantas, entre cinco e oito anos, e ocorrência do escurecimento epidérmico das frutas. As plantas foram escolhidas ao acaso em cada pomar. Para avaliação de variabilidade genética, foi utilizada a técnica de RAPD. As frutas foram avaliadas quanto ao grau de escurecimento, após três meses de armazenamento. Para avaliar o escurecimento, foi usada uma escala de 0 a 5. Todos os locais...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: RAPD; Armazenamento; Qualidade.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-29452004000300045
Registros recuperados: 379
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