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Expressão gênica diferencial envolvida com condronecrose bacteriana com osteomielite em frangos de corte com 35 dias de idade. Repositório Alice
PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; JAENISCH, F. R. F.; GIACHETTO, P. F.; SETTLES, M. L.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
A incidência de problemas ósseos é considerada uma das principais preocupações para a indústria avícola devido a perdas econômicas significativas e ao impacto negativo no bem-estar. As vias metabólicas e os genes envolvidos nas patologias ósseas permanecem desconhecidos. A condronecrose bacteriana com osteomielite (CBO) é uma das principais doenças ligadas a problemas locomotores em frangos. Na tentativa de esclarecer os mecanismos genéticos envolvidos na manifestação da CBO, objetivou-se identificar os genes diferencialmente expressos no fêmur de frangos de corte normais e afetados por esta desordem, por meio da tecnologia de RNA-Seq. Neste estudo foram utilizados frangos de corte comerciais machos aos 35 dias de idade, sendo 4 normais e 4 com CBO...
Tipo: Separatas Palavras-chave: CBO; Genes diferencialmente expressos; GO; RNA Seq.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033043
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Integrative analysis between genome-wide association study and expression quantitative trait Loci reveals bovine muscle gene expression regulatory polymorphisms associated with intramuscular fat and backfat thickness. Repositório Alice
VIGNATO, B. S.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; MOREIRA, G. C. M.; POLETI, M. D.; PETRINI, J.; GARCIA, I. S.; CLEMENTE, L. G.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
Understanding the architecture of gene expression is fundamental to unravel the molecular mechanisms regulating complex traits in bovine, such as intramuscular fat content (IMF) and backfat thickness (BFT). These traits are economically important for the beef industry since they affect carcass and meat quality. Our main goal was to identify gene expression regulatory polymorphisms within genomic regions (QTL) associated with IMF and BFT in Nellore cattle. For that, we used RNA-Seq data from 193 Nellore steers to perform SNP calling analysis. Then, we combined the RNA-Seq SNP and a high-density SNP panel to obtain a new dataset for further genome-wide association analysis (GWAS), totaling 534,928 SNPs. GWAS was performed using the Bayes B model. Twenty-one...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Backfat thickness; Carcass and meat quality; Expression quantitative trait loci; Intramuscular fat content; RNA Seq; SNP; Nellore cattle; Nellore.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1145918
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Transcriptional profile of Herbaspirillum rubrisubalbicans in response of sugarcane apoplastic fluid. Repositório Alice
POLESE, V.; SILVA, P. R. A.; PESSOA, D. D. V.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I.; VIDAL, M. S..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Diazotrophic bacteria; Plant bacteria interaction; RNA Seq.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105472
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Whole transcriptome analysis of pectoralis major muscle reveals differences in calcium signaling pathway between white striping affected and unaffected broilers. Repositório Alice
MARCHESI, J. A. P.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; SETTLES, M. L.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: RNA Seq; Muscle disorder; Myopathy; Differentially expressed genes.; Gallus gallus..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033769
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