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GENCODE: Creating a Validated Manually Annotated Geneset for the Whole Human Genome Nature Precedings
A. Bignell; A. Frankish; B. Aken; M. Diekhans; F. Kokocinski; M. Lin; M. Tress; J. Van Baren; I. Barnes; T. Hunt; D. Carvalho-Silva; C. Davidson; S. Donaldson; J. Gilbert; E. Hart; M. Kay; R. Kinsella; D. Lloyd; J. Loveland; J. E. Mudge; C. Snow; J. Vamathevan; L. Wilming; M. Brent; M. Gerstein; R. Guigó; R. Harte; M. Kellis; S. Searle; J. Harrow; T. Hubbard.
The Human and Vertebrate Analysis and Annotation (HAVANA) group at the Wellcome Trust Sanger Institute produced the manually annotated geneset for the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) pilot project and, as part of the Gencode subgroup, are reprising this role in the scale up to cover the whole human genome. Our manual annotation is checked computationally and validated experimentally. Loci and transcripts predicted to be absent from the initial annotation are identified by comparison with a number of state-of-the-art algorithms for identifying exons, splice sites, transcripts and pseudogenes. Where novel features are confirmed the annotation is updated. Annotated coding transcripts are analysed to assess their coding potential by investigating...
Tipo: Poster Palavras-chave: Genetics & Genomics; Bioinformatics.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3155/version/1
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Avaliação dos teores de macronutrientes (N, P, K, Ca e Mg) em dejeto proveniente da bovinocultura de leite submetido à homogeneização Sci. Agrar.Paran. / SAP
A. C. Gonçalves Jr.; Unioeste; P. P. Pozza; Unioeste; L. D. Castilha; C. Selzlein; D. B. Lazzeri; H. Nacke.
O trabalho proposto teve por objetivo determinar o tempo necessário de homogeneização dos macronutrientes nitrogênio (N), fósforo (P), potásio (K), cálcio (Ca) e magnésio (Mg) nas diferentes profundidades do reservatório de dejetos de bovinos leiteiros. O estudo foi realizado no ano de 2005 na granja Schöne no Município de Marechal Cândido Rondon, PR. As amostras líquidas (48) foram coletadas em um reservatório de 120 m cúbicos, com quatro repetições, em diferentes profundidades e diferentes tempos de homogeneização. O delineamento experimental utilizado...
Tipo: Artigo Avaliado por Pares Palavras-chave: Homogeneizador; Reservatório de dejetos; Macronutrientes.
Ano: 2009 URL: http://e-revista.unioeste.br/index.php/scientiaagraria/article/view/2026
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Efeitos de sistemas de preparo nas propriedades físicas de um latossolo vermelho acriférrico cultivado com milho Sci. Agrar.Paran. / SAP
A. Carvalho Filho; FAFRAM – Ituverava; M. E.G. Silveira; Faculdade Dr. Francisco Maeda; R. P. Silva; FCAV – UNESP; J. W. Cortez; FCAV – UNESP; L. C.C. Carvalho; UFLA, Lavras - MG.
Este trabalho teve como objetivo comparar os efeitos de diferentes sistemas de preparo na resistência mecânica do solo à penetração e densidade de um Latossolo Vermelho acriférrico e seus efeitos na cultura do Milho (Zea mays L.). Os sistemas de preparo utilizados foram: plantio direto, escarificador, grade aradora, arado de aivecas, arado de discos e solo sem preparo(cerrado), formando um delineamento inteiramente casualizado (DIC) em esquema fatorial 6x4 (6 sistemas de preparo e 3 profundidades) com quatro repetições. Os resultados mostraram que a umidade do solo não interferiu na resistência mecânica à...
Tipo: Artigo Avaliado por Pares Palavras-chave: Densidade do solo; Compactação; Resistência mecânica à penetração.
Ano: 2009 URL: http://e-revista.unioeste.br/index.php/scientiaagraria/article/view/2038
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Microeconometrics using stata Buscador Latinoamericano
A. Colin Cameron; Pravin K. Trivedi; Cameron, A. Colin.
Tipo: Text Palavras-chave: STATA.
Ano: 2009 URL: http://www.flacso.org.ec/biblio/shared/biblio_view.php?bibid=111482&tab=opac&oai:flacso.org.ec:111482
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Variabilidade genética em famílias de meios-irmãos de milheto pérola semeadas na época da seca Sci. Agrar.Paran. / SAP
A. C.T. Costa; Unioeste; L. B. Oliveira; UFRRJ; M. B. Pereira; UFRRJ; M. G.F. Carmo; UFRRJ; C. Pimentel; UFRRJ.
No Brasil existe uma grande demanda por cultivares de milheto para a produção de biomassa e de grãos, pois atualmente há um número reduzido de cultivares disponíveis no mercado. Por isto, o objetivo desta pesquisa foi estudar a variabilidade genética dos caracteres produção de biomassa e de grãos, bem como de outros caracteres de importância agronômica, em uma população submetida a seleção entre famílias, no plantio da seca. Foram utilizadas famílias de meios-irmãos de um composto formado pelo cruzamento natural dos genótipos africanos HKP,...
Tipo: Artigo Avaliado por Pares Palavras-chave: Pennisetum glaucum; Herdabilidade; Progresso genético; Melhoramento vegetal.
Ano: 2009 URL: http://e-revista.unioeste.br/index.php/scientiaagraria/article/view/2056
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Invictus Buscador Latinoamericano
a film by Clint Eastwood; Eastwood, Clint.
Tipo: MovingImage Palavras-chave: CINE.
Ano: 2009 URL: http://www.flacso.org.ec/biblio/shared/biblio_view.php?bibid=134617&tab=opac&oai:flacso.org.ec:134617
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Rendimento de sementes produzidas na sucessão soja – milho safrinha na região noroeste do Paraná Sci. Agrar.Paran. / SAP
A. L. Braccini; UEM; L. P. Albrecht; UEM; M. R. Ávila; UEM; C. A. Scapim; UEM; M. C. Lana; Unioeste; A. Minuzzi; UEM; M. Stulp; UEM.
O trabalho foi conduzido no ano agrícola de 2001/02 com objetivo de avaliar a produtividade das sementes obtidas na sucessão soja precoce – milho safrinha, bem como comparar o rendimento das culturas semeadas fora da época convencional com o plantio na época recomendada, em Maringá – PR. Foram conduzidos ensaios com três cultivares precoces de soja (BRS 183, CD 207 e M-SOY 6101) e três híbridos, utilizando-se quatro repetições. A semeadura realizada em 15/10 e 15/11, para o milho e soja, respectivamente. Partindo-se do rendimento de sementes nas parcelas foram calculadas as produtividades em kg há, bem como o grau de...
Tipo: Artigo Avaliado por Pares Palavras-chave: Glycine max; Zea mays; Rendimento; Sucessão de culturas.
Ano: 2009 URL: http://e-revista.unioeste.br/index.php/scientiaagraria/article/view/2089
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Nutrição mineral de crisântemo de corte submetido a diferentes doses de lodo de esgoto e composto de lixo urbano Sci. Agrar.Paran. / SAP
A. M. Conte e Castro; Unioeste; C. S.F. Boaro; UNESP; João Domingos Rodrigues; UNESP.
O presente trabalho teve como objetivo avaliar doses crescentes de composto de lixo urbano (CLU) e lodo de esgoto (LE) na nutrição de plantas de crisântemo de corte. O experimento foi conduzido sob cultivo protegido em solo classificado como Latossolo Vermelho-Amarelo distroférrico. Adotou-se delineamento experimental em blocos ao acaso em esquema fatorial 2x4, onde foram utilizados dois resíduos: composto de lixo urbano e lodo de esgoto e quatro doses: 0, 10, 20 e 30 Mg ha-1, com 4 repetições. Foram avaliados massa seca, macro e micronutientes da parte aérea (folhas + hastes) e do sistema radicular. Os dados foram analisados pelo programa ESTAT. As...
Tipo: Artigo Avaliado por Pares Palavras-chave: Dendranthema grandiflora; Resíduos orgânicos; Nutrientes; Dendranthema grandiflora residues organics nutrient.
Ano: 2009 URL: http://e-revista.unioeste.br/index.php/scientiaagraria/article/view/2037
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BFO/DOLCE Primitive Relation Comparison Nature Precedings
A. Patrice Seyed.
This paper examines the primitive relations (dependence, quality, and constitution) of the BFO and DOLCE upper ontologies, employed in developing domain ontologies of the biomedical sciences. The strengths in both upper ontologies are examined, which sets a framework for developing a common upper ontology that utilizes the assets of both.
Tipo: Poster Palavras-chave: Bioinformatics.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3481/version/1
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Estabilidade de genótipos de feijoeiro cultivados em condições de safra das águas e da seca em Marechal Cândido Rondon - Pr. Sci. Agrar.Paran. / SAP
A. Richart; UEL; M. C. Lana; Unioeste; R. M. Del Águila; Embrapa; J. B. Duarte Jr.; O. J. Kuhn; Unioeste.
Este trabalho objetiva avaliar a estabilidade de genótipos de feijoeiro, cultivados em condições de safra das águas e da seca no município de Marechal Cândido Rondon, região Oeste do Estado do Paraná. O delineamento experimental utilizado em cada ambiente foi de blocos ao acaso, com quatro repetições e sete tratamentos (dois cultivares do tipo grão preto: FT-Nobre e IAC-Unã e cinco do tipo grão carioca: IAPAR-80, IAPAR-81, Pérola, Carioca e Rudá). Os resultados encontrados indicam que a maioria dos cultivares de feijoeiro, mostraram adaptação ampla na mudança de...
Tipo: Artigo Avaliado por Pares Palavras-chave: Estabilidade; Adaptabilidade; Cultivar; Feijão.
Ano: 2009 URL: http://e-revista.unioeste.br/index.php/scientiaagraria/article/view/2087
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The History, Development and Impact of Computed Imaging in Neurological Diagnosis and Neurosurgery: CT, MRI, and DTI Nature Precedings
Aaron G. Filler.
A steady series of advances in physics, mathematics, computers and clinical imaging science have progressively transformed diagnosis and treatment of neurological and neurosurgical disorders in the 115 years between the discovery of the X-ray and the advent of high resolution diffusion based functional MRI. The story of the progress in human terms, with its battles for priorities, forgotten advances, competing claims, public battles for Nobel Prizes, and patent priority litigations bring alive the human drama of this remarkable collective achievement in computed medical imaging.
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Biotechnology; Cancer; Neuroscience.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3267/version/1
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The History, Development and Impact of Computed Imaging in Neurological Diagnosis and Neurosurgery: CT, MRI, and DTI Nature Precedings
Aaron G. Filler.
A steady series of advances in physics, mathematics, computers and clinical imaging science have progressively transformed diagnosis and treatment of neurological and neurosurgical disorders in the 115 years between the discovery of the X-ray and the advent of high resolution diffusion based functional MRI. The story of the progress in human terms, with its battles for priorities, forgotten advances, competing claims, public battles for Nobel Prizes, and patent priority litigations bring alive the human drama of this remarkable collective achievement in computed medical imaging.
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Biotechnology; Cancer; Neuroscience.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3267/version/4
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The History, Development and Impact of Computed Imaging in Neurological Diagnosis and Neurosurgery: CT, MRI, and DTI Nature Precedings
Aaron G. Filler.
A steady series of advances in physics, mathematics, computers and clinical imaging science have progressively transformed diagnosis and treatment of neurological and neurosurgical disorders in the 115 years between the discovery of the X-ray and the advent of high resolution diffusion based functional MRI. The story of the progress in human terms, with its battles for priorities, forgotten advances, competing claims, public battles for Nobel Prizes, and patent priority litigations bring alive the human drama of this remarkable collective achievement in computed medical imaging.
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Biotechnology; Cancer; Neuroscience.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3267/version/5
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The History, Development and Impact of Computed Imaging in Neurological Diagnosis and Neurosurgery: CT, MRI, and DTI Nature Precedings
Aaron G. Filler.
A steady series of advances in physics, mathematics, computers and clinical imaging science have progressively transformed diagnosis and treatment of neurological and neurosurgical disorders in the 115 years between the discovery of the X-ray and the advent of high resolution diffusion based functional MRI. The story of the progress in human terms, with its battles for priorities, forgotten advances, competing claims, public battles for Nobel Prizes, and patent priority litigations bring alive the human drama of this remarkable collective achievement in computed medical imaging.
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Biotechnology; Cancer; Neuroscience.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3267/version/2
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MR Neurography and Diffusion Tensor Imaging: Origins, History & Clinical Impact Nature Precedings
Aaron G. Filler.
Objective – Methods were invented that made it possible to image peripheral nerves in the body and to image neural tracts in the brain. Over a 15 year period, these techniques – MR Neurography and Diffusion Tensor Imaging – were then deployed in the clinical and research community and applied to about 50,000 patients. Within this group, about 5,000 patients having MR Neurography were carefully tracked on a prospective basis.

Method – In the study group a uniform imaging methodology was applied and all images were reviewed and registered by referral source, clinical indication, efficacy of imaging and quality. Various classes of image findings were identified and subjected to a...
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Neuroscience.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/2877/version/1
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The History, Development and Impact of Computed Imaging in Neurological Diagnosis and Neurosurgery: CT, MRI, and DTI Nature Precedings
Aaron G. Filler.
A steady series of advances in physics, mathematics, computers and clinical imaging science have progressively transformed diagnosis and treatment of neurological and neurosurgical disorders in the 115 years between the discovery of the X-ray and the advent of high resolution diffusion based functional MRI. The story of the progress in human terms, with its battles for priorities, forgotten advances, competing claims, public battles for Nobel Prizes, and patent priority litigations bring alive the human drama of this remarkable collective achievement in computed medical imaging.
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Biotechnology; Cancer; Neuroscience.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/3267/version/3
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MR Neurography and Diffusion Tensor Imaging: Origins, History & Clinical Impact Nature Precedings
Aaron G. Filler.
Objective – Methods were invented that made it possible to image peripheral nerves in the body and to image neural tracts in the brain. Over a 15 year period, these techniques – MR Neurography and Diffusion Tensor Imaging – were then deployed in the clinical and research community and applied to about 50,000 patients. Within this group, about 5,000 patients having MR Neurography were carefully tracked on a prospective basis.

Method – In the study group a uniform imaging methodology was applied and all images were reviewed and registered by referral source, clinical indication, efficacy of imaging and quality. Various classes of image findings were identified and subjected to a...
Tipo: Manuscript Palavras-chave: Neuroscience.
Ano: 2009 URL: http://precedings.nature.com/documents/2877/version/2
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Shifting positionalities the local and international geo-politics of surveillance and policing Buscador Latinoamericano
Aaron Tobler.
Tipo: Text Palavras-chave: VIGILANCIA; SEGURIDAD NACIONAL; TERRORISMO; ESTADOS UNIDOS; REINO UNIDO.
Ano: 2009 URL: http://www.flacso.org.ec/biblio/shared/biblio_view.php?bibid=112089&tab=opac&oai:flacso.org.ec:112089
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Updating Geographic Distribution of Artemia urmiana GÜNTHER, 1890 (Branchiopoda: Anostraca) in Europe: An Integrated and Interdisciplinary Approach IBSS Repository
Abatzopoulos, Th. J.; Amat, F.; Baxevanis, A. D.; Belmonte, G.; Hontoria, F.; Maniatsi, S.; Moscatello, S.; Mura, G.; Shadrin, N. V..
Artemia urmiana (a species previously considered endemic of Lake Urmia, NW Iran) has been found in Lake Koyashskoe, a hypersaline lake on the Black Sea coast of the Crimean peninsula (Ukraine). Therefore, this is the first record of A. urmiana in Europe which updates its distribution. The species identification was based on an integrated and interdisciplinary approach using discriminant analysis of the morphometric characters, scanning electron microscopy, and molecular profile analysis. The data derived from the above mentioned approaches converge to significant similarity of the population under investigation with A. urmiana. The updated geographic distribution of the species, deriving from the present report, asks for additional contribution of other...
Tipo: Journal Contribution Palavras-chave: Salt lakes; Scanning electron microscopy; Discriminant analysis; Molecular analysis; Biogeography.
Ano: 2009 URL: http://repository.ibss.org.ua/dspace/handle/99011/1069
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A Comparative Histological Study of the Tongue of Rat (Rattus Norvegicus), Bat (Eidolon Helvum) and Pangolin (Manis Tricuspis) International Journal of Morphology
Abayomi,Taiwo A; Ofusori,David A; Ayoka,Oladele A; Odukoya,Samson A; Omotoso,Emmanuel O; Amegor,Frank O; Ajayi,Sunday A; Ojo,Gideon B; Oluwayinka,Oladele P.
This study assessed the micro anatomical differences in the tongue of rat, bat and pangolin with a view to establishing the functional anatomical differences of these mammalian tongues on their dietary pattern. Ten rats, ten bats and ten pangolins were used for this study. The animals were sacrificed and the tongue excised and processed for light microscopical study adopting the following stains: Haematoxylin Eosin, Verhoeff Gieson and Masson trichrome. The results showed non papillation of the keratinized stratified epithelium of pangolin tongue unlike the papillation seen in the tongue of the rat and bat. While the filiform papillation seen in the rat was bristle like, the filiform papillae in the bat were crown-like. There was also an unusual dense...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Rat; Bat; Pangolin; Tongue; Micro-anatomy.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-95022009000400026
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