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Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Repositório Alice
SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Differences between the expression of the two alleles of a gene are known as allele-specific expression (ASE), a common event in the transcriptome of mammals. Despite ASE being a source of phenotypic variation, its occurrence and effects on genetic prediction of economically relevant traits are still unexplored in bovines. Furthermore, as ASE events are likely driven by cis-regulatory mutations, scanning them throughout the bovine genome represents a significant step to elucidate the mechanisms underlying gene expression regulation. To address this question in a Bos indicus population, we built the ASE profile of the skeletal muscle tissue of 190 Nelore steers, using RNA sequencing data and SNPs genotypes from the Illumina BovineHD BeadChip (770 K bp)....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; Regulação da expressão gênica; Allelic expression; Allele-specific expression; Bos Indicus; Gene expression regulation.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125395
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Antioxidants on crioula breend ram semen cryopreservation. Repositório Alice
PRADIEÉ, J.; CARDOSO, T. F.; SILVA, E. F.; LAZZARI, J. C.; GONÇALVES, A. O.; MONDADORI, R. G.; PEGORARO, L. M. C.; LUCIA JUNIOR, T..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Semen.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/936111
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Associação entre variantes cis regulatórias do gene KCNJ11e características econômicas em bovinos Nelore. Repositório Alice
OLIVEIRA, K. S. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; REGITANO, L. C. de A..
Características de produção como eficiência alimentar e de qualidade da carne bovina são de suma importância para o agronegócio, agroindústria e consumidores. Assim, ferramentas biotecnológicas como a genômica podem adicionar informações para identificar potenciais biomarcadores com a finalidade de auxiliar os programas de melhoramento e seleção de bovinos de corte.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SNP; Expressão gênica; Sítio de ligação de fator de transcriçã0; Ilha CpG; Qualidade da carne; Bos Indicus.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115556
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Different media used for selection of competent swine oocytes with Brilliant cresyl blue staining. Repositório Alice
SANTOS, E. C. da S.; PRADIEÉ, J.; GONÇALVES, O. de A.; MADEIRA, E. M.; LAZZARI, J. C.; CARDOSO, T. F.; SCHIAVON, R. S.; PEGORARO, L. M. C.; MONDADORI, R. G.; VIEIRA, A. D.; LUCIA JR, T..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bovino.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/934501
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Effect of ß-Mercaptoetanol and cysteine on post-thawing quality and oxidative activity of ram sperm and on the viability of vitrified sheep embryos. Repositório Alice
PRADIEÉ, J.; CARDOSO, T. F.; SILVA, E. F.; GONÇALVES, A. O.; GASTAL, G. D. A.; ROSA, C. E.; MONDADORI, R. G.; PEGORARO, L. M. C.; VIEIRA, A. D.; LUCIA JUNIOR, T..
2016
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sheep embryos; Antioxidant; Reactive oxygen species; Frozen ram sperm; Vitrification.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1053502
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Influence of speerm processing on IVP of bovine embryos. Repositório Alice
GONÇALVES, A. O.; CARDOSO, T. F.; SILVA, E. F.; PRADIEÉ, J.; MADEIRA, E. M.; SANTOS, E. C. D S.; LAZZARI, J. C.; PEGORARO, L. M. C.; DINIZ, A..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Reprodução animal.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/935940
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Influência de diferentes gradientes de densidade na seleção espermática para a produção in vitro de embriões bovinos das raças angus e jersey. Repositório Alice
CARDOSO, T. F.; GONÇALVES, A. de O.; PRADIEÉ, J.; MADEIRA, E. M.; SANTOS, E. C. da S.; LAZZARI, J. C.; VIANNA, L. L.; VIEIRA, A. D.; PEGORARO, L. M. C..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bovinos.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/948880
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Percoll® e optiprep® como mini gradientes para seleção espermática no sistema de produção in vitro de embriões bovinos. Repositório Alice
GONÇÇALVES, A. de O.; CARDOSO, T. F.; PRADIEÉ, J.; MADEIRA, E. M.; SANTOS, E. S. da S.; LAZZARI, J. C.; VIEIRA, A. D.; PEGORARO, L. M. C..
2012
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Embriões.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/952292
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Potential biomarkers for feed efficiency-related traits in nelore cattle identified by co-expression network and integrative genomics analyses. Repositório Alice
LIMA, A. O. de; KOLTES, J. E.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; CESAR, A. S. M.; TIZIOTO, P. L.; AFONSO, J.; SOUZA, M. de S.; PETRINI, J.; ROCHA, M. I. P.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A..
Feed efficiency helps to reduce environmental impacts from livestock production, improving beef cattle profitability. We identified potential biomarkers (hub genes) for feed efficiency, by applying co-expression analysis in Longissimus thoracis RNA-Seq data from 180 Nelore steers. Six co-expression modules were associated with six feed efficiency-related traits (p-value ≤ 0.05). Within these modules, 391 hub genes were enriched for pathways as protein synthesis, muscle growth, and immune response. Trait-associated transcription factors (TFs) ELF1, ELK3, ETS1, FLI1, and TCF4, were identified with binding sites in at least one hub gene. Gene expression of CCDC80, FBLN5, SERPINF1, and OGN was associated with multiple feed efficiency-related traits...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Longissimus thoracis; Biomarcadores; Expressão gênica; Feed efficiency; Hub genes; Systems biology; WGCNA; Bos Indicus; Gene expression.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124356
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