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Desenvolvimento e validação de uma plataforma de genotipagem em larga escala para Coffea canéfora. Repositório Alice
CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C..
bitstream/item/206381/1/412-3112-1-PB.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: C canephora; SNP; Diversidade genética; DNA array; Genetic diversity.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116195
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Estudo de associação genômica ampla para importantes características agronômicas em Coffea canephora. Repositório Alice
CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; VEIGA, A. D.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MARRACCINI, P.; VIEIRA JUNIOR, I. C.; BALESTRE, M.; ANDRADE, A. C..
RESUMO: O Estudo de Associação Genômica Ampla (Genome-Wide Association Studies ? GWAS) surgiu com o intuito de capturar o efeito de genes na determinação de determinada característica fenotípica. Para isso, os indivíduos selecionados são genotipados em escala genômica e fenotipados para as características de interesse e então, a partir de análises estatísticas entre os polimorfismos de DNA e a variação no fenótipo, os genes que controlam essas características podem ser identificados. Por se tratar de uma espécie perene e de ciclo longo, os programas de melhoramento genético convencional do cafeeiro são demorados (vários anos) e de custo elevado. A geração de cultivares superiores via melhoramento genético ainda lida com o desafio de agregar simultaneamente...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Nucleotídeo de polimorfismo único; Genome Wide Association Studies; Genetic diversity; Café; Coffea Canephora; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114202
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Expressão alelo específica em Coffea canephora associados à resistência a nematoides. Repositório Alice
VALERIANO, J. C.; LIMA, E. A. de; AQUINO, S. O. de; CARNEIRO, F. de A.; CARNEIRO, W. W. de J.; MATTOS, N. G.; CARNEIRO, R. M. D. G.; ANDRADE, A. C..
bitstream/item/206383/1/417-2764-1-PB.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: RNAseq; Coffea Canephora; Meloidogyne.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116202
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Seleção de SNPs candidatos para a distinção de clones de Coffea canephora das variedades registradas e/ou protegidas no Brasil. Repositório Alice
MATTOS, N. G.; CARNEIRO, W. W. de J.; CARNEIRO, F. de A.; ANDRADE, A. C..
O café Conilon pertence à espécie Coffea canephora, uma planta diploide (2n = 2 × = 22), perene, alógama, com alta variabilidade genética. Por consequência, sua lavoura é proveniente de uma variedade clonal, onde as mudas são oriundas de um trabalho prévio de seleção de plantas matrizes, as quais apresentam as seguintes vantagens em relação à de sementes: menor custo de implementação, maior produtividade, maior uniformidade de maturação, melhor qualidade do grão, ciclo diferenciado de maturação e programação escalonada de colheita, proporcionando o sucesso na formação da lavoura.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Variedade clonal; Cafe conilon; MAF (Minor Allele Frequency); Coffea canephora; Clone; SNPs (single nucleotide polymorphism).
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084686
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Seleção genômica ampla no melhoramento de Coffea canephora. Repositório Alice
CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; VEIGA, A. D.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MARRACCINI, P.; VIEIRA JUNIOR, I. C.; BALESTRE, M.; ANDRADE, A. C..
Neste trabalho, um grande número de indivíduos e marcadores foram selecionados, para se avaliar a aplicabilidade da SGA em termos de resposta de seleção das características alvo e precisão da predição em uma população de C. canephora.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cafeeiro; Seleção Genômica Ampla; Valores genéticos genômicos; Polimorfismo de nucleotídeo único; Seleção genômica; Genomic Selection; DNA array; Coffea Canephora; Café; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114192
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