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Métodos e estratégias em proteômica e suas aplicações na área vegetal Ciência Rural
Salvato,Fernanda; Carvalho,Mayra Costa da Cruz Gallo de.
A implementação da espectrometria de massa (MS) para as análises de peptídeos (MS) e de aminoácidos (MS em tandem ou MS/MS) tornou possível a identificação de centenas de proteínas em experimentos únicos. Uma grande variedade de estratégias está disponível atualmente para o fracionamento e a purificação de amostras, a identificação de proteínas, a quantificação, a análise de modificações pós-traducionais (MPT's) e os estudos de interação. Dessa forma, a proteômica abre novas perspectivas na biologia de plantas com ênfase nos estudos de variabilidade genética, estresses fisiológicos e desenvolvimento de plantas.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Proteômica; Análise de proteínas; Interatômica; Plantas.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000300039
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New insights into Phakopsora pachyrhizi infection based on transcriptome analysis in planta Genet. Mol. Biol.
Rincão,Michelle Pires; Carvalho,Mayra Costa da Cruz Gallo de; Nascimento,Leandro Costa; Lopes-Caitar,Valéria S.; Carvalho,Kenia de; Darben,Luana M.; Yokoyama,Alessandra; Carazzolle,Marcelo Falsarella; Abdelnoor,Ricardo Vilela; Marcelino-Guimarães,Francismar Correa.
Abstract Asian soybean rust (ASR) is one of the most destructive diseases affecting soybeans. The causative agent of ASR, the fungus Phakopsora pachyrhizi, presents characteristics that make it difficult to study in vitro, limiting our knowledge of plant-pathogen dynamics. Therefore, this work used leaf lesion laser microdissection associated with deep sequencing to determine the pathogen transcriptome during compatible and incompatible interactions with soybean. The 36,350 generated unisequences provided an overview of the main genes and biological pathways that were active in the fungus during the infection cycle. We also identified the most expressed transcripts, including sequences similar to other fungal virulence and signaling proteins. Enriched P....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Asian soybean rust; Multigenic families; Transposable elements.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572018000400671
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Sequenciamento de DNA de nova geração e suas aplicações na genômica de plantas Ciência Rural
Carvalho,Mayra Costa da Cruz Gallo de; Silva,Danielle Cristina Gregorio da.
As plataformas de sequenciamento de nova geração são uma alternativa poderosa para estudos de genômica estrutural e funcional. Na genômica de plantas, os trabalhos com as novas plataformas têm sido destinados ao sequenciamento de transcritos, ressequenciamento ou sequenciamento de novo de genomas plastidiais. Neste trabalho, são detalhadas as tecnologias das plataformas mais utilizadas atualmente, bem como é revisada a aplicação dessas tecnologias na genômica estrutural e funcional de plantas.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Leituras curtas; Ressequenciamento; Sequenciamento de novo; Genômica estrutural de plantas; Transcritômica de plantas; Genômica funcional.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000300040
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