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Contribuição das raças charolês e nelore na acurácia de imputação de animais Canchim. Repositório Alice
DUARTE, I. N. H.; MAIA, R. de O. G.; MARCIANO, L E. A.; SANTOS, M. S.; BERNARDES, P. A.; BERRY, D.; REGITANO, L. C. de A.; BUZANSKAS, M. E..
A utilização de ferramentas genômicas na área do melhoramento genético animal tem como objetivo elevar os ganhos genéticos anuais por meio de intensificação na seleção de reprodutores de alto potencial genético e redução do intervalo de gerações, contribuindo para o aumento em produtividade. Painéis de marcadores moleculares do tipo SNP (?single nucleotide polymorphism?) com diferentes densidades são comumente utilizados em estudos genômicos e, por muitas vezes, o emprego de painéis de baixa densidade torna-se necessário para redução de custos na genotipagem de animais (2). O objetivo deste trabalho foi utilizar como população de referência as raças Nelore (NE) e Charolês (CH) para verificar a viabilidade de imputação na raça composta Canchim (CA) e o...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Gado Charolês; Gado Nelore; Gado Canchim; Marcador Molecular.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101194
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Cross-population selection signatures in Canchim composite beef cattle. Repositório Alice
ROCHA, I. M.; DUARTE, I. N. H.; BESSA, A. F. DE O.; ROLA, L. D.; BUZANSKAS, M. E.; GENUÍNO, M. V. H.; BERRY, D. P.; MUNARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A.; MARCONDES, C. R..
Analyses of livestock genomes have been used to detect selection signatures, which are genomic regions associated with traits under selection leading to a change in allele frequency. The objective of the present study was to characterize selection signatures in Canchim composite beef cattle using cross-population analyses with the founder Nelore and Charolais breeds. High-density single nucleotide polymorphism genotypes were available on 395 Canchim representing the target population, along with genotypes from 809 Nelore and 897 Charolais animals representing the reference populations. Most of the selection signatures were co-located with genes whose functions agree with the expectations of the breeding programs; these genes have previously been reported...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genome Wide Association; Positive selection; Target gene; Identification; Traits; Scan; Polymorphism; Animal stress.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1144244
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Estratégias de imputação em gado Canchim utilizando população de referência da raça Nelore. Repositório Alice
MARCIANO, L. E. A.; MAIA, R. de O. G.; SANTOS; DUARTE, I. N. H.; BERNARDES, P. A.; CHUD, T. C. S.; REGITANO, L. C. de A.; BUZANSKAS, M. E..
The use of genomic tools in animal breeding has been widely applied to improve productivity. Imputation methods could be used to reduce genotyping costs and increase the amount of genomic information, which are needed for various studies. The aim of this study was to consider the Canchim cattle (a composite beef breed) as target population and the Nelore breed as reference population to evaluate the imputation accuracy. A total of 285 Canchim, 114 MA genetic group and 814 Nelore animals were used in this study. Imputation was carried out using the FImpute software and genotype imputation accuracy was measured by concordance rate (CR) and allelic R square (R2). Five imputation scenarios were tested and CR results varied from 64.71% to 89.69%. The R2 varied...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Marcadores moleculares; Raça composta; Melhoramento Genético Animal; Reprodução Animal; Gado de Corte; Bovino; Animal breeding; Beef cattle.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110873
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