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	Provedor de dados Repositório Alice (35) Infoteca-e (5) Autor FORMIGHIERI, E. F. (40) ALVES, A. A. (15) SOUZA JUNIOR, M. T. (15) LEAO, A. P. (11) CAPDEVILLE, G. de (9) STEINDORFF, A. S. (9) ALMEIDA, J. R. M. de (6) VARGAS, L. H. G. (5) FERREIRA FILHO, J. A. (4) LIMA, R. S. (4) SOUZA, M. S. (4) BRITO, L. S. de (3) CAMPOS, T. de (3) CUNHA, R. N. V. da (3) KOBAYASHI, A. K. (3) MOLINARI, H. B. C. (3) OLIVEIRA, J. C. de (3) PEREIRA, V. M. (3) RIOS, S. de A. (3) SANTIAGO, T. R. (3) Mais... Palavra-chave American oil palm (4) Bioinformática (4) Melhoramento Genético Vegetal (4) Acre (3) Amazônia Ocidental (3) Amendoim forrageiro (3) Arachis pintoi (3) Banco de Germoplasma (3) Cacahuetes forrajeros (3) Forage legumes (3) Forage peanut (3) Leguminosa Forrageira (3) Leguminosas forrajeras (3) Western Amazon (3) Amazonia Occidental (2) Bioinformatics. (2) Brazilian Elaeis oleifera (2) Breeding and Genetic Improvement (2) Dendê (2) Diversidade genética (2) Mais... Tipo do documento Separatas (21) Artigo de periódico (6) Parte de livro (3) Anais e Proceedings de eventos (2) Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) (2) Comunicado Técnico (INFOTECA-E) (2) Teses (2) Documentos (INFOTECA-E) (1) Folders (1) Mais... Ano 2022 (1) 2021 (4) 2020 (3) 2019 (1) 2018 (2) 2017 (8) 2016 (4) 2015 (2) 2014 (2) 2012 (8) 2011 (3) 2006 (2) Mais... País Brazil (40) Idioma Inglês (21) Português (19)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 40 Primeira ... 1 2 ... Última A bioinformática na pesquisa de microrganismos. Infoteca-e FORMIGHIERI, E. F.. bitstream/item/80582/1/Agroenergia-em-revista-n.5-EduFormigh.pdf Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Embrapa; Laboratório Multiusuário de Bioinformática; Laboratório de Bioinformática em Bioenergia; Estudos de microrganismos; Embrapa Agroenergia. Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/955049 American oil palm from Brazil: Genetic diversity, population structure, and core collection. Repositório Alice PEREIRA, V. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P. de; RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T.. The American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: American oil palm; Brazilian Elaeis oleifera; Diversidade genética; Dendê; Óleo; Melhoramento Genético Vegetal; Banco de Germoplasma; Breeding and Genetic Improvement; Genetic improvement. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127457 American oil palm from Brazil: genetic diversity, population structure, and core collection. Repositório Alice PEREIRA, V. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P. de; RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T.. The American oil palm [Elaeis oleifera (Knuth) Cortés] has pronounced importance in oil palm breeding programs. Here, a germplasm bank (GB) of E. oleifera plants collected in the Amazon rainforest in Brazil was submitted to single nucleotide polymorphism (SNP) marker identification, selection, and use, aiming to characterize genetic diversity and population structure and to design a core collection (CC). Five hundred and fifty-three plants from 206 subsamples, collected at 19 localities spread throughout six geographic regions, were submitted to genotyping-by-sequencing analysis. A set of 1,827 high-quality SNP markers was then selected and used to run the genetic diversity and population structure analysis. The genetic diversity found is of moderate... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: American oil palm; Brazilian Elaeis oleifera; Diversidade genética; Dendê; Óleo; Melhoramento Genético Vegetal; Banco de Germoplasma; Breeding and Genetic Improvement; Genetic improvement. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127527 Avaliação da fragmentação do DNA genômico de Elaeis guineensis Jacq e Elaeis oleífera (Kunth) Corté por meio de ondas sonoras de alta frequência e autoclavagem. Repositório Alice VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FARIAS. P. de F.; ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Fragmentação de DNA genômico; Sonicador; Autoclave; Enzimas de restrição; Elaeis spp; Ultrassom. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938462 Biochemical and phylogenetic characterization of the wastewater tolerant Chlamydomonas biconvexa Embrapa|LBA40 strain cultivated in palm oil mill effluent. Repositório Alice CEREIJO, C. R.; PASCOAL, P. V.; RIBEIRO, D. M.; BRASIL, B. dos S. A. F.; FORMIGHIERI, E. F.; GARCIA, L. C.; STEINDORF, A. S.; NASCIMENTO, R. C.; SANTANA, H.. The increasing demand for water, food and energy poses challenges for the world´s sustainability. Tropical palm oil is currently the major source of vegetable oil worldwide with a production that exceeds 55 million tons per year, while generating over 200 million tons of palm oil mill effluent (POME). It could potentially be used as a substrate for production of microalgal biomass though. In this study, the microalgal strain Chlamydomonas biconvexa Embrapa|LBA40, originally isolated from a sugarcane vinasse stabilization pond, was selected among 17 strains tested for growth in POME retrieved from anaerobic ponds of a palm oil industrial plant located within the Amazon rainforest region. During cultivation in POME, C. biconvexa Embrapa|LBA40 biomass... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Chlamydomonas biconvexa Embrapa; LBA40 Biomassa Palm oils Microbial biomass Microbial genetics Wastewater. Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1131384 Biodiversity bioprospecting for xylitol production: selection, physiological and genetic characterization of new yeast strains. Repositório Alice TRICHEZ, D.; CARNEIRO, C. V. G. C.; SOARES, C. E. V. F.; STEINDORFF, A. S.; FORMIGHIERI, E. F.; ALMEIDA, J. R. M. de. Tipo: Separatas Palavras-chave: Produção de xilitol.; Biodiversidade.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084425 Bioenergy Metabolomics DB. Repositório Alice SOUZA, M. S.; SOARES, V. de A.; BRITO, L. S. de; ABDELNUR, P. V.; FORMIGHIERI, E. F.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Bioenergy Metabolomics DB; Estágio atual; Desenvolvimento; Funcionalidades planejadas. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1057107 Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas. Repositório Alice FORMIGHIERI, E. F.. Dissertação (Mestrado) - Centro de Energia Nuclear na Agricultura, Universidade de São Paulo, São Paulo, SP. Tipo: Teses Palavras-chave: Genomas; Sequência de aminoácidos; Sequenciamento.; Biologia Molecular.. Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/891185 Bioinformatics and physic nut. Repositório Alice RODRIQUES, E; LIMA, R. S.; LAVIOLA, B. G.; FORMIGHIERI, E. F.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Brjatropha; Physic nut.; Bioinformatics.. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/937609 Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource. Repositório Alice VIEIRA, L. G. E.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; MORAES, A. H. de A.; METHA, A.; OLIVEIRA, A. C. de; LABATE, C. A.; MARINO, C. L.; MONTEIRO-VITORELLO, C. de B.; MONTE, D. C.; GIGLIOTI, E.; KIMURA, E. T.; ROMANO, E.; KURAMAE, E. E.; LEMOS, E. G. M.; ALMEIDA, E. R. P. de; JORGE, E. C.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, F. R. da; VINECKY, F.; SAWAZAKI, H. E.; DORRY, H. F. A.; CARRER, H.; ABREU, I. N.; BATISTA, J. A. N.; TEIXEIRA, J. B.; KITAJIMA, J. P.; XAVIER, K. G.; LIMA, L. M. de; CAMARGO, L. E. A. de; PEREIRA, L. F. P.; COUTINHO, L. L.; LEMOS, M. V. F.; ROMANO, M. R.; MACHADO, M. A.; COSTA, M. M. do C.; SÁ, M. F. G. de; GOLDMAN, M. H. S.; FERRO, M. I. T.; TINOCO, M. L. P.; OLIVEIRA, M. C.; VAN SLUYS, M-A.; SHIMIZU, M. M.; MALUF, M. P.; EIRA, M. T. S. da; GUERREIRO FILHO, O.; ARRUDA, P.; MAZZAFERA, P.; MARIANI, P. D. S. C.; OLIVEIRA, R. L. B. C. de; HARAKAVA, R.; BALBAO, S. F.; TSAI, S. M.; MAURO, S. M. Z. di; SANTOS, S. N.; SIQUEIRA, W. J.; COSTA, G. G. L.; FORMIGHIERI, E. F.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Projeto genoma; Brasil; Café. Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187149 Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites. Repositório Alice OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMPOS, T. de. O uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi... Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Pastos forrajeros; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; RNA-Seq; RNA sequencing; Belomonte; Amarillo MG-100; Genoma funcional; Cultivo mixto; Leguminosas forrajeras; Repeticiones de microsatélite; Análisis de secuencia; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental.; Amendoim forrageiro; Pastagem Consorciada; Marcador Genético; Banco de Germoplasma.; Leguminosa Forrageira; Gramínea Forrageira; Sequence analysis; Germplasm conservation.; Forage legumes; Arachis pintoi; Microsatellite repeats; Mixed cropping; Forage grasses. Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125415 Caracterização de novos microssatélites desenvolvidos a partir do transcriptoma de amendoim forrageiro. Repositório Alice OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, L. M. da; FORMIGHIERI, E. F.; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de. O amendoim forrageiro tem ganhado cada vez mais importância devido às vantagens associadas ao seu uso. Entretanto, a quantidade de microssatélites disponíveis para a espécie ainda é restrita, o que tem sido um gargalo no avanço do programa de melhoramento. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e caracterizar novos microssatélites a partir do transcriptoma de folhas de Arachis pintoi. Foram testados 186 locos em 19 acessos. Os locos com os melhores perfis de amplificação (64) foram selecionados para avaliação de polimorfismo, dos quais 63 (98,4%) apresentaram perfis polimórficos, com média de 7,37 alelos por loco. Os valores médios de heterozigosidade esperada (HE) e observada (HO) foram 0,72 e 0,31, respectivamente. Os marcadores... Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; Transcriptoma da folha; Fitomejoramiento; Leguminosas forrajeras; Repeticiones de microsatélite; Hojas; Variación genética; Conservación del germoplasma; Embrapa Acre; Rio Branco (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Leguminosa Forrageira; Marcador Genético; Variação Genética; Banco de Germoplasma; Plant breeding; Forage legumes; Arachis pintoi; Genetic markers; Microsatellite repeats; Transcriptome; Leaves; Genetic variation; Germplasm conservation. Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1145988 Determinação de estádios meióticos em elaeis oleifera (kunth) cortés. Repositório Alice FARIAS, M. P.; VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.. Tipo: Folders Palavras-chave: Análise citológica; Microsporócitos; Flores masculinas; Estádios meióticos; Hibridação in situ; Cultura de micrósporo; Plantas haplóides; Elaeis Oleifera; Inflorescência. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938498 Divergence of DNA methylation and gene expression in Setaria viridis accessions under drought stress. Repositório Alice SANTIAGO, T. R.; DUARTE, K. E.; SOUZA, W. R. de; STEINDORFF, A. S.; FORMIGHIERI, E. F.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Methylomes; TE menthylation; Whole genome bisulphite sequencing; Differential methylation. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1097377 Elaeis oleifera genome draft - genomics of american oil palm. Repositório Alice LIMA, R. S.; LOBO, F. P.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; RODRIGUES, E. L. de C.; ALVES, A. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FORMIGHIERI, E. F.. In that scenario, Embrapa Agroenergy is making efforts to improve bioenergy generation and accelerate selection of superior genotypes, through NGS and large-scale genotyping technologies. Some colleagues have already estimated of Elaeis species genome size using flow cytometry, and in parallel, we sequenced one lane of Illumina HiSeq 2000 for three E. oleifera and one E. guineensis accessions, for initial comparison. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Genoma de palmeira; Óleo de palma.; Elaeis Guineensis.; Palm oils; Genomics. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946637 Embrapa agrienergy and bioinformatics. Repositório Alice LIMA, R. S.; FORMIGHIERI, E. F.; SOUZA JUNIOR, M. T.. D 156. Tipo: Separatas Palavras-chave: Bioinformática. Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/918427 Embrapa Agrienergy oil palm research platform focuses in developing biotechnology and bioinformatics to assist breeding. Repositório Alice FORMIGHIERI, E. F.; LIMA, R. S.; ALVES, A. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.. D 157. Tipo: Separatas Palavras-chave: Bioinformática. Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/918432 Estabelecimento de coleção nuclear da Palma de Óleo Americana [Elaeis oleifera (Kunth) Cortés]. Repositório Alice FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Palma de óleo americana. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099507 Estabelecimento de um protocolo eficiente para extração de rna a partir de folhas jovens de elaeis guineensis jacq. Repositório Alice VARGAS, L. H. G.; LEAO, A. P.; FARIAS, M. P.; ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Extração de RNA; Folhas jovens de Elaeis guineensis; RNASeq; CDNA; Micro e Small RNAs. Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/938503 Exploring American Oil Palm (Elaeis oleifera) genetic resources in Brazil through a combination of genetic and genomic approaches. Repositório Alice ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; LEAO, A. P.; LOBO, F. P.; RIOS, S. A.; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.. We started a project to explore American Oil Palm genetic resources through a combination of genetic and genomic approaches. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Óleo de palma; Recursos genéticos; Sequenciamento de genoma.; Elaeis Guineensis.; Genetic resources; Genome.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1008610 Registros recuperados: 40 Primeira ... 1 2 ... Última

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