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A draft genome assembly for the forage grass Urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
ABSTRACT: Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, and known for its high nutritional quality. It is closely related to other important forage species of Urochloa, playing a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, which is mostly focused on inter-specific hybrids. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species, as well as in assessments of germplasm diversity and structure. Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence. Here, we strengthen the set of genomic tools for tropical...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Montagem de sequência de DNA; Bioinformática; De novo Assembly; Brachiaria Ruziziensis; Pastagem; Genoma.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099953
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A phased diploid genome assembly for the forage grass urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, known for its high nutritional quality. It is closely related to important forage species of Urochloa, and plays a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, mostly focused on inter-specific hybirds. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species (Silva et al., 2013), as well as in assessments of germplasm diversity and structure (Pessoa-Filho et al., 2015). Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence (Pessoa-Filho et al., 2017). Here, we...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Brasil; Genoma; Capim Urochloa.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107378
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Análise genômica em bovinos. Infoteca-e
ROSA, A. J. de M.; FRAGOSO, R. da R..
bitstream/item/75672/1/art-024.pdf
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bovino; Genética Animal.; Animal genetics; Cattle..
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/869380
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Avaliação do desenvolvimento de MPBs de cana-de-açúcar (SP 80-3280) inoculadas com BiomaPhos em solo com diferentes níveis de fósforo. Repositório Alice
COSTA JÚNIOR, S.; FRAGOSO, R. da R.; KOBAYASHI, A. K.; CANÇADO, G. M. de A..
No presente estudo, o desempenho de mudas pré-brotadas (MPBs) da variedade SP80-3280 tratadas ou não (controles) com diferentes doses do inoculante líquido BiomaPhos, formulado com cepas BRM 119 (Bacillus megaterium) e BRM 2084 (Bacillus subtilis) estão sendo avaliados.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Saccharum spp; Fósforo lábil; Fósforo não-lábil; Inoculante biológico; Nutrição mineral; Labile phosphorus; Non-labile phosphorus; Biological inoculant; Mineral nutrition; Cana de Açúcar; Saccharum; Sugarcane.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1151216
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Avaliação do desenvolvimento de MPBs de cana-de-açúcar (SP 80-3280) inoculadas com BiomaPhos em solo com diferentes níveis de fósforo. Repositório Alice
COSTA JÚNIOR, S.; FRAGOSO, R. da R.; KOBAYASHI, A. K.; CANÇADO, G. M. de A..
No presente estudo, o desempenho de mudas pré-brotadas (MPBs) da variedade SP80-3280 tratadas ou não (controles) com diferentes doses do inoculante líquido BiomaPhos, formulado com cepas BRM 119 (Bacillus megaterium) e BRM 2084 (Bacillus subtilis) estão sendo avaliados. Após a inoculação das MPBs, estas foram cultivadas em solos com níveis de adubação fosfatada (superfosfa-to triplo, 45% P2O5) variando de 0,50% a 100% da adubação recomendada.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Saccharum spp; Fósforo lábil; Fósforo não-lábil; Inoculante biológico; Nutrição mineral; Labile phosphorus; Non-labile phosphorus; Biological inoculant; Mineral nutrition; Cana de Açúcar; Fósforo; Inoculante; Nutrição; Saccharum; Sugarcane.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1151219
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Caracterização de novas espécies virais infectando plantas forrageiras no Brasil e reação de genótipos de Panicum maximum à virose. Repositório Alice
SILVA, K. N.; SOUZA, J. M.; MELO, F. L.; NAGATA, T.; SILVA, M. S.; ORILIO, A. F.; FERNANDES, C. D.; JANK, L.; SANTOS, M. F.; VERZIGNASSI, J. R.; FRAGOSO, R. da R.; DESSAUNE, S. N.; RESENDE, R. O..
Em área experimental da Embrapa Gado de Corte, Campo Grande-MS, genótipos de espécies de Panicum, Brachiaria e Stylosanthes têm exibido sintomas típicos de infecção viral, como mosaico nas folhas e redução do crescimento da parte aérea, cuja etiologia ainda não estava esclarecida. Fontes de resistência são as principais formas de controle da doença. Objetivou-se, neste trabalho, identificar o(s) vírus agente(s) da doença, bem como fontes de resistência de P. maximum à mesma. Folhas sintomáticas foram maceradas em tampão PBS e o extrato foliar foi centrifugado e filtrado. O RNA viral foi extraído utilizando-se RNeasy Mini Kit, de acordo com as instruções do fabricante. As amostras de RNA foram concentradas e sequenciadas na Macrogen inc. (Korea) usando-se a...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Diversidade viral.; Graminea; Genoma; Filogenia; Estilosante..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1066082
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Caracterização do gene ácido cafeico-O-Methyl Transferase de Passiflora tenuifila. Repositório Alice
CORDEIRO, M. C. R.; SILVA, F. R. da; FRAGOSO, R. da R.; OLIVEIRA, J. da S.; JUNQUEIRA, N. T. V.; FALEIRO, F. G.; COSTA, A. M..
Ref. 71321.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Passiflora tenuifila; Biotecnologia de alimentos; Ácido cafeico-o-metil transferase; Maracujá; Biotecnologia.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081995
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Differentially expressed genes in cotton plant genotypes infected with Meloidogyne incognita. Repositório Alice
BARBOSA, A. E. A. de D.; FRAGOSO, R. da R.; SOUZA, D. dos S. de L.; FREIRE, E.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; VIANA, A. A. B.; TOGAWA, R. C.; GUIMARÃES, L. M.; MARTINS, N. F.; CIA, E.; FERNANDEZ, D.; LIMA, L. M. de; SILVA, M. C. M. da; ROCHA, T. L.; SA, M. F. G. de.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Genes de resistência; Algodão; Gossypium Hirsutum; Meloidogyne Incognita; Cotton.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/579620
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Ectopic expression of a Meloidogyne incognita dorsal gland protein in tobacco accelerates the formation of the nematode feeding site. Repositório Alice
SOUZA, D. dos S. DE L. E; SOUZA JUNIOR, J. D. A. DE; GROSSI DE SÁ, M.; ROCHA, T. L.; FRAGOSO, R. da R.; BARBOSA, A. E. A. DE D.; OLIVEIRA, G. R. DE; NAKASU, E. Y. T.; SOUSA, B. A. DE; PIRES, N. F.; DUSI, D. M. de A.; CARNEIRO, R. M. D. G.; PINTO, E. R. de C.; ALMEIDA-ENGLER, J. DE; ENGLER, G.; MARTINS-DE-SÁ, C.; SA, M. F. G. de.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Fumo; Nematóide.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/872576
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Estudo da expressão do gene ACC Synthase em frutos de P. tenuifila. Repositório Alice
CORDEIRO, M. C. R.; SILVA, F.; FRAGOSO, R. da R.; OLIVEIRA, J. da S.; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; COSTA, A. M..
Ref. 71408.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Passiflora tenuifila; Maracujá alho; Expressão do gene ACC sintase; Maracujá; Etileno.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081998
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Estudo do mecanismo de hiperacumulação de níquel em plantas nativas do Cerrado. Repositório Alice
LEME, V. B. P.; CORDEIRO, M. C. R.; NAGATA, T.; OLIVEIRA-FILHO, E. C. de; AQUINO, F. de G.; MIRANDA, Z. de J. G.; FRAGOSO, R. da R.; SILVA, M. S.; BARROS, L. M. G.; ALMEIDA, J.; ANDRADE, L. R. M. de.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Planta nativa.; Cerrado; Metal Pesado; Níquel..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/659919
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Estudo do mecanismo de hiperacumulação de níquel em plantas nativas do Cerrado (2009). Infoteca-e
PAES LEME, V. B.; CORDEIRO, M. C. R.; NAGATA, T.; OLIVEIRA-FILHO, E. C. de; AQUINO, F. de G.; MIRANDA, Z. de J. G.; FRAGOSO, R. da R.; SILVA, M. S.; BARROS, L. M. G.; ALMEIDA, J.; ANDRADE, L. R. M. de.
bitstream/item/78169/1/p2009-056.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Planta nativa; Indigenuous organisms; Nickel mining waste; Soil contamination; Growth; Environmental regeneration.; Cerrado; Metal Pesado; Níquel.; Environmental degradation..
Ano: 2009 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/737103
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Genetically modified soybean for insect-pests and disease control. Repositório Alice
GROSSI-DE-SÁ, M. F.; PELEGRINI, P. B.; FRAGOSO, R. da R..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Soja transgênica; Controle de doenças; Controle de pestes.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/901550
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Identificação de um transcrito para a enzima serina acetil transferase (SAT) em planta hiperacumuladora de níquel presente nos solos ultramáficos de Niquelândia e Barro Alto, GO. Repositório Alice
PAES LEME, V. B.; CORDEIRO, M. C. R.; NAGATA, T.; FRAGOSO, R. da R.; SILVA, M. S.; BARROS, L. M. G.; ALMEIDA, J. D. D.; OLIVEIRA FILHO, E. C. D.; AQUINO, F. D. G.; MIRANDA, Z. de J. G.; ANDRADE, L. R. M..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: SAT; Gene; Seleção.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/572587
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Improving the use of genomic tools in tropical forage grass breeding with diploid ruzigrass as a reference. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Forrageira Tropical; Genoma; Brachiaria Ruziziensis; Melhoramento Genético Vegetal.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1120871
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Improving the use of genomic tools in tropical forage grass breeding with diploid ruzigrass as a reference. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Forrageira Tropical; Genoma; Brachiaria Ruziziensis; Melhoramento Genético Vegetal.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108398
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Integrated omic approaches reveal molecular mechanisms of tolerance during soybean and meloidogyne incognita interactions. Repositório Alice
ARRAES, F. B. M.; VASQUEZ, D. D. N.; TAHIR, M.; PINHEIRO, D. H.; FAHEEM, M.; FREITAS-ALVES, N. S.; MOREIRA-PINTO, C. E.; MOREIRA, V. J. V.; PAES-DE-MELO, B.; LISEI-DE-SA, M. E.; MORGANTE, C. V.; MOTA, A. P. Z.; LOURENÇO-TESSUTTI, I. T.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; FRAGOSO, R. da R.; ALMEIDA-ENGLER, J. de; LARSEN, M. R.; GROSSI-DE-SA, M. F..
The root-knot nematode (RKN), Meloidogyne incognita, is a devastating soybean pathogen worldwide. The use of resistant cultivars is the most effective method to prevent economic losses caused by RKNs. To elucidate the mechanisms involved in resistance to RKN, we determined the proteome and transcriptome profiles from roots of susceptible (BRS133) and highly tolerant (PI595099) Glycine max genotypes 4, 12, and 30 days after RKN infestation. After in silico analysis, we described major defense molecules and mechanisms considered constitutive responses to nematodeinfestation, such as mTOR, PI3K-Akt, relaxin, and thermogenesis. The integrated data allowed us to identify protein families and metabolic pathways exclusively regulated in tolerant soybean...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Root-knot nematode; Differential expression; Meloidogyne Incognita; Soja; Glycine Max; Transcriptome; Proteome; Phenylpropanoids.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1148619
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Interação molecular planta-nematóide. Infoteca-e
FRAGOSO, R. da R.; LOURENÇO, I. T.; VIANA, A. A. B.; SOUZA, D. dos S. de L.; ANDRADE, R. V. de; MEHTA, A.; BRASILEIRO, A. C. M.; PINTO, E. R. de C.; LIMA, L. M. de; ROCHA, T L.; SA, M. F. G. de.
ABSTRACT: The endoparasitic sedentary phytonematodes of genera Heterodera, Globodera (known as cyst nematodes, CN) and Meloidogyne (the root-knot nematodes, RKN) are major crop phytopathogens, causing estimated losses of US$ 125 billion annually in the world. These plant-parasitic nematodes share some parasitism mechanisms, which ensure host-tissue invasion and host-defense evasion. The establishment and maintenance of the sophisticated molecular plant-nematode interaction are based upon several secreted molecules that access plant cellular processes, transforming them in enlarged, multinucleate, and metabolically active feeding cells. Nematicides applications are usually expensive, inefficient and environmentally hazardous. Crop rotation, bio-control...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Controle; Pests of plants.; Genética Vegetal; Nematóide; Praga de Planta; Resistência Genética.; Nematoda; Genetics.; Genetic resistance.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/571936
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Isolation and characterization of a cDNA encoding a serine proteinase from the root-knot nematode Meloidogyne incognita. Repositório Alice
FRAGOSO, R. da R.; BATISTA, J. A. N.; OLIVEIRA NETO, O. B. O.; GROSSI-de-SÁ, M. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Nematóide de planta; Proteinase; Clonagem; Meloidogyne Incognita.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/185896
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Isolation and functional characterization of a cotton ubiquitination-related promoter and 5'UTR that drives high levels of expression in root and flower tissues. Repositório Alice
VIANA, A. A. B.; FRAGOSO, R. da R.; GUIMARÃES, L. M.; PONTES, N.; OLIVEIRA-NETO, O.; ARTICO, S.; NARDELI, S. M.; ALVES-FERREIRA, M.; BATISTA, J. A. N.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Modificação genética; Algodão; Biodiesel.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/914577
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