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A draft genome assembly for the forage grass Urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
ABSTRACT: Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, and known for its high nutritional quality. It is closely related to other important forage species of Urochloa, playing a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, which is mostly focused on inter-specific hybrids. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species, as well as in assessments of germplasm diversity and structure. Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence. Here, we strengthen the set of genomic tools for tropical...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Montagem de sequência de DNA; Bioinformática; De novo Assembly; Brachiaria Ruziziensis; Pastagem; Genoma.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099953
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A phased diploid genome assembly for the forage grass urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
Ruzigrass (Urochloa ruziziensis) is a diploid, tropical forage grass native to Africa, widely planted in Brazil, known for its high nutritional quality. It is closely related to important forage species of Urochloa, and plays a crucial role in the breeding program of brachiaria grasses, mostly focused on inter-specific hybirds. Previous studies from our group based on shallow Illumina sequencing resulted in the development of the first molecular markers for the species (Silva et al., 2013), as well as in assessments of germplasm diversity and structure (Pessoa-Filho et al., 2015). Assembly and analysis of complete plastid genomes for four Urochloa species allowed the characterization of their phylogenetic divergence (Pessoa-Filho et al., 2017). Here, we...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Brasil; Genoma; Capim Urochloa.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107378
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Análise genômica em bovinos. Infoteca-e
ROSA, A. J. de M.; FRAGOSO, R. da R..
2010
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bovino; Genética animal; Cattle; Animal genetics.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/869380
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Caracterização de novas espécies virais infectando plantas forrageiras no Brasil e reação de genótipos de Panicum maximum à virose. Repositório Alice
SILVA, K. N.; SOUZA, J. M.; MELO, F. L.; NAGATA, T.; SILVA, M. S.; ORILIO, A. F.; FERNANDES, C. D.; JANK, L.; SANTOS, M. F.; VERZIGNASSI, J. R.; FRAGOSO, R. da R.; DESSAUNE, S. N.; RESENDE, R. O..
Em área experimental da Embrapa Gado de Corte, Campo Grande-MS, genótipos de espécies de Panicum, Brachiaria e Stylosanthes têm exibido sintomas típicos de infecção viral, como mosaico nas folhas e redução do crescimento da parte aérea, cuja etiologia ainda não estava esclarecida. Fontes de resistência são as principais formas de controle da doença. Objetivou-se, neste trabalho, identificar o(s) vírus agente(s) da doença, bem como fontes de resistência de P. maximum à mesma. Folhas sintomáticas foram maceradas em tampão PBS e o extrato foliar foi centrifugado e filtrado. O RNA viral foi extraído utilizando-se RNeasy Mini Kit, de acordo com as instruções do fabricante. As amostras de RNA foram concentradas e sequenciadas na Macrogen inc. (Korea) usando-se a...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Estilosante; Diversidade viral; Graminea; Genoma; Filogenia.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1066082
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Caracterização do gene ácido cafeico-O-Methyl Transferase de Passiflora tenuifila. Repositório Alice
CORDEIRO, M. C. R.; SILVA, F. R. da; FRAGOSO, R. da R.; OLIVEIRA, J. da S.; JUNQUEIRA, N. T. V.; FALEIRO, F. G.; COSTA, A. M..
bitstream/item/168538/1/caracterizacao-do-gene-acido-cafeico-proceedings.galoa.com.br-slaca-slaca-trabalhos3-caracter.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Passiflora tenuifila; Biotecnologia de alimentos; Ácido cafeico-o-metil transferase; Maracujá; Biotecnologia.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081995
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Ectopic expression of a Meloidogyne incognita dorsal gland protein in tobacco accelerates the formation of the nematode feeding site. Repositório Alice
SOUZA, D. dos S. DE L. E; SOUZA JUNIOR, J. D. A. DE; GROSSI DE SÁ, M.; ROCHA, T. L.; FRAGOSO, R. da R.; BARBOSA, A. E. A. DE D.; OLIVEIRA, G. R. DE; NAKASU, E. Y. T.; SOUSA, B. A. DE; PIRES, N. F.; DUSI, D. M. de A.; CARNEIRO, R. M. D. G.; PINTO, E. R. de C.; ALMEIDA-ENGLER, J. DE; ENGLER, G.; MARTINS-DE-SÁ, C.; SA, M. F. G. de.
bitstream/item/202170/1/1-s2.0-S0168945210002591-main.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fumo; Nematóide.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/872576
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Estudo da expressão do gene ACC Synthase em frutos de P. tenuifila. Repositório Alice
CORDEIRO, M. C. R.; SILVA, F.; FRAGOSO, R. da R.; OLIVEIRA, J. da S.; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; COSTA, A. M..
bitstream/item/168541/1/estudo-da-expressao-do-gene-P-tenuifila-proceedings.galoa.com.br-slaca-slaca17-trabalhos-estudo-d.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Passiflora tenuifila; Maracujá alho; Expressão do gene ACC sintase; Maracujá; Etileno.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1081998
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Estudo do mecanismo de hiperacumulação de níquel em plantas nativas do Cerrado. Repositório Alice
LEME, V. B. P.; CORDEIRO, M. C. R.; NAGATA, T.; OLIVEIRA-FILHO, E. C. de; AQUINO, F. de G.; MIRANDA, Z. de J. G.; FRAGOSO, R. da R.; SILVA, M. S.; BARROS, L. M. G.; ALMEIDA, J.; ANDRADE, L. R. M. de.
2009
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Níquel; Metal pesado; Planta nativa; Cerrado.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/659919
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Estudo do mecanismo de hiperacumulação de níquel em plantas nativas do Cerrado (2009). Infoteca-e
PAES LEME, V. B.; CORDEIRO, M. C. R.; NAGATA, T.; OLIVEIRA-FILHO, E. C. de; AQUINO, F. de G.; MIRANDA, Z. de J. G.; FRAGOSO, R. da R.; SILVA, M. S.; BARROS, L. M. G.; ALMEIDA, J.; ANDRADE, L. R. M. de.
2009
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Níquel; Metal pesado; Planta nativa; Cerrado; Indigenuous organisms; Nickel mining waste; Soil contamination; Growth; Environmental degradation; Environmental regeneration.
Ano: 2009 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/737103
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Genetically modified soybean for insect-pests and disease control. Repositório Alice
GROSSI-DE-SÁ, M. F.; PELEGRINI, P. B.; FRAGOSO, R. da R..
2011
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Soja transgênica; Controle de doenças; Controle de pestes.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/901550
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Improving the use of genomic tools in tropical forage grass breeding with diploid ruzigrass as a reference. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
bitstream/item/211473/1/Resumo-iftbc-2019-SouzaSobrinho-Improving.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Forrageira Tropical; Genoma; Brachiaria Ruziziensis; Melhoramento Genético Vegetal.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1120871
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Improving the use of genomic tools in tropical forage grass breeding with diploid ruzigrass as a reference. Repositório Alice
PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E..
bitstream/item/196085/1/iftbc-2019-online-abstract-boopg92.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Forrageira Tropical; Genoma; Brachiaria Ruziziensis; Melhoramento Genético Vegetal.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1108398
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Interação molecular planta-nematóide. Infoteca-e
FRAGOSO, R. da R.; LOURENÇO, I. T.; VIANA, A. A. B.; SOUZA, D. dos S. de L.; ANDRADE, R. V. de; MEHTA, A.; BRASILEIRO, A. C. M.; PINTO, E. R. de C.; LIMA, L. M. de; ROCHA, T L.; SA, M. F. G. de..
ABSTRACT: The endoparasitic sedentary phytonematodes of genera Heterodera, Globodera (known as cyst nematodes, CN) and Meloidogyne (the root-knot nematodes, RKN) are major crop phytopathogens, causing estimated losses of US$ 125 billion annually in the world. These plant-parasitic nematodes share some parasitism mechanisms, which ensure host-tissue invasion and host-defense evasion. The establishment and maintenance of the sophisticated molecular plant-nematode interaction are based upon several secreted molecules that access plant cellular processes, transforming them in enlarged, multinucleate, and metabolically active feeding cells. Nematicides applications are usually expensive, inefficient and environmentally hazardous. Crop rotation, bio-control...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Genética vegetal; Praga de planta; Nematóide; Controle; Resistência genética; Genetics; Pests of plants; Nematoda; Genetic resistance.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/571936
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Isolation and characterization of a cDNA encoding a serine proteinase from the root-knot nematode Meloidogyne incognita. Repositório Alice
FRAGOSO, R. da R.; BATISTA, J. A. N.; OLIVEIRA NETO, O. B. O.; GROSSI-de-SÁ, M. F..
bitstream/item/178383/1/ID-253061.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Nematóide de planta; Proteinase; Clonagem; Meloidogyne Incognita.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/185896
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Isolation and functional characterization of a cotton ubiquitination-related promoter and 5'UTR that drives high levels of expression in root and flower tissues. Repositório Alice
VIANA, A. A. B.; FRAGOSO, R. da R.; GUIMARÃES, L. M.; PONTES, N.; OLIVEIRA-NETO, O.; ARTICO, S.; NARDELI, S. M.; ALVES-FERREIRA, M.; BATISTA, J. A. N.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de.
bitstream/item/183510/1/1472-6750-11-115.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Modificação genética; Algodão; Biodiesel.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/914577
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Meloidogyne incognita: molecular cloning and characterization of a cDNA encoding a cathepsin D-like aspartic proteinase. Repositório Alice
FRAGOSO, R. da R.; LOURENÇO, I. T.; BATISTA, J. A. N.; OLIVEIRA NETO, O. B.; SILVA, M. C. M.; ROCHA, T. L.; COUTINHO, M. V.; GROSSI DE SÁ, M. F..
bitstream/item/178480/1/SP-19748-ID-31746.PDF
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Caractrização molecular; Nematóide; Meloidogyne.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/257647
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Molecular cloning and characterization of an a-amylase cDNA highly expressed in major feeding stages of the coffee berry borer, Hypothenemus hampei. Repositório Alice
BEZERRA, C. A.; MACEDO, L. L. P.; AMORIM, T. M. L.; SANTOS, V. O.; FRAGOSO, R. da R.; LUCENA, W. A.; MENEGUIM, A. M.; VALENCIA-JIMENEZ, A.; ENGLER, G.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de; FREIRE, E. V. S. A..
Abstract: a-Amylases are common enzymes responsible for hydrolyzing starch. Insect-pests, whose larvae develop in seeds, rely obligatorily on a-amylase activity to digest starch, as their major food source. Considering the relevance of insect a-amylases and the natural a-amylase inhibitors present in seeds to protect from insect damage, we report here the molecular cloning and nucleotide sequence of the full-length AmyHha cDNA of the coffee berry borer, Hypothenemus hampei, a major insect-pest of coffee crops. The AmyHha sequence has 1879 bp, containing a 1458 bp open reading frame, which encodes a predicted protein with 485 amino acid residues, with a predicted molecular mass of 51.2 kDa. The deduced protein showed 55?79% identity to other insect...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; Curculionideo; Praga de planta; Amido; Hidrolise; Curculionidae; Gene expression; Insect pests; Starch; Enzymatic hydrolysis.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1003023
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Molecular cloning and characterization of an alfa-amylase cDNA highly expressed in major feeding stages of the coffee berry borer, Hypothenemus hampei. Repositório Alice
BEZERRA, C. A.; MACEDO, L. L. P.; AMORIM, T. M. L.; SANTOS, V. O.; FRAGOSO, R. da R.; LUCENA, W. A.; MENEGUIM, A. M.; VALENCIA-JIMENEZ, A.; ENGLER, G.; SILVA, M. C. M.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; GROSSI-DE-SA, M. F..
Abstract: a-Amylases are common enzymes responsible for hydrolyzing starch. Insect-pests, whose larvae develop in seeds, rely obligatorily on a-amylase activity to digest starch, as their major food source. Considering the relevance of insect a-amylases and the natural a-amylase inhibitors present in seeds to protect from insect damage, we report here the molecular cloning and nucleotide sequence of the full-length AmyHha cDNA of the coffee berry borer, Hypothenemus hampei, a major insect-pest of coffee crops. The AmyHha sequence has 1879 bp, containing a 1458 bp open reading frame, which encodes a predicted protein with 485 amino acid residues, with a predicted molecular mass of 51.2 kDa. The deduced protein showed 55?79% identity to other insect...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; Curculionideo; Praga de planta; Amido; Hidrolise; Curculionidae; Gene expression; Insect pests; Starch; Enzymatic hydrolysis.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1006141
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Pesos e rendimentos da carcaça de bovinos Nelore Mocho selecionados para maciez. Repositório Alice
MOREIRA, L. da C.; EIFERT, E. da C.; MAGNABOSCO, C. de U.; ROSA, A. J. de M.; FRAGOSO, R. da R.; SOUZA, F. M. de; LOPES, F. B.; GONZALEZ, R. D. S..
A falta de padronização e de qualidade das carcaças ofertadas faz com que a carne bovina brasileira receba baixas remunerações, além da limitada expansão para novos mercados. Dessa forma, objetivou-se avaliar as características de peso ao abate, peso da carcaça e seus rendimentos de 68 bovinos machos da raça Nelore Mocho, inteiros, oriundos de uma população segregante para maciez da carne. Os animais foram abatidos ao apresentarem 5 mm de espessura de gordura e/ou 500 kg de peso vivo. Antes do embarque para o frigorifico, os animais foram pesados para obtenção do peso ao abate. Ao final da linha de abate, as meias carcaças foram pesagens individuais para obtenção do peso de carcaça quente e carcaça fria após resfriamento por 24 horas em câmara. O...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Peso vivo; Carne; Zebu; Qualidade; Quality; Live weight; Meat.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1007880
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Prospecção de moléculas-alvo para intervenção da interação planta-praga. Repositório Alice
FRAGOSO, R. da R..
O nematóide formador de galhas Meloidogyne incognita ("southem root-knot nematode", SRN) apresenta distribuição mundial, causando grandes perdas em várias culturas. Seu ciclo de vida compreende seis estádios de desenvolvimento (ovo, larva 1-4 e adulto). A larva L2, fase infectiva, penetra na raiz de planta hospedeira por força mecânica e degradação enzimática para, então, estabelecer a interação planta-patógeno. Em condições favoráveis, as larvas L2 se diferenciam em f'emeas adultas apomíticas, que completam o ciclo de vida após a deposição de mais de 2000 ovos. As práticas agrícolas atuais não são eficientes contra os fitonematóides, de modo que uma estratégia poderosa e promissora para o controle de nematóides é a produção de plantas transgênicas...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Meloidogyne incognita; Identificação molecular; Caracterização molecular; Genes codificadores de proteínas; Parasitismo; Plantas transgênicas; Resistência a fitonematóides.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188037
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