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| Dutech, C.; Enjalbert, J.; Fournier, E.; Delmotte, F.; Barrès, B.; Carlier, J.; Tharreau, D.; Giraud, T.. |
| Although they represent powerful genetic markers in many fields of biology, microsatellites have been isolated in few fungal species. The aim of this study was to assess whether obtaining microsatellite markers with an acceptable level of polymorphism is generally harder from fungi than in other organisms. We therefore surveyed the number,nature and polymorphism level of published microsatellite markers in fungi from the literature and from our own data on seventeen fungal microsatellite-enriched libraries, and in five other phylogroups (angiosperms, insects, fishes, birds and mammals). Fungal microsatellites indeed appeared both harder to isolate and to exhibit lower polymorphism than in other organisms. This appeared to be due, at least in part, to... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: MARQUEUR GENETIQUE; MICROSATELLITE; CHAMPIGNON; ANALYSE DE DONNEES SSR; PLANT PATHOGEN; POLYMORPHIC; MARKERS; DEVELOPMENT; ISOLATION; FEATURES; AFFECTING POLYMORPHISM. |
| Ano: 2007 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200780b37b09&uri=/notices/prodinra1/2008/04/ |
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| Ribot, C.; Cesari, S.; Hirsch, J.; Vincent, D.; Gagey, M.J.; Vallet, J.; Gautier, P.; Notteghem, J.L.; Job, C.; Job, D.; Fournier, E.; Plomion, C.; Morel, J.B.; Lebrun, M.H.; Kroj, T.. |
| The ascomycete Magnaporthe oryzae causes « blast disease » affecting several cereals inparticular rice. During the compatible interaction, the first phase of M. oryzae infection cycleis biotrophic. M. oryzae is suspected to secrete, as bacterial and oomycete pathogens, anarsenal of effector proteins that disrupt the activation and execution of plant defenses. In orderto identify M. oryzae effectors, a search for putatively secreted proteins during rice infectionwas performed from different sequence datasets such as, genome annotation data,transcriptome data of blast fungus-infected rice leaves, and proteomic data of blast proteinsreleased in culture media. A list of 370 candidate effectors expressed during rice infection andpossessing a putative signal... |
| Tipo: Conference Paper |
Palavras-chave: EFFECTEUR; CHAMPIGNON; MAGNAPORTHE. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20107b2d38db&uri=/notices/prodinra1/2010/08/ |
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| Saleh, D.; Fournier, E.; Tharreau, D.. |
| Magnaporthe oryzae est un champignon pathogène du riz et d’autres Poacées. Chez cetAscomycète, la reproduction sexuée n’a jamais été observée dans la nature mais certainessouches gardent la capacité de se croiser en conditions contrôlées. M. oryzae esthétérothallique, la reproduction sexuée nécessite donc 2 souches de signes de compatibilitésexuelle (SCS) opposés (Mat1.1 et Mat1.2 codés par 2 gènes différents au locus MAT). Deplus, au moins une des 2 souches doit être femelle-fertile, c’est à dire capable de différencierles périthèces, structures femelles où se déroule la méiose. La structure génétique despopulations collectées sur riz suggère un mode de reproduction majoritairement asexué danspresque toute l’aire de répartition. Mais l’existence de... |
| Tipo: Conference Paper |
Palavras-chave: REPRODUCTION; MAGNAPORTHE; TYPE SEXUEL. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010499d477b&uri=/notices/prodinra1/2010/08/ |
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| Giraud, F.; Giraud, T.; Aguileta, G.; Fournier, E.; Samson, R.; Cruaud, C.; Lacoste, S.; Ropars, J.; Tellier, A.; Dupont, J.. |
| We report the development of 17 microsatellite markers in the cheese fungi Penicillium camemberti and P. roqueforti, using an enrichment protocol. Polymorphism and cross-amplification were explored using 23 isolates of P. camemberti, 26 isolates of P. roqueforti and 2 isolates of each of the A chtysogenum and P. nalgiovense species. used to produce meat fermented products. The markers appeared useful for differentiating species, both using their amplification sizes and the sequences of their flanking regions. The microsatellite locus PC4 was particularly suitable for distinguishing contaminant species closely related to P. camemberti and for clarifying the phylogenetic relationship of this species with its supposed ancestral form, P. commune. We analyzed... |
| Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: CONTAMINANT; DOMESTICATION; PC4 MARKER; MULTIGENIC PHYLOGENY; PENICILLIUM; STARTER CULTURES. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20112cbb5aae&uri=/notices/prodinra1/2011/01/ |
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| Andanson, A.; Fournier, E.; Grognard, F.; Halkett, F.; Mailleret, L.; Tharreau, D.; Ravigné, V.. |
| Les organismes vivant tirent leurs ressources de l’environnement et les allouent auxdifférentes fonctions biologiques assurant leur développement (croissance, survie,reproduction…). Or les ressources disponibles dans un environnement donné sont finies etmême la plupart du temps limitantes. L’individu doit donc faire des compromis dansl’allocation des ressources à ses différentes fonctions biologiques. Ces compromis vont seretrouver au niveau des traits d’histoire de vie (âge et taille à maturité, nombre dedescendants…), conditionnant ainsi les capacités d’adaptation des individus à leurenvironnement. Chez les champignons phytopathogènes, on peut distinguer deux modesd’exploitation des ressources contrastés : la nécrotrophie, où le pathogène exploite des... |
| Tipo: Conference Paper |
Palavras-chave: STRATEGIE OPTIMALE D’ALLOCATION DES RESSOURCES; COMPROMIS; BIOTROPHE; NECROTROPHE; TRAITS D’HISTOIRE DE VIE; AGRESSIVITE. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD201017e589aa&uri=/notices/prodinra1/2010/08/ |
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| Fournier, E.; Mississipi, S.; Milazzo, J.; Tertois, C.; Ravigné, V.; Tharreau, D.. |
| La recherche des traits impliqués dans la virulence et adaptatifs pour un hôte ou son parasite,l’étude des compromis entre ces traits et des bases génétiques de ces traits, sont cruciales pourla compréhension de l’évolution de la virulence. Dans les pathosystèmes cultivés, la virulence(classiquement définie comme la baisse de fitness infligée à l’hôte par son parasite) estremplacée par la notion de pouvoir pathogène défini comme la quantité de dommages infligéeà l’hôte. Une partie du pouvoir pathogène dépend d’interactions spécifiques qualitatives detype gène pour gène prenant de facto en compte la variabilité des génotypes hôtes et parasites.Par contre, très peu de travaux intégrant les interactions génotype X génotype (G X G) ontporté sur l’agressivité,... |
| Tipo: Conference Paper |
Palavras-chave: ADAPTATION; RESISTANCES PARTIELLES; POUVOIR PATHOGENE; TRAITS DE VIE; MAGNAPORTHE ORYZAE. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20102c50cb4e&uri=/notices/prodinra1/2010/08/ |
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