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Associação entre variantes cis regulatórias do gene KCNJ11e características econômicas em bovinos Nelore. Repositório Alice
OLIVEIRA, K. S. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; REGITANO, L. C. de A..
Características de produção como eficiência alimentar e de qualidade da carne bovina são de suma importância para o agronegócio, agroindústria e consumidores. Assim, ferramentas biotecnológicas como a genômica podem adicionar informações para identificar potenciais biomarcadores com a finalidade de auxiliar os programas de melhoramento e seleção de bovinos de corte.
Tipo: Separatas Palavras-chave: SNP; Expressão gênica; Sítio de ligação de fator de transcriçã0; Ilha CpG; Qualidade da carne; Bos Indicus.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115556
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Muscle allele-specifc expression QTLs may afect meat quality traits in Bos indicus. Repositório Alice
BRUSCADIN, J. J.; SOUZA, M. M. de; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A..
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in transcript sequences showing allele-specifc expression (ASE SNPs) were previously identifed in the Longissimus thoracis muscle of a Nelore (Bos indicus) population consisting of 190 steers. Given that the allele-specifc expression pattern may result from cis-regulatory SNPs, called allele-specifc expression quantitative trait loci (aseQTLs), in this study, we searched for aseQTLs in a window of 1 Mb upstream and downstream from each ASE SNP. After this initial analysis, aiming to investigate variants with a potential regulatory role, we further screened our aseQTL data for sequence similarity with transcription factor binding sites and microRNA (miRNA) binding sites. These aseQTLs were overlapped with...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão gênica; Functional genomics; Regulação gênica; Polimorfismo de nucleotídeo único; Gene regulation; Animal biotechnology; Bos Indicus; Gado Nelore; Animal breeding; Gene expression; Genetic markers; Genetics; Genome; Genomics; Genotype; Single nucleotide polymorphism; Quantitative trait loci.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1131654
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Muscle allele-specific expression QTLs may affect meat quality traits in Bos indicus. Repositório Alice
BRUSCADIN, J. J.; SOUZA, M. M. de; OLIVEIRA, K. S. de; ROCHA, M. I. P.; AFONSO, J.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A..
Abstract. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) located in transcript sequences showing allele-specific expression (ASE SNPs) were previously identified in the Longissimus thoracis muscle of a Nelore (Bos indicus) population consisting of 190 steers. Given that the allele-specific expression pattern may result from cis-regulatory SNPs, called allele-specific expression quantitative trait loci (aseQTLs), in this study, we searched for aseQTLs in a window of 1 Mb upstream and downstream from each ASE SNP. After this initial analysis, aiming to investigate variants with a potential regulatory role, we further screened our aseQTL data for sequence similarity with transcription factor binding sites and microRNA (miRNA) binding sites. These aseQTLs were...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Loci de característica quantitativa; Expressão alélica; Imprint genômico; Allelic expression; Allele-specific expression; Gado Nelore; Bos Indicus; Single nucleotide polymorphism; Quantitative trait loci; Genomic imprinting.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1133623
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Variantes da região promotora do gene KCNJ11 em bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
OLIVEIRA, K. S. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; MELO, A. L. de; REGITANO, L. C. de A..
A eficiência alimentar é uma característica moderadamente herdável, que por possuir uma mensuração onerosa e tardia, tem sua incorporação em programas de melhoramento animal dificultada. Estudos prévios de mapeamento identificaram o gene KCNJ7 7, que possui importante função sobre vias metabólicas relacionadas a eficiência alimentar, tais como a via de insulina, em uma região de QTL (quantitative trait loci) para maciez da carne.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Sítios-alvo de fator de transcrição; Gado Nelore; Melhoramento Genético Animal; Bos Indicus; Animal breeding; Transcription factors.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095987
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