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Estimativas de efeitos genéticos em bezerros cruzados por diferentes modelos e métodos de estimação R. Bras. Zootec.
Pimentel,Eduardo da Cruz Gouveia; Queiroz,Sandra Aidar de; Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto.
Os objetivos neste trabalho foram comparar estimativas de parâmetros genéticos obtidas por meio de dois modelos - um contendo apenas efeitos aditivos e de dominância e outro que incluiu os efeitos aditivo-conjunto (complementaridade) e epistático - e testar alternativas de critérios objetivos para determinação do coeficiente lambda na aplicação da regressão de cumeeira. Os resultados obtidos revelaram que a escolha de um critério para determinação do coeficiente lambda em regressão de cumeeira depende não apenas do conjunto de dados e do modelo utilizado, mas, sobretudo, de um conhecimento prévio acerca do fenômeno estudado e do significado prático e da interpretação dos parâmetros encontrados. Pelo uso de modelos mais completos para avaliação de efeitos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Epistasia; Estimação viesada; Heterose; Multicolinearidade; Regressão de cumeeira.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400012
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Use of direct and iterative solvers for estimation of SNP effects in genome-wide selection Genet. Mol. Biol.
Pimentel,Eduardo da Cruz Gouveia; Sargolzaei,Mehdi; Simianer,Henner; Schenkel,Flávio Schramm; Liu,Zengting; Fries,Luiz Alberto; Queiroz,Sandra Aidar de.
The aim of this study was to compare iterative and direct solvers for estimation of marker effects in genomic selection. One iterative and two direct methods were used: Gauss-Seidel with Residual Update, Cholesky Decomposition and Gentleman-Givens rotations. For resembling different scenarios with respect to number of markers and of genotyped animals, a simulated data set divided into 25 subsets was used. Number of markers ranged from 1,200 to 5,925 and number of animals ranged from 1,200 to 5,865. Methods were also applied to real data comprising 3081 individuals genotyped for 45181 SNPs. Results from simulated data showed that the iterative solver was substantially faster than direct methods for larger numbers of markers. Use of a direct solver may allow...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Breeding value; Genomic selection; Mixed model equations; Numerical method.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000100033
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Use of ridge regression for the prediction of early growth performance in crossbred calves Genet. Mol. Biol.
Pimentel,Eduardo da Cruz Gouveia; Queiroz,Sandra Aidar de; Carvalheiro,Roberto; Fries,Luiz Alberto.
The problem of multicollinearity in regression analysis was studied. Ridge regression (RR) techniques were used to estimate parameters affecting the performance of crossbred calves raised in tropical and subtropical regions by a model including additive, dominance, joint additive or "profit heterosis" and epistatic effects and their interactions with latitude in an attempt to model genotype by environment interactions. A software was developed in Fortran 77 to perform five variant types of RR: the originally proposed method; the method implemented by SAS; and three methods of weighting the RR parameter lambda. Three mathematical criteria were tested with the aim of choosing a value for the lambda coefficient: the sum and the harmonic mean of the absolute...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Crossbreeding; Epistasis; Genotype by environment interaction; Heterosis; Multicollinearity.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000400006
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