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Abundance, distribution and potential impact of transposable elements in the genome of Mycosphaerella fijiensis. Repositório Alice
SANTANA, M. F.; SILVA, J. C. F.; BATISTA, A. D.; RIBEIRO, L. E.; SILVA, G. F. da; ARAÚJO, E. F. de; QUEIROZ, M. V. de.
Mycosphaerella fijiensis is a ascomycete that causes Black Sigatoka in bananas. Recently, the M. fijiensis genome was sequenced. Repetitive sequences are ubiquitous components of fungal genomes. In most genomic analyses, repetitive sequences are associated withtransposable elements (TEs). TEs are dispersed repetitive DNA sequences found in a host genome. These elements have the ability to move from one location to another within the genome, and their insertion can cause a wide spectrum of mutations in their hosts. Some of the deleterious effects of TEs may be due to ectopic recombination among TEs of the same family. In addition, some transposons are physically linked to genes and can control their expression. To prevent possible damage caused by the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Mycosphaerella fijiensis; Transposable elements; RIP; Genome.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946093
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Análise molecular do rDNA de Hemileia vastatrix. Repositório Alice
SANTANA, M. F.; ZAMBOLIM, E. M.; OLIVEIRA, L. O. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, L..
Os espaçadores transcritos internos (ITS1 e ITS2) e o gene 5,8S do rDNA nuclear de 15 populações de H. vastatrix foram amplificados por PCR com o objetivo de estudar a diversidade genética. Os fragmentos amplificados foram clonados, e dos clones resultantes, 4 a 7 foram seqüenciados. As 82 seqüências resultantes revelaram a existência de 68 haplótipos definidos por 63 substituições de base e cinco indels. Entre os 68 haplótipos, 64 foram exclusivos, isto é, cada um deles foi detectado em uma única lavoura, dois (1 e 2) foram compartilhados entre lavouras distintas e dois (19 e 29) foram exclusivos, mas detectados duas vezes na mesma lavoura. Os haplótipos geraram uma rede única mostrando que 65 deles são de origem mais recente e de distribuição restrita, e...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Hemileia vastatrix; Haplótipos; ITS (Internal transcribed spacer); RDNA; Diversidade genética.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906053
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Estrutura genética da população de Hemileia vastatrix com base no marcador AFLP. Repositório Alice
MAIA, T. A.; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T.; MIZUBUTI, E. S. G.; SANTANA, M. F.; ZAMBOLIM, L..
A estrutura genética populacional de Hemileia vastatrix foi determinada usando o marcador AFLP em 91 isolados coletados em lavouras cafeeiras de Minas Gerais, Espírito Santo e São Paulo. Após ampliA estrutura genética populacional de Hemileia vastatrix foi determinada usando o marcador AFLP em 91 isolados coletados em lavouras cafeeiras de Minas Gerais, Espírito Santo e São Paulo. Após amplificações seletivas, usando quatro combinações de primers (EcoRI/MseI), foram analisados 100 fragmentos polimórficos. Cada isolado apresentou um padrão único de alelos AFLP, constatando-se alta diversidade genotíA estrutura genética populacional de Hemileia vastatrix foi determinada usando o marcador AFLP em 91 isolados coletados em lavouras cafeeiras de Minas Gerais,...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Hemileia vastatrix; Genética de população; AFLP.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903147
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Genetic diversity analysis of isolates of the fungal bean pathogen Pseudocercospora griseola from central and southern Brazil. Repositório Alice
ABADIO, A. K. R.; LIMA, S. S.; SANTANA, M. F.; SALOMÃO, T. M. F.; SARTORATO, A.; MIZUBUTI, E. S. G.; ARAÚJO, E. F.; QUEIROZ, M. V. de..
Planting resistant varieties is the most effective control measure against the angular leaf spot of dry beans, a fungal disease caused by Pseudocercospora griseola. However, dry bean varieties with durable resistance are not easily obtained. Knowledge about the genetic variability of the pathogen population is key for the success of dry bean breeding programs aimed at developing resistant materials, but finding suitable operationally simple and genetically accurate markers is not an easy task. The aim of this study was to assess the suitability of the ISSR-PCR technique to quantify the genetic variability of P. griseola isolates. Total DNA of 27 P. griseola isolates from Goiás, Minas Gerais, Espírito Santo, and Paraná States was extracted and amplified...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Pseudocercospora griseola; Feijão; Phaseolus vulgaris; Mancha angular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/933546
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Genetic diversity of Mycosphaerella fijiensis in Brazil analyzed using an ERIC-PCR marker. Repositório Alice
SILVA, G. F. da; PAIXÃO, R. D. V.; QUEIROZ, C. B.; SANTANA, M. F.; SOUZA, A.; SOUSA, N. R.; HANADA, R. E.; GASPAROTTO, L..
2014
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Black Sigatoka; Pseudocercospora fijiensis; Banana plant; Musa spp; Genetic variability; Sigatoka-negra; Doença de planta; Fungo; Diversidade genética.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/996041
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