|
|
|
Registros recuperados: 22 | |
|
|
HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B.. |
Trans-splicing is an unusual form of RNA processing mechanism where distinct pre-mRNA sequences contribute to the formation of a single mRNA. It is common in nematodes and kinetoplastids, but it is rare in superior organisms. Nevertheless, some recent studies show that trans-splicing, although rare, may be more widespread than believed (Gingeras). Consequently, its identification in large databanks is very important for posteriori experimental confirmation. Recently, we have developed a Bioinformatic methodology that successfully found 16 inter-chromosomal trans-splicing candidate sequences in a large human full length cDNA (FlcDNA) databank (Herai & Yamagishi, in press). Unfortunately, our methodology was supposed to be applied on organisms with high... |
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) |
Palavras-chave: Bioinformática; Algoritmo; Algorithms; Bioinformatics; RNA splicing. |
Ano: 2010 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/868482 |
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F.. |
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R. |
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) |
Palavras-chave: Agrupamento de dados; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise estatística; Análise de componentes principais - PCA; Gene expression; Algorithms; Statistical analysis; Principal component analysis. |
Ano: 2010 |
URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/883623 |
| |
|
| |
|
| |
|
|
COLTRI, P. P.; CORDEIRO, R. L. F.; SOUZA, T. T. de; ROMANI, L. A. S.; ZULLO JÚNIOR, J.; TRAINA JÚNIOR, C.; TRAINA, A. J. M.. |
Diante do grande desafio que é classificar imagens de sensoriamento remoto de café, o objetivo deste trabalho foi aplicar o novo algoritmo QMAS para classificar áreas de café comparando os resultados com o método tradicional de Classificação Supervisionada MAXVER, em imagens Geoeye-1. Os resultados indicam que o algoritmo QMAS obteve mais êxito na classificação das áreas de café do que o MAXVER, configurando-se em uma alternativa viável a classificação de imagens de satélite. |
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) |
Palavras-chave: Cafe; Cafeicultura; Padrão espectral; Algoritmo de classificação QMAS; Coffee crops; Spectral pattern; Algorithms. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/895471 |
| |
|
| |
|
| |
|
|
Siegelman, Lia; Roquet, Fabien; Mensah, Vigan; Riviere, Pascal; Pauthenet, Etienne; Picard, Baptiste; Guinet, Christophe. |
Most available CTD Satellite Relay Data Logger (CTD-SRDL) profiles are heavily compressed before satellite transmission. High-resolution profiles recorded at the sampling frequency of 0.5 Hz are, however, available upon physical retrieval of the logger. Between 2014 and 2018, several loggers deployed on elephant seals in the Southern Ocean have been set in continuous recording mode, capturing both the ascent and descent for over 60 profiles per day during several months, opening new horizons for the physical oceanography community. Taking advantage of a new dataset made of seven such loggers, a postprocessing procedure is proposed and validated to improve the quality of all CTD-SRDL data: that is, both high-resolution profiles and compressed low-resolution... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Algorithms; Data processing; In situ oceanic observations. |
Ano: 2019 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00494/60567/64043.pdf |
| |
|
|
Schemberger,Elder E.; Fontana,Fabiane S.; Johann,Jerry A.; Souza,Eduardo G. De. |
ABSTRACT Precision Agriculture (PA) uses technologies with the aim of increasing productivity and reducing the environmental impact by means of site-specific application of agricultural inputs. In order to make it economically feasible, it is essential to improve the current methodologies as well as proposing new ones, in which data regarding productivity, soil, and compound indicators are used to determine Management Areas (MAs). These units are heterogeneous areas within the same region. With these methodologies, data mining (DM) techniques and algorithms may be used. In order to integrate DM techniques to PA, the aim of this study was to associate MAs created for soy productivity using the Fuzzy C-means algorithm by SDUM software over a 9.9-ha plot as... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Algorithms; EM; KDD; K-means; Weka. |
Ano: 2017 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-69162017000100185 |
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
LEITE, C. C. C.; SILVA. E. F. da; SILVA, R. F.; AGUIAR, M. O.; FIGUEIREDO, E. O.; SILVA, M. L. M. da. |
Uma área de Manejo Florestal Sustentável dividida em compartimentos de igual tamanho não corresponderá a uma distribuição regular de volume, renda e espécies. Como alternativa, a formação das Unidades de Produção Anual (UPAs) pode ser modelada como um problema clássico conhecido como P-medianas. Desse modo, os objetivos desse estudo foram: 1) Apresentar um modelo de programação linear inteira binária para realizar a formação de UPAs, promovendo a regulação da produção florestal e; 2) propor um método heurístico para a obtenção de soluções viáveis sub-ótimas. A área de estudo consiste em uma área de manejo florestal 1.057,41 ha de floresta tropical nativa localizada no Estado do Acre. Os dados utilizados são provenientes do inventário florestal censitário... |
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) |
Palavras-chave: Manejo florestal sustentável; Regulação da produção florestal; Ditribuição espacial de espécies; Unidade de Produção Anual (UPA); Heurística; Heuristic; Algoritmo heurístico; P-mediana; Bujari (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Produção florestal; Floresta tropical; Floresta nativa; Programação linear; Sustainable forestry; Timber production; Tropical rain forests; Linear programming; Algorithms; Western Amazon; Silvicultura sustentable; Producción de madera; Bosque tropical húmedo; Programación lineal; Algoritmos; Amazonia Occidental. |
Ano: 2016 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1067267 |
| |
Registros recuperados: 22 | |
|
|
|