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Analysis of Bm86 conserved epitopes: is a global vaccine against Cattle Tick Rhipicephalus microplus possible? Repositório Alice
BLECHA, I. M. Z.; CSORDAS, B. G.; AGUIRRE, A. de A. R.; CUNHA, R. C.; GARCIA, M. V.; ANDREOTTI, R..
The cattle tick Rhipicephalus microplus causes significant economic losses in agribusiness. Control of this tick is achieved mainly through the application of chemical acaricides, often resulting in contamination of animal food products and of the environment. Another major concern associated with acaricide use is the increasing reports of resistance of this tick vector against the active ingredients of many commercial products. An alternative control method is vaccination. However, the commercially available vaccine based on a protein homologous to Bm86 exhibits variations in efficacy relative to the different geographical locations. This study aimed to identify antigenic determinants of the sequences of proteins homologous to Bm86. Phylogenetic analyses...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Immuno-bioinformatics; Phylogenetic analyses; Imuno Bioinformática; Análise filogenética; Carrapato; Boi; Rhipicephalus microplus; Ticks.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101841
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Caracterização e análise filogenética de retrotransposons LTR em três diferentes espécies de Arachis. Repositório Alice
FONSECA, F. C. A.; NIELEN, S.; LEAL-BERTIOLI, S. C. M.; GUIMARÃES, P. M.; BERTIOLI, D. J..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Arachis; Caracterização; Análise filogenética.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188533
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Epidemiologia molecular de surto de raiva bovina na região central do Rio Grande do Sul, 2012 Ciência Rural
Kanitz,Fábio Adriano; Kowalski,Ananda Paula; Batista,Helena Beatriz de Carvalho Ruthner; Carnieli Junior,Pedro; Oliveira,Rafael de Novaes; Weiblen,Rudi; Flores,Eduardo Furtado.
A raiva é uma doença infecciosa do sistema nervoso central de mamíferos causada pelo vírus da raiva (RabV), geralmente, transmitido pela mordedura de animais infectados. No Brasil, os morcegos hematófagos Desmodus rotundus são as principais fontes de infecção do RabV para bovinos e equinos. Este artigo descreve uma investigação epidemiológica e molecular de surtos de raiva ocorridos na região central do Rio Grande do Sul, entre maio e agosto de 2012. Nesse período, 45 casos suspeitos de raiva foram relatados em 22 pequenos rebanhos, localizados dentro de um raio de 4,7km, no município de Pinhal Grande. Desses, 32 amostras foram submetidas para diagnóstico da raiva, sendo que o RabV e/ou antígenos virais foram identificados em 27 amostras. Em um segundo...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Raiva; Desmodus rotundus; Surtos; Análise filogenética.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014000500012
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Identidade e propriedades de isolados de potyvírus provenientes de Capsicum spp. Trop. Plant Pathol.
Truta,Adriana A.C.; Souza,Ana R. R. e; Nascimento,Ana V. S. do; Pereira,Rita de Cássia; Pinto,Cleide M.F.; Brommonschenkel,Sérgio H.; Carvalho,Murilo G. de; Zerbini,F. Murilo.
Vinte isolados virais provenientes de Capsicum spp. foram coletados em Minas Gerais, São Paulo, Espírito Santo e Rio de Janeiro visando definir a etiologia dos mosaicos. Para a caracterização biológica realizou-se teste de gama de hospedeiros e inoculação em cultivares diferenciadoras de pimentão (Capsicum annuum). Dois isolados provenientes de batata (Solanum tuberosum) (PVY N-BR e PVY O-BR) foram utilizados como controles. Os resultados indicaram considerável grau de variabilidade biológica entre os isolados, embora todos tenham sido identificados preliminarmente como Potato virus Y (PVY). A reação das cultivares diferenciadoras classificou os isolados como patótipo 1 ou 1.2 de PVY. Anti-soros foram produzidos a partir de partículas virais purificadas de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pimentão; Pimenta; PVY; PepYMV; Caracterização biológica; Sorologia; Análise filogenética; Proteína capsidial.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000200007
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Identification and taxonomy of some entomopathogenic Paecilomyces spp. (Ascomycota) isolates using rDNA-ITS sequences. Repositório Alice
INGLIS, P. W.; TIGANO, M. S..
bitstream/item/178061/1/ID-27755-1.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Análise filogenética; RDNA; Taxonomia molecular; Paecilomyces.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/187899
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Marcadores moleculares e análise filogenética. Infoteca-e
BUSO, G. S. C..
Marcadores Moleculares e Análise Filogenética; Utilização de DNA na análise filogenética; Métodos de inferência da filogenia; Métodos para construção das árvores filogenéticas; Análise de Máxima Parcimônia; Árvores de consenso; Método de máxima verossimilhança; Como enraizar uma árvore filogenética? Como utilizar os programas de construção de árvores filogenéticas? Limitações dos métodos descritos; Exemplos de utilização de marcadores moleculares em estudos filogenéticos; REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Marcadores moleculares; Análise filogenética.
Ano: 2005 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/187120
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Phylogenetic analysis of nodulation and nitrogen fixation genes of a brazilian collection of Bradyrhizobium strains. Repositório Alice
MENNA, P.; RIBEIRO, R. A.; HUNGRIA, M..
The genus Bradyrhizobium encompasses a variety of bacteria that can live in symbiotic and endophytic associations with legumes and non-legumes, and are characterized by physiological and symbiotic versatility and broad geographical distribution. In studies with Bradyrhizobium strains the comparison of phylogenies of nodulation and housekeeping genes has indicated a monophyletic origin of nodulation genes and diffusion by vertical and horizontal gene transfer, the last one probably influenced by the host plants. In previous studies with the strains analyzed in this study we have shown high diversity in the 16S rRNA, ITS rRNA, atpD, glnII, dnaK and recA housekeeping genes (Menna et al., 2006, 2009). However, despite indications of great genetic variability...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise filogenética; Fixação de nitrogênio; Nitrogen fixation.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/877017
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Taxonomia, análise cladística e descrição de uma espécie nova de Palpibracus Rondani (Diptera, Muscidae) Rev. Bras. entomol.
Soares,Elaine Della Giustina; Carvalho,Claudio José Barros de.
Palpibracus Rondani é um gênero de Muscidae que aloca 16 espécies, incluindo Palpibracus darwini sp. nov., descrita com base em espécimens macho de Concepción, Chile. Foi realizada uma análise cladística baseada em 31 caracteres morfológicos de adultos e utilizando 12 espécies como grupos externos. A análise mostrou que Palpibracus é um gênero monofilético cujo grupo-irmão é o gênero Brachygasterina. O relacionamento entre as espécies foi: (P. veneris ((P. albuquerquei (P. peruvianus, P. trivittatus)) (P. fasciculatus, P. nigriventris)) ((P. spicatus, P. uvivittatus) (P. lancifer (P. darwini sp. nov. (P. chilensis, P. confusus (P. pilosus ( P. similis (P. separatus, P. carvalhoi)))))))). Palpibracus apicalis Malloch foi alocada tentativamente em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Análise filogenética; Chave para espécies; Sistemática.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0085-56262005000200001
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Vírus da artrite encefalite caprina: isolamento e caracterização de parte do gene gag Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Lima,P.P.; Rocha,M.A.; Stancek,D.; Gouveia,A.M.G.; Oliveira,G.D.R..
Amostras de sangue de 12 animais soropositivos pelo teste de imunodifusão em gel de agarose e que não apresentavam sinais clínicos sugestivos de infecção pelo vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV) foram coletadas para isolamento viral. Mácrofagos derivados de monócitos foram co-cultivados com células de membrana sinovial caprina (MSC), resultando em cinco amostras que apresentaram efeito citopático característico do tipo persistente, semelhante ao observado para o CAEV. Uma técnica de reação em cadeia de polimerase (PCR) foi padronizada para amplificar parte do gene gag do genoma pró-viral, codificante para a proteína do capsídeo viral (p25). As cinco amostras foram amplificadas pela PCR e três delas, BR-UFMG/PL1, BR-UFMG/PL2 e BR-UFMG/PL3, foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: Vírus da artrite-encefalite caprina; Isolamento; PCR; Análise filogenética.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352004000200001
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