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Approches multifactorielles pour l'étude d'interactions entre l'huître creuse Crassostrea gigas et deux Vibrio pathogènes, V. splendidus et V. aestuarianus : épidémiologie, variabilité de la sensibilité de l'hôte et pathogenèse ArchiMer
De Decker, Sophie.
Oyster production is the main aquaculture activity in France and is dominated by the rearing of Crassostrea gigas. In the aquatic ecosystems where the species is grown, bacteria of the genus Vibrio are found to be dominant. Two Vibrio species, V. splendidus and V. aestuarianus, are frequently associated with Crassostrea gigas summer mortality episodes. The aims of this work were to study Vibrio-oyster interactions and their modulations according to virulence mechanisms and to genetic and physiological parameters of the host. Using specific, sensitive and quantifying diagnostic tools developed in this study, as well as standardized experimental infection trials, some components of the virulence of Vibrio strains and host susceptibility were delineated and...
Tipo: Text Palavras-chave: Bactériologie; Vibrio pathogène; Interactions Vibrio-huître; Crassostrea gigas; Vibrio splendidus; Vibrio aestuarianus; Epidémiologie; Facteurs de sensibilité.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00016/12697/9618.pdf
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Biostatistiques et Processus Spatiaux National Institute of Agronomic Research
Chadoeuf, Joël.
Tipo: Working Paper Palavras-chave: Ecology; Epidemiology; Population dynamics; Biostatistics; Ecologie; Epidémiologie; Dynamique des populations; Biostatistique.
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/2174/186
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Défis de la surveillance des maladies chez les coquillages marins en France ArchiMer
Lupo, Coralie; Francois, Cyrille; Arzul, Isabelle; Garcia, Celine; Joly, Jean-pierre; Renault, Tristan.
The basic concepts and objectives of animal disease surveillance are common to all types of animal production. Yet, the procedures for implementation have been mostly developed for terrestrial animal productions. Disease surveillance in marine shellfish calls for specific measures in view of the peculiarities of marine biology and rearing techniques. The main objective of disease surveillance in marine shellfish is to detect as early as possible exotic and newly emerging diseases. With this objective in mind, a national surveillance network for surveillance of mollusc diseases called Repamo has been developed. It combines passive reporting and risk-based surveillance.
Tipo: Text Palavras-chave: Surveillance; Coquillage; Milieu marin; Détection précoce; Epidémiologie; Surveillance; Shellfish; Marine environment; Early detection.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00109/22023/19653.pdf
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Données sur le nouveau parasite de l'huître plate. Situation épidémiologique ArchiMer
Tige, Gilbert; Grizel, Henri; Comps, Michel.
Abnormal mortalities of flat oysters, Ostrea edulis, have been monitored in June 1979 in some farms of l'Ile Tudy. The examination of these oysters with light and electron microscopy showed different forms of an intracellular parasite localized in the connective tissue of the gills and the digestive gland. It is also detectable in the blood vessels and the stomachal epithelium. Numerous parasited oysters showed distinctive branchial damages (perforations, indentations) visible through macroscopic examination. The epidemiological monitoring carried out on the Norman and Breton coast revealed the presence of this parasite in a large number of flat oyster farms. The percentage of parasited oysters is higher in areas where mortalities have been monitored but...
Tipo: Text Palavras-chave: Epidémiologie; Huître plate; Ostrea edulis; Mortalité.
Ano: 1980 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1980/acte-4925.PDF
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Epidémiologie analytique et descriptive des agents pathogènes, étude de la diversité des virus de type herpès (action 1). Etude des relations hôtes/agents pathogènes, pathogénèse des infections à virus de type herpèsvirus (action 2) - Contrat Région Poitou-Charentes 2000-2006 ArchiMer
Renault, Tristan; Le Roux, Frederique; Berthe, Franck; Arzul, Isabelle; Miossec, Laurence; Robert, Maeva; Chollet, Bruno.
Nous disposons aujourd'hui d'o utils diagnostiques sensibles et spécifiques (PCR, HIS ... ) et d'un protocole de transmission de l' infection qui permettent d'assurer un suivi des productions larvaires en écloserie de bivalves pour les espèces considérées comme sensibles aux infections à herpèsvirus, mais également pour de nouvelles espèces. En effet, des mortalités massives (100 %) ont été rapportées dans une écloserie de coquille St-Jacques en Bretagne et ont pu être associées à la détection de OsHV -1. Les résultats obtenus concernant cette espèce, Pecten maximus, complètent et reflètent l'ensemble des travaux réalisés.
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Epidémiologie; Virus; Herpès virus; Bivalves; Crassostrea gigas; Ruditapes philippinarum; Pecten maximus.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15472/12851.pdf
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Epidémiologie des bivalves ArchiMer
Grizel, Henri.
The notions of pathology and epidemiology in marine aquaculture are relatively new, especially as far as molluscs are concerned, as they've only been used for about thirty years. Although numerous studies have been conducted, and the concepts in these specific fields have evolved, only very few actions are proposed to stop the spreading of a disease. Only a few main mollusc species are cultivated throughout the world and most of them suffered or suffer from epizooties. Today, their pathological history is more solid: several infectious diseases are now known, numerous pathogens or potential pathogens have been described, diverse mortalities have been studied and several types of tumours have been observed. We now live in some cases, as for the flat oyster...
Tipo: Text Palavras-chave: Aquaculture marine; Pathologie; Conchyliculture; Bivalves; Epidémiologie.
Ano: 1992 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1992/acte-6580.pdf
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Epidémiologie et facteurs de virulence des bactéries du genre Vibrio responsables de mortalité de crevettes d'élevage en Nouvelle-Calédonie. Pespectives de lutte ArchiMer
Goarant, Cyrille.
La Nouvelle-Calédonie présente de nombreux atouts pour la pénéiculture. Le ralentissement brutal de son développement en 1993 s'explique par l'émergence d'une pathologie saisonnière qui affecte les crevettes juvéniles en grossissement, mettant en cause des bactéries du genre Vibrio et qui a reçu le nom de Syndrome 93. Vibrio penaeicida et V. nigripulchritudo sont deux espèces au pouvoir pathogène particulièrement élevé qui affectent les élevages. Une étude de typage moléculaire a permis de préciser leur épidémiologie et de proposer quelques conseils d'ordre zoosanitaire. Un suivi épidémiologique par amplification génique est en cours pour V. penaeicida, qui montre l'importance des facteurs écologiques dans l'apparition des épisodes pathologiques. La...
Tipo: Text Palavras-chave: Litopenaeus stylirostris; Vibrio penaeicida; Epidémiologie; Pathogénicité; Nouvelle-Calédonie.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00444/55510/57060.pdf
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Epidémiologie moléculaire des espèces Marteilia en Europe ArchiMer
Le Roux, Frédérique; Audemard, Corinne; Cochennec, Nathalie; Thebault, Anne; Berthe, Franck.
Responsible for massive epizootics, the Marteilia type parasites are very dangerous infectious agents for oysters. As a matter of fact, in France the spreading out of the parasitosis caused by Marteilia refringens disturbed dangerously the flat oyster, Ostrea edulis, production; destroying a large percentage of the farms on the Atlantic coast. The fight against marteiliose implies a good management of the contamination risk, that is to say the identification of the parasite(s), the characterization of the host(s), vector(s) or reservoir(s) and the understanding of the parasite's transmission mode.
Tipo: Text Palavras-chave: Bivalves; Biologie Moléculaire; Marteilia refringens; Epidémiologie.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3271.pdf
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Epidemiovigilance dans le cas de mortalités anormales de coquillages : exemple des coques du Croizic ArchiMer
Thebault, Anne.
Detection of an emerging disease is a crucial aspect for animal health. For the french marine mollusc aquaculture the interest is obvious, after three catastrophic epizooties. The methodological approach must be done by three different disciplines : epidemiology, ecology and marine pathology. Those three approachs are complementary in the special context of marine outbreaks. The uncertainty about many criteria and the lack of  proofs feasible for showing the causality link, make the different approachs a necessity. The first step is the study of the three boxes, host, agent, environrnent. This approach, made for studying the cockles of the Croisic's bay could help us to make hypothesis about the possible origins ofmortality, and to a void measurement,...
Tipo: Text Palavras-chave: Epidémiologie; Maladie émergente; Coques; Cerastoderma edule; Océanologie; Epidemiology; Emerging disease; Cockles; Cerastoderma edule; Oceanology.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00448/55950/57428.pdf
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Etude des agents pathogènes et épidémiologie ArchiMer
Renault, Tristan; Le Roux, Frederique; Berthe, Franck; Robert, Maeva; Chollet, Bruno; Gerard, Andre.
Le programme 4 portant sur la pathologie des coquillages dans le cadre d'une gestion durable des productions ostréicoles, comporte 2 actions principales réparties en une étude d'épidémiologie analytique et descriptive des agents pathogènes (Action 1), et l'étude des relations hôtes/agents pathogènes (Action 2). Les résultats 2001 présentés ici sont relatifs à ces 2 actions, avec notamment des informations sur les infections à virus de type herpès, et de recherche de bactéries pathogènes chez Crassostrea gigas lors des épisodes de mortalités estivales. Par ailleurs, l'émergence d'un programme national, intitulé MOREST (pour Mortalités Estivales) sur l' huître creuse C. gigas va permettre de rappeler le contexte scientifique des relations hôtes/pathogènes.
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Agents pathogènes; Epidémiologie; Huître creuse; Crassostrea gigas.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31011/29414.pdf
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Etude épidémiologique descriptive des mortalités exceptionnelles d'huîtres creuses enregistrées sur le littoral français en 2008 ArchiMer
Miossec, Laurence; Allain, Gwenhael; Arzul, Isabelle; Francois, Cyrille; Garcia, Celine; Cameron, Angus.
En 2008, des mortalités massives d'huîtres creuses (Crassostrea gigas) ont été recensées en France pendant l'été. Ce phénomène, observé de façon récurrente sur les côtés françaises depuis le milieu des années 70, a présenté un caractère exceptionnel en 2008 car il a été observé simultanément dans tous les bassins ostréicoles. De plus, les taux de mortalité calculés ont été particulièrement élevés (80 à 100 % pour de nombreux lots). La détection, fréquente et souvent simultanée, d'herpèsvirus OsHV1 et de plusieurs bactéries de la famille des Vibrionacées dans le cadre de la surveillance menée par le réseau national Repamo (réseau de pathologie des mollusques) a mis en évidence le caractère infectieux de l'épisode épidémique 2008. Une étude épidémiologique a...
Tipo: Text Palavras-chave: France; Crassostrea gigas; Huîtres; Mortalités; Epidémiologie.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/acte-6771.pdf
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La bonamiose de l' huître plate Ostrea edulis. Bilan des connaissances actuelles, analyse des données collectées en France de 1989 à 2004, mesures de lutte et perspectives ArchiMer
Blanchet, Estelle.
Bonamiosis, favoured by change of temperature and stress, causes mortalities in the adult flat oyster Ostrea edulis in the majority of European oyster farmers. The life cycle of this Haplosporidia protozoan Bonamia ostreae is unknown, it is not dttectable during the five mon th latent period. Because of the Jack of sensibility of reference techniques, histology and tissue smear, further use of PCR assays or HCM-CC, in particular, is recommended. Analysis of data collected in France from 1989 to 2004 shows the absence of simple prediction methods and an apparent cyclicity of the disease. Transfer restriction and control of boat hulls can protect uninfected areas. Reducing stress and density, commercialising earlier can limit losses in infected areas. The...
Tipo: Text Palavras-chave: Bivalve; Bonamia ostreae; Epidémiologie; Haplosporidia; Huître plate; Lutte; Ostrea edulis; Protozoaire; Surveillance; Bonamia ostreae; Control; Epidemiology; Flat oyster; Haplosporidia; Ostrea edulis; Protozoan; Survey.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00451/56235/57795.pdf
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Les réseaux d'épidémio-surveillance REPANUI et REPAMO ArchiMer
Joly, Jean-pierre; Cochennec, Nathalie; Fougerouse, Angélique; Francois, Cyrille.
Created in 1992, the French network REPAMO is in charge of the surveillance and monitoring of the mollusc health status along the French coast according to European legislation. The missions of the network are the following: (1) the surveillance of notifiable diseases present in France, (2) the study of abnormal mortalities, (3) the surveillance of health status of cultivated and natural mollusc populations. The more recent network REPANUI has similar goals mainly focused on the pearl oyster health status to support the oyster farming industry in French Polynesia.
Tipo: Text Palavras-chave: REPAMO; REPANUI; Perspective; Gestion; Organisation; Epidémiologie; Réseaux surveillance.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2978.pdf
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Pathologie des invertébrés marins d'intérêt aquacole. Contribution et stratégies de recherches ArchiMer
Mialhe, Eric.
Les productions d'invertébrés sont prépondérantes en aquaculture marine qui est économiquement très importate pour un grand nombre de pays, notamment de la zone Sud. Cette activité est confrontée à de nombreux problèmes des pathologie qui remettent en cause sa périnnité et son développment. Jusque dans les années quatre-vingt, les travaux relatifs à la pathologie des mollusques et des crevettes ont essentiellement porté sur la description des agents pathogènes. La création en 1985 par l'ISTPM/IFREMER d'un laboratoire pourvu de tous les équipements nécessaires aux techniques de pathologie a permis de mettre en place un programme de recherches orienté vers le contrôle des maladies. Une double stratégie de travail a été alors défine pour apporter  à...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathologie; Immmunologie; Génétique; Mollusque; Crevette; Diagnostic; Epidémiologie; Traitement; Sélection; Transformation génétique.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00443/55479/57009.pdf
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Rapport sur la situation zoosanitaire du cheptel Crassostrea gigas : cas du bassin de Marennes-Oléron ArchiMer
Grizel, Henri; Renault, Tristan; Cochennec, Nathalie; Tige, Gilbert; Audic, Guylaine; Pichot, Yves; Chollet, Bruno; Goulletquer, Philippe; Soletchnik, Patrick; Geairon, Philippe; Prou, Jean.
Le cheptel d'huîtres creuses, Crassostrea gigas, du Bassin de Marennes-Oléron a subi ces dernières années des morta lités (mai 88, mai 91, été 1992 et hiver 92-93). Les examens histopathologiques pratiqués durant celles-ci n'ont pas permis de déceler d'agents pathogènes. Les causes avaient été attribuées essentiellement, pour les premiers cas, à un manque de nourriture corrélé avec des conditions de sécheresse (donc un manque d'apport d'eau douce pour le bassin) et à des surcharges trop importantes des biomasses de fiItreurs, huîtres y compris. L'explication du dernier cas de mortalité survenue au cours de l'hiver serait d'un autre ordre: l'abaissement brutal des salinités, notamment dans les claires où étaient épurées soit des huîtres natives fragilisées,...
Tipo: Text Palavras-chave: Etude zoosanitaire; Mortalité; Epidémiologie; Pathologie; Marennes Oléron.
Ano: 1993 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00050/16152/13635.pdf
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Relance de l'huître plate Ostrea edulis L.. Rapport d'avancement 1987 ArchiMer
Ifremer, Equipe Ressources Aquacoles de La Trinité-sur-Mer; Ifremer, Pathologie et Génétique des Invertébrés Marins de La Tremblade.
La situation zoosanitaire reste inchangée en ce qui concerne l'extension des parasitoses, cependant à l'exception de la Baie de Saint-Brieuc, la virulence de Bonamia ostreae a diminuée et a permis de poursuivre les essais d'élevage à Cancale et de reprendre l'élevage en Baie de Quiberon. Des essais réalisés avec le naissain d'écloserie obtenu à partir d'huîtres ayant résisté à la parasitose montre l'acquisition d'une certaine résistance. Les tests seront poursuivis en 1988 et au cours des Prochaines années. Selon les résultats, l'effort de captage pourra être porté sur les zones où cette résistance pourrait être plus marquée. Les travaux sur les modèles menés en pathologie fondamentale ont permis de mettre en évidence chez Crassostrea gigas un facteur de...
Tipo: Text Palavras-chave: Ostrea edulis; Epidémiologie; Pathologie; Hémocytes; Echantillonnage; Elevage.
Ano: 1988 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00271/38221/36380.pdf
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Revue systématique de la littérature relative aux facteurs de risque de mortalité des moules exploitées en France ArchiMer
Lupo, Coralie; Le Bouquin, Sophie.
La recherche bibliographique maximalisée réalisée dans le cadre de cette revue systématique de la littérature a permis de décrire le paysage de la connaissance existante sur les facteurs de risque de mortalité des espèces de moules M. edulis et M. galloprovincialis. Ces travaux ont abouti à la formalisation d’une méthodologie rigoureuse, transparente et reproductible pour la réalisation de revue systématique relative aux facteurs de risque de mortalité chez les coquillages marins. Cette revue a décrit la diversité des définitions de la mortalité des moules et ses facteurs de risque. Elle a également permis d’apprécier la quantité et la qualité des preuves recensées. Cette revue systématique a recensé 125 facteurs étudiés pour leur relation avec la...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques marins; Coquillages bivalves; Moules; Mytilus edulis; Mytilus galloprovincialis; Mortalité; Facteurs de risque; Epidémiologie; Revue systématique; Bibliographie; Marine molluscs; Bivalve shellfish; Mussels; Mytilus edulis; Mytilus galloprovincialis; Mortality; Risk factors; Epidemiology; Systematic review; Bibliography.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00487/59916/63099.pdf
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Suivi pathologique du développement larvaire dans les bassins de Marennes-Oléron et d'Arcachon ArchiMer
Lamothe, Julien.
Des infections à virus de type Herpès sont rapportées chez différentes espèces de mollusques bivalves, à travers le monde. Elles sont associées à de fortes mortalités des larves dans les périodes chaudes de l'année dans des écloseries. Les variations inter-annuelles d'intensité du captage de Crassostrea gigas, et plus particulièrement le déficit de celui-ci en 1998, dans le bassin d'Arcachon, ont conduit à un programme pluriannuel de suivi. Ainsi, l'évolution des populations naturelles de larves d'huître creuse, des deux bassin de captage, Arcachon et Marennes-Oléon, est suivi afin d'expliquer d'éventuelles anomalies du recrutement. Dans ce cadre, la détection du virus de type Herpès sur ces larves du milieu naturel a été effectuée, à partir d'un protocole...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques bivalves; Crassostrea gigas; Huître creuse; Larves; Herpèsvirus; Captage; Mortalités anormales; Epidémiologie.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00368/47926/47955.pdf
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Taxinomie et épidémiologie moléculaires du parasite Marteilia refringens Grizel et al. 1974 : intérêt pour la gestion du risque sanitaire en conchyliculture ArchiMer
Berthe, Franck.
Infectious diseases are currently recognised as a major limiting factor to development and sustainability of aquaculture of molluscs. The study is focused on the European flat oyster, Ostrea edulis and its paramyxean parasite Marteilia refringens. Results are contributing to the prevention of risk associated to infected stocks imports from endemic zones, by developing molecular diagnostic tools that are specific, sensible and reliable. Phylogeny and taxonomy of Marteilia refringens, previously impeded by microscopy limits, were clarified by sequencing the rDNA SSU, small sub-unit in the rRNA gene cluster. These new insights have practical implications discussed in a pragmatic polyphasic approach involving pathology and epidemiology. This approach led us to...
Tipo: Text Palavras-chave: Marteilia refringens; Marteilia maurini; Ostrea edulis; Mytilus edulis; Pathologie; Phylogénie moléculaire; Taxinomie; Epidémiologie; Marteilia refringens; Marteilia maurini; Ostrea edulis; Mytilus edulis; Molluscs diseases; Molecular phylogeny; Taxonomy; Epidemiology.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00109/21980/19594.pdf
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Traitement à haute température des huîtres infectées par l’ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1). TEMPO - Rapport 2016 ArchiMer
Pernet, Fabrice.
Le naissain d’huître creuse Crassostrea gigas est touché chaque année depuis 2008 par des mortalités causées par un microvariant de l’ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1 μVar). Plusieurs études montrent que ces évènements de mortalité se produisent préférentiellement lorsque la température de l’eau est comprise entre 16°C et 24°C. Par conséquent, une exposition rapide des huîtres infectées par OsHV-1 à des températures supérieures à 24°C pourrait limiter les mortalités causées par le virus. Il est proposé de (1) vérifier l’hypothèse selon laquelle l’exposition à haute température réduit la mortalité des huîtres infectées par OsHV-1, et (2) déterminer si les animaux qui ont survécu suite à l’infection par OsHV-1 et au traitement thermique sont...
Tipo: Text Palavras-chave: Epidémiologie; Huître; OsHV-1; Risque; Survie; Température; Epidemiology; Oysters; OsHV-1; Risk; Survival; Temperature.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00434/54574/55953.pdf
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