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Amplificação cruzada de marcadores microssatélites desenvolvidos para Melipona subnitida (Ducke) em Frieseomelitta varia (Lepeletier). Repositório Alice
MOURA, V. G. de; NEGREIROS, A. B.; SILVA, G. R. da; SOUZA, I. G. de B.; PEREIRA, F. de M.; DINIZ, F. M..
Com escassos estudos, as abelhas-sem-ferrão da espécie Frieseomelitta varia (Lepeletier), apresentam potencial econômico e ecológico que, diante das adversidades ambientais, remete a medidas de conservação que garantam a sobrevivência da espécie. Com isso, o uso de marcadores microssatélites constitui importante ferramenta para auxiliar a elaboração de estratégias de manejo e conservação.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Abelhas-sem-ferrão; Primers heterólogos; Genética de populações.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102381
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Análise dos coeficientes de endogamia e de parentesco para qualquer nível de ploidia usando o pacote estatístico R Bragantia
Peternelli,Luiz Alexandre; Ferreira,Fábio Medeiros; Rocha,Rodrigo Barros; Barros,Willian Silva; Barbosa,Márcio Henrique Pereira.
São poucos os softwares disponíveis para a análise de parentesco e, até a presente data, nenhum pode realizar a análise de parentesco para organismos poliplóides, com número par (2k) de cromossomos. Implementou-se junto ao programa R uma rotina capaz de executar a análise de parentesco para qualquer nível 2k de ploidia, número de indivíduos (ou populações) e número de gerações envolvidas na árvore genealógica. A função principal, calc.rxy() calcula o coeficiente de endogamia (F X) de cada indivíduo; coeficientes de parentesco (rXY) entre dois indivíduos quaisquer; e coeficiente de parentesco médio, variância, mínimo e máximo, para cada indivíduo. Ela pode mostrar a matriz completa de parentesco ou uma submatriz pré-definida de indivíduos selecionados....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genética de populações; Poliplóides; Análise de pedigree.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052009000400004
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Banco de germoplasma de pinos: Instituto Florestal de São Paulo, Brasil. Repositório Alice
FREITAS, M. L. M.; ZANATTO, A. C. S.; SOUSA, V. A. de; AGUIAR, A. V. de; SEBBENN, A. M.; ZIMBACK, L..
2011
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética de populações; Parâmetros genéticos; Melhoramento vegetal; Araucaria angustifolia.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/907930
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Caracterização de um rebanho da raça ovina Somalis Brasileira com base em análise de Pedigree. Repositório Alice
AGUIAR, A. L. de; COSTA, A. C.; GALVÃO, M. A. A.; SANTOS, T. N. M. dos; SILVA, K. de M.; SHIOTSUKI, L.; LOBO, R. N. B..
Resumo: Este estudo teve como objetivo avaliar a estrutura populacional do Núcleo de Conservação de Ovinos da Raça Somalis Brasileira, da Embrapa Caprinos e Ovinos, Sobral - CE. Foram utilizadas informações de pedigree de 1.353 animais, nascidos entre os anos 2000 e 2014. A endogamia média e o coeficiente médio de parentesco foram 2,68% e 9,60% respectivamente. O número máximo de gerações conhecidas foi de oito, com aumento significativo das informações de pedigree ao longo das gerações. Do total de animais estudados, 86,55%, 61,25% e 45,49% possuíam informações de pedigree na primeira, segunda e terceira ascendência. O intervalo médio de gerações foi de 4,33 anos. O tamanho efetivo da população foi de 27,48 animais, abaixo do valor recomendado para a...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Raça Somalis Brasileira; Diversidade genética; Genetic diversity as resource; Diversidade genética; Estrutura populacional; Raça localmente adaptada; Pedigree; Variabilidade genética; Genética de populações; Raça localmente adaptada; Ovino; Conservação; Endogamia; Sheep; Genetic diversity as resource; Animal genetics; Population genetics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1035378
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Caracterização genética de bovinos da raça Nelore Variedade Vermelha por meio de marcadores microssatélites1. Repositório Alice
EGITO, A. A. do; PEDREIRA,M. M.; ROSA, A. do N.; SIQUEIRA, F.; SANTOS, S. A..
2013
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Diversidade genética; Genética de populações; STR; Structure.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/972012
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Clonal selection of Eucalyptus grandis x Eucalyptus globulus for productivity, adaptability, and stability, using SNP markers. Repositório Alice
TORRES-DINI, D.; NUNES, A. C. P.; AGUIAR, A. V. de; NIKICHUK, N.; CENTURIÓN, C.; CABRERA, M.; MORAES, M. L. T.; RESENDE, M. D. V. de; SEBBENN, A. M..
In Uruguay, reforestations with Eucalyptus sp. is of fundamental importance to supply paper, pulp, and wood production. This study investigates genetic, productivity, stability, and adaptability parameters in the selection of Eucalypts grandis x Eucalyptus globulus full-sib hybrid clones. The study was conducted in a clonal test, repeated in two different soils types, in Rio Negro State, Uruguay. The population was characterized phenotypically for diameter at breast height (dbh) and genotyped for SNP markers (EuCHIP60K chip). Mean dbh was similar between sites and the genotype?environment interaction was simple. We found high genotype correlation in clone performance between environments (0.708), indicating the possibility of selecting the same clones for...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genética de populações; Genética quantitativa; Forest breeding; Gene markers; Eucalipto; Híbrido; Melhoramento genético vegetal; Eucalyptus; Hybrids; Plant breeding; Population genetics; Quantitative genetics.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080981
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Comparação bayesiana de modelos com uma aplicação para o equilíbrio de Hardy-Weinberg usando o coeficiente de desequilíbrio Ciência Rural
Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Aquino,Luiz Henrique de.
O equilíbrio de Hardy-Weinberg é um dos principais assuntos estudados pela Genética de populações. Neste contexto, o presente trabalho aborda a análise e a comparação bayesiana de modelos utilizando o coeficiente de desequilíbrio (D A). Para isso, realizou-se um estudo de simulação no qual as seguintes distribuições a priori foram consideradas: Dirichlet (modelo 1); beta - função degrau uniforme (modelo 2); uniforme - função degrau uniforme (modelo 3); e as prioris independentes uniformes (modelo 4). Exemplos de aplicação a dados reais de grupos raciais também são apresentados e discutidos. As amostras das distribuições marginais a posteriori para os parâmetros de interesse foram obtidas mediante o algoritmo Metropolis-Hastings, o qual foi implementado no...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fator de Bayes; Genética de populações; Simulação de dados.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000500016
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Diversidade e estrutura genética para virulência de três populações sul brasileiras de Puccinia coronata Bragantia
Vieira,Eduardo Alano; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Chaves,Márcia Soares; Oliveira,Antônio Costa de; Martins,Andreza Figueirola; Silva,José Antônio Gonzalez da; Hartwig,Irineu; Silva,Giovani Olegário da; Carvalho,Marcos Fontoura de; Busato,Cyrano Cardoso.
Estudos de diversidade e estrutura genética de populações de patógenos por meio de genes de resistência conhecidos são importantes, por permitirem o acesso de forma direta aos genes de virulência/avirulência dos indivíduos das diferentes populações-alvo. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade e a estrutura genética de três populações de Puccinia coronata f. sp avenae Fraser & Led do Estado do Rio Grande do Sul, por meio da utilização do padrão fenotípico de virulência/avirulência de 40 isolados a 25 genes Pcs. Os resultados obtidos evidenciaram que apesar da elevada variabilidade em virulência dos isolados sul-brasileiros, a população apresenta diversidade genética moderada, principalmente em função da alta virulência...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avena sativa L.; Ferrugem da folha da aveia; Resistência; Genética de populações.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052006000100019
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Estimates of genetic parameters and variability in provenances and progeny of Handroanthus vellosoi PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
Batista, Camila Moreira; Freitas, Miguel Luiz Menezes; Moraes, Marcela Aparecida de; Zanatto, Antonio Carlos Scatena; Santos, Pedro César dos; Zanata, Marcelo; Moraes, Mario Luiz Teixeira de; Sebbenn, Alexandre Magno.
The present study aimed at estimating genetic parameters and variability among and within provenances for silvicultural traits of Handroanthus vellosoi (Toledo) Mattos, in provenances and progenies test stands, located at the Luiz Antônio Experimental Station (São Paulo State, Brazil). The test was established in the compact family block design, with two provenances (allocated in the plots), six replicates and sub-linear plots of five plants, totalizing 35 progenies. Diameter at breast height (DBH), plant height, cylindrical volume, stem form and survival at 24 years of age were evaluated. Significant differences among the provenances were observed only to the trait stem form. The analysis of deviance showed significant differences among progenies for the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ex situ conservation; Tropical tree species; Population genetics; Quantitative genetics Recursos genéticos florestais; Conservação genética; Genética de populações; Genética quantitativa; Melhoramento genético florestal Conservação ex situ; Espécies arbóreas tropicais; Genética de populações; Genética quantitativa.
Ano: 2012 URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/358
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Estudo genético de Araucaria angustifolia (BERT) O. Ktze. como base para um programa de controle dos danos causados pelo macaco-prego aos plantios comerciais de Pinus spp. Repositório Alice
D'AGOSTIN, P. T.; SOUSA, V. A. de; MIKICH, S. B.; LIEBLICH, D..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética de populações; Variedade de araucária; Isoenzima.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/315614
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Estudo preliminar de transferabilidade de marcadores microssatélites desenvolvidos para abelhas Melipona em Frieseomelitta varia (Lepeletier). Repositório Alice
MOURA, V. G. de; NEGREIROS, A. B.; SOUZA, I. G. de B.; SILVA, G. R. da; PEREIRA, F. de M.; DINIZ, F. M..
Com escassos estudos, as abelhas-sem-ferrão da espécie Frieseomelitta varia (Lepeletier) apresentam potencial econômico e ecológico que remete a medidas de conservação que garantam a sobrevivência da espécie diante das adversidades ambientais. Com isso, o uso de marcadores microssatélites constitui importante ferramenta para auxiliar a elaboração de estratégias de manejo e conservação.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Abelhas-sem-ferrão; Amplificação cruzada; Genética de populações.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1120523
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Método bootstrap aplicados em níveis de reamostragem na estimação de parâmetros genéticos populacionais Scientia Agricola
Carlini-Garcia,Luciana Aparecida; Vencovsky,Roland; Coelho,Alexandre Siqueira Guedes.
Marcadores isoenzimáticos ou moleculares têm sido empregados em estudos da estrutura genética e do sistema reprodutivo de populações naturais. Parâmetros genéticos populacionais de interesse são estimados, porém, há pouca informação sobre o erro associado a essas estimativas em função dos diferentes níveis de amostragem. Neste trabalho, o método de reamostragem bootstrap foi aplicado sobre locos, indivíduos, populações e indivíduos e populações concomitantemente, em dados de populações naturais. Para os parâmetros índice de fixação total (F ), índice de fixação intrapopulacional ( f ), diversidade entre populações (teta) e taxa aparente de cruzamento (t a) foram obtidos, em função das fontes de reamostragem, os erros associados às estimativas desses...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Estrutura populacional; Genética de populações; Estimação.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162001000400021
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Paternidade em rebanhos caprinos por meio de microssatélites de DNA. Repositório Alice
ARAÚJO, A. M. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA C. S.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T.; COLUMBIANO, V. S..
2004
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Caprino; Estrutura populacional; Genética de populações; Microssatélites; Raça naturalizada; Teste de paternidade; Microsatellite.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/534250
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Populational genetic structure of Manilkara huberi (Ducke) A. Chev., a heavily logged amazonian timber species. Repositório Alice
AZEVEDO, V. C. R.; CIAMPI, A. Y.; KANASHIRO, M..
bitstream/item/175961/1/doc126.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcadores moleculares; Marcadores microssatélites; Diversidade genética; Genética de populações; Estrutura; Maçaranduba; Manilkara Huberi.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/907715
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Similaridade genética entre rebanhos de bovinos curraleiro pé-duro: implicações para a sua conservação. Repositório Alice
EGITO, A. A. do; JULIANO, R. S..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética de populações; Gestão genética; Raça localmente adaptada; STR.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027343
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Similaridade genética entre rebanhos de bovinos Curraleiro Pé-Duro: implicações para a sua conservação. Repositório Alice
EGITO, A. A. do; MARTINEZ MARTINEZ, A.; FIORAVANTI, M. C. S.; JULIANO, R. S.; LANDI, V.; MOURA, M. I.; SILVA, M. C.; DELGADO, J. V. B..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética de populações; Gestão genética; Raça localmente adaptada; STR; Raça; Bovino; Animal genetic; Cattle.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027794
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Sistema de reprodução em população natural de Chorisia speciosa A. St.-Hil. (Bombacaceae) Rev. Bras. Bot.
Souza,Lina M.F.I.; Kageyama,Paulo Y.; Sebbenn,Alexandre M..
O objetivo do presente trabalho foi avaliar a taxa de cruzamento de uma população de Chorisia speciosa por marcadores isoenzimáticos. Foram amostradas sementes de polinização aberta em 28 árvores e tecidos foliares em 53 árvores adultas de uma população de C. speciosa localizada na Estação Ecológica de Bauru, São Paulo, Brasil. Observou-se 18 alelos distribuídos em sete locos polimórficos. O índice de fixação (<img border=0 width=32 height=32 id="_x0000_i1026" src="../../../img/revistas/rbb/v26n1/a11let_f.gif" align=absmiddle>) foi menor nos adultos em relação às progênies, sugerindo seleção contra homozigotos. A estimativa da taxa de cruzamento multilocos (<img border=0 width=32 height=32 id="_x0000_i1027"...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Chorisia speciosa; Eletroforese de isosimas; Genética de populações; Linhagens correlacionadas; Taxa de crescimento.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-84042003000100012
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Variabilidade Genética em Populações de Aedes aegypti (L.) (Diptera: Culicidae) Utilizando Marcadores de RAPD Neotropical Entomology
Hiragi,Cassia; Simões,Kenya; Martins,Erica; Queiroz,Paulo; Lima,Luzia; Monnerat,Rose.
Aedes aegypti (L.) é vetor de importantes doenças como a febre amarela e a dengue, presentes em regiões tropicais e subtropicais. Para o sucesso no seu controle biológico é importante conhecer a estrutura genética e os mecanismos que resultaram na diversidade das populações. O objetivo deste estudo foi analisar a variabilidade genética de diferentes populações de A. aegypti utilizando marcadores de RAPD (Polimorfismo de DNA amplificado ao acaso). DNA de dez larvas coletadas a partir de três populações de diferentes localidades foi analisado usando dez iniciadores de RAPD. Os resultados indicaram a existência de variabilidade genética inter e intrapopulacional. Isso foi confirmado por um dendrograma que agrupou as populações em dois blocos principais com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Vetor da dengue; Genética de populações; Resistência.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2009000400018
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Variação genética de uma população natural de Araucaria angustifolia (Bert) O. Ktze. Repositório Alice
BORTULLUCI, D.; SOUSA, V. A.; RIGONI, D..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Isoenzima; Genética de populações; Pinheiro-do-Paraná.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/315613
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