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A new glanapterygine catfish of the genus Listrura (Siluriformes: Trichomycteridae) from southeastern Brazil, corroborated by morphological and molecular data Neotropical Ichthyology
Villa-Verde,Leandro; Lazzarotto,Henrique; Lima,Sergio M. Q..
Listrura costai, new species, is described from small streams in a swampy coastal plain in the rio Jurumirim basin, Angra dos Reis Municipality, Rio de Janeiro State, southeastern Brazil. The new species is morphologically very similar to L. nematopteryx and L. picinguabae, all possessing only one long pectoral-fin ray. It differs from its congeners by possessing an autapomorphic character: first hypobranchial with an anterior process (vs. process absent). Other features such as coloration, numbers of opercular and interopercular odontodes, number of anal-fin rays, head length, and shape of some bone structures help to distinguish the new species from L. nematopteryx and L. picinguabae. Molecular analyses using partial sequences of the mitochondrial DNA...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Atlantic rain forest; Genetic distance; Mitochondrial DNA; Taxonomy.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1679-62252012000300005
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A new species of Tetragonopterus Cuvier, 1816 (Characiformes: Characidae: Tetragonopterinae) from the rio Jari, Amapá, northern Brazil Neotropical Ichthyology
Melo,Bruno F; Benine,Ricardo C; Mariguela,Tatiane C; Oliveira,Claudio.
A new species of Tetragonopterus is described from the rio Jari, a tributary to the left margin of rio Amazonas, at the border between Amapá and Pará States, northern Brazil. It is morphologically diagnosed from the other species of the genus (T. argenteus, T. chalceus, and T. rarus new combination) by the lozenge-shaped spot on the caudal peduncle vs. rounded to square spot on the other species. Partial sequences of the mitochondrial gene Cytochrome Oxidase C subunit I, from representatives of all valid species of Tetragonopterus, including this new species, were analyzed. The obtained results revealed a significant genetic distance between the new species and its congeners. A discussion on the new combination, Tetragonopterus rarus, is also provided.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: COI gene; Genetic distance; Mitochondrial DNA; Neotropical fish; Taxonomy.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1679-62252011000100002
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Allozyme comparison of two populations of Rineloricaria (Siluriformes, Loricariidae) from the Ivaí River, upper Paraná River basin, Brazil Genet. Mol. Biol.
Limeira,Daniel M.; Renesto,Erasmo; Zawadzki,Cláudio H..
Two allopatric morphotypes of the genus Rinelocaria were compared through the allozyme electrophoresis technique: one morphotype, R. pentamaculata, from the Keller River in the middle stretch of the Ivaí River basin and the other, R. aff. pentamaculata, from the São João River in the upper portion of the Ivaí River basin. The morphotype from the São João River was collected upstream from the São João waterfall, which is about 80 m deep. Twelve enzymatic systems (AAT, ADH, EST, GCDH, G3PDH, GPI, IDH, LDH, MDH, ME, PGM and SOD) were analyzed, which allowed to score 22 loci. Only loci Aat-2, Est-3 and Mdh-C showed polymorphism. The two samples differed in allele frequencies at the three polymorphic loci. The average expected heterozygosity for all loci was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other Palavras-chave: Allozymes; Fish genetics; Genetic distance; Polymorphism; Loricariidae; Pisces.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572009000200034
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Avaliacao da divergencia genetica de germoplasma de abobora procedente de diferentes areas do Nordeste do Brasil. Repositório Alice
RAMOS, S. R. R.; QUEIROZ, M. A. de; CASALI, V. W. D.; CRUZ, C. D..
O objetivo deste estudo foi utilizar tecnicas de analise multivariada para avaliar o grau de similaridade genetica entre 40 acessos de abobora (Cucurbita moschata D.), coletados em tres areas distintas da regiao Nordeste do brasil, verificando a relacao entre procedencia e divergencia genetica. O delineamento utilizado foi o de blocos casualizados com tres repeticoes. Foram avaliados os seguintes caracteres: comprimento do intemodio; diametro do caule; comprimento do peciolo e do limbo; largura do limbo; numero de dias para surgimento da primeira flor masculina e feminina.; n. do no em que surgiu a primeira flor masculina e feminina; peso e comprimento do fruto; diametro maior e menor do fruto. espessura do epicarpo e da polpa; diametro da cavidade...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Divergencia genetica; Avaliacao; Nordeste; Northeast; Abóbora; Cucúrbita Moschata; Germoplasma; Genetic distance; Germplasm; Brazil; Pumpkins.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/132978
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Biochemical comparison of two Hypostomus populations (Siluriformes, Loricariidae) from the Atlântico Stream of the upper Paraná River basin, Brazil Genet. Mol. Biol.
Ito,Kennya F.; Renesto,Erasmo; Zawadzki,Cláudio H..
Two syntopic morphotypes of the genus Hypostomus - H. nigromaculatus and H. cf. nigromaculatus (Atlântico Stream, Paraná State) - were compared through the allozyme electrophoresis technique. Twelve enzymatic systems (AAT, ADH, EST, GCDH, G3PDH, GPI, IDH, LDH, MDH, ME, PGM and SOD) were analyzed, attributing the score of 20 loci, with a total of 30 alleles. Six loci were diagnostic (Aat-2, Gcdh-1, Gpi-A, Idh-1, Ldh-A and Mdh-A), indicating the presence of interjacent reproductive isolation. The occurrence of few polymorphic loci acknowledge two morphotypes, with heterozygosity values He = 0.0291 for H. nigromaculatus and He = 0.0346 for H. cf. nigromaculatus. F IS statistics demonstrated fixation of the alleles in the two morphotypes. Genetic identity (I)...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Allozymes; Hypostomus nigromaculatus; Fish genetics; Genetic distance; Polymorphism.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572009000100008
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Differentiation of free-ranging chicken using discriminant analysis of phenotypic traits R. Bras. Zootec.
Al-Atiyat,Raed M.; Aljumaah,Riyadh S.; Abudabos,Alaeldein M.; Alotybi,Masoud N.; Harron,Raafat M.; Algawaan,Abdulaziz S.; Aljooan,Hassan S..
ABSTRACT In this study, we investigated the differentiation of five different chicken ecotypes - Center, North, South, West, and East - of Saudi Arabia using discriminate analysis. The analysis was based on nine important morphological and phenotypic traits: body color, beak color, earlobe color, eye color, shank color, comb color, comb type, comb size, and feather distribution. There was a strong significant relationship between the phenotype and effect of geographic height in terms of comb type and earlobe color in males as well as body, beak, eye, and shank color. In particular, the comb type and earlobe color differentiated the ecotypes of males. Among the females, the beak, earlobe, eye, shank color, and feather distribution had more differentiating...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biodiversity; Genetic distance; Genetic variation; Indigenous; Morphology.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982017001000791
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Dissimilaridade entre genótipos de Tucumã-do-Pará (Astrocaryum vulgare Mart.) desejáveis para frutos por marcadores RAPD. Repositório Alice
OLIVEIRA, N. P. de; OLIVEIRA, M. do S. P. de; CUNHA, E. F. M..
2010
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: RAPD; Dissimilaridade; Tucumã; Astrocarium vulgare; Marcador molecular; Variação genética; Astrocaryum vulgare; Genetic markers; Genetic variation; Random amplified polymorphic DNA technique; Genetic distance.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1036925
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Distinct genetic structure in populations of Chrysoperla externa (Hagen) (Neuroptera, Chrysopidae) shown by genetic markers ISSR and COI gene Rev. Bras. entomol.
Barbosa,Nara C. C. P.; Freitas,Sérgio de; Morales,Adriana C..
Distinct genetic structure in populations of Chrysoperla externa (Hagen) (Neuroptera, Chrysopidae) shown by genetic markers ISSR and COI gene. Green lacewings are generalist predators, and the species Chrysoperla externa presents a great potential for use in biological control of agricultural pests due to its high predation and reproduction capacities, as well as its easy mass rearing in the laboratory. The adaptive success of a species is related to genetic variability, so that population genetic studies are extremely important in order to maximize success of the biological control. Thus, the present study used nuclear (Inter Simple Sequence Repeat - ISSR) and mitochondrial (Cytochrome Oxidase I - COI) molecular markers to estimate the genetic variability...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genetic distance; Green lacewings; Insecta; Population structure; Variability.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0085-56262014000200012
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Divergencia entre sete populacoes de melancia (Citrullus lanatus), com base em caracteres morfologicos. Repositório Alice
FERREIRA, M. A. J. da F.; QUEIROZ, M. A. de; BRAZ, L. T.; CHURATA-MASCA, M.G.C..
bitstream/item/182363/1/Genetcs-and-Molecular-Biology-v.21-n.3-p.253-1998.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Divergencia genetica; Morfologia; Plant population; Citrullus Lanatus; Melancia; População de Planta; Genetic distance; Plant anatomy; Watermelons.
Ano: 1998 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/132058
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Divergencia genetica em acessos de guandu. Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; ARAUJO, F. P. de.
Foram caracterizados, no ano de 1991, em Petrolina, PE, 54 acessos de guandu, em parcelas unicas, sem repeticao. Nove caracteres quantitativos de maior importancia agronomica foram usados para determinacao da distancia genetica e formacao de grupos similares de acessos. As tecnicas empregadas foram: a) o Metodo de Agrupamento de Tocher, adotando a distancia euclidiana dos dados originais padronizados como medida de dissimilaridade; e b) dispersao grafica dos acessos em relacao aos dois primeiros componentes principais. Os acessos graniferos ICPL 6 e ICP6971, os forrageiros D1 Type, D3 Type e ICP 6970 e misto D1 Type, sao recomendados como progenitores, considerando nao so sua distancia genetica, mas tambem seu comportamento agronomico.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Guandu; Genetica; Distancia; Melhoramento; Genotipo; Cajanus cajan; Pigeonpea; Breeding; Genotype; Genetic distance; Guandu; Melhoramento genetico.
Ano: 1994 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/133142
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Divergência genética em acessos de mangueira no Vale do São Francisco. Repositório Alice
COSTA, J. G. da..
bitstream/item/176742/1/Separata-9569.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Característica; Divergência genética; Characteristics; Manga; Mangifera Indica; Variedade; Genetic distance; Mangoes; Varieties.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/134531
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Divergencia genetica em genotipos de feijao-de-corda avaliados em dois ambientes. Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; ARAUJO, F. P. de.
Foram avaliados 50 genotipos de feijao-de-corda em Petrolina, PE, em dois ambientes distintos: 1) plantio irrigado, no segundo semstre de 1994 (A1), e 2) plantio dependente de chuvas, no primeiro semestre de 1995 (A2). O delineamento foi em blocos ao acaso, com duas repeticoes, sendo as parcelas formadas por uma linha com 16 plantas, com espacamento de 1,0m x 0,5m para os dois ambientes. Foram analisados 10 caracteres quantitativos, tendo como medida de dissimilaridade as distancias generalizadas de Mahalanobis e para agrupamento o metodo proposto por Tocher. Houve a formacao de nove e 12 grupos de genotipos, respectivamente para A1 e A2. Os genotipos constituintes de cada grupo nao foram exatamente os mesmos nos dois ambientes, exceto no grupo 4. Os que...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genotipo; Divergencia genetica; Genotypes; Genetic distance; Feijao de corda; Cowpea.
Ano: 1997 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/133157
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Divergência genética entre acessos de açaizeiro fundamentada em descritores morfoagronômicos. Repositório Alice
OLIVEIRA, M. do S.P. de.; FERREIRA, D.F.; SANTOS, J.B. dos..
Este trabalho teve como objetivo estimar a divergência genética entre acessos de açaizeiro conservados na coleção de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental, em Belém, PA, por meio de descritores morfoagronômicos. A avaliação foi realizada em 87 acessos, com base em 22 caracteres: sete relativos à planta, três à floração, três a frutos e nove à produção de frutos, no período de 1995 a 2001. Foram efetuadas análises univariadas e multivariadas, com estimativas das dissimilaridades obtidas pela distância euclidiana média padronizada, e formação dos agrupamentos obtida pelos métodos UPGMA e Tocher. Os acessos apresentaram alto índice de variação na maioria dos caracteres. As distâncias genéticas entre os pares de acessos variaram de 0,09 a 1,87, com média de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Euterpe oleracea; Variabilidade; Análise multivariada; Agrupamento; Distância genética; Variability; Multivariate analysis; Grouping; Genetic distance.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/126117
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Divergência genética entre acessos de um banco de germoplasma de capim-elefante. Repositório Alice
SHIMOYA, A.; CRUZ, C.D.; FERREIRA, R. de P.; PEREIRA, A.V.; CARNEIRO, P.C.S..
O objetivo deste trabalho foi estudar a divergência genética entre 99 acessos de capim-elefante (Pennisetum purpureum) do Banco de Germoplasma da Embrapa, em Coronel Pacheco, MG. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, com cinco repetições de 99 tratamentos (97 genótipos e duas testemunhas). Foram avaliadas 17 características quantitativas. Utilizaram-se as análises multivariadas: distância de Mahalanobis, método de Tocher e variáveis canônicas. Pelo método de Tocher, 99 genótipos de capim-elefante foram agrupados em 18 grupos. Pela análise de variáveis canônicas, 81,80% da variância acumulada foi explicada pelas sete primeiras variáveis canônicas. Quanto à importância relativa das características avaliadas, diâmetro do colmo, largura da...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pennisetum purpureum; Genótipos; Distância genética; Variabilidade genética; Seleção; Forrageiras; Genotypes; Genetic distance; Genetic variability; Selection; Forage.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/107476
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Divergencia genetica entre clones de guaranazeiro. Repositório Alice
NASCIMENTO FILHO, F.J. do; ATROCH, A.L.; SOUSA, N.R. de; GARCIA, T.B.; CRAVO, M.da S.; COUTINHO, E.F..
As técnicas multivariadas, para estimar a diversidade genética de um grupo de progenitores, têm sido utilizadas com freqüência pelos melhoristas de plantas. Os progenitores são utilizados em cruzamentos biparentais ou múltiplos, para formação de populações segregantes que tenham maior probabilidade de recuperação de genótipos superiores. Este trabalho foi realizado com o objetivo de identificar clones de guaranazeiro produtivos e divergentes que possam ser utilizados em um programa de cruzamentos para obter híbridos com alto valor heterótico e materiais para propagação vegetativa. Foram avaliados 148 clones de guaranazeiro atualmente em uso no programa de melhoramento genético da Embrapa-Centro de Pesquisa Agroflorestal da Amazônia Ocidental. Utilizou-se,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Paullinia cupana; Distancia genetica; Cruzamento; Hibridos; Populacao de plantas; Metodos de melhoramento; Genetic distance; Crossbreeding; Hybrids; Plant population; Breeding methods.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/103741
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Diversidad genética, estructura genética y sistema de cruzamiento en Pinus johannis. Colegio de Postgraduados
García Gómez, Verónica.
Pinus johannis M. F. Robert es una especie endémica de México que se distribuye en poblaciones aisladas en la sierra Madre Oriental. Los objetivos del presente estudio fueron: a) conocer el nivel de diversidad genética y estructura genética de P. johannis; y b) estimar su tasa de cruzamiento. Se utilizaron 143 árboles en cuatro poblaciones de Pinus johannis para estimar los parámetros de diversidad genética tales como número promedio de alelos por locus, porcentaje de loci polimórficos, heterocigosidad observada y esperada. Para calcular la tasa de cruzamiento (t) se utilizó tejido de semilla de 127 árboles. Para conocer la diversidad genética se analizaron nueve sistemas enzimáticos en geles de almidón utilizando electroforesis, y tres para el sistema de...
Palavras-chave: Heterocigosidad; Índice de fijación; Distancia genética; Tasa de cruzamiento; Autofecundación; Heterozygosity; Fixation index; Genetic distance; Outcrossing rate; Selfing.
Ano: 2013 URL: http://hdl.handle.net/10521/2377
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Diversidade molecular entre populações de Spodoptera frugiperda no Brasil avaliada por marcadores AFLP. Repositório Alice
PINTO, C. C.; GRÜTZMACHER, A. D.; ROSA, A. P. S. A. da; MANICA-BERTO, R.; MENDES, S. M.; ARGE, L. W. P.; BORGES, C. T..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade molecular, por meio de marcadores AFLP, de seis populações de Spodoptera frugiperda coletadas na cultura do milho, em diferentes regiões geográficas do Brasil. O DNA foi extraído de lagartas de quarto instar, e as reações de AFLP foram realizadas com sete combinações de oligonucleotídeos iniciadores. A partir das seis populações de S. frugiperda estudadas, foi identificado um grupo principal formado por três populações geneticamente mais relacionadas. As populações de S. frugiperda analisadas mostram alta variabilidade genética, com máximo de 58% de similaridade.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Biotype; Genetic distance; Fall armyworm; Molecular markers.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1017873
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Estimation of genetic distance among genotypes of caraway (Carum carvi L.) using RAPD-PCR Agronomy
Seidler-Łożykowska, Katarzyna; Institute of Natural Fibres and Medicinal Plants; Kuczyńska, Anetta; Polish Academy of Sciences; Mikołajczyk, Katarzyna; Plant Breeding and Acclimatization Institute; Nowakowska, Joanna; Plant Breeding and Acclimatization Institute; Bocianowski, Jan; Poznań University of Life Sciences.
In order to estimate genetic diversity among starting materials and breeding strains of caraway, a collection of 17 accessions from botanical gardens in Europe, two cultivars ‘Rekord’ and ‘Kończewicki’, and four own breeding strains were analyzed by RAPD-PCR. The representative samples, each of five individual plants of accession, cultivar or strain, were taken from young rosette leaves. Forty of Genset Oligos RAPD primers were used for analysis and eight of them produced clear and reproducible banding patterns. In total, 62 banding patterns were obtained revealing 23 polymorphic bands, whereas the number of polymorphic bands ranged from two to four for one primer. The GS12 and GS43 primers generated two polymorphic bands, while each of the GS8, GS21,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Carum carvi L.; Genetic distance; Genotype; RAPD.
Ano: 2014 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/18197
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Genetic characterization of Japanese plum cultivars (Prunus salicina) using SSR and ISSR molecular markers Ciencia e Investigación Agraria
Carrasco,Basilio; Díaz,Carole; Moya,Mario; Gebauer,Marlene; García-González,Rolando.
The genetic characterization of 29 elite Japanese plum cultivars (Prunus salicina) and 4 Prunus cultivars was carried out by analyzing 97 Simple Sequence Repeat (SSR) alleles and 232 binary Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) loci. A high level of genetic variability was found for these two molecular markers among the Japanese plum cultivars compared to other Prunus species. On average, the variability found by analyzing the SSR alleles were Na = 12.1, Ne = 5.2, Ho = 0.9, He = 0.8 and F= -0.127, whereas ISSR yielded values of h = 0.15 and I = 0.27. The genetic relationship among cultivars was estimated with Principal Coordinate Analysis (PCA) and a Bayesian clustering approach using the software program Structure. This program identified two subgroups...
Tipo: Journal article Palavras-chave: AMOVA; Bayesian analysis; Genetic distance; PCA; Plum; Structure.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202012000300012
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Genetic divergence among processing tomato hybrids and formation of new segregating populations Ciência e Agrotecnologia
Figueiredo,Alex Sandro Torre; Resende,Juliano Tadeu Vilela de; Schwarz,Kélin; Marodin,Josué Clock; Galvão,Alexandre Gonçalves; Resende,Nathalia Campos Vilela.
ABSTRACT Tomato is the most important vegetable species and has a strong bottleneck effect in its domestication and evolution. In exploring the existing genetic variability in commercial germplasm, germplasm has been proven to be an excellent alternative to obtain inbred lines in order to provide superior new hybrids in the future. In this sense, the objective of this study was to estimate the genetic distance among commercial processing tomato hybrids via agronomical and quality postharvest fruit traits with the aim of suggesting promising crosses for the formation of base populations for tomato breeding. Ten hybrids of processing tomato were evaluated in a complete randomized block design with three replicates. In total, eleven agronomic and postharvest...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Solanum lycopersicum; Genetic distance; Pre-breeding; Breeding populations; Transgressive segregate.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542017000300279
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