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Amélioration du protocole de PCR quantitative pour la détection de l'OsHV1 chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, dans le cadre du projet TRIPLOFIMER et suivi d'individus lors du phénomène de mortalité estivale dans le cadre du projet AQUAFIRST ArchiMer
Riou, Antoine.
Depuis 1991, des épisodes de mortalités massives touchent les élevages ostréicoles français, notamment pour l'espèce Crassostrea gigas. Un des facteurs responsables de ces événements est le virus de l'Herpès de l'huître : Oyster Herpesvirus type 1 ou OsHV-1. Les travaux réalisés au cours de ce stage ont contribué dans un premier temps à l'amélioration du protocole d'analyse basé sur l'utilisation d'un appareil de Polymerase Chain Reaction (PCR) en temps résel, puis aux analyses et au suivi de la charge virale par cette technique, d'individus entrant dans le cadre des projets - TRIPLOMER et AQUAFIRST-UE. Cette approche permettra par la suite de réaliser des diganostics fiables de la maladie tout en précisant le nombre de copies ADN (Acide...
Tipo: Text Palavras-chave: Protocole; Herpes vrus; PCR quantitative; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Diagnostic.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14459/11761.pdf
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Anomalies des coquilles d'huîtres creuses Crassostrea gigas observées sur le littoral français en mai-juin 1989 dues au ver Polydora et aux peintures antisalissures ArchiMer
Catherine, Martial; Blateau, Dominique; Mazurie, Joseph; Le Bec, Claude.
La recrudescence du ver Polydora dans les coquilles d'huîtres creuses observée dès l'été 1988 a pour principale conséquence le développement parfois très important de formations variqueuses et des chambres à vase à l'intérieur des huîtres, ce qui est très préjudiciable à leur qualité commerciale. Le bilan de l'infestation des coquilles d'huîtres par le ver Polydora sur le littoral normand et atlantique en mai et juin 1989 montre que les secteurs ostréicoles les plus touchés se situent à proximité de la Loire et de la Vilaine. Divers traitements des huîtres contre le Polydora sont possibles. Les meilleurs résultats sont obtenus par la combinaison de l'action de la saumure et d'un assec de 24 heures. L'examen du chambrage à gel colloïdal dans les huîtres...
Tipo: Text Palavras-chave: Polydora; Huîtres creuses; Chambrage; Galeries; Traitement; Peintures marines; TBT; Réglementation.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00104/21491/19072.pdf
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Bases génétiques et variabilité des caractères physiologiques impliqués dans la croissance de Crassostrea gigas ArchiMer
Baud, Jean-pierre; Palvadeau, Hubert; Nourry, Max; Haure, Joel; Penisson, Christian; Boudry, Pierre.
La production française d' huître creuse Crassostrea gigas représente, avec 144000 tonnes de production, la 4ème' place au ni veau mondial après la Chine (2 285 000 t), le Japon (225 000t.) et la Corée (1 85 000t.). Ce bivalve filtreur possède un potentiel d'adaptation élevé puisqu'on le trouve sous des latitudes très diverses. Malgré son importance économique mondiale (2 900 000 tonnes de production en 1996), à ce jour, très peu de programmes de sélection ont été mis en oeuvre sur cette espèce, qui n'est pas considérée comme domestiquées au sens génétique du terme. Toutefois, avant de lancer des programmes - nécessairement de grande ampleur - pour la sélection de souches d' huîtres creuses Crassostrea gigas, il est utile de répondre au préalable à...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Variabilité génétique; Croissance; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00048/15881/13303.pdf
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CAPRETAR : Etude comparative des caractéristiques cytogénétiques et des performances de survie de naissains sauvages issus du CAPtage PREcoce ou TARdif ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hemissi, Issam; Bodin, Stephane; Robert, Stephane; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe.
L'action de recherche CAPRETAR (CAptage PREcoce ou TARdif: 2009-2010) a été réalisée dans le cadre du Contrat de Plan Etat Région - Poitou Charentes (CPER-PC 2007- 2013) développement durable des Pertuis Charentais. Cette action, s 'inscrit dans le cadre d 'un lien direct qui existerait entre la nature précoce/tardive d 'un captage naturel et la qualité des naissains de l'huître creuse C. gigas qui en sont issus (qualité génétique : « R » résistante ou « S » sensible et qualité génomique : taux des aneuploïdies et des dommages à l'ADN). L'objectif de cette action vise à estimer durant l 'année (2010) les performances relatives de survie de naissains issus d 'un captage précoce ou tardif réalisé l'année précédente (2009). Les résultats escomptés visent à...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Cytogénétique; Captage; Reproduction; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00062/17283/14794.pdf
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Caractérisation des mortalités de C. gigas dans leurs écosystèmes. Rapport du thème I du projet Morest en 2004 ArchiMer
Soletchnik, Patrick; Ropert, Michel.
L'objectif de ce thème est de préciser les relations entre Mortalités et Environnement, en déclinant cette relation à travers les "risques environnementaux" caractérisés depuis le début du programme MOREST. La température, les bassins versant et/ou l'eau douce, la ressource trophique, le compartiment sédimentaire, autant de facteurs impliqués directement ou indirectement dans les processus de mortalité. Ces facteurs d'influence "externes" sont étudiés à différentes échelles d'espace (du national au régional) et de temps (Interannuel à saisonnier) en s'appuyant à la fois sur des données issues de bases institutionnelles (REMORA, REPHY, METEO-FRANCE) mais également sur les résultats de terrain observés depuis le début du programme MOREST sur les 3 sites...
Tipo: Text Palavras-chave: Mortalité estivale; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Bassin de Marennes Oléron; MOREST.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00164/27551/25716.pdf
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Contribution du Laboratoire Conchylicole de Poitou Charente (LCPC) au programme national sur les MORtalités ESTivales (MOREST) de l'huître creuse Crassostrea gigas. Résumé des principales actions menées en 2001 ArchiMer
Soletchnik, Patrick.
Au cours de l’année 2001, dans le cadre de la première année du programme national Morest sur les mortalités estivales d’huîtres creuses, Crassostrea gigas, le laboratoire conchylicole du Poitou-Charentes a été amené à travailler sur plusieurs opérations : les différents types de mortalité, leur caractérisation sur les trois sites ateliers du programme (Baie des Veys, rivière d’Auray et banc de Perquis dans le sud du bassin de Marennes), la caractérisation des familles génétiques produites en écloserie et la cinétique de mortalité sur le site de Fouras : secteur de captage traditionnel dans le bassin de Marennes. Enfin, des tests ont été réalisés sur les naissains produits en écloserie afin de tenter des trouver un indicateur physiologique de leur...
Tipo: Text Palavras-chave: Mortalité estivale; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Bassin de Marennes Oléron; MOREST.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00164/27548/25713.pdf
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Contributions du Laboratoire Conchylicole de Poitou-Charente (LCPC) au défi MOREST (mortalités estivales d'huîtres creuses) en 2003. Thématique "Ecologie côtière" ArchiMer
Soletchnik, Patrick; Le Moine, Olivier; Geairon, Philippe; Razet, Daniel; Blouin, Frederic; David, Delphine; Couty, Angelique.
Depuis 2001, le laboratoire participe au défi MOREST, comme laboratoire d'Ecologie côtière dans l'organisation et l'animation d'études pluridisciplinaires et comme site atelier du défi. En 2003, le LCPC encadre une opération de recherche impliquant 14 laboratoires sur l'étude du modèle de mortalité plat table dans le Bassin de Marennes Oléron. Un large panel des causes de mortalité est étudié; facteurs physico chimiques, agents pathogènes, substances toxiques (pesticides ou relargages chimiques), etc …. Le labo est également impliqué en accompagnement d'actions de caractérisation de la mortalité de naissain (lignées consanguines sur estran) et sur des opérations de caractérisation précoce de la mortalité en laboratoire. Enfin, l'effet "site de gestion...
Tipo: Text Palavras-chave: Mortalité estivale; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Bassin de Marennes Oléron; MOREST.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00164/27550/25715.pdf
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Cultures marines en eaux profondes dans les pertuis charentais : détermination des zones propices à l'élevage d'huîtres Crassostrea gigas ArchiMer
La conchyliculture en Charente-Maritime compte 4 500 conchyliculteurs qui exploitent 2800 concessions avec 7 400 emplois directs déclarés. Chaque année, une diminution de 4-5% des concessionnaires parallèlement à une diminution de l'ordre de 1 à 2% des surfaces exploitées est observée. Cette tendance peut s'expliquer par la pyramides des âges des conchyliculteurs et la baisse de compétitivité de l'ostréiculture charentaise vis à vis des principaux bassins de production concurrents (Bretagne, Normandie). La mortalité cumulée dans le Bassin de Marennes-Oléron est supérieure à 50% au cours d'un cycle d'élevage qui atteint maintenant 3-5 ans pour 18 mois dans les années 1970....
Tipo: Text Palavras-chave: Ostréiculture; Eaux profondes; Pertuis Charentais; Charente-Maritime; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Etude de site.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00014/12482/9328.pdf
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Définition et test de nouvelles amorces pour la détection en PCR du virus de type herpès infectant les huîtres ArchiMer
Renault, Tristan; Lipart, Cecile.
La collaboration, entamée en 1996 avec A. Davison du Medical Research Council de Glasgow, a permis d'aboutir à l'obtention d'informations sur la équence de fragments clonés d'ADN de virus de type herpès infectant les huîtres.
Tipo: Text Palavras-chave: Détection PCR; Virologie; Virus; Herpès; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Techniques.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31048/29465.pdf
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Déterminisme du recrutement : données préliminaires sur le développement et la survie larvaire de Crassostrea gigas ArchiMer
His, Edouard.
Hormis les facteurs anthropiques (voir références bibliographiques HIS et al .), l es facteurs nutritionnels jouent un rôle prépondérant dans le déroulement de la vie pélagique des larves de bivalves ; un déficit nutritionnel peut, à lui seul, hypothéquer les chances de captage (PERSOONE et al, 1980; HIS et ROBERT, 1985). Or les données dont nous disposons ont été presque exclusivement obtenues en milieu expérimental (voir synthèse de LUCAS, 1982); il n 'est pas certain qu'elles puissent être extrapolées au milieu naturel. Site exceptionnel en ce qui concerne la reproduction des huîtres, le bassin d'Arcachon permet l'isolement de véligères du milieu naturel, aux différents stades de la vie pélagique; émissions massives, faible charge en tripton favorisent...
Tipo: Text Palavras-chave: Reproduction; Larves; Véligères; Huîtres creuses; Crassostrea ggias.
Ano: 1986 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00050/16157/13640.pdf
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Diversité génétique chez les huîtres creuses du genre Crassostrea : quelles ressources pour quelle amélioration des productions de C; gigas? ArchiMer
Boudry, Pierre.
Despite the economic importance of oyster farming, knowledge about genetic resources of these species is still limited. The objectives of my research were to provide further information about (1) taxomomy, phylogeny and phylogeography of Crassostrea oysters, (2) to compare C. gigas and C. angulata strains of various geographic origins and (3) to study phenotypic and genetic variation for traits of aquacultural interest in C. gigas. Studies based on DNA polymorphism and chromosomes allowed to improve or correct identification, geographic range and phylogeographic relationships among several species. The comparison of various strains of C. gigas and C. angulata, both in laboratory and field conditions, revealed significant differences among taxa and the...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Cupped oysters; Genetic improvement by selection; Variability; Strains testing; Phylogeny; Genetic resources; Crassostrea gigas; Huîtres creuses; Amélioration par la sélection; Variabilité; Testage de souches; Phylogénie; Ressources génétiques.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/these-3354.pdf
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Estimation des stocks d'huîtres cultivées dans le bassin de Marennes-Oléron en 1986 ArchiMer
Bodoy, Alain; Bacher, Cedric; Geairon, Philippe.
Une estimation du stock d' huîtres creuses en élevage dans le bassin de Marennes-Oléron a été effectuée en août 1986 . Le stock s'élevait alors à 90 000 tonnes, avec une précision de 8,4 %. Ce stock se répartit en 30 300 tonnes pour l'élevage à plat et 59 700 tonnes pour l'élevage en surélevé. Il s'est donc produit une augmentation des tonnages en élevage qui est de 9,4 % entre 1985 et 1986. L'augmentation de tonnage concerne surtout l 'élevage en surélevé, et plus particulièrement les huîtres fixées sur collecteurs. La séparation des classes d'âge au niveau des collecteurs a permis d'améliorer la précision des estimations. Elle a également permis de montrer l'importance de la classe d'âge de 1 an (16 900 tonnes), qui correspond au captage particulièrement...
Tipo: Text Palavras-chave: Ostréiculture; Stocks; Croissance; Production; Huîtres creuses.
Ano: 1987 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00048/15903/13331.pdf
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Estimation des stocks d'huîtres en élevage dans la Baie de Bourgneuf en 2002 ArchiMer
Haure, Joel; Martin, Jean-louis; Dupuy, Beatrice; Nourry, Max; Palvadeau, Hubert; Papin, Mathias; Penisson, Christian; Le Moine, Olivier; Geairon, Philippe; Razet, Daniel.
Depuis plusieurs années, un déficit de croissance est noté en baie de Bourgneuf et confirmé par les résultats du réseau REMORA qui montrent des gains de poids très nettement inférieurs à la moyenne nationale. Ce déficit de croissance s'accentue particulièrement en 2000. L' une des hypothèses pouvant être mise en avant pour expliquer les causes de ce manque de croissance est la biomasse accrue des organismes filtreurs cultivés ou non : huîtres, moules, crépidules. Afin d'avoir un e vision globale du fonctionnement de l'écosystème de la baie, il est nécessaire d'étudier l' importance relative de ces différents stocks de coquillages. Le LCPL a réalisé en 2002 l'estimation du stock d' huîtres cultivées dans la baie de Bourgneuf. Pour ce type d'estimation, la...
Tipo: Text Palavras-chave: Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Estimation de stock; Biomasse; Baie de Bourgneuf; Vendée.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00047/15869/13288.pdf
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Estimation des stocks d'huîtres sauvages sur les zones non concédées de la partie vendéenne de la Baie de Bourgneuf en 2004 ArchiMer
Martin, Jean-louis; Haure, Joel; Dupuy, Beatrice; Nourry, Max; Palvadeau, Hubert; Papin, Mathias; Penisson, Christian; Thouard, Emmanuel.
La baie de Bourgneuf est un bassin de 34000 ha dont l'activité ostréicole représente à elleseule plus de 95% du chiffre d'affaire local réalisé par la production conchylicole. Lesdifférentes études qui ont été réalisées ont montré que le stock d'huîtres en élevage (40000t) et la production annuelle (13000 t) qui en est issue variaient peu au cours des années (Barillé-Boyer et al., 1997, Haure et al. , 2003). Toutefois, les performances de croissance, ainsi que la qualité des huîtres produites sont médiocres et place ce bassin au dernier rang des sites français de production (données du réseau REMORA). Plusieurs études ont été entreprises, pour expliquer ce phénomène, par l'approche de la capacité trophique de cet écosystème et l'estimation des biomasses...
Tipo: Text Palavras-chave: Conchyliculture; Biomasse; Stocks; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Baie de Bourgneuf.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00048/15877/13299.pdf
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Estimation du stock d'huîtres creuses Crassostrea gigas, en élevage en Baie de Cancale, en octobre 2002 ArchiMer
Mazurie, Joseph; Bouget, Jean-francois.
in order to estimate the carrying capacity of Mont Saint-Michel Bay, the stock (or biomass) of cupped oysters, Crassostrea gigas, cultivated intertidally, in Cancale Bay, has been estimated in october 2002. Aerial photographs, at 2 scales (1/10 000 and 1/2000), provided by the mollusc farmers union, have been used to estimate the cumulative length of surelevaged trestles (« tables ») and the occupation rate by oyster bags. A field survey, between the 7th and 9th of october 2002, has been conducted by Ifremer with the help of « Lycée Maritime de Saint-Malo », on 40 sampled stations : 3 subsample bags per station were examined (counts and weights of different age-class oysters). 309 ha out of 333 leased ha were considered exploited (after elimination of...
Tipo: Text Palavras-chave: Baie du Mont Saint Michel; Cancale; Crassostrea gigas; Cupped oysters; Production; Biomass; Baie du Mont Saint Michel; Cancale; Crassostrea gigas; Huîtres creuses; Production; Biomasse; Stock.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/rapport-5296.pdf
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Etude de la croissance d'une population d'huîtres creuses Crassostrea gigas ArchiMer
Lemery, Nicolas.
Dans le but d'optimiser et développer des productions aquacoles, l'IFREMER travaille notamment sur l'amélioration génétique des espèces aquacoles. Ce programme, cofinancé par la région Poitou-Charentes dans le cadre du plan pour sa partie investissement par l'Union Européenne dans le cadre du projet "GENEPHYS 1996-2000" pour sa partie fonctionnement, associe des partaenaires anglais, irlandais, grecs et français. Ce vaste projet, dont la coordination générale est assurée par La Tremblade, a débuté en Janvier 1996. Il vise à établir les relations entre les caractères physiologiques impliqués dans la croissance (respiration, assimilation, digestion, excrétion, rendement métabolique, etc...) et leurs bases génétiques (déterminisme, variabilité intra et inter...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique population; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Elevage larvaire; Variation croissance.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14378/11668.pdf
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Etude de la faisabilité d'élevages d'huîtres en eau profonde dans le Pertuis Charentais ArchiMer
Heral, Maurice.
Le bassin de Marennes-Oléron, premier bassin ostréicole français est une baie chroniquement en surcharge. Les déficits de croissance et l'accroissement des mortalités non liées à des pathogènes se sont accentués parallèlement aux anomalies climatiques. Les 3 années de sécheresse (1989-1992) ont montré la grande dépendance pour la productivité de cet écosystème, aux apports d'eau douce estivaux, d'où les conflits pour l'usage de l'eau qui sont apparus. Sur le cheptel affaibli du bassin de Marennes-Oléron en 1993 a été identifiée une chlamydie-like qui altère les branchies des huîtres et qui devrait être un élément supplémentaire de fragilisation du cheptel. La conchyliculture en Charente-Maritime regroupe 4 500 conchyliculteurs qui exploitent 2 800...
Tipo: Text Palavras-chave: Etude de site; Ostréiculture; Eau profonde; Zone de Culture; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 1993 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00048/15900/13328.pdf
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Etude de l'évolution de la microflore planctonique des eaux, fèces et pseudofeces de l'huître Crassostrea gigas ArchiMer
IFREMER - Laboratoire Ecosystèmes Conchylicoles (LEC) La Tremblade; ECOCEAN - Environnement Littoral & Marin La Rochelle.
Tipo: Text Palavras-chave: Physiologie; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Fèces; Pseudofeces; Microflore planctonique.
Ano: 1990 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25475/23628.pdf
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Etude des anomalies chromosomiques chez Crassostrea gigas ArchiMer
Lapegue, Sylvie; Mccombie, Helen; Leitao, Alexandra; Bouilly, Karine; Sabatier, Sebastien; Heurtebise, Serge; Boudry, Pierre; Thiriot, Catherine; Gerard, Andre.
Divers travaux menés depuis 1984 montrent qu'il existe, chez l'huître creuse Crassostrea gigas, des cellules montrant un nombre anormal de chromosomes (2n = 19, 18 ou même 17 au lieu de 2n = 20). Le niveau d'aneuploïdie est déterminé par le décompte des chromosomes à partir de suspensions cellulaires de tissu branchial. Le pourcentage de cellules aneuploïdes est toujours significativement supérieur dans les "lots de queue", c'est-à-dire les huîtres présentant des croissances plus faibles, et peut atteindre plus de 30 %. Récemment, une étude réalisée au sein du programme européen « Genephys » a démontré que plus de 50 % de la variance pour la vitesse de croissance était liée au taux d'aneuploïdie. Cependant, de nombreux points concernant ce phénomène...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Chromosomes; Anomalies; Aneuploïdie; Atrazine; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31013/29417.pdf
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Etude des anomalies chromosomiques chez Crassostrea gigas - Contrat de Plan Région Poitou-Charentes 2000-2006. Convention 2000 ArchiMer
Lapegue, Sylvie; Mccombie, Helen; Leitao, Alexandra; Bouilly, Karine; Sabatier, Sebastien; Heurtebise, Serge; Boudry, Pierre; Thiriot Quievreux, Catherine; Gerard, Andre.
Divers travaux menés depuis 1984 montrent qu’il existe, chez l’huître creuse Crassostrea gigas, des cellules montrant un nombre anormal de chromosomes (2n = 19, 18 ou même 17 au lieu de 2n = 20). Le niveau d’aneuploïdie est déterminé par le décompte des chromosomes à partir de suspensions cellulaires de tissu branchial. Le pourcentage de cellules aneuploïdes est toujours significativement supérieur dans les "lots de queue", c'est-à-dire les huîtres présentant des croissances plus faibles, et peut atteindre plus de 30 %. Récemment, une étude réalisée au sein du programme européen « Genephys » a démontré que plus de 50 % de la variance pour la vitesse de croissance était liée au taux d’aneuploïdie. Cependant, de nombreux points concernant ce phénomène...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Chromosomes; Aneuploïdie; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15474/12853.pdf
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