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Combined index of genomic prediction methods applied to productivity traits in rice. Repositório Alice
SUELA, M. M.; LIMA, L. P.; AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M.; SILVA, F. F. e.
A cultura do arroz tem grande importância nacional e mundial por ser um dos cereais mais produzidos e consumidos no mundo, caracterizando-se como o principal alimento de mais da metade da população mundial. Em função de sua importância alimentar, desenvolver métodos eficientes que visam a predição e a seleção de indivíduos geneticamente superiores, quanto a características da planta, é de extrema importância para os programas de melhoramento. Diante disso, o objetivo deste trabalho foi avaliar e comparar a eficiência do método Delta-p, G-BLUP, BayesCpi, BLASSO e o índice Delta-p/G-BLUP, índice Delta-p/BayesCpi e índice Delta-p/BLASSO, na estimação de valores genômicos e dos efeitos de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) em dados fenotípicos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Predição genômica; Ganho genético; Genomic prediction; Genetic gain; Bayesian alphabet; Molecular bases; Regression; Índice de Seleção; Selection index.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110881
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Genomic prediction of assitive and non-additive effects using genetic markers and pedigrees in pines breeding. Repositório Alice
ALMEIDA FILHO, J. E. de A.; RODRIGUES, J. F. G.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE JÚNIOR, M.; MUÑOZ, P.; KIRST, M..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Conífera; Melhoramento genético; Predição genômica; Marcador genético.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1021904
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Genomic prediction of growth traits in Pinus taeda using genome-wide sequence-based DArT-seq markers. Repositório Alice
AGUIAR, A. V. de; TEIXEIRA-FREITAS, D. M. A.; ALMEIDA FILHO, J. E. de; SOUSA, V. A. de; RESENDE, M. D. V. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D..
2015
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pinus taeda; Espécie exótica; Marcador molecular; Predição genômica; Melhoramento genético.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1021996
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Seleção e associação genômica ampla para características de crescimento e escores visuais em bovinos da raça Hereford e Braford. Repositório Alice
CAMPOS, G. S..
This thesis was structured in three chapters. In the first one, the genetic parameters were estimated using linear and threshold models for the traits of visual scores and also the cross validation and multinomial regression were used for validation of the models. There was no difference in the parameter estimation when the scores had normal distribution, such as for conformation, precocity, musculature and size. Heritability values (h2) ranged from 0.18 to 0.26 with the linear model and from 0.19 to 0.29 with the threshold. However, when the score had no normal distribution, such as navel, there were advantages in using the threshold model, with a h2 value of 0.42 and a linear model of 0.22. The second study aimed to evaluate the accuracy genomic...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Validação cruzada; Predição genômica; Modelo Bayesiano; Bovino; Gado de Corte; Genoma; Método Estatístico.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099079
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Seleção genômica no melhoramento do pinhão-manso: precisão do modelo entre safras Repositório Alice
LAVIOLA, B. G.; SANTOS, A. dos; FALCAO, R.; CARNEIRO, A. de S.; COMBY, A. C. O.; GOMES, E. S.; ROCHA, L. de S.; FERREIRA, A. G. C.; CARVALHO, J. L. R. de; SANTOS, J. V. J. dos; COLLI, W. B.; RODRIGUES, E. V..
bitstream/item/210855/1/B-LAVIOLA-SEG-Selecao-genomica-no-melhoramento-do-pinhao-manso.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Predição genômica; Acurácia; Jatropha Curcas.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1120318
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Seleção genômica para tolerância ao déficit hídrico em milho. Repositório Alice
DIAS, K. O. das G.; GEZAN, S. A.; GUIMARAES, C. T.; NODA, R. W.; SOUZA, J. C. de; PASTINA, M. M.; GUIMARAES, L. J. M..
2016
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Predição genômica; Efeito aditivo; Efeito de dominância; Genoma.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1055735
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Triple categorical regression for genomic selection: application to cassava breeding. Repositório Alice
LIMA, L. P.; AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; VIANA, J. M. S.; OLIVEIRA, E. J. de.
Genome-wide selection (GWS) is currently a technique of great importance in plant breeding, since it improves efficiency of genetic evaluations by increasing genetic gains. The process is based on genomic estimated breeding values (GEBVs) obtained through phenotypic and dense marker genomic information. In this context, GEBVs of N individuals are calculated through appropriate models, which estimate the effect of each marker on phenotypes, allowing the early identification of genetically superior individuals. However, GWS leads to statistical challenges, due to high dimensionality and multicollinearity problems. These challenges require the use of statistical methods to approach the regularization of the estimation process. Therefore, we aimed to propose a...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: G-BLUP; BLASSO; Genomic prediction; Genomic heritability; Quantitative genetics theory; Molecular markers; Herdabilidade genômica; Predição genômica; Genética quantitativa; Ridge; Marcador Molecular; Prediction.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1110879
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