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An overview of Phoneutria nigriventer spider venom using combined transcriptomic and proteomic approaches. Repositório Alice
DINIZ, M. R. V.; PAIVA, A. L. B.; GUERRA-DUARTE, C.; NISHIYAMA JÚNIOR, M. Y.; MUDADU, M. de A.; OLIVEIRA, U. de; BORGES, M. H.; YATES, J. R.; JUNQUEIRA-DE-AZEVEDO, I. de.
Abstract. Phoneutria nigriventer is one of the largest existing true spiders and one of the few considered medically relevant. Its venom contains several neurotoxic peptides that act on different ion channels and chemical receptors of vertebrates and invertebrates. Some of these venom toxins have been shown as promising models for pharmaceutical or biotechnological use. However, the large diversity and the predominance of low molecular weight toxins in this venom have hampered the identification and deep investigation of the less abundant toxins and the proteins with high molecular weight. Here, we combined conventional and next-generation cDNA sequencing with Multidimensional Protein Identification Technology (MudPIT), to obtain an in-depth panorama of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Proteômica; Transcriptoma; Phoneutria nigriventer; Proteomics; Transcriptomics.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102272
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Análise das proteínas de reserva do grão dos 550 acessos da coleção nuclear de arroz da Embrapa (CNAE). Repositório Alice
SILVEIRA, R. D. D.; SANTOS, K. F. E. N.; CRUZEIRO, G. A. V.; BORBA, T. C. O.; DIDONET, C. G. M.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve como objetivo quantificar as proteínas totais dos 550 acessos da CNAE, a fim de conhecer a influência do tipo de cultivo e da origem de cada acesso nos seus teores de proteínas.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Rice; Recurso genético; Proteína; Qualidade do grão; Proteômica; Coleção nuclear; Banco de germoplasma; Conpeex.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/217547
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Aplicações da proteômica na pesquisa vegetal. Infoteca-e
MEIRELES, K. G. X..
A Proteômica surgiu como uma das vertentes da era pós-genômica e vem contribuindo significativamente para o entendimento global e integrado do sistema biológico. O estudo do proteoma envolve todo o conjunto de proteínas expresso pelo genoma de uma célula, como também pode ser direcionado somente àquelas que se expressam diferencialmente em condições específicas. Proteômica dedica-se também ao conjunto de isoformas de proteínas e modificações pós-traducionais, às interações entre elas, bem como à descrição estrutural de moléculas e seus complexos. Esta revisão apresenta as principais tecnologias empregadas em estudos proteômicos, e faz um levantamento de trabalhos recentes que utilizaram abordagens proteômicas para a identificação de genes e rotas...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Proteína; Proteômica; Proteoma; Genética vetetal; Pesquisa; Espectrometria de massa; Estresse biótico; Estresse abiótico.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/326868
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Avaliação de métodos de extração de proteínas de tecido foliar e radicular de cana-de-açúcar para estudos de proteômica. Infoteca-e
RIFFEL, A.; VIANA, L. da S.; COSTA, J. G. da; SANTANA, A. E. G..
O Brasil é o maior produtor mundial de cana-de-açúcar e nas últimas décadas, os estudos envolvendo a cultura, principalmente relacionados à biotecnologia e o melhoramento genético têm se acentuado. Uma ferramenta bastante útil para esses estudos é a proteômica. O sucesso dos estudos envolvendo a proteômica, e em específi co os que utilizam a eletroforese bidimensional (2-DE), depende principalmente de uma efi ciente extração das proteínas que variará com a recalcitrância do material e a remoção dos contaminantes. Nesse aspecto, os tecidos da cana-de-açúcar possuem natureza altamente fi brosa com grande rigidez e apresentam níveis elevados de enzimas oxidativas, compostos fenólicos, carboidratos e outros metabólitos que podem interferir na 2-DE. Portanto,...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Cana-de-açúcar; Análise foliar; Proteômica; Proteína.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964943
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Bioinformática e química combinatória na busca de compostos medicamentosos para inibição de proteínas no combate à malaria. Repositório Alice
JARDINE, J. G..
A malária é uma das principais doenças que afligem as populações de países tropicais, infectando mais de 300 milhões de pessoas anualmente e causando a morte de cerca de 1,1 milhão delas. Descobrir novos fármacos antimaláricos é de vital importância para os países tropicais, cabendo a estes essa tarefa uma vez que os países desenvolvidos canalizam seus recursos, principalmente para o desenvolvimento de medicamentos de combate ao câncer. Para planejar um novo fármaco é necessário o conhecimento das propriedades estruturais da molécula e de seu alvo e sua relação entre estrutura química e atividade. Para identificação de ligantes inibidorcs ou ativadores, pode-se utilizar recursos da Bioinformática, os quais consistem em sobrepor a estrutura em três...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Proteômica; Química combinatória; Malária; Bioinformatics; Proteomics.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/225
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Estudo integrado de genômica e proteômica associados à qualidade do café. Repositório Alice
SILVA, V. C.; MELO, J. A. T.; BARBOSA, E. A.; SILVA, L. P.; BLOCH JÚNIOR, C.; ANDRADE, A. C..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Café; Genômica; Proteômica.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188537
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Extração e análise eletroforética em gel de poliacrilamida (SDS-PAGE) de proteínas totais de folhas e raízes de Piper tuberculatum Acta Amazonica
Silva,Redinaldo dos Santos; Souza,Cláudia Regina Batista de.
O Estado do Pará é o principal produtor brasileiro de pimenta-do-reino (Piper nigrum Link), entretanto a sua produção tem sido bastante afetada pela doença conhecida como fusariose. O Fusarium solani f. sp. piperis é o agente causador desta doença que afeta o sistema radicular da planta, causando o apodrecimento das raízes e a queda das folhas levando à morte da planta. Algumas piperáceas nativas da região amazônica, entre elas a espécie Piper tuberculatum Jacq., têm se mostrado resistentes à infecção pelo F. solani f. sp. piperis, e desta forma têm sido utilizadas em estudos de interação planta-patógeno. Neste trabalho foram avaliadas cinco condições de extração de proteínas com o objetivo de selecionar tampões adequados para a extração de proteínas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fusariose; Fusarium solani f. sp. piperis; Piper nigrum; Piper tuberculatum; Proteômica; SDS-PAGE.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0044-59672009000200002
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Fisiologia e proteômica da resposta ao alagamento em genótipos contrastantes de Brachiaria brizantha. Repositório Alice
COSTA, P.P.O.L.; MEIRELES, K. G. X.; LAURA, V. A.; VALLE, C. B. do; ROBLES, C.S.; NASCIMENTO, D.C.; NAKA, I. M..
O objetivo deste trabalho é avaliar a resposta fisiológica de genótipos contrastantes de Brachiaria brizantha ao alagamento e associá-la a genes que se expressam durante o período de estresse. Sementes das cultivares Marandu (suscetível) e Arapoty (tolerante) foram germinadas em gerbox e as mudas transplantadas para vasos após dez dias.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pastagem; Melhoramento genético vegetal; Proteômica; Brachiaria brizantha.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876026
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Hypoxia-inducible myoglobin expression in nonmuscle tissues. Repositório Alice
FRASER, J.; MELLO, L. V. de; WARD, D.; REES, H. H.; WILLIAMS, D. R.; FANG, Y.; BRASS, A.; GRACEY, A. Y.; COSSINS, A. R..
bitstream/item/177942/1/ID-26551-1.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Globin expression; Adaptação de hypoxia; Microarray; Proteômica.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/186962
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Identificação das proteínas nos testículos de ovinos Somalis e Santa Inês. Repositório Alice
ELOY, A. M. X.; SILVA, N. M. M.; VALLE, R. V.; SANTOS, F. W. V.; FURTADO, J. R..
Proteins identification in Somalis and Santa Inês testes.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Eletroforese unidimensional; Proteômica; Tecido testicular; Ovino; Raça Somalis; Raça Santa Inês.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/906909
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Imagens por espectrometria de massa como uma nova ferramenta para o estudo integrado de genômica e proteômica do café. Repositório Alice
BARBOSA, E. A.; SILVA, L. P.; VINECKY, F.; ANDRADE, A. C.; BLOCH JÚNIOR, C..
2006
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biologia celular; Café; Genômica; Proteômica.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/188517
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Metabolômica e espectrometria de massas. Infoteca-e
ABDELNUR, P. V..
2011
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Metabolômica; Genômica funcional; Genômica; Transcriptômica; Proteômica; Metabolômica; Biologia sistêmica.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/917736
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Métodos e estratégias em proteômica e suas aplicações na área vegetal Ciência Rural
Salvato,Fernanda; Carvalho,Mayra Costa da Cruz Gallo de.
A implementação da espectrometria de massa (MS) para as análises de peptídeos (MS) e de aminoácidos (MS em tandem ou MS/MS) tornou possível a identificação de centenas de proteínas em experimentos únicos. Uma grande variedade de estratégias está disponível atualmente para o fracionamento e a purificação de amostras, a identificação de proteínas, a quantificação, a análise de modificações pós-traducionais (MPT's) e os estudos de interação. Dessa forma, a proteômica abre novas perspectivas na biologia de plantas com ênfase nos estudos de variabilidade genética, estresses fisiológicos e desenvolvimento de plantas.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Proteômica; Análise de proteínas; Interatômica; Plantas.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000300039
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Otimização de protocolo para extração de proteínas de polpa de maçã. Repositório Alice
BARBOSA, A. B. de A.; GONÇALVES, B. X.; PEGORARO, C.; ROMBALDI, C. V.; GIRARDI, C. L..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Proteômica; Proteínas de polpa de maçã; Maçã.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1021205
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Perfil proteico do plasma seminal de touros pantaneiros e sua relação com a congelabilidade do sêmen. Repositório Alice
SOUTO, P. L. G.; MOURA, A. de A. A. N.; RAMOS, A. F..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Raça local; Criopreservação; Proteômica.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1000705
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Perfil proteico-imunogênico de proteínas detentoras de alto valor diagnóstico de lentivírus de pequenos ruminantes. Repositório Alice
AZEVEDO, D. A. A. de.
Os lentivírus de pequenos ruminantes, vírus da artrite encefalite caprina e vírus maedi visna, pertencem a família Retroviridae. São relacionados genética e antigenicamente, causam doenças crônicas e progressivas, levando a perdas produtivas e econômicas. A transmissão interespécie desses vírus pode ser preocupante devido a recombinação genética desses lentívirus. O estudo da proteômica desses vírus torna-se necessário para o conhecimento da função dos genes. A análise proteômica sorológica (SERPA) associada a espectrometria de massas (EM), dentre muitas possibilidades, permite o conhecimento de proteínas de valor diagnóstico. Com isso objetivou-se delinear o perfil proteíco-imunogênico bidimensional de lentivírus de pequenos ruminantes caracterizando...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: CAEV; Proteômica; Análise proteônica sorológica; SERPA; LVPR; Espectrometria de massa; Artrite encefalite caprina; Lentivirose; Caprino; Ovino; Doença animal; Biotecnologia; Espectrometria; Lentivirus; Caprine arthritis encephalit virus; Visna maedi virus; Mass spectrometry; Goats; Sheep; Animal diseases; Immunodiagnosis; Serological diagnosis; Lentivirus.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1032426
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Prospecção de metodologia para extração protéica em gramíneas forrageiras compatível com análise proteômica. Repositório Alice
NASCIMENTO, D. C. do; MEIRELES, K. G. X.; ROBLES, C. S.; COSTA, P. P. O. L. da..
O objetivo deste estudo é avaliar metodologias de extração de proteínas de Brachiaria, visando indicar aquela que proporciona a obtenção de extratos protéicos mais concentrados e livres de contaminantes.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pastagem; Proteômica; Planta forrageira.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/876028
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Proteínas testiculares de ovinos Santa Inês e Dorper. Repositório Alice
SILVA, N. M. M.; VALLE, R. V. do; ELOY, A. M. X.; SANTOS, F. W. V. dos; ALBUQUERQUE, F. H. M. A. R. de; OLIVEIRA, E. L. de; FURTADO, J. R..
Proteins of testicular Santa Inês sheep and Dorper. The characterization and identification of variables can influence the reproductive performance of the animal, whether reproductive or productive. The study of proteomics is an important tool for unveiling some of these physiological processes. The objective of this study was to identify the different protein bands present in testicular tissue of Dorper and Santa Inês sheep breeds. The experiment was conducted at Embrapa Sheep and Goats, Sobral, state of Ceará, Brazil. Seventeen sheep were salughtered (seven Santa Inês and ten Dorper, aged between five and six months), for testicular tissue collection. The protein bands were identified by one-dimensional SDS-PAGE electrophoresis on polyacrylamide gel at...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Eletroforese unidimensional; Proteômica; Tecido testicular; Ovino; Raça Dorper.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/918006
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