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Absolute quantification of viruses by TaqMan real-time RT-PCR in grapevines. Repositório Alice
FAJARDO, T. V. M.; VANNI, M. F.; NICKEL, O..
The absolute quantification determines the absolute amount of a targeted nucleic acid expressed as a copy number or concentration. The knowledge of virus concentrations in commercial crops possesses high relevance to ensure a reliable diagnosis. The objective of this study was to perform an absolute quantification of five viruses in infected grapevines (Vitis spp.). Different known amounts of the standard sample (cloned viral cDNA or in vitro transcribed viral RNA) were quantified by TaqMan RT-qPCR. Based on these data, standard curves were generated plotting Ct values (threshold cycle) against the log of the standard sample amount. Infected grapevine samples were evaluated to determine virus titers, which were highly variable. This result may contribute...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: RT-qPCR; GRSPaV; GVA; GVD; GLRaV-3; Videira.; Uva; Virus..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1069291
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Avaliação da incidência de vírus em acessos de pimenta em campo. Repositório Alice
MARTINEZ, A.; ARAUJO, J. S. D. P.; LIMA, M. F.; MATOS, R. P.; REIFSCHNEIDER, F. J. B..
Resumo 854-1
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Pimenta; Doença de planta; Virus.; Capsicum frutescens..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/982211
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Avaliação da resistência de materiais comerciais de tomateiro a oito viroses que afetam a cultura no Brasil. Repositório Alice
MACEDO, M. A.; BARRETO, S. S.; INOUE-NAGATA, A. K..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a resistência dos materiais de tomate palantados atualmente no país a oito dos principais vírus que afetam a cultura.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Tomate; Doença de planta; Virus.; Solanum lycopersicum..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/908569
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Detection of the current circulating Equine Infectious Anemia virus in Brazil by quantitative PCR. Repositório Alice
ARAUJO JUNIOR, J. P.; MALOSSI, C. D.; LIMA, M. F. N. T. de; AGUIAR, D. M.; ULLMANN, L. S..
Edição dos resumos do XXVII Brazilian Congress of Virology & XI Mercosur Meeting of Virology, Pirienópolis, GO, 2016.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Anemia Infecciosa; Virus.; Equine infectious anemia..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1070355
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Effect of the begomovirus transmission efficiency for the predominance of tomato severe rugose virus (TOSRV) in tomatos crops. Repositório Alice
MACEDO, M. A.; FERREIRA, M. S.; GUIMARÃES, V. N.; INOUE-NAGATA, A. K..
Tomato severe rugose virus (ToSRV) and Tomato golden vein virus (TGVV) are bipartite begomoviruses, transmitted by whiteflies (Bemisia tabaci biotypeB), frequently found infecting tomato (Solanum lycopersicum) crops in Brazil. To more fully understand the interaction begomovirus/whitefly, as well as how occurrence of mixed infection may influence virus emergence and dominance in an infected plant, a study on begomovirus transmission was carried out focusing on the determination of transmission efficiency of two begomoviruses, ToSRV and TGVV, in single and double infection.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Tomato severe rugose virus; ToSRV; Tomato golden vein virus; TGVV; Whitefly.; Tomato; Solanum lycopersicon; Tomate; Mosca branca; Inseto; Praga; Doença de planta; Virus..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/992314
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Estudo da diversidade de begomovirus em tomateiro cultivado na região da caatinga do Brasil. Repositório Alice
SOUZA, J. O. D.; NAGATA, A. K. I..
O presente trabalho teve como objetivo analisar a diversidade de begomovirus infectando tomateiro no Nordeste brasileiro.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Tomate; Doença de planta; Virus.; Solanum lycopersicum..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/981104
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Estudo in silico de sítios de restrição enzimática de genes da proteína capsidial e análise de diversidade genética de Apple chlorotic leaf spot virus em fruteiras de semente e caroço. Repositório Alice
CUNHA, E. T. da; NICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M..
Cultivares comerciais de macieiras são infectadas por 3 espécies principais de vírus: Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV), Apple stem grooving virus (ASGV) e Apple stem pitting virus (ASPV), geralmente em infecções complexas. O objetivo do estudo foi caracterizar a diversidade genética de genes da proteína capsidial (CP) de isolados de ACLSV.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Cultivar de maçã; Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV); Apple stem grooving virus (ASGV); Apple stem pitting virus (ASPV); Restrição enzimática; Macieira; Iniciação cientifica; Anais; CNPUV.; IC; Maca; Virus..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1049057
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Evaluation of nested and semi nested PCR in detection of equine infectious anemia virus infection in horses of Pantanal region, Brazil. Repositório Alice
CAVALCANTE, R. V.; NOGUEIRA, M. F.; ARAÚJO Jr. J. P..
Equine infectious anemia (EIA) is caused by a retrovirus and its primary mode of transmission comprises transfer of blood from infected animals to healthy ones. In Brazil, EIA notification is mandatory and its confirmation is based in serological tests followed by euthanasia of infected animals. AGID and ELISA are serological techniques recommended because have good accuracy and reliable results for detection of positive animals; however, some cases may display false results. Based on that, the aim of this study was to evaluate nested PCR technique in samples from Brazil. We tested five combinations of these primers, using 12 DNA samples extracted from positive horses from Pantanal (endemic area) in both serological techniques.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Anemia Infecciosa Equina; EIAV (Equine infectious anemia virus).; Equino; Virus.; Epidemiology; Equine infectious anemia; Horse diseases..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076399
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Identification and effects of mixed infection of Potyvirus isolates with Cucumber mosaic virus in cucurbits. Repositório Alice
BARBOSA, G. da S.; LIMA, J. A. de A.; QUEIROZ, M. A. de; DIAS, R. de C. S.; LIMA, C. S..
Mixed infections in cucurbits are frequently observed in natural conditions between viruses from the Potyvirus genus and Cucumber mosaic virus (CMV), which significantly decreases productivity. The objectives of the present study was to compare the host range of PRSV-W, WMV, and ZYMV isolates and evaluate the effects of mixed infections with CMV in zucchini plants (Cucurbita pepo L.). Host range studies comprising 23 plant species confirmed some similarities and biological differences among the isolates of PRSV-W, ZYMV, and WMV. RT-PCR confirmed the amplification of DNA fragments of the PRSV-W, WMV, and ZYMV coat protein gene (cp) and cytoplasm inclusion gene (ci). The virus interaction studies in zucchini Caserta plants indicated synergistic interactions,...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Mosaico do mamoeiro; Vírus do mosaico da melancia; Cucurbitácea.; Doença; Virus.; Papaya ringspot virus; Zucchini yellow mosaic virus; Watermelon mosaic virus; Cucumber mosaic virus; Potyvirus..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1053338
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Inheritance of a tolerant reaction to Tomato chlorosis crinivirus in tomato. Repositório Alice
PEREIRA-CARVALHO, R. C.; FONSECA, M. E. N.; NOGUEIRA, L.; FERNANDES-ACIOLI, N. A. N.; BOITEUX, L. S..
Resumo 1555.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Tomate; Doença de planta; Virus.; Solanum lycopersicum..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/911023
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Levantamento de vírus em lavouras de alho o Brasil. Repositório Alice
FERNANDES, F. R.; SOUZA, J. M.; ALVES, R. C..
O presente trabalho teve o objetivo de realizar a diagnose viral em amostras de alho provenientes de lavouras localizadas nos municípios de Planaltina - DF, Cristópolis - BA, Mirangaba - BA e Bueno Brandão - MG.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Allim sativum.; Alho; Doença de planta; Virus..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943697
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Phenotypic expression and spectrum of efficiency to four bipartite Begomovirus species of novel tomato resistance sources. Repositório Alice
MACHADO, M. R.; CARVALHO, R. C. P.; MENDONZA, L. L.; FONSECA, M. E. N.; RIBEIRO, S. G.; BOITEUX, L. S..
In the present work individual plants of these five accessions as well as the tomato cultivar 'Viradouro' (susceptible control) and TX-468-RG (resistant control due to the recessive locus tcm-1) were evaluated in biolistic assays with infective clones of four begomovirus of the Brazilian complex: Tomato severe rugose virus (ToSRV); Tomato rugose mosaic virus (ToRMV); Tomato yellow vein streak virus (ToYVSV) and Tomato chlorotic mottie virus (ToCMoV).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Bergomovirus.; Tomate; Variedade resistente; Doença de planta; Virus.; Solanum lycopersicum..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1001714
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Principais doenças do morangueiro no Brasil e seu controle. Infoteca-e
REIS, A.; COSTA, H..
Descreve as principais doenças do morangueiro,causadas por fungos, bactéria, vírus e uma de origem ainda desconhecida: Vermelhão.
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Morango; Doença de planta; Bactéria; Fungo; Virus.; Fragaria ananassa..
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/916685
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Registro de isolados de Sida yellow net vírus associados a plantas de tomateiro no Estado do Rio de Janeiro, Brasil. Repositório Alice
ACIOLI, N. A. N. F.; COSTA, A. F.; REIS, A.; FONSECA, M. E. N.; BOITEUX, L. S..
Resumo 847-1. Na publicação: BOITEUX, M. E. D. N. F.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Soalum lucopersicum.; Tomate; Melhoramento genético vegetal; Variedade resistente; Virus..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/981434
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Sequencia completa do DNA-A de um isolado de Tomato chlorotie vein virus infectando tomateiro no Estado do Ceará, Brasil. Repositório Alice
ACIOLI, N. A. N. E.; FONSECA, M. E. N.; BOITEUX, L. S..
Resumo 847-2. Na publicação: BOITEUX, M. E. D. N. F.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Ceará; Solanun lycopersicum.; Tomate; Virus.; Begomovirus..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/981565
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Tomato chlorosis virus on the weed Physalis angulata within tomato fields in São Paulo State, Brazil. Repositório Alice
ABREU, H.; FONSECA, M. E. de N.; PEREIRA-CARVALHO, R. C.; BOITEUX, L. S..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Physalis angulata L.; Tomate; Doença de planta; Virus.; Solanum lycopersicum..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943675
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Tospovírus emergence, interspecific reassortment and mixed infections in Brazil: advances in Breeding for broad spectrum tospovirus resistance. Repositório Alice
RESENDE, R. O.; BOITEUX, L. S..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Virus.; Solanum lycopersicum; Tospovirus..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033054
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Vira-cabeça: ameaça à bataticultura no Brasil. Infoteca-e
LIMA, M. F.; MICHEREFF FILHO, M..
bitstream/item/153845/1/digitalizar0153.pdf
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Solanum tuberosum L.; Batata; Doença de planta; Virus..
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1061599
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Vira-cabeça do tomateiro: sintomas, epidemiologia, transmissão e medidas de manejo. Infoteca-e
LIMA, M. F.; MICHEREFF FILHO, M..
bitstream/item/131429/1/COT-110.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Vira-cabeça.; Tomate; Doença de planta; Virus.; Solanum lycopersicum; Tospovirus..
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1026816
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Vírus que infectam plantas. Repositório Alice
LIMA, M. F..
Resumo de palestra.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Topovirus.; Geminivírus; Hortaliça; Virus.; Tobamovirus.; Potyvirus.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/969469
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