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Registro completo
Provedor de dados:  Repositório Alice
País:  Brazil
Título:  Is a genome a codeword of an error-correcting code?
Autores:  FARIA, L. C. B.
ROCHA, A. S. L.
KLEINSCHMIDT, J. H.
SILVA-FILHO, M. C.
BIM, E.
HERAI, R. H.
YAMAGISHI, M. E. B.
PALAZZO JÚNIOR, R.
Data:  2012-05-29
Ano:  2012
Palavras-chave:  Biologia
Sequência de DNA
Genome
Biology
Nucleotide sequences
Resumo:  Since a genome is a discrete sequence, the elements of which belong to a set of four letters, the question as to whether or not there is an error-correcting code underlying DNA sequences is unavoidable. The most common approach to answering this question is to propose a methodology to verify the existence of such a code. However, none of the methodologies proposed so far, although quite clever, has achieved that goal. In a recent work, we showed that DNA sequences can be identified as codewords in a class of cyclic error-correcting codes known as Hamming codes. In this paper, we show that a complete intron-exon gene, and even a plasmid genome, can be identified as a Hamming code codeword as well. Although this does not constitute a definitive proof that there is an error-correcting code underlying DNA sequences, it is the first evidence in this direction.

2012
Tipo:  Artigo em periódico indexado (ALICE)
Idioma:  Inglês
Identificador:  16712

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/925637

http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/60323/1/journal.pone.0036644.pdf
Editor:  PLoS ONE, San Francisco, v. 7, n. 5, p. 1-9, May 2012.
Relação:  Embrapa Informática Agropecuária - Artigo em periódico indexado (ALICE)
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