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Registro completo
Provedor de dados:  Repositório Alice
País:  Brazil
Título:  Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore.
Autores:  SOMAVILLA, A. L.
HIGA, R. H.
MUDADU, M. de A.
ALENCAR, M. M. de
REGITANO, L. C. de A.
REDE BIFEQUALI
Data:  2012-12-19
Ano:  2012
Palavras-chave:  Bos indicus
Desequilíbrio de ligação
Genotipagem
REHH
Snps
Resumo:  A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001).

2012
Tipo:  Artigo em anais de congresso (ALICE)
Idioma:  Português
Identificador:  21465

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943057

http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/72480/1/LUCIANA2.pdf
Editor:  In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.
Relação:  Embrapa Pecuária Sudeste - Artigo em anais de congresso (ALICE)
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