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Provedor de dados:  Repositório Alice
País:  Brazil
Título:  Prediction of binding hot spot residues by using structural and evolutionary parameters.
Autores:  HIGA, R. H.
TOZZI, C. L.
Data:  2011-02-01
Ano:  2009
Palavras-chave:  Estrutura proteica
Interações proteína-proteína
Previsão de resíduos hot spots
Protein structure
Prediction
Resumo:  In this work, we present a method for predicting hot spot residues by using a set of structural and evolutionary parameters. Unlike previous studies, we use a set of parameters which do not depend on the structure of the protein in complex, so that the predictor can also be used when the interface region is unknown. Despite the fact that no information concerning proteins in complex is used for prediction, the application of the method to a compiled dataset described in the literature achieved a performance of 60.4%, as measured by F-Measure, corresponding to a recall of 78.1% and a precision of 49.5%. This result is higher than those reported by previous studies using the same data set.

2009
Tipo:  Artigo em periódico indexado (ALICE)
Idioma:  Inglês
Identificador:  15522

http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/875214

http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26210/1/gmb2009.pdf
Editor:  Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 3, p. 626-633, 2009.
Relação:  Embrapa Informática Agropecuária - Artigo em periódico indexado (ALICE)
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