Consulta: creatorFacets:"Benabdelmouna, Abdellah"
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Les surmortalités des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas : acquis des recherches en 2010
Provedor de dados: 5
Autores: Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Soletchnik, Patrick; Lupo, Coralie; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Pernet, Fabrice; Bachere, Evelyne; Bedier, Edouard; Petton, Bruno; Gaussem, Florian; Stanisiere, Jean-yves; Degremont, Lionel.
Depuis 2008, la filière ostréicole française doit faire face à des surmortalités exceptionnelles des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas, (huîtres de moins d’un an) comprises entre 60 et 90% dans tous les sites d’élevage. Des cas de mortalité similaires ont été décrits en Irlande, dans les îles anglo-normandes, au Portugal en 2009 et au Royaume-Uni en 2010. Récemment deux épisodes de mortalité, associés à la présence d’un virus OsHV1 μvar (ou un variant très proche) ont été également décrits en Nouvelle Zélande (décembre 2010) et en Australie (janvier 2011) soulignant la vulnérabilité de la filière ostréicole dans le monde. L’objectif de ce document est de faire un point sur les recherches menées depuis l’apparition de ce phénomène et de...
Tipo: Text
Ano: 2011
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14423/11719.pdf

Single or dual experimental infections with Vibrio aestuarianus and OsHV-1 in diploid and triploid Crassostrea gigas at the spat, juvenile and adult stages
Provedor de dados: 5
Autores: Azema, Patrick; Travers, Marie-agnes; Benabdelmouna, Abdellah; Degremont, Lionel.
French production of the Pacific cupped oyster, Crassostrea gigas, is currently threatened by two pathogens, OsHV-1 and V. aestuarianus. While oysters selected for their higher resistance to OsHV-1 are now available for the industry, the impact of V. aestuarianus on such oysters is unknown, especially for triploids. In addition, experimental infection has used the virus or the bacteria alone, but there have been no investigations of dual exposure to these pathogens. This study is the first report of single or dual exposure in spat (Spat1 and Spat2), juvenile and adult naïve oysters. For each of the two stocks evaluated, unselected oysters and oysters selected for their higher resistance to OsHV-1 infection were tested, as well as their triploid siblings of...
Tipo: Text
Palavras-chave: Vibrio aestuarianus; OsHV-1; Dual exposure; Ploidy; Selection; Crassostrea gigas.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00347/45835/45918.pdf

Double résistance aux infections dues aux organismes pathogènes Vibrio aestuarianus et OsHV-1 chez l’huître creuse Crassostrea gigas – DORE. Rapport scientifique final de l’étude DORE, convention DPMA-Ifremer 2016
Provedor de dados: 5
Autores: Degremont, Lionel; Maurouard, Elise; Godfrin, Yoann; Travers, Marie-agnes; Morga, Benjamin; Lamy, Jean-baptiste; Benabdelmouna, Abdellah.
Depuis 2012, le nombre de cas de mortalités d’huîtres creuses adultes (Crassostrea gigas) rapportés dans le cadre des réseaux de surveillance de l’Ifremer, et dans lesquels la bactérie Vibrio aestuarianus a été isolée, a fortement augmenté. Les objectifs de cette étude étaient (1) d’étudier la sensibilité des huîtres C. gigas à une infection à V. aestuarianus pour des lots diploïdes et triploïdes et (2) déterminer la réponse à la sélection pour une meilleure résistance à V. aestuarianus pour des huîtres C. gigas. Neuf stocks ont été utilisés, répartis en trois niveaux de sélection, chacun étant donc répliqué par trois pontes. Pour chaque stock, un lot diploïde (2n), un lot triploïde (3n_chim) produit par la rétention d’un globule polaire, et trois lots...
Tipo: Text
Palavras-chave: Vibrio aestuarianus; OsHV-1; Sélection; Résistance; Triploïdes; Huître creuse; Crassostrea gigas; Vibrio aestuarianus; OsHV-1; Selective breeding; Disease resistance Pacific oyster; Crassostrea gigas; Triploids.
Ano: 2017
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00404/51530/52140.pdf

CAPRETAR : Etude comparative des caractéristiques cytogénétiques et des performances de survie de naissains sauvages issus du CAPtage PREcoce ou TARdif
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Hemissi, Issam; Bodin, Stephane; Robert, Stephane; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe.
L'action de recherche CAPRETAR (CAptage PREcoce ou TARdif: 2009-2010) a été réalisée dans le cadre du Contrat de Plan Etat Région - Poitou Charentes (CPER-PC 2007- 2013) développement durable des Pertuis Charentais. Cette action, s 'inscrit dans le cadre d 'un lien direct qui existerait entre la nature précoce/tardive d 'un captage naturel et la qualité des naissains de l'huître creuse C. gigas qui en sont issus (qualité génétique : « R » résistante ou « S » sensible et qualité génomique : taux des aneuploïdies et des dommages à l'ADN). L'objectif de cette action vise à estimer durant l 'année (2010) les performances relatives de survie de naissains issus d 'un captage précoce ou tardif réalisé l'année précédente (2009). Les résultats escomptés visent à...
Tipo: Text
Palavras-chave: Génétique; Cytogénétique; Captage; Reproduction; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2011
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00062/17283/14794.pdf

Parental exposure to the herbicide diuron results in oxidative DNA damage to germinal cells of the Pacific oyster Crassostrea gigas
Provedor de dados: 5
Autores: Barranger, Audrey; Heude-berthelin, Clothilde; Rouxel, Julien; Adeline, Beatrice; Benabdelmouna, Abdellah; Burgeot, Thierry; Akcha, Farida.
Chemical pollution by pesticides has been identified as a possible contributing factor to the massive mortality outbreaks observed in Crassostrea gigas for several years. A previous study demonstrated the vertical transmission of DNA damage by subjecting oyster genitors to the herbicide diuron at environmental concentrations during gametogenesis. This trans-generational effect occurs through damage to genitor-exposed gametes, as measured by the comet-assay. The presence of DNA damage in gametes could be linked to the formation of DNA damage in other germ cells. In order to explore this question, the levels and cell distribution of the oxidized base lesion 8-oxodGuo were studied in the gonads of exposed genitors. High-performance liquid chromatography...
Tipo: Text
Palavras-chave: Crassostrea gigas; Oxidative stress; DNA damage; Germ cell; Pesticides.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00295/40655/39753.pdf

Les pratiques culturales peuvent-elles permettre de réduire la surmortalité du naissain d'huîtres creuses? Récapitulatif des essais d'élevage et expérimentations zootechniques menés sur le territoire français entre 2008 et 2010
Provedor de dados: 5
Autores: Soletchnik, Patrick; Mazurie, Joseph; Allain, Gwenhael; Bedier, Edouard; Benabdelmouna, Abdellah; Blin, Jean-louis; Bouquet, Anne-lise; Cochet, Hélène; Degremont, Lionel; Gaussem, Florian; Gervasoni, Erika; Glize, Philippe; Petton, Bruno; Roussel, Pierre-yves; Pernet, Fabrice.
This paper summarizes knowledge about relations between husbandry practices and oyster spat mortalities since 2008 in France. These relations are strictly analyzed from a panel of experiments set on the shore (in outdoor experiments) by Ifremer teams and technical institutes all over French coasts. Results show some practices are able to reduce spat mortality with some influencing factors relevant of spat quality (sanitary status, natural or genetic selection) or husbandry practices. Spat “free” of virus is able to survive up to 90% when it is isolated and confined in ponds or nursery, during an epidemic crisis. When outbreaks occurred in oyster beds, natural or nursery spat died in almost same proportions. In 2010, some studies conducted in Mediterranean...
Tipo: Text
Palavras-chave: Surmortalité; Naissain; Huître creuse; OsHV-1; Pratiques culturales; Mortality; Spat; Cupped oyster; Crassostrea gigas; OsHV-1; Cultural practices.
Ano: 2011
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14280/25847.pdf

Effects of an environmentally relevant concentration of diuron on oyster genitors during gametogenesis: responses of early molecular and cellular markers and physiological impacts
Provedor de dados: 5
Autores: Akcha, Farida; Barranger, Audrey; Bachere, Evelyne; Berthelin, C. Heude; Piquemal, D.; Alonso, P.; Sallan, R. Rondon; Dimastrogiovanni, G.; Porte, C.; Menard, Dominique; Szczybelski, A.; Benabdelmouna, Abdellah; Auffret, M.; Rouxel, Julien; Burgeot, Thierry.
Genitors of the Pacific oyster Crassostrea gigas were submitted during gametogenesis to a short pulse exposure to the herbicide diuron at a realistic environmental concentration. Histological analysis showed no effect of diuron on gametogenesis course, sex ratio and reproductive effort. A non-significant increase in testosterone and progesterone levels was observed in genitors exposed to the herbicide. At cell level, diuron exposure was shown to modulate the phagocytic activity of circulating hemocytes. The results of a transcriptional analysis showed that diuron affected the expression of genes belonging to functions known to play a major role during oyster gametogenesis such as gene transcription regulation, DNA replication and repair, DNA methylation...
Tipo: Text
Palavras-chave: Oyster; Pesticide; Reproduction; Histology; Gene expression; RT-qPCR; Steroid; Immunity.
Ano: 2016
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00309/41983/83232.pdf

Study of genetic damage in the japanese oyster induced by an environmentally-relevant exposure to diuron: evidence of vertical transmission of dna damage
Provedor de dados: 5
Autores: Barranger, Audrey; Akcha, Farida; Rouxel, Julien; Brizard, Raphael; Maurouard, Elise; Pallud, Marie; Menard, Dominique; Tapie, N.; Budzinski, Helene; Burgeot, Thierry; Benabdelmouna, Abdellah.
Pesticides represent a major proportion of the chemical pollutants detected in French coastal waters and hence a significant environmental risk with regards to marine organisms. Commercially-raised bivalves are particularly exposed to pollutants, among them pesticides, as shellfish farming zones are subject to considerable pressure from agricultural activities on the mainland.  The aims of this study were to determine (1) the genotoxic effects of diuron exposure on oyster genitors and (2) the possible transmission of damaged DNA to offspring and its repercussions on oyster fitness. To investigate these points, oysters were exposed to concentrations of diuron close to those detected in the Marennes-Oleron Basin (two 7-day exposure pulses at 0.4 and 0.6 μg...
Tipo: Text
Palavras-chave: Herbicide; Diuron; Oyster; Genotoxicity; Comet assay; Cytogenetics.
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00162/27311/25541.pdf

Etude de la CINétique et DIffusion de la MORtalité (CINDIMOR) chez les juvéniles de l'huître creuse Crassostrea gigas
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe; Degremont, Lionel.
Depuis son introduction en France, l’huître creuse du Pacifique Crassostrea gigas subit des épisodes répétés de mortalité estivale touchant principalement les juvéniles. A partir de 2008, un nouveau pallier a été franchi et ces épisodes de mortalité estivale se sont accrus en intensité, touchant jusqu’à 90% des lots. Actuellement, ces mortalités touchent l’ensemble des façades maritimes ainsi que plusieurs pays utilisant des naissains d’origine Française. L’ostréiculture Française est basée sur l’utilisation majoritaire de naissains sauvages issus d’un captage naturel (75 à 80%) réalisé au niveau des bassins d’Arcachon et de Marennes Oléron en complément avec l’utilisation de naissains, principalement triploïdes, produits par diverses écloseries privées...
Tipo: Text
Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Mortalité; Condition d'élevage; Historique des lots.
Ano: 2011
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00063/17405/14910.pdf

CARTAMO : CARTographie des Anomalies génomiques dans les gisements naturels d'huîtres creuses du bassin de Marennes Oléron
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Hemissi, Issam.
Depuis son existence, le réseau biovigilance détecte des naissains sauvages issus du captage naturel atteints d'anomalies génomiques dont le taux varie en fonction des années et des sites de captage. Dans d'autres suivis, nous avons montré que ces anomalies génomiques affectant les naissains de C. gigas étaient négativement corrélées avec le niveau de survie des naissains. Dans le contexte des mortalités qui impactent lourdement depuis 2008 les naissains de C. gigas, et compte tenu du fait que les deux principaux bassins naisseurs français, étudiés dans le cadre du réseau Biovigilance, sont à la base de la fourniture de pratiquement les trois quarts des naissains annuellement utilisés, l'occurrence de ces anomalies génomiques mises en évidence dans le...
Tipo: Text
Palavras-chave: Génétique; Anomalies génomiques; Huître creuse; Crassostrea gigas.
Ano: 2011
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00062/17281/14793.pdf

Parental exposure to environmental concentrations of diuron leads to aneuploidy in embryos of the Pacific oyster, as evidenced by fluorescent in situ hybridization
Provedor de dados: 5
Autores: Barranger, Audrey; Benabdelmouna, Abdellah; Degremont, Lionel; Burgeot, Thierry; Akcha, Farida.
Changes in normal chromosome numbers (i.e. aneuploidy) due to abnormal chromosome segregation may arise either spontaneously or as a result of chemical/radiation exposure, particularly during cell division. Coastal ecosystems are continuously subjected to various contaminants originating from urban, industrial and agricultural activities. Genotoxicity is common to several families of major environmental pollutants, including pesticides, which therefore represent a potential important environmental hazard for marine organisms. A previous study demonstrated the vertical transmission of DNA damage by subjecting oyster genitors to short-term exposure to the herbicide diuron at environmental concentrations during gametogenesis. In this paper, Fluorescent in...
Tipo: Text
Palavras-chave: Aneuploidy; FISH; Diuron; Crassostrea gigas.
Ano: 2015
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00238/34911/33216.pdf

Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2009
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Tourbiez, Delphine; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
En 2009, La caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2008 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon a été réalisée dans le cadre du réseau biovigilance. Les échantillons des naissains sauvages issus de ce captage naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1121 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l’absence d’animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage rospectés sont caractérisés par la présence accrue de naissains affectés de diverses anomalies génomiques (cassures d’ADN et diminution de la taille du génome,...
Tipo: Text
Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Génétique; Ploïdie; Naissain; Bassin Marennes Oléron; Charente-Maritime; Bassin d'Arcachon; Gironde.
Ano: 2011
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14282/11559.pdf

Plan de sauvegarde 2012, 3ème édition : synthèse des résultats 2012-2013
Provedor de dados: 5
Autores: Degremont, Lionel; Maurouard, Elise; Connes, Coralie; Ledu, Christophe; Benabdelmouna, Abdellah.
Depuis 2008 l’ostréiculture française subit des mortalités massives d'huîtres creuses, Crassostrea gigas, qui menacent les approvisionnements en naissains et, par voie de conséquence, fragilise la filière ostréicole. C’est dans ce contexte qu'a été mis en place à partir de 2010 une opération désignée sous le terme plan de sauvegarde. Cette opération sous forme contractuelle fait intervenir l'Ifremer, des écloseries privées, le Ministère en charge de l'Agriculture et le CNC. Le premier plan de sauvegarde (PS1) a été initié en 2010, suivi par un deuxième en 2011 (PS2), et un troisième en 2012 (PS3). L’objectif premier de ce plan est d’apporter une réponse temporaire au déficit de production grandissant en fournissant aux écloseries des animaux présentant une...
Tipo: Text
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00229/34041/32448.pdf

Procédures d'échantillonnage pour la conservation des espèces aquacoles dans la Cryobanque Nationale
Provedor de dados: 5
Autores: Vandeputte, Marc; Labbe, Catherine; Suquet, Marc; Fauvel, Christian; Goardon, Lionel; Duclos, Delphine; Danchin-burge, Coralie; Vergnet, Alain; Rault, Paul; Degremont, Lionel; Benabdelmouna, Abdellah; Brizard, Raphael; Haffray, Pierrick.
Tipo: Text
Ano: 2012
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00098/20975/18597.pdf

Chromosomal organization of simple sequence repeats in the Pacific oyster (Crassostrea gigas): (GGAT)(4), (GT)(7) and (TA)(10) chromosome patterns
Provedor de dados: 5
Autores: Bouilly, Karine; Chaves, R.; Leitao, A.; Benabdelmouna, Abdellah; Guedes Pinto, H.
Chromosome identification is essential in oyster genomic research. Fluorescence in situ hybridization (FISH) offers new opportunities for the identification of oyster chromosomes. It has been used to locate satellite DNAs, telomeres or ribosomal DNA sequences. However, regarding chromosome identification, no study has been conducted with simple sequence repeats (SSRs). FISH was used to probe the physical organization of three particular SSRs, (GGAT)(4), (GT)(7) and (TA)(10) onto metaphase chromosomes of the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Hybridization signals were observed in all the SSR probes, but the distribution and intensity of signals varied according to the oligonucleotide repeat. The intercalary, centromeric and telomeric bands were observed...
Tipo: Text
Palavras-chave: Simple sequence repeats (SSRs); Mollusks; Fluorescence in situ hybridization (FISH); Crassostrea gigas; Chromosome identification.
Ano: 2008
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-6132.pdf

Plan de sauvegarde 2011 : synthèse de résultats 2011-2012
Provedor de dados: 5
Autores: Chavanne, Herve; Maurouard, Elise; Yonneau, Caroline; Heroin, Debora; Ledu, Christophe; Degremont, Lionel; Benabdelmouna, Abdellah.
Afin de permettre l’approvisionnement partiel des établissements ostréicoles en naissain « à survie améliorée », un protocole d’approvisionnement partiel de sauvegarde (PSI) a été mis en place en 2010 entre le CNC, les CRCs, les écloseurs et l’Ifremer afin de fournir aux ostréiculteurs du naissain présentant les meilleures chances de survie face aux mortalités estivales. Il avait ainsi été décidé que des écloseries privées produiraient du naissain triploïde « à survie améliorée » en 2010 à partir de géniteurs, femelles diploïdes et mâles tétraploïdes, sélectionnés et fournis par Ifremer. Sur la base notamment des recommandations des Assises de la Conchyliculture, l’opération a été reconduite en 2011 (PSII) et 2012 (PSIII). Suite aux productions réalisées...
Tipo: Text
Palavras-chave: Mortalités; Crassostrea gigas; Huîtres creuses; Triploïde R; Sélection Génétique.
Ano: 2013
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25412/23563.pdf

Niveau de ploïdie des huîtres des bassins de captage de Marennes Oléron et Arcachon (Campagne biovigilance 2007)
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Grouhel, Stephanie; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
The monitoring of spat ploidy collected in the two main collection basins-Marennes Oléron and Arcachon-was realised through flow cytometry. Natural spat samples were collected on 3 sites in each basin and a total of 1 002 animals were analysed. Based on our samples, the results concluded that no polyploid, triploid or tetraploid animals were collected in the two investigated basins. These results comply with our provisions and do not bring any reason for a change in the practices used in triploid oyster culture. However, complementary studies on triploid residual gametogenesis, the nature of their gametes and that of their offsprings will have to be continued in order to fine-tune the estimates of the parameters on which the modeling scenarii of the...
Tipo: Text
Palavras-chave: Reproduction; Captage; Arcachon; Marennes Oléron; Génétique; Crassotrea gigas; Huîtres; Naissain; Ploïde.
Ano: 2007
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-3905.pdf

MYTILOBS Campagne 2018 - 2019, Réseau d'observation des moules d'élevage sur la côte Atlantique et dans la Manche
Provedor de dados: 5
Autores: Normand, Julien; Benabdelmouna, Abdellah; Louis, Wilfried; Grizon, James.
La campagne 2018-2019 est la sixième campagne consécutive du MYTILOBS après stabilisation des procédures et des protocoles. Au cours de cette campagne, une action supplémentaire visant à caractériser la qualité cyto-génétique des cheptels a été adossée au réseau. Le suivi des 2 points de Roulières et de Boyard a dû être abandonné, et un lot de moules de 2 ans a été ajouté au cheptel sentinelle pour le suivi des mortalités qui l’ont affecté. Les résultats de l’action d’observation mettent en évidence des mortalités toujours très présentes sur les sites du réseau qui avaient été les plus affectés au cours des années précédentes (principalement, la Baie de Bourgneuf et les secteurs d’élevage des Pertuis Charentais). La croissance des moules s’est avérée...
Tipo: Text
Palavras-chave: Moules; Mortalités; Observation; Variation spatio temporelle.
Ano: 2020
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00653/76490/77570.pdf

Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et étude des facteurs liés, action – MORBLEU-2018
Provedor de dados: 5
Autores: Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Bierne, Nicolas; Chasselin, Leo; Degremont, Lionel; Guesdon, Stephane; Lamy, Jean-baptiste; Le Moine, Olivier; Normand, Julien; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une étude spécifique cofinancée par la DPMA et réalisée par l’Ifremer a été initiée, l’action de recherche MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Les années 2015- 2017 ont permis de dégager des éléments de connaissance et des pistes relatifs aux facteurs biotiques et abiotiques qui semblent intervenir dans le phénomène de hausse de mortalité des moules depuis 2014. Pour l’année 2018, les actions d’observation et de suivis du milieu et des moules ont été fortement réduites et trois axes principaux ont été poursuivis : i) l’étude de la relation entre l’évolution des équilibres microbiens planctoniques et l’apparition de mortalités...
Tipo: Text
Ano: 2019
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00588/70056/67999.pdf

Ostreid herpesvirus type 1 replication and host response in adult Pacific oysters, Crassostrea gigas
Provedor de dados: 5
Autores: Segarra, Amelie; Baillon, Laury; Tourbiez, Delphine; Benabdelmouna, Abdellah; Faury, Nicole; Bourgougnon, Nathalie; Renault, Tristan.
Since 2008, massive mortality outbreaks associated with OsHV-1 detection have been reported in Crassostrea gigas spat and juveniles in several countries. Nevertheless, adult oysters do not demonstrate mortality in the field related to OsHV-1 detection and were thus assumed to be more resistant to viral infection. Determining how virus and adult oyster interact is a major goal in understanding why mortality events are not reported among adult Pacific oysters. Dual transcriptomics of virus-host interactions were explored by real-time PCR in adult oysters after a virus injection. Thirty-nine viral genes and five host genes including MyD88, IFI44, IkB2, IAP and Gly were measured at 0.5, 10, 26, 72 and 144 hours post infection (hpi). No viral RNA among the 39...
Tipo: Text
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00213/32414/30887.pdf

Blue mussel mortality outbreak in France is associated with heavy genomic abnormalities detected by flow cytometric analysis of hemolymph
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Ledu, Christophe.
Since 2014, blue mussel industry in France has been facing heavy mortality outbreaks (90–100%) affecting both juveniles and adults. This report presents evidence of heavy genomic abnormalities associated with mortality outbreaks in blue mussels from the Atlantic coast of France. Ploidy characteristics of hemic cells were investigated using Flow CytoMetry (FCM), revealing an unusual, broad continuum of ploidy distribution from hypodiploidy to tetraploidy. FCM was additionally used to evaluate, at individual and populations levels, different thresholds of genomic abnormality (GA%)using the percentage of non-diploid nuclei. Individual mussels were considered to be abnormal when more than 10% of hemocytes in S–G2/M phase were present. At the population level,...
Tipo: Text
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00356/46720/46591.pdf

Autotetraploid Pacific oysters (Crassostrea gigas) obtained using normal diploid eggs: induction and impact on cytogenetic stability
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Ledu, Christophe.
We describe two methods of producing viable and fertile autotetraploid Pacific oyster (Crassostrea gigas Thunberg) based on the use of normal-sized oocytes produced by normal diploid females. Our methods showed that the oocyte size is not a limiting factor for the success of the induction to autotetraploidy. These methods offer means of direct introgression of genetic progress from elite diploid lines to tetraploids used as broodstock, avoiding a triploid step with the risk of transferring undesirable traits from highly fecund triploids. High variability in the level of cytogenetic stability was found among the different tetraploid oysters tested showing that induction method has an important impact on the long-term cytogenetic stability of the...
Tipo: Text
Palavras-chave: Oyster; Tetraploid induction; Mosaicism; Aneuploidy; Cytogenetic stability.
Ano: 2015
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00278/38924/37464.pdf

Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2010
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le réseau biovigilance a réalisé en 2010 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2009 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur 4 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1379 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d 'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage prospectés sont caractérisés par la présence de naissains affectés de diverses anomalies génomiques: cassures d 'ADN et Aneuploïdie (hypodiploïdie) ADN c à d une diminution de la taille du...
Tipo: Text
Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Anomalie génomique; Aneuploïdie.
Ano: 2010
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18124/15677.pdf

Effect of ploidy on the mortality of Crassostrea gigas spat caused by OsHV-1 in France using unselected and selected OsHV-1 resistant oysters
Provedor de dados: 5
Autores: Degremont, Lionel; Ledu, Christophe; Maurouard, Elise; Nourry, Max; Benabdelmouna, Abdellah.
The effect of ploidy on the mortality of Crassostrea gigas spat caused by the ostreid herpesvirus (OsHV-1) genotype μVar was investigated at five sites along the Atlantic coast in France in 2011. Sibling diploids and triploids were produced using either unselected or selected OsHV-1-resistant oysters. No significant interactions were found between the factors of environment, genotype and ploidy at the endpoint dates. The mean mortality rates at the sites were 62 and 59% for diploids and triploids, respectively, and the two rates were not significantly different. The mean mortality rates were 33 and 32% for sibling diploids and triploids, respectively, when OsHV-1-resistant parents were used, and 91 and 85%, respectively, when unselected parents were used....
Tipo: Text
Palavras-chave: Diploid; Triploid; Mortality; Crassostrea gigas; Ostreid herpesvirus OsHV-1.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31028/29427.pdf

Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les pertuis charentais, le bassin d'Arcahon et la baie de Bourgneuf. Réseau Biovigilance, campagne 2012
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Maurouard, Elise; D'Amico, Florence; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James.
Comme pour les années précédentes, le réseau biovigilance a réalisé en 2012 la caractérisation du niveau de ploïdie de naissains captés en 2011. En plus des deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon, un bassin additionnel (baie de Bourgneuf) a été prospecté grâce à l’analyse de naissains sauvages captés en 2011 au niveau du site de la bernerie en Retz. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur plusieurs sites de chaque bassin pour un total analysé de 1340 animaux. En tenant compte de l’échantillonnage, les résultats de suivi de ploïdie sont interprétés comme une absence d’animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les trois bassins prospectés. Cependant, comme les...
Tipo: Text
Palavras-chave: Ploïdie; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Captage naissain; Pertuis Charentais; Bassin d'Arcachon; Baie de Bourgneuf.
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00176/28730/27197.pdf

Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2008
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Hubert, Mathias; Cantin, Christian; D'Amico, Florence; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le suivi de la ploïdie du naissain capté dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et d'Arcachon a été réalisé par cytométrie en flux . Les échantillons de naissain naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total de 1002 animaux analysés. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l 'absence d'animaux polyploïdes. triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Ces résultats sont conformes aux prévisions en la matière et n'apportent donc aucune raison de modification des pratiques en cours dans la filière ostréicole triploïde. Cependant, pour la deuxième année consécutive, les deux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon...
Tipo: Text
Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Aneuploïdie; Marennes Oléron; Arcachon; Crassostrea gigas.
Ano: 2008
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18131/15679.pdf

Mortality associated with OsHV-1 in spat Crassostrea gigas: role of wild-caught spat in the horizontal transmission of the disease
Provedor de dados: 5
Autores: Degremont, Lionel; Benabdelmouna, Abdellah.
The French oyster production of Crassostrea gigas is based on two sources of spat: wild-caught (WC) and hatchery-produced (HP). Massive mortality related to the ostreid herpesvirus type 1 (OsHV-1) has affected both sources in France since 2008. We investigated the mortality in juvenile C. gigas due to the horizontal transmission of OsHV-1 within (separated condition) and between (mixed condition) the two spat sources in three environments from April to June 2010. In the separated condition, no mortality was observed in the HP batches, while the WC batches experienced moderate to high mortality (40–80 %). In contrast, the WC and HP batches experienced high mortality in all tested environments for the mixed condition. At the beginning of the trial, the HP...
Tipo: Text
Palavras-chave: Crassostrea gigas; Wild-caught; Hatchery-produced; Spat; Mortality; Horizontal transmission; Ostreid herpesvirus OsHV-1.
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00188/29921/28387.pdf

Observatoire national du cycle de vie de l’huître creuse en France. Rapport annuel ECOSCOPA 2019
Provedor de dados: 5
Autores: Fleury, Elodie; Petton, Sebastien; Corporeau, Charlotte; Benabdelmouna, Abdellah; Pouvreau, Stephane.
Occupant une place de premier ordre dans les paysages côtiers français, l’ostréiculture est le premier contributeur de la filière aquacole française avec une production estimée à 85000 tonnes ces dernières années. Pourtant, depuis 2008, cette espèce est affectée par des épisodes de mortalités massives et récurrentes déclenchées par la présence d'agents infectieux viraux (de type Herpes virus OsHV-1 μVar) en conjonction avec des facteurs environnementaux (i.e. élévation de la température). Cette infection virale induit une altération des défenses antimicrobiennes ainsi qu'une déstabilisation de son microbiote. Ce processus conduit à une infection secondaire par des bactéries opportunistes potentiellement pathogènes qui se multiplient rapidement entrainant...
Tipo: Text
Palavras-chave: Huître creuse; Physiologie; Cytogénétique; Écologie; Réseau National.
Ano: 2020
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00687/79902/82833.pdf

The mass mortality of blue mussels (Mytilus spp) from the Atlantic coast of France is associated with heavy genomic abnormalities as evidenced by flow cytometry
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Ledu, Christophe.
Since 2014, France’s blue mussel industry has been facing heavy mortality outbreaks (90-100%) affecting both juveniles and adults. This report presents evidence of heavy genomic abnormalities associated with mortality outbreaks in blue mussels, Mytilus edulis-galloprovincialis, from the Atlantic coast of France. In this study, ploidy characteristics of hemic cells were investigated using Flow CytoMetry (FCM), revealing an unusual, broad continuum of ploidy distribution from hypodiploidy to tetraploidy. FCM was additionally used to evaluate, at individual and populations levels, different thresholds of genomic abnormality (GA%) using the percentage of non-diploid nuclei. Individual mussels were considered to be abnormal when more than 10% of hemocytes in...
Tipo: Text
Palavras-chave: Mussels; Mortality; Cytogenetic quality; Hemocytes; Ploidy.
Ano: 2016
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00341/45171/44566.pdf

Fluorescence in situ hybridization (FISH) or rDNA genes (5S and 18-5.8-28S) as a tool for chromosomal tagging and to assess the occurrence of somatic and sperm aneuploidy in Pacific oyster Crassostrea gigas
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Nadolna, Katarzyna; Ledu, Christophe.
Aneuploidy (or alteration of chromosome number) has been frequently described in diploid, triploid and tetraploid C. gigas. In diploid Pacific oysters, aneuploidy affects 1 to 3 chromosomes in up to 35% of the somatic cells and is positively correlated with inferior growth of the animal and thus could be associated with significant economic loss in this major aquaculture species. In polyploid Pacific oysters, aneuploidy was shown to be more heavily frequent and is linked to reversion to lower ploidy levels and is at the origin of aberrant gametes formation. In this context, identification of individual chromosomes involved in aneuploidy events both in somatic and germinal cells would be an important step towards the study of the exact occurrence of this...
Tipo: Text
Palavras-chave: Chromosome; Aneuploidy; Genetic; Crassostrea gigas; Pacific oysters.
Ano: 2008
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/acte-3502.pdf

Gamete quality in triploid Pacific oyster (Crassostrea gigas)
Provedor de dados: 5
Autores: Suquet, Marc; Malo, Florent; Quere, Claudie; Ledu, Christophe; Le Grand, Jacqueline; Benabdelmouna, Abdellah.
Triploidy induction in shellfish aims to obtain faster growth and sterility of reared individuals. Triploid Pacific oysters are most often not totally sterile, but have greatly reduced reproductive capacities compared to those recorded in diploid individuals. The description of gamete output in triploid aquatic animals is most often confined to the assessment of fecundity in females. The present work aims at further describing gamete quality of triploid Pacific oysters and comparing it to values observed in diploid individuals. Diploid and triploid oysters (produced by mating tetraploid males × diploid females) were reared in standard conditions and then transferred to the wild to allow the offspring to attain reproductive maturity. At the end of...
Tipo: Text
Palavras-chave: Crassostrea gigas; Reproduction; Triploidy; Gamete.
Ano: 2016
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00277/38835/37581.pdf

Synthesis of the “PLAN DE SAUVEGARDE” using selected all-triploid oysters to reduce the shortage of spat in France due to OsHV-1–associated mortality in Crassostrea gigas
Provedor de dados: 5
Autores: Dégremont, Lionel; Maurouard, Elise; Ledu, Christophe; Benabdelmouna, Abdellah.
Due to massive mortality of Crassostrea gigas spat in France since 2008, a “plan de sauvegarde” was set up from 2011 to 2014 (hereafter referred to as PS1 to PS4), in order to reduce the shortage of spat. This plan involved the participation of commercial hatcheries, the French Research Institute for Exploitation of the Sea (Ifremer), and the Direction des Pêches Maritimes et de l'Aquaculture (DPMA) of the French Ministry of Agriculture. It was based on selecting diploid lines of C. gigas for their higher resistance to the oyster herpesvirus OsHV-1 (2nR group), and one of these lines was subsequently tetraploidized (4nR group). Both the 2nR and 4nR groups were produced by Ifremer, and then transferred to commercial hatcheries that produced the selected...
Tipo: Text
Palavras-chave: Triploids; Mortality; Crassostrea gigas; OsHV-1; Disease resistance.
Ano: 2019
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00484/59596/62598.pdf

Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et étude des facteurs liés, action –MORBLEU-2017
Provedor de dados: 5
Autores: Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Bierne, Nicolas; Costes, Louis; Degremont, Lionel; Garcia, Celine; Guesdon, Stephane; Lamy, Jean-baptiste; Le Moine, Olivier; Morga, Benjamin; Normand, Julien; Robert, Stephane; Saunier, Alice; Soletchnik, Patrick; Travers, Marie-agnes.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une étude spécifique cofinancée par la DPMA et réalisée par l’Ifremer a été initiée, l’action de recherche MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Les années 2015 et 2016 ont permis de dégager des éléments de connaissance et des pistes relatifs aux facteurs biotiques et abiotiques qui semblent intervenir dans le phénomène de hausse de mortalité des moules depuis 2014. Pour l’année 2017, les trois objectifs principaux étaient de : i) poursuivre la description du phénomène de mortalité ainsi que le contexte environnemental associé en effectuant une nouvelle campagne d’études et d’observations in situ, ii) tester des hypothèses...
Tipo: Text
Palavras-chave: Moules; Mytilus edulis; Mortalité; Statut cytogénétique; Anomalies génomiques; Populations; Facteurs environnementaux; Ecologie microbienne.
Ano: 2018
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00503/61503/65337.pdf

Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron, Baie de Bourgneuf et Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2011
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Ollier, Simon; Maurouard, Elise; D'Amico, Florence; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James.
Comme pour les années précédentes, le réseau biovigilance a réalisé en 2011 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2010. Pour la première fois, en plus des deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon, un bassin additionnel (Vendée) a été prospecté via l'analyse de naissains sauvages captés en 2010 au niveau de la baie de Bourgneuf. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur les sites de chaque bassin pour un total analysé de plus de 1800 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les trois bassins prospectés. Cependant, les bassins de...
Tipo: Text
Palavras-chave: Génétique; Ploïdie; Huître creuse; Crassostrea gigas; Naissain; Analyse cytométrique; Analyse statistique; Bassin de Marennes Oléron; Arcachon; Baie de Bourgneuf.
Ano: 2012
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21837/19427.pdf

Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles charentais et vendéens : description et facteurs liés – MORBLEU
Provedor de dados: 5
Autores: Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Degremont, Lionel; Guesdon, Stephane; Le Moine, Olivier; Morga, Benjamin; Bierne, Nicolas; Travers, Marie-agnes; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une première année d’étude a été réalisée au travers de l’action MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Elle a été menée dans les Pertuis charentais et la baie de Bourgneuf. Dans ce même contexte, elle a été reconduite en 2016 afin de poursuivre l’analyse des données collectées en 2015, renouveler une campagne d’étude et d’observation in situ, formuler des hypothèses autour de facteurs favorisants ces épisodes de mortalité de moules, développer des essais permettant de tester ces hypothèses dans le futur et produire des lots de moules pour ces essais et pour caractériser le potentiel adaptatif des animaux face aux épisodes de...
Tipo: Text
Palavras-chave: Moules; Mytilus edulis; Facteurs environnementaux; Mortalité; Equilibre microbien; Populations; Qualité cytogénétique; Anomalies hémocytaires; Expression de gènes; Physiologie.
Ano: 2017
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00391/50288/50978.pdf

Mortalités d'huîtres creuses adultes (Crassostrea gigas) et infection à Vibrio aestuarianus - AESTU
Provedor de dados: 5
Autores: Travers, Marie-agnes; Degremont, Lionel; De Lorgeril, Julien; Azema, Patrick; Montagnani, Caroline; Benabdelmouna, Abdellah; Nicolas, Jean-louis; Le Roux, Frederique.
En 2012, le nombre de cas de mortalités d’huîtres creuses adultes rapportés dans le cadre du réseau Repamo, et dans lesquels la bactérie Vibrio aestuarianus a été isolée, a fortement augmenté. Afin d’apporter de premiers éléments de réponse concernant cette augmentation, les objectifs de cette étude étaient de déterminer si l’émergence/la ré-émergence de V. aestuarianus était associée (i) à l’apparition d’un génotype bactérien particulier et/ou (ii) à une sensibilité accrue de certains animaux. L’Ifremer dispose d’une collection de souches bactériennes appartenant majoritairement au genre Vibrio et qui comporte différents isolats de V. aestuarianus, collectés depuis 2001 pendant ou hors épisodes de mortalité. La comparaison de ces isolats en termes de...
Tipo: Text
Palavras-chave: Vibrio aestuarianus; Huître creuse; Crassostrea gigas; Bactérie; Ré-émergenece; Virulence; Génome; Statut immunitaire; Génétique.
Ano: 2014
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00229/34037/32430.pdf

Mortality investigation of Mytilus edulis and Mytilus galloprovincialis in France: An experimental survey under laboratory conditions
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Garcia, Celine; Ledu, Christophe; Lamy, Pierre; Maurouard, Elise; Degremont, Lionel.
In the context of mass mortality outbreaks affecting adult and juvenile mussels since 2014 in France, two investigations were conducted to study mussel mortality under laboratory conditions in 2015. The first investigated the horizontal transmission of a putative causal agent of the mortality among two stocks of wild Mytilus edulis and the potential genetic resistance of adults and their progenies. The second evaluated the resistance of pure and hybrid crosses of M. edulis and M. galloprovincialis at the spat stage to a mortality outbreak. For the first time in France, we described several mortality outbreaks affecting spat and adult mussels under laboratory conditions. Mortality was observed for seawater temperatures ranging from 10 to 23 °C, although the...
Tipo: Text
Palavras-chave: Mytilus edulis; Mytilus galloprovincialis; Interspecific hybrids; Mortality outbreaks.
Ano: 2018
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55696/57364.pdf

Genomic abnormalities affecting mussels (Mytilus edulis-galloprovincialis) in France are related to ongoing neoplastic processes, evidenced by dual flow cytometry and cell monolayer analyses
Provedor de dados: 5
Autores: Benabdelmouna, Abdellah; Saunier, Alice; Ledu, Christophe; Travers, Marie-agnes; Morga, Benjamin.
In the context of the abnormal mass mortality of mussels in France since 2014, Flow CytoMetry (FCM) was used in 2015 and 2016 to study the DNA content and cell cycle characteristics of hemic circulating cells collected from 2000 mussels. The mussels were sampled from 12 wild and cultivated blue mussels stocks distributed along the French Atlantic coast from the south Brittany to Pertuis Charentais areas. During these surveys, various genetic abnormalities were frequently detected, and ploidy characteristics revealed contrasting profiles that corresponded to respective contrasting sanitary status, i.e. healthy mussels with high cytogenetic quality (HCQ) versus diseased mussels with low cytogenetic quality (LCQ). In the present work, FCM and hemocytology...
Tipo: Text
Palavras-chave: Mussels; Hemocytes; Flow cytometry; Hemocytology; Cytogenetic quality; Neoplasia.
Ano: 2018
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00455/56623/58443.pdf