Consulta: creatorFacets:"Eiras,Marcelo"
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Data/hora: 09/06/2024 07:41:09

Detection of three Allexivirus species infecting garlic in Brazil
Provedor de dados: 86
Autores: Melo Filho,Péricles de Albuquerque; Nagata,Tatsuya; Dusi,André Nepomuceno; Buso,José Amauri; Torres,Antonio Carlos; Eiras,Marcelo; Resende,Renato de Oliveira.
Garlic viruses often occur in mixed infections under field conditions. In this study, garlic samples collected in three geographical areas of Brazil were tested by Dot-ELISA for the detection of allexiviruses using monoclonal specific antibodies to detect Garlic virus A (GarV-A), Garlic virus B (GarV-B), Garlic virus C (GarV-C) and a polyclonal antiserum able to detect the three virus species mentioned plus Garlic virus D (GarV-D). The detected viruses were biologically isolated by successive passages through Chenopodium quinoa. Reverse Transcriptase Polimerase Chain Reaction (RT-PCR) was performed using primers designed from specific regions of the coat protein genes of Japanese allexiviruses available in the Genetic Bank of National Center of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Allium sativum; Virus detection; Coat protein; Dot-ELISA; RT-PCR.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2004000800002

Production of polyclonal antisera using recombinant coat proteins of Grapevine leafroll-associated virus 2 and Grapevine virus B
Provedor de dados: 86
Autores: Radaelli,Paula; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Nickel,Osmar; Eiras,Marcelo; Pio-Ribeiro,Gilvan.
The objective of this work was to produce and characterize specific antisera against Brazilian isolates of Grapevine leafroll-associated virus 2 (GLRaV-2) and Grapevine virus B (GVB), developed from expressed coat proteins (CPs) in Escherichia coli, and to test their possible use for the detection of these two viruses in diseased grapevines. The coat protein (CP) genes were RT-PCR-amplified, cloned and sequenced. The CP genes were subsequently subcloned, and the recombinant plasmids were used to transform E. coli cells and express the coat proteins. The recombinant coat proteins were purified, and their identities were confirmed by SDS-PAGE and Western blot and used for rabbit immunizations. Antisera raised against these proteins were able to recognize the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Vitis; GLRaV-2; GVB; Indirect ELISA; Recombinant protein; Western blot.
Ano: 2008
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008001000020

Desempenho agronômico de videiras com e sem sintomas de viroses, e comparação molecular de isolados virais
Provedor de dados: 86
Autores: Nascimento,Monique Bezerra; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Eiras,Marcelo; Czermainski,Ana Beatriz Costa; Nickel,Osmar; Pio-Ribeiro,Gilvan.
Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos de viroses em videiras sintomáticas e assintomáticas sobre as variáveis agronômicas relacionadas ao vigor das plantas e à qualidade enológica da uva, e comparar os isolados virais obtidos nessas duas condições. Realizaram-se dois experimentos com quatro cultivares. Todas as plantas foram indexadas, por meio da reação em cadeia da polimerase via transcrição reversa (RT-PCR) em tempo real, quanto à provável ocorrência dos seguintes vírus: Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD), Grapevine leafroll-associated virus (GLRaV-1 ao -4, GLRaV-4 estirpe 5), Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV) e Grapevine fleck virus (GFkV). As variáveis avaliadas foram:...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Grapevine; Vitis; Complexo do lenho rugoso; Enrolamento-da-folha; PCR em tempo real.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015000700541

Molecular characterization of GSyV-1 and GLRaV-3 and prevalence of grapevine viruses in a grape-growing area
Provedor de dados: 63
Autores: Moura,Cátia Jacira Martins de; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Eiras,Marcelo; Silva,Fábio Nascimento da; Nickel,Osmar.
ABSTRACT: The aims of this study were to determine the prevalence of viruses in 119 samples from 32 grapevine cultivars, collected from nine vineyards in a specific grape-growing area in southeastern Brazil, perform a partial molecular characterization of 14 isolates of Grapevine Syrah virus 1 (GSyV-1) and Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) and assess the coat protein genetic variability of these viruses. The detection of viruses was implemented by real-time RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) aiming to detect seven viruses and one viroid. With the exception of the Grapevine Cabernet Sauvignon reovirus (GCSV), the viruses and viroid that were evaluated were widespread in the sampled areas, often in high prevalence and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Vitis; Diagnosis; Variability; Incidence; Leafroll.
Ano: 2018
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162018000100043

Tomato rugose mosaic virus in Tomato Crops in São Paulo State, Brazil
Provedor de dados: 102
Autores: Colariccio,Addolorata; Bergmann,Jéssica C.; Eiras,Marcelo; Chaves,Alexandre L.R.; Chagas,César M.; Zerbini,F. Murilo.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582006000600015

Erigeron bonariensis: hospedeira alternativa do Lettuce mosaic virus no Brasil
Provedor de dados: 102
Autores: Chaves,Alexandre L. R.; Braun,Marina R.; Eiras,Marcelo; Colariccio,Addolorata; Galleti,Silvia R.
O gênero Erigeron (Asteraceae), de plantas da vegetação espontânea, encontra-se amplamente disseminado nas regiões Sul e Sudeste do Brasil, sendo freqüentemente encontrado em lavouras perenes e anuais. Plantas de E. bonariensis com sintoma de mosaico, típico do induzido por vírus, foram coletadas no município de São Paulo e submetidas a análises ao microscópio eletrônico de transmissão, testes biológicos, sorológicos e moleculares. Em cortes ultrafinos do tecido foliar original, observaram-se inclusões tubulares e cata-ventos dispersos no citoplasma. Através de inoculação mecânica, somente Chenopodium amaranticolor, C. quinoa, Nicotiana benthamiana e N. clevelandii foram infetadas. Os resultados obtidos em ELISA foram negativos quando se utilizaram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Palavras-chave: Potyvirus; LMV; Detecção; Vegetação espontânea.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582003000300014

Tomato chlorotic spot virus in hydroponically-grown lettuce in São Paulo State, Brazil
Provedor de dados: 102
Autores: Colariccio,Addolorata; Eiras,Marcelo; Chaves,Alexandre L. R.; Harakava,Ricardo; Chagas,César M.
In the regions of Campinas and Sumaré, São Paulo, Brazil, hidroponically grown crops of Lettuce (Lactuca sativa) cv. Verônica, which showed virus-like symptoms were examined by electron microscope, biological, serological and molecular tests. Pleomorphic, enveloped particles (80-100 nm in diameter) were always detected in these samples. Experimentally inoculated host plants, including lettuce, reacted with tospoviruses-induced symptoms. Some differences were observed in Gomphrena globosa, which reacted by showing local lesions and systemic mosaic. Two isolates of Tomato chlorotic spot virus (TCSV) were identified by DAS-ELISA and by RT-PCR. The sequencing and alignment of the RT-PCR coat protein amplified fragments have indicated a high degree of homology...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Palavras-chave: Tospovirus; Serology; RT-PCR; Sequencing.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000300012

Citrus exocortis viroid and Hop Stunt viroid Doubly infecting grapevines in Brazil
Provedor de dados: 102
Autores: Eiras,Marcelo; Targon,Maria Luisa P.N.; Fajardo,Thor V.M.; Flores,Ricardo; Kitajima,Elliot W.
Viroids, non-protein-coding small (246-401 nt) circular single-stranded RNAs with autonomous replication, are currently classified into two families. Within the family Pospiviroidae, Citrus exocortis viroid (CEVd) belongs to the genus Pospiviroid while Hop stunt viroid (HSVd) is the single member of the genus Hostuviroid. These pathogens are distributed worldwide and infect a large number of hosts. In Brazil, isolates of CEVd and HSVd have been detected in both citrus and grapevine. To characterize and study the genetic variability of these viroids, total RNA from leaves of grapevine Vitis vinifera 'Cabernet Sauvignon' and V. labrusca 'Niagara Rosada' from Bento Gonçalves, RS, was used as a template for RT-PCR amplification with specific primers for the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: CEVd; HSVd; Pospiviroid; Hostuviroid; Pospiviroidae.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582006000500002

Caracterização de um isolado do Pepper mild mottle virus que não quebra a resistência do gene L3 em Capsicum sp.
Provedor de dados: 102
Autores: Eiras,Marcelo; Chaves,Alexandre L. R.; Moreira,Silvia R.; Araujo,Jansen de; Colariccio,Addolorata.
Sementes de pimenta (Capsicum baccatum) 'Dedo de Moça' destinadas ao plantio comercial e adquiridas no município de São Paulo, SP, analisadas quanto à presença de vírus, por meio de testes biológicos e sorológicos revelaram-se infetadas por uma estirpe do Pepper mild mottle virus (PMMoV). Para confirmar a identidade do isolado, promoveu-se a RT-PCR com oligonucleotídeos que flanqueiam a ORF da capa protéica de espécies do gênero Tobamovirus do subgrupo 1. Os fragmentos de DNA amplificados, quando seqüenciados e comparados com outros isolados de tobamovírus depositados no GenBank, apresentaram valores de identidade de nucleotídeos entre 94 e 100% com outras seqüências de PMMoV, inferiores a 75% para as demais espécies de tobamovírus do subgrupo I (Tobacco...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Tobamovirus; Pimenta; Pimentão; Seqüenciamento.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000600014

Detecção de um isolado de Grapevine virus A e caracterização do gene da proteína capsidial
Provedor de dados: 102
Autores: Fajardo,Thor V. M.; Nickel,Osmar; Eiras,Marcelo; Kuhn,Gilmar B.
O Grapevine virus A (GVA) está associado à "Acanaladura do lenho de Kober", uma doença do complexo rugoso da videira (Vitis spp.). Neste trabalho, um isolado brasileiro de GVA (GVA-RS) foi caracterizado biologicamente por transmissão mecânica para cinco hospedeiras herbáceas e por enxertia na videira indicadora cv. Kober 5BB, e também por sorologia. O RNA total foi extraído de videira infetada cv. Pirovano 65. Para a RT-PCR, dois pares de oligonucleotídeos foram utilizados. Dois fragmentos de DNA, 430 e 451 pb, apresentando sobreposição parcial de nucleotídeos, foram amplificados por PCR. A seqüência do gene da proteína capsidial do GVA-RS com 597 nucleotídeos e 198 aminoácidos deduzidos, com massa molecular calculada de 21,6 kDa, foi alinhada a outros...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Videira; Vitis; GVA; Vitivirus.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582003000500009

Detection of Varicosavirus and Ophiovirus in lettuce associated with lettuce big-vein symptoms in Brazil
Provedor de dados: 102
Autores: Colariccio,Addolorata; Chaves,Alexandre L.R.; Eiras,Marcelo; Chagas,César M.; Roggero,Piero.
During surveys undertaken from 1998 to 2003 in the major vegetable growing areas of the city of São Paulo green belt, lettuce (Lactuca sativa) and endive (Cichorium endivia) plants were observed, which showed chlorotic thickening of foliar veins, defective growth and, in some cases, failure to form complete heads. Biological and serological [DAS-Enzyme linked immunosorbent assay (Elisa)] tests together with electron microscope observations, revealed the presence of Lettuce big-vein virus and Mirafiori lettuce virus, in these plants both responsible for the lettuce big-vein syndrome.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other
Palavras-chave: Lettuce big-vein associated virus; Mirafiori lettuce virus; Lettuce; Virus transmitted by fungi.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582005000400014

Detecção e caracterização biológica e molecular de Rupestris stem-pitting associated virus e seu efeito na fotossíntese de videiras
Provedor de dados: 102
Autores: Fajardo,Thor V.M.; Eiras,Marcelo; Santos,Henrique P.; Nickel,Osmar; Kuhn,Gilmar B.
Rupestris stem pitting associated virus (RSPaV) é o agente causal das "caneluras do tronco de Rupestris" da videira (Vitis spp.). Neste trabalho, um isolado de RSPaV, encontrado em videiras cv. Cabernet Franc no Rio Grande do Sul, foi estudado. O vírus foi detectado biologicamente, por enxertia em videira indicadora cv. Rupestris du Lot, em 26,2% das amostras avaliadas. A seqüência parcial do gene da replicase do RSPaV, isolado sul-brasileiro, com 831 nucleotídeos amplificados por RT-PCR e 276 aminoácidos deduzidos, apresentou maior identidade de nucleotídeos (98,1%) e aminoácidos deduzidos (99,6%), com dois isolados norte-americanos. O RSPaV estudado apresentou baixa homologia (37-41%) com outros vírus do gênero Foveavirus. A maioria das mudas de videira...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Vitis; RSPaV; Foveavirus; Caracterização.
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000200016

Avaliação da variabilidade do Grapevine leafroll-associated virus 1 e 3 por análise de seqüências de nucleotídeos e polimorfismo conformacional de fita simples
Provedor de dados: 102
Autores: Fajardo,Thor V.M.; Eiras,Marcelo; Schenato,Paula G.; Nickel,Osmar; Kuhn,Gilmar B.
As principais espécies de vírus envolvidas na etiologia do enrolamento da folha da videira (Vitis spp.) são Grapevine leafroll-associated virus 1 e 3 (GLRaV-1 e -3). Neste estudo da variabilidade desses vírus, foram amplificados dois fragmentos de DNA (396 bp do GLRaV-1 e 602 bp do GLRaV-3) por RT-PCR, a partir de RNA total extraído de nervuras e pecíolos de videiras infetadas, utilizando-se dois pares de oligonucleotídeos. Os DNAs amplificados foram clonados e reamplificados, a partir dos clones recombinantes, e comparados quanto às diferenças conformacionais das fitas simples desnaturadas (SSCP). Foram observados dois padrões distintos de perfis eletroforéticos para cada vírus, tendo sido seqüenciado pelo menos um clone viral correspondente a cada...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Videira; Vitis; GLRaV-1; GLRaV-3; SSCP.
Ano: 2005
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582005000200013

First report of Turnip mosaic virus in horseradish in Brazil
Provedor de dados: 102
Autores: Eiras,Marcelo; Chaves,Alexandre L.R.; Colariccio,Addolorata; Chagas,César M.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582007000200013

Viróides e virusóides: relíquias do mundo de RNA
Provedor de dados: 102
Autores: Eiras,Marcelo; Daròs,Jose Antonio; Flores,Ricardo; Kitajima,Elliot W.
Até meados do século XX, os vírus eram considerados os representantes mais simples da escala biológica. A descoberta dos RNAs satélites e dos viróides por volta de 1970 foi surpreendente, pois comprovou-se a existência de uma nova classe de moléculas auto-replicativas ainda mais simples, denominada agentes sub-virais. Há indícios de que os viróides e virusóides (que formam uma classe de RNAs satélites), teriam feito parte do "Mundo de RNA" (que precedeu o mundo atual baseado no DNA e proteínas), podendo ser considerados fósseis moleculares dessa era antiga. A simplicidade desses agentes sub-virais e o fato de que a molécula de RNA deve interagir diretamente com fatores do hospedeiro para o desenvolvimento do seu ciclo infeccioso colocam esses patógenos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Interação patógeno/hospedeiro; Silenciamento gênico; Evolução; Ribozima; RNA satélite; Patogênese; Taxonomia; Quasispecies.
Ano: 2006
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582006000300001

Caracterização de uma nova estirpe do Tomato mosaic virus isolada de tomateiro no Estado de São Paulo
Provedor de dados: 102
Autores: Moreira,Silvia R.; Eiras,Marcelo; Chaves,Alexandre L.R.; Galleti,Silvia R.; Colariccio,Addolorata.
Um vírus isolado em Guaratinguetá, SP, de tomateiro (Lycoporsicon esculentum) 'Santa Clara' com sintomas característicos de virose, foi estudado por meio de plantas indicadoras e de hospedeiras diferenciais pertencentes a linhagens homozigotas de tomateiro, ensaios de estabilidade in vitro, purificação, contrastação negativa, testes sorológicos de ELISA-PTA e imunomicroscopia eletrônica, utilizando-se anti-soros contra diferentes vírus do gênero Tobamovirus. O isolado infetou plantas de espécies de amarantáceas, quenopodiáceas e solanáceas. Plantas de Chenopodium amaranticolor reagiram com sintomas locais e sistêmicos; Nicotiana sylvestris e N. rustica reagiram com lesões locais e a linhagem homozigota de tomateiro Tm-2 mostrou-se imune ao vírus. Nas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Tobamovirus; Hospedeiras diferenciais; Sorologia; Seqüenciamento.
Ano: 2003
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582003000600004

Variability of the coat protein gene of Grapevine leafroll-associated virus 3 in Brazil
Provedor de dados: 102
Autores: Fajardo,Thor V.M.; Dianese,Érico C.; Eiras,Marcelo; Cerqueira,Daniela M.; Lopes,Daniela B.; Ferreira,Marisa A.S.V.; Martins,Cláudia R.F.
Leafroll is an economically important disease affecting grapevines (Vitis spp.). Nine serologically distinct viruses, Grapevine leafroll-associated virus-1 through 9, are associated with this disease. The present study describes the coat protein gene sequence of four GLRaV-3 isolates occurring in the São Francisco River basin, Northeastern Brazil. The viral RNA was extracted from GLRaV-3 ELISA-positive plants and the complete coat protein gene was amplified by RT-PCR. Sequences were generated automatically and compared to the complete coat protein sequence from North American (NY1) and Chinese (Dawanhong Nº2 and SL10) GLRaV-3 isolates. The four studied isolates, named Pet-1 through 4, showed deduced amino acid identities of 98-100% (Pet-1 through 3) and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Closteroviridae; Ampelovirus; GLRaV-3.
Ano: 2007
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582007000400008

Detecção e caracterização molecular parcial do Grapevine fleck virus em videiras
Provedor de dados: 102
Autores: Fajardo,Thor V.M.; Eiras,Marcelo; Schenato,Paula G.; Nickel,Osmar; Kuhn,Gilmar B.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report
Ano: 2004
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000400020

Caracterização parcial de um Tymovirus isolado de tomateiros
Provedor de dados: 53
Autores: Batista,Isabel Cristina; Eiras,Marcelo; Harakava,Ricardo; Colariccio,Addolorata.
Um Tymovirus isolado de sementes de tomateiro (Solanum lycopersicum) 'Paronset' com sintomas de necrose, denominado TyToRS08, foi caracterizado quanto ao círculo de hospedeiras, propriedades físico-químicas, sorológicas e moleculares. O vírus foi transmitido mecanicamente a partir de folhas, frutos e sementes infectadas. A gama de hospedeiras incluiu espécies de Amaranthaceae, Chenopodiaceae e Solanaceae, induzindo sintomas local e sistêmicos na maior parte das espécies, exceto para Nicotiana sylvestris, N. tabacum 'Samsun', 'White Burley' e 'Xanthi' que não manifestaram sintomas. Em tomateiros 'Alambra', 'Thomas', 'Diva', 'Romana' e 'Graziela', o vírus induziu sintomas de mosaico e necrose branca. A presença do vírus foi detectada, nas sementes infectadas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Tymoviridae; Solanum lycopersicum; Transmissão; Semente.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052012000200011

Reação de genótipos de feijão-caupi revela resistência às coinfecções pelo Cucumber mosaic virus, Cowpea aphid-borne mosaic virus e Cowpea severe mosaic virus
Provedor de dados: 53
Autores: Oliveira,Cláudia Roberta Ribeiro de; Freire Filho,Francisco Rodrigues; Nogueira,Maria do Socorro da Rocha; Barros,Gislanne Brito; Eiras,Marcelo; Ribeiro,Valdenir Queiroz; Lopes,Ângela Celis de Almeida.
O rendimento do feijão-caupi pode ser afetado por diversos fatores, em especial as viroses. As principais espécies de vírus que infectam o feijão-caupi, no Brasil, são: Cucumber mosaic virus (CMV), Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), Cowpea severe mosaic virus (CPSMV) e o Bean golden mosaic virus (BGMV). Este trabalho foi realizado em duas etapas e teve como objetivo avaliar a reação de genótipos de feijão-caupi quanto à resistência à infecção simples pelo CMV e mista nas combinações CMV+CABMV, CMV+CPSMV-I e CMV+CABMV+CPSMV-I. Inicialmente, foram incluídos 57 genótipos, sendo três avaliações em gaiolas com tela antiafídeos sob infecção controlada, e uma em condição de campo sob infecção natural. Em seguida, foram selecionados 18 genótipos para serem...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Vigna unguiculata; Resistência a vírus; Efeito sinérgico.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052012000100010

Detecção e caracterização molecular dos genes da proteína capsidial de ilarvírus e ampelovírus que infectam fruteiras temperadas
Provedor de dados: 65
Autores: Fajardo,Thor Vinícius Martins; Nickel,Osmar; Eiras,Marcelo.
Dentre os principais patógenos que incidem em fruteiras temperadas, destacam-se o Prune dwarf virus (PDV), o Apple mosaic virus (ApMV) e o Grapevine leafroll-associated virus 1 (GLRaV-1). Neste trabalho foram realizadas a detecção e a caracterização molecular dos genes da proteína capsidial de isolados destas três espécies virais. RNAs totais foram extraídos de amostras de folhas de pessegueiros, macieiras e videiras e, nas reações de RT-PCR, foram utilizados oligonucleotídeos específicos para cada espécie viral. Os cDNAs amplificados foram clonados e sequenciados. Foram verificadas altas identidades entre as sequências de nucleotídeos dos genes da proteína capsidial dos isolados brasileiros de PDV, ApMV e GLRaV-1 e isolados de outros países, independente...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: PDV; ApMV; GLRaV-1; Pessegueiro; Macieira; Videira.
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000100002

Incidência de vírus em videiras no Nordeste brasileiro e caracterização molecular parcial de isolados virais locais
Provedor de dados: 65
Autores: Catarino,Aricléia de Moraes; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Pio-Ribeiro,Gilvan; Eiras,Marcelo; Nickel,Osmar.
Os objetivos deste trabalho foram identificar as espécies virais presentes em vinhedos comerciais de duas regiões do Nordeste do Brasil e realizar a caracterização molecular parcial de isolados de três espécies virais. A diagnose foi realizada por meio de RT-PCR em tempo real para a detecção de Grapevine rupestris stem pitting-associated virus (GRSPaV), Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine leafroll-associated virus 2, 3 e 4 (GLRaV-2, -3 e -4), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine rupestris vein feathering virus (GRVFV) e Grapevine fanleaf virus (GFLV). Exceto para GFLV, os vírus avaliados estão amplamente disseminados nas áreas amostradas, frequentemente em altas incidências e em infecções múltiplas, de até 98% e 76,4%, na Zona da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Proteína capsidial; Levantamento; Detecção; Variabilidade; Vitis.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782015000300379

v.40, n.11, p.2249-2255, nov, 2010
Provedor de dados: 65
Autores: Basso,Marcos Fernando; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Eiras,Marcelo; Ayub,Ricardo Antônio; Nickel,Osmar.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000200033

v.40, n.11, p.2385.2388, nov, 2010
Provedor de dados: 65
Autores: Basso,Marcos Fernando; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Eiras,Marcelo; Ayub,Ricardo Antônio; Nickel,Osmar.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Ano: 2011
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000200032

Molecular characterization of Prunus necrotic ringspot virus isolated from rose in Brazil
Provedor de dados: 65
Autores: Fajardo,Thor Vinícius Martins; Nascimento,Monique Bezerra; Eiras,Marcelo; Nickel,Osmar; Pio-Ribeiro,Gilvan.
ABSTRACT: There is no molecular characterization of Brazilian isolates of Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV), except for those infecting peach. In this research, the causal agent of rose mosaic was determined and the movement (MP) and coat (CP) protein genes of a PNRSV isolate from rose were molecularly characterized for the first time in Brazil. The nucleotide and deduced amino acid sequences of MP and CP complete genes were aligned and compared with other isolates. Molecular analysis of the MP and CP nucleotide sequences of a Brazilian PNRSV isolate from rose and others from this same host showed highest identities of 96.7% and 98.6%, respectively, and Rose-Br isolate was classified in PV32 group.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report
Palavras-chave: Diagnosis; Sequencing; Ilarvirus; PNRSV; ApMV; ArMV.
Ano: 2015
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782015001202197

Detecção e identificação molecular de vírus associados a videiras sintomáticas e assintomáticas
Provedor de dados: 65
Autores: Basso,Marcos Fernando; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Eiras,Marcelo; Ayub,Ricardo Antônio; Nickel,Osmar.
A propagação vegetativa da videira favorece infecções virais múltiplas, com expressão diferencial de sintomas em função da combinação da cultivar ou espécie da hospedeira com a espécie viral. Os objetivos deste trabalho foram detectar e identificar as espécies virais presentes em duas espécies/cultivares de videira: uma sintomática e outra assintomática. DsRNA de ambas as amostras foi submetido à RT-PCR com 17 pares de oligonucleotídeos específicos para a detecção de Grapevine virus A (GVA), Grapevine virus B (GVB), Grapevine virus D (GVD), Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine fanleaf virus (GFLV), Arabis mosaic virus (ArMV), Grapevine chrome mosaic virus (GCMV), Rupestris stem pitting-associated virus (RSPaV), Grapevine leafroll-associated virus 1 a 4...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: RSPaV; GLRaV-2; GLRaV-3; Vitis; Diagnose; Variabilidade.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010001100001

Detection and partial molecular characterization of Grapevine fleck virus, Grapevine virus D, Grapevine leafroll-associated virus -5 and -6 infecting grapevines in Brazil
Provedor de dados: 65
Autores: Fajardo,Thor Vinícius Martins; Eiras,Marcelo; Nickel,Osmar; Dubiela,Carla Rosa; Souto,Eliezer Rodrigues de.
Grapevine fleck, rugose wood and leafroll are three grapevine viral diseases whose causal agents (or associated viruses) respectively are Grapevine fleck virus (GFkV), Grapevine virus D (GVD) and Grapevine leafroll-associated virus 5 and 6 (GLRaV-5 and -6). The objective of this work was to perform a partial molecular characterization of local isolates of these four viral species that infect grapevines. The nucleotide and deduced amino acid sequences of complete genes of the coat protein (CP) (of GFkV), the CP and the RNA binding protein (of GVD), the CP and the partial hHSP70 gene (of GLRaV-5) and the partial hHSP70 gene (of GLRaV-6) were aligned and compared in silico with other isolates. These data extend the available information about Brazilian...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Diagnosis; Sequencing; Maculavirus; Vitivirus; Ampelovirus; Vitis.
Ano: 2012
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782012001200004

Produção de antissoro policlonal utilizando a proteína capsidial recombinante do Rupestris stem pitting-associated virus
Provedor de dados: 65
Autores: Basso,Marcos Fernando; Fajardo,Thor Vinícius Martins; Eiras,Marcelo; Ayub,Ricardo Antônio; Nickel,Osmar.
O Rupestris stem pitting-associated virus (RSPaV) é o agente causal das caneluras do lenho da videira. Este trabalho teve como objetivo produzir antissoro policlonal a partir da proteína capsidial (CP) recombinante do RSPaV e avaliar a sua especificidade e sensibilidade. O gene da CP do RSPaV, com 780pb, foi previamente caracterizado. Esse gene foi subclonado no sítio de restrição EcoRI, no vetor de expressão pRSET-B e o plasmídeo recombinante foi utilizado para induzir a expressão da CP em Escherichia coli. A CP, ligada a uma cauda de seis histidinas, foi purificada por meio de cromatografia de afinidade em coluna de Ni-NTA a partir do extrato de proteínas totais extraídas de E. coli. A identidade da proteína purificada foi confirmada em SDS-PAGE e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article
Palavras-chave: Videira; RSPaV; Detecção; Sorologia.
Ano: 2010
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010001100022